| 解淀粉芽孢杆菌TF28抗菌蛋白TasA基因序列分析及蛋白质结构预测 |
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| 引用本文： | 高娃,姜威,孟利强,李晶,陈靖宇,曹旭,胡基华,刘宇帅,张鹏远,张淑梅.解淀粉芽孢杆菌TF28抗菌蛋白TasA基因序列分析及蛋白质结构预测[J].基因组学与应用生物学,2015(2):313-318. |
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| 作者姓名： | 高娃 姜威 孟利强 李晶 陈靖宇 曹旭 胡基华 刘宇帅 张鹏远 张淑梅 |
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| 作者单位： | 黑龙江省科学院微生物研究所;黑龙江省科学院高技术研究院;东北农业大学资环学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金青年基金项目(31301780);黑龙江省科学院学科专项和学科团队项目(2014sw09)共同资助 |
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| 摘 要： | 本研究以解淀粉芽孢杆菌TF28为材料,采用PCR方法从基因组DNA中扩增出抗菌蛋白Tas A基因,利用生物信息学方法对Tas A基因序列及其编码的蛋白质结构进行分析和预测。结果表明Tas A基因全长786 bp,含有一个完整的开放阅读框和一个终止密码子,编码261个氨基酸,经Blast比对,该基因与其它解淀粉芽孢杆菌Tas A基因同源性为95%~99%,与B.amyloliquefaciens FZB42(CP 000560.1)Tas A基因序列同源性最高为99%,与B.amyloliquefaciens DSM7(FN597644.1)的同源性最低为95%。预测该基因编码蛋白质分子量为28 k D,等电点为6.35,是含有信号肽和跨膜结构的亲水蛋白,蛋白结构中含有糖基化和磷酸化位点,二级结构中以琢螺旋、茁折叠和无规则卷曲为主。
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| 关 键 词： | 解淀粉芽孢杆菌 Tas A基因 序列分析 蛋白结构预测 |
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