基于双重芯片式数字PCR快速鉴定KPC型碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌的方法

【背景】由于碳青霉烯类药物的泛用和滥用,致使肺炎克雷伯菌碳青霉烯耐药株与日俱增,产碳青霉烯酶是肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类药物耐药的主要原因。目前对肺炎克雷伯菌碳青霉烯耐药株的检测方法存在费时费力、特异性差、灵敏度低等问题。【目的】建立一种能同时检测肺炎克雷伯菌和碳青霉烯酶基因bla_KPC的双重芯片式数字PCR方法。【方法】依据肺炎克雷伯菌的特有基因yhaI和碳青霉烯耐药基因bla_KPC保守序列设计特异性引物和探针,确定双重芯片式数字PCR同时对yhaI和bla_KPC两个基因核酸浓度绝对定量的检测范围、检出限和最佳实验体系,并进行方法特异性、灵敏度、重复性分析及临床菌株的检测。【结果】双重芯片式数字PCR检测灵敏度比双重实时荧光定量PCR提高了约1.5个数量级,在两基因同时检出的情况下,最低检出限分别为3.74 copies/μL (yhaI基因)和1.93 copies/μL (bla_KPC基因);优化后的双重芯片式数字PCR对参考菌株检测特异性的结果与双重实时荧光定量PCR结果一致;利用优化后的双重芯片式数字PCR方法共检测58株临床菌株,其中肺炎克雷伯菌43株,属肺炎克雷伯菌且含有bla_KPC基因的菌株13株,这与质谱及耐药谱检测结果一致。【结论】利用双重芯片式数字PCR技术建立了产KPC型碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌的绝对定量检测方法。该方法特异性强、灵敏度高、准确度好,可用于检测具有碳青霉烯酶基因bla_KPC的肺炎克雷伯菌的核酸检测和定量分析,也为产其他类型碳青霉烯酶的病原菌检测提供了新的技术参考。     

非洲哈茨木霉LMNS-M9的鉴定、生物学特性及其对藜麦的促生作用

【背景】藜麦作为风靡全球的功能性食品,其种子内生非洲哈茨木霉的研究尚未见报道。【目的】从藜麦种子中筛选出有抑菌活性的内生真菌,分析其抑菌和促生作用。【方法】通过形态学及ITS、tef1和rpb2基因序列等方法对筛选出的内生真菌进行鉴定;采用平板对峙和平板倒扣等方法测定内生真菌的抑菌活性;利用盆栽试验测定内生菌株对藜麦生长的影响。【结果】综合形态学特征和系统发育分析结果,确定菌株LMNS-M9为非洲哈茨木霉(Trichoderma afroharzianum)。30℃、pH 5.0和镁离子适宜菌株LMNS-M9菌丝生长和产孢;葡萄糖、乳糖、蛋白胨、磷酸二氢钾适宜菌株LMNS-M9菌丝生长;葡萄糖、硝酸铵、磷酸氢二钾适宜菌株LMNS-M9产孢。菌株LMNS-M9对Botrytis cinerea、Ascochyta caulina、Fusarium citri、Alternaria alternata和Trichothecium roseum的抑制率分别为12.53%、51.96%、52.38%、59.25%和62.04%,挥发物的抑制率分别为35.86%、61.54%、33.33%、41...     

ICU呼吸机相关性肺炎患者病原菌分布及NLR、血清磷、PCT联合检测对死亡风险的预测价值探讨

摘要 目的：研究重症监护室（ICU）呼吸机相关性肺炎（VAP）患者病原菌分布及中性粒细胞与淋巴细胞计数比值（NLR）、血清磷、降钙素原（PCT）联合检测对死亡风险的预测价值。方法：选取上海市第一人民医院于2020年1月～2022年1月收治的60例VAP患者。采集所有患者呼吸道分泌物并进行细菌培养。此外,将其按照预后的不同分为死亡组21例以及存活组39例,比较两组NLR、血清磷及PCT水平。以单因素及多因素Logistic分析VAP患者死亡的危险因素,并通过受试者工作特征（ROC）曲线分析NLR、血清磷及PCT预测死亡的效能。结果：60例VAP患者呼吸道分泌物检出病原菌共82株,以革兰阴性菌占比最高,共检出革兰阴性菌75.61%、革兰阳性菌21.95%、真菌2.44%。按照占比从高到低的顺序分别为鲍氏不动杆菌20.73%,铜绿假单胞菌18.29%,肺炎克雷伯菌17.07%,金黄色葡萄球菌13.41%,大肠埃希菌12.20%,其他革兰阴性菌7.32%,表皮葡萄球菌4.88%,肠球菌属3.66%,真菌2.44%。死亡组NLR及PCT水平均高于存活组,而血清磷水平低于存活组（P＜0.05）。单因素分析结果显示：急性生理与慢性健康评分（APACHEⅡ）评分及有创机械通气时间均和VAP患者死亡有关（P＜0.05）。多因素Logistic回归分析显示：APACHEⅡ评分较高、有创机械通气时间较长与NLR、PCT水平较高均是VAP患者死亡危险因素,血清磷水平较高是VAP患者死亡的保护因素（P＜0.05）。ROC曲线分析显示：NLR、血清磷及PCT联合预测VAP患者死亡的效能优于上述三项指标单独预测。结论：VAP患者主要病原菌为革兰阴性菌,临床应合理选用抗菌药物治疗,NLR、血清磷及PCT均和患者死亡有关,联合检测对死亡风险的预测价值较高。     

重症肺炎患者病原菌分布、临床结局分析及血清尿素氮与肌酐比值、尿素氮与白蛋白比值联合检测的临床意义

摘要 目的：分析重症肺炎（SP）患者病原菌分布和临床结局并探讨血清尿素氮与肌酐比值（UCR）、尿素氮与白蛋白比值（UAR）联合检测的临床意义。方法：选取2019年8月～2022年8月三六三医院收治的107例SP患者,根据临床结局分为死亡组和存活组。分析SP患者病原菌分布情况。采用单因素和多因素Logistic回归分析SP患者临床结局的影响因素,采用受试者工作特征（ROC）曲线分析血清UCR、UAR水平对SP患者临床结局的评估价值。结果：107例SP患者痰液标本中培养出122株病原菌,其中革兰阴性菌75株（61.48%）,革兰阳性菌39株（31.97%）,真菌8株（6.56%）。107例SP患者院内死亡率为40.19%（43/107）。多因素Logistic回归分析显示,年龄增加、肺外并发症≥2个和UCR、UAR升高为SP患者临床结局不良的独立危险因素,氧合指数增加为其独立保护因素（P＜0.05）。ROC曲线分析显示,血清UCR、UAR联合评估SP患者临床结局的曲线下面积（AUC）大于各指标单独评估。结论：SP患者病原菌分布以革兰阴性菌为主,血清UCR、UAR升高为SP患者临床结局不良的独立危险因素,可能成为SP患者临床结局的辅助评估指标,且二者联合评估SP患者临床结局的价值较高。     

重症急性胰腺炎合并腹腔感染患者病原菌分布、药物敏感性分析及其院内死亡的危险因素探讨

摘要 目的：观察重症急性胰腺炎（SAP）合并腹腔感染（IAI）患者病原菌分布,分析药物敏感性,同时探讨其院内死亡的危险因素。方法：本研究纳入2017年1月~2022年1月期间来解放军联勤保障部队第九二二医院接受治疗并确诊的SAP合并IAI患者100例,采集患者腹水标本,观察其病原菌分布,分析药物敏感性。入院后收集患者人口学特征、实验室检查等资料,探讨患者院内死亡的危险因素。结果：100例SAP合并IAI患者腹水标本中,分离出186株病原菌,其中革兰阴性菌有108株,占比58.06%。革兰阳性菌51株,占比27.42%。真菌27株,占比14.52%。鲍曼不动杆菌对不同抗菌药物的敏感性均较低,大肠埃希菌对厄他培南、亚胺培南、哌拉西林／他唑巴坦、庆大霉素、美罗培南的敏感性较高,肺炎克雷伯菌对亚胺培南、美罗培南的敏感性较高,葡萄球菌属对替加环素、万古霉素、利奈唑胺的敏感性较高,屎肠球菌对替加环素、利奈唑胺的敏感性较高,粪肠球菌对氨苄西林、万古霉素、环丙沙星、替加环素的敏感性较高。单因素分析显示,SAP合并IAI患者院内死亡与器官障碍数目、膀胱压、入院时急性生理学与慢性健康状况评分（APACHE II）评分、白细胞计数（WBC）、血钙、红细胞压积（HCT）、总胆固醇（TC）、甘油三醋（TG）、降钙素原（PCT）、C反应蛋白（CRP）、动脉二氧化碳分压（PaCO₂）、动脉氧分压（PaO2）有关（P<0.05）。多因素Logistic回归分析结果显示：器官障碍数目偏多、血钙偏低、CRP偏高、APACHE II评分偏高、膀胱压偏高、PaO₂偏低、WBC偏高是导致SAP合并IAI患者院内死亡的危险因素（P<0.05）。结论：SAP合并IAI患者病原菌分布以革兰阴性菌为主,主要的革兰阴性菌、革兰阳性菌耐药率高。此外,器官障碍数目偏多、血钙偏低、CRP偏高、APACHE II评分偏高、膀胱压偏高、PaO₂偏低、WBC偏高是影响SAP合并IAI患者院内死亡的危险因素。     

LT（K63／R72）, a New Mutant of Escherichia coli Heat-labile Enterotoxin, Exhibits Characteristics More Similar to LT（K63） than LT（R72）

LT(K63), a non-toxic mutant and LT(R72), a low toxic mutant of E. coli heat-labile enterotoxin are frequently used mucosal adjuvants. In many cases, the adjuvanticity of LT(K63) is lower than that of LT(R72), but LT(K63), which induces a mixed Th1/Th2 response, exhibits a higher level of protection than LT(R72) which induces a polarized Th2-type response. To utilize the advantages of both adjuvants, a doublemutation LT(K63/R72) was generated and purified. The characterization results showed that there was no significant difference in production rate and immunogenicity between wild type LT and LT mutants. The results also showed that the toxicity and the trypsin sensitivity of LT(K63/R72) are between that of LT(K63)and LT(R72). Using HPLC, when samples in an OHpak SB-800 column were eluted by denatural buffer(TEAN containing 10 mg/ml SDS), we found the stability of LT(K63/R72) was higher than that of LT(R72)and lower than that of LT(K63). Through further analyzes, we found that LT(K63/R72) exhibits characteristics more closely related to LT(K63) than LT(R72).     

病原真菌和细菌毒性基因的分离和鉴定

本文讨论最新发展起来的病原真菌和细菌毒性基因的分离和鉴别原理和方法,涉及到基因表达分析法、基因转移方法、基因组比较法、诱变方法及其诱变子的筛选鉴定。着重讨论了这些方法的优点和局限性,评估了标记诱变法（ＳＴＭ）和限制酶介导的整合法（ＲＥＭＩ）两者相互结合在病原真菌毒性基因克隆中的应用潜力。     

115株来自泌尿系感染病原菌的细菌学及其药敏分析

作者对泌尿系统感患者中段尿分离出的１１５株细菌进行分析。结果：来自住院患者男女比例为１∶３,共检出２０个菌种,其中革兰氏阴性杆菌占７８．８％,以大肠埃希氏菌检出率最高,占５１．８％;革兰氏阳性球菌以表皮葡萄球菌和粪肠球菌为主,占１１．７％;药敏试验结果表明：革兰氏阴性杆菌对丁胺卡那、头孢三嗪、亚胺硫霉素、头孢噻肟、呋喃妥因较敏感;革兰氏阳性球菌除对万古霉素、环丙氟哌酸、利福平较敏感外,对其它抗菌素都有相当高的耐药性。来自门诊患者男女之比为１∶９,共检出１８个菌种,其中革兰氏阴性杆菌占６６．７％,以大肠埃希氏菌为主,占３０．０％,其次为变形杆菌（６．６％）;革兰氏阳性球菌以粪肠球菌为主,占总检出菌的１３．３％,药物敏感率较住院患者高,细菌分布更广。     

病原菌与自然植物种群

在自然植物种群中,病原菌与寄主植物不仅在个体发育的水平上相互作用,而且在系统发育的水平上相互作用。这后一种相互作用的不是病原菌与寄主植物的共进化。本文论述了病原菌与寄主植物共进化的主要方面原菌的致病力和寄主植物种群的遗传结构。鉴于传媒方式在进化上具有重要意义,本文还简单介绍了媒体传布的菌病的种群模型。     

病原细菌致病性基因表达的环境调控

病原细菌致病性基因表达的环境调控胡稳奇（湖南省生物研究所长沙４４０００６）细菌是动物、植物乃至人类的重要致病微生物,可以引起人类的许多烈性和急性传染病,如鼠疫、霍乱、伤寒和传染性痢疾等。病理学家很久以前就注意到,病原细菌引起致病,是病原、行主及环境条...