临床宏基因组学应用现状及存在问题分析

众所周知,宏基因组学是一种通过提取样品中微生物的总DNA,构建宏基因组文库,研究环境中全部微生物的遗传组成及其菌落功能的方法。而宏基因组新一代测序(metagenome next-generation sequencing, mNGS)是在宏基因组学基础上进一步发展起来的新一代测序技术,无需对患者标本进行培养,直接分析标本中的微生物DNA或RNA。本文介绍了宏基因组学在临床上的应用,包括传染病的诊断、疾病和健康状态下的微生物组分析、人类宿主反应分析和肿瘤相关病毒及其基因组鉴定,并简要探讨了临床宏基因组学研究中所遇到的挑战及解决方法。     

不同种植方式对花生田间小气候效应和产量的影响

在大田高产条件下,研究了同一密度下不同种植方式对花生田间小气候效应及产量的影响.结果表明:增大行距和采用大小行种植方式有利于增加田间透光率,提高冠层空气温度与地表温度,降低田间相对湿度,提高田间CO2浓度,提高群体光合速率,进而增加荚果产量.但是行距过大,导致各种环境资源的浪费.采用大行距55cm小行距35cm的大小行种植方式是比较合理的种植方式.     

乙型肝炎病毒DNA聚合酶反式调节蛋白HBVDNAPTP1的表达、纯化与初步鉴定

目的构建HBVDNAPTP1基因的原核表达载体,诱导其在大肠埃希菌中表达,并对融合蛋白进行纯化。方法利用逆转录-PCR获得乙型肝炎病毒(HBV)DNA聚合酶(Polymerase)反式调节人类新基因HBVD-NAPTP1,测序正确后插入至原核表达载体pET-32a(+)中,转化BL21(DE3)宿主菌进行诱导,并利用组氨酸亲和层析方法对融合蛋白进行纯化。结果 HBVDNAPTP1原核表达载体转化宿主菌后,经0.5 mmol/L IPTG、30℃诱导5 h获得了分子量约为31 kD的HBVDNAPTP1融合蛋白的优化表达,Western blotting证实融合蛋白的特异性。亲和层析纯化后得到较纯的HBVDNAPTP1融合蛋白,每升培养菌液中可获得2.24 mg的纯化蛋白。结论成功获得纯化的HBVDNAPTP1融合蛋白,为今后开展HBVDNAPTP1的生物学功能研究奠定了物质基础。     

低频脉冲电疗联合针灸对脑卒中后吞咽障碍患者吞咽功能、脑血流以及血浆一氧化氮、超氧化物歧化酶的影响

目的:探讨低频脉冲电疗联合针灸对脑卒中后吞咽障碍患者吞咽功能、脑血流以及血浆一氧化氮、超氧化物歧化酶的影响。方法:选取2013年3月~2019年12月期间我院收治的脑卒中后吞咽障碍患者80例,按照随机数字表法分为对照组(n=40)和研究组(n=40),对照组患者予以低频脉冲电疗,研究组在对照组基础上联合针灸治疗,比较两组患者的疗效、吞咽功能、脑血流、血浆一氧化氮、超氧化物歧化酶水平以及不良反应发生情况。结果:研究组治疗1个月后的临床总有效率为92.50%(37/40),高于对照组的72.50%(29/40)(P<0.05)。两组治疗1个月后右侧椎动脉、基底动脉、左侧椎动脉的平均血流速度均升高,且研究组高于对照组(P<0.05)。两组患者治疗1个月后一氧化氮下降,且研究组低于对照组(P<0.05);超氧化物歧化酶升高,且研究组高于对照组(P<0.05)。两组患者治疗1个月后洼田饮水试验等级均降低,且研究组低于对照组(P<0.05)。两组不良反应发生率对比差异无统计学意义(P>0.05)。结论:低频脉冲电疗联合针灸治疗脑卒中后吞咽障碍患者,可有效促进脑循环,改善患者吞咽功能,减轻机体氧化应激,疗效显著。     

南京市场葡萄干卫生状况调查及清洗方法初探

通过泥沙类杂质和菌落总数的分析测定对南京市场收集的15种(其中散称的6种、袋装的9种)葡萄干进行了卫生状况调查,结果葡萄干泥沙类杂质含量约0.19%,葡萄干原样菌落总数平均约3.9×103CFU/g,表明市场上的葡萄干直接食用是不卫生。经自来水20 s短时间高压冲洗或继而再淋无菌水后测定,结果表明自来水高压冲洗后最高除菌率为92.0%,无菌水冲洗后最高除菌率为98.3%,样品葡萄干的菌落总数都能降到1 000以下。这方法生产上简单可行,对提高市场葡萄干质量具有重要意义。     

IL-21对恒河猴SHIV特异性CD8~+T细胞毒性效应的影响

目的探讨白细胞介素21(interleukin 21,IL-21)对SHIV特异性CD8+T细胞毒性效应的影响。方法定时采集16只SHIV感染恒河猴的外周血,应用实时荧光定量RT-PCR测定病毒载量,流式细胞仪测定CD8+T细胞绝对数,并且体外检测经IL-21刺激SHIV特异性CD8+T细胞后其IL-21R、CD107a及胞内穿孔素(perforin)的表达水平。结果体内实验结果表明外周血病毒载量和CD8+T细胞绝对数之间呈一定程度的负相关。体外实验结果表明SHIV特异性CD8+T细胞经IL-21刺激后其细胞表面表达的IL-21R显著上调,而且perforin+CD8+T细胞和CD107a+CD8+T细胞的百分比上升,同未经刺激的对照组相比具有统计学差异。结论 IL-21能够促进SHIV特异性CD8+T细胞的毒性效应。     

STAT3 入核分子机制的初步研究

为了研究Stat3入核的分子机制,将SV40大T抗原的经典核定位序列NLS(nuclear localization sequence)分别融合在Stat3-GFP分子和缺失突变体Dstat3-GFP的分子之间,构建Stat3-NLS-GFP和Dstat3-NLS-GFP融合分子。转染293T细胞,以NLS-GFP为阳性对照,通过激光共聚焦显微镜的观察融合分子的亚细胞位置,未经白介素-6刺激的Stat3-NLS-GFP和经白介素-6刺激的Stat3-GFP呈胞核分布,未经白介素-6刺激的Stat3-GFP和Dstat3-NLS-GFP呈胞浆分布,初步证明Stat3入核是由于获得了核定位序列。     

传统藏药材波棱瓜的氨基酸分析

采用FDBN柱前衍生高效液相色谱法测定了藏药材波棱瓜中氨基酸的含量。结果表明,波棱瓜中氨基酸总量为189.4g·kg-1,其中8种必需氨基酸含量占氨基酸总量的33.47%。     

桡足类与硅藻相互作用的研究进展

硅藻对桡足类繁殖的影响是近年来海洋生态学的热点问题,主要体现在降低了桡足类的产卵和孵化成功率。其可能原因在于硅藻大量繁殖后由于缺乏某种关键营养物质或自身产生某种抑制物阻碍了桡足类繁殖过程。但目前现场、室内实验结果不一：室内实验结果显示硅藻对桡足类繁殖的抑制作用主要是因为缺乏必要的多不饱和酸（PUFAs）。而现场实验结果则表明硅藻可产生次级代谢产物（小分子量的醛类）阻碍桡足类卵的孵化。由于目前对这种硅藻．桡足类相互作用机制和影响程度尚不清楚,如果这一现象在自然海区中普遍存在,传统上关于“硅藻-桡足类-鱼类”的海洋经典食物链观点势必存在极大的缺陷。文章介绍了这一问题的目前研究进展和将来的研究前景。     

灭活的双歧杆菌对EPEC的黏附抑制作用

目的：研究灭活的青春双歧杆菌DMS8504对肠致病灶大肠埃希菌（EPEC）黏附抑制作用。方法：通过与活菌比较,观察灭活的双歧杆菌粘附于人大肠癌CCL－229细胞后对EPEC的黏附抑制作用。结果：用SCS或pH5.0新鲜BS肉汤悬浮的双歧杆菌能够安全抑制EPEC的黏附,而仅用SCS或pH5.0新鲜BS肉汤均不能抑制其黏附。