PCR专一性研究——PCR的二段扩增法

多聚酶链式反应（polymerasechainreaction,PCR）技术问世几年以来,已经广泛应用于分子生物学的各个领域。通过对此技术方法的改进及与其他技术配合,其应用范围更加扩大,方法更加简化。然而在进行分子生物学研究中,PCR扩增（的）产物的专一性特别重要。本文探更多还原提出了一二段扩增法,很好地解决了引物不理想和由于内切酶位点的引入带来的PCR非专一性扩增.     

循环海水养鱼系统中pH值调节技术研究

分别采用NaHCO3、Na2CO3和NaOH 3种碱性试剂,3种添加方式调节循环海水养殖系统中水样的pH值。结果表明:从NaHCO3、Na2CO3和NaOH相应的滴定曲线确定突跃点pH值分别为7.25±0.04,7.22±0.01,7.11±0.01;发现添加714m g/L的NaHCO3可以有效提高并稳定水体的pH值,调节效果优于另两种碱试剂;"一次性"、"分四次"和"连续性"3种添加方式中,以"连续性"添加的水体pH值上升最平缓。要使循环海水的pH值维持在7.20～8.00之间,应在突跃点pH值7.22前夕,用连续添加的方式加入NaHCO3试剂,周期约为15～19 d。     

青蒿内生真菌分离、分子鉴定及深绿木霉对青蒿的促生作用研究

为从青蒿(Artemisia annua L.)内生真菌中筛选有促生作用的菌株,用组织分离法从青蒿侧枝中分离内生真菌并进行分子鉴定,对其中1株真菌深绿木霉对青蒿幼苗的促生作用进行了研究。结果表明,从青蒿侧枝中获得23株内生真菌,鉴定出16种,以炭疽菌属占优势。深绿木霉发酵液对青蒿种子发芽和幼苗生长具有显著抑制作用;深绿木霉液体发酵菌丝体在4-5月对青蒿幼苗生长具有显著的促进作用,但7月以后没有明显促进作用。因此,深绿木霉可作为青蒿苗肥,与化肥配合可施用于成株。     

克氏肺炎杆菌NiFe-氢酶基因的克隆与序列分析

采用CLUSTAL-W软件对Swiss-Prot蛋白数据库中已报道的NiFe-氢酶大亚基氨基酸序列进行比对分析,找到保守区并根据此设计兼并引物。利用其中一对引物进行PCR得到一条大小约为1000bp的DNA序列,并根据此序列设计引物进行反向PCR得到整个NiFe-氢酶的序列。再利用生物信息学软件对此氢酶的序列进行二、三级结构预测及大小亚基的对接(docking)。结果表明克氏肺炎杆菌的NiFe-氢酶属于一类膜结合放氢酶(Ech氢酶)。     

T-box转录因子Brachyury在肿瘤相关研究中的进展

Brachyury是T-box转录因子家族的重要成员,与肿瘤发展密切相关,在肿瘤上皮-间质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)中发挥重要作用,可能成为肿瘤免疫治疗的潜在靶点。从Brachyury与肿瘤转移、分期、预后的关系,对肿瘤EMT的诱导调节,对肿瘤传统治疗的抵抗及靶向Brachyury的肿瘤免疫治疗等方面进行了综述,并展望了Brachyury未来的研究方向和临床应用前景。     

糖元合成酶激酶3β对微管相关蛋白tau的磷酸化作用

tau蛋白是中枢神经系统中重要的微管相关蛋白,其功能受磷酸化调节.异常过度磷酸化的tau蛋白是阿尔茨海默病患者脑中神经纤维缠结的主要组成部分.糖元合成酶激酶3β(glycogen synthase kinase-3β,GSK-3β)是重要的tau蛋白激酶之一,它虽可催化tau蛋白多个位点的磷酸化,但对不同位点,其催化效率不同.通过位点特异性、磷酸化依赖的tau蛋白抗体,用免疫印迹技术,检测GSK-3β对tau蛋白位点特异性的磷酸化作用及动力学.用双倒数作图,计算GSK-3β催化tau磷酸化以及各个位点磷酸化的Km值,并结合培养细胞中的实验,研究GSK-3β对tau蛋白磷酸化作用的位点特异性.结果显示,GSK-3β催化tau蛋白多个位点的磷酸化,其中包括Thr181、Ser199、Ser202、Thr205、Thr212、Thr217、Thr231、Ser396和Ser404,对不同的位点磷酸化作用,其Km值不同,GSK-3β对Ser396的Km值最低,即对Ser396位点的亲和性最高,催化其磷酸化的能力最强.在培养的细胞中,也显示了GSK-3β的表达引起Ser396位点的磷酸化最明显.     

细胞表面糖链末端唾液酸和岩藻糖与某些细胞生物学行为的关系

用神经氨酸酶和a-L-岩藻糖苷酶分别切除人肝癌细胞株7721细胞表面糖链中的末端唾液酸(SA)和岩藻糖(Fuc)残基来研究表面聚糖结构和某些细胞生物学行为之间的关系.选择细胞对纤连蛋白(Fn)、层黏蛋白(Ln)和人脐静脉内皮细胞(HUVEC)的黏附能力、细胞趋化性迁移以及趋化性侵袭作为细胞行为的指标.结果表明表面糖链末端SA对细胞黏附至Fn并不必需,对细胞黏附至Ln和细胞的趋化性侵袭却至为重要,而对细胞黏附至HUVEC以及趋化性迁移则为关键性残基.与SA相比,Fuc可能参与细胞Fn、Ln和HUVEC的黏附,但对趋化性迁移以及趋化性侵袭并不重要.细胞对HUVEC的黏附以及趋化性迁移和侵袭可被唾液酸化Lewis X(SLex)的单抗抑制,但不被未唾液酸化的Lewis X(Lex)单抗抑制,这一结果支持SA在上述三种细胞过程中较Fuc残基重要.     

用于治疗类风湿性关节炎的JAK 抑制剂

类风湿性关节炎是一种临床常见的慢性自身免疫性疾病,发病过程中滑膜组织及细胞分泌的大量细胞因子通过不同途径激活JAK/STAT 信号通路,并导致病变。因此,选择JAK 抑制剂针对性地阻断JAK/STAT 通路,可达到改善类风湿性关节炎病理过程的目的。概述JAK/STAT 信号通路的组成与结构、功能与机制以及在类风湿性关节炎发病过程中的作用,并着重介绍若干具代表性的已上市和尚处于临床及临床前研究阶段的JAK 抑制剂在类风湿性关节炎治疗中的应用研究。     

黄山风景区旅游干扰对植物群落及其土壤性质的影响

为了解黄山风景区旅游开发的生态影响,采用样方法对黄山风景区主要游览线路两侧植物群落及其土壤进行了调查,通过比较距游径0m、5m、10m,15m等干扰强度不同地段植物群落及其土壤性质变化特征,分析了旅游干扰对植物群落及其土壤性质的影响.结果表明:旅游干扰对植物群落乔木层影响不大,但对乔木层的更新有一定影响;对灌木层盖度影响较为明显,随距游径距离的增加,灌木层盖度趋于上升;对草本层影响最为显著,游径边缘5m以内干扰强度最大地段草本层高度明显降低,但草本层盖度未显示出随干扰强度变化的规律性,旅游干扰增加了草本层物种多样性,对草本层物种组成也有明显影响.旅游干扰对植物的影响范围可达游径外10m.旅游干扰对枯枝落叶层的影响最为显著,随干扰强度增加,枯枝落叶层厚度明显减少,其影响范围至少可达游径外15m.旅游干扰对植物群落的土壤性质也有较为明显的影响,随干扰强度的增加,土壤有机质含量、土壤全氮、全磷含量趋于下降,土壤pH值、全钾含量则趋于上升.土壤受旅游干扰影响范围可达游径外15m左右,但以5m内最为显著.     

基于DNA扣除法的Real-time RT-PCR对工程乳酸菌外源基因表达的绝对定量分析

本研究旨在利用Real-time RT-PCR对外源基因在工程乳酸菌中的表达进行定量分析,建立一种新的Real-time RT-PCR分析方法。采用玻璃珠热酚法提取工程乳酸菌总RNA,对外源目的基因的反转录(含有cDNA和DNA)样品和非反转录(仅含DNA)样品进行Real-time PCR检测,根据经典绝对定量方法并结合DNA扣除法进行分析,将得到的Ct值通过标准曲线换算为样品拷贝数,通过从反转录样品中扣除DNA样品的拷贝数的量,去除了DNA对实验结果的影响,得出最终的定量结果。采用以上方法分析工程乳酸乳球菌NZ9000中外源纤维素酶基因CBHⅡ的表达情况,对表达量较低的目的基因进行转录水平的分析,避免了RNA的损失,得到了外源基因表达的量为(1.28±0.02)×10-1 copies/cfu。这种基于DNA扣除法的Real-time RT-PCR绝对定量方法可以有效地对外源基因在工程乳酸菌中的表达进行分析。