DNA 序列中模式发现的一种快速算法

模式发现是生物信息学的一个重要研究方向,但目前的大部分算法还不能保证获得最优的模式．文章推导了针对三个序列片段相似性关系的判据,将其作为剪枝规则,提出并实现了一种深度优先的穷举搜索算法——判据搜索算法(criterion search algorithm,CRISA),理论分析表明,对绝大多数模式发现问题,CRISA具有多项式的计算时间复杂度和线性的空间复杂度。对仿真的和实际的生物序列数据的测试也表明,CRISA能够快速而完全地识别出序列中所有的模式,具有优于其它算法的总体评价,能够应用于实际的模式发现问题。     

沙眼衣原体15个血清型omp1基因的VS1和VS2区序列分析

目的比较分析沙眼衣原体15个血清型omp1基因VS1和VS2序列的同源性和变异性。方法巢式PCR扩增VS1-VS2基因,自动测序仪测定核苷酸序列,DNAstar生物软件进行比对分析。结果15个血清型沙眼衣原体扩增出大小453bp的VS1-VS2基因。VS1区域序列比对显示血清群B和中间群的VS1核苷酸序列相对保守,而血清群C各型VS1区域表现出较大的核苷酸变异,型间显示1～9个核苷酸替换,且发生在中心区域。血清型VS2序列较VS1存在更多的变异,血清群B中各血清型间均存在2～19个核苷酸的改变,血清群C表现为4～8个核苷酸差异,中间群的F和G型之间存在6个核苷酸差异。结论阐明VS1和VS2区核苷酸的多态性,为下一步进行该蛋白表达和构建寡核苷酸型特异性探针奠定了基础。     

每期20题(初中用)

1.螂鱼的消化系统中,不与食物接触的器官是 )。A.肠B.食管c.气管D.肝胰脏2.有关鱼类特征的描述哪项正确()。A.心脏二腔,二腔中都为动脉血B.附月支骨与脊柱不相连C.软骨鱼的鳃有鳃盖保护D.唾液腺发达,与水生习性有关3.「列在一生的某时期里形成脊索的动物是 A. 4.位是( A. I今 C. D.海胆B.章鱼c.鸽子D义昌鱼在显微镜卜观察活金负尾部毛细血管,最好的部有血液流动的小血管血液流动尾部的血管红细胞成单行通过的血管血液;友向头部的血管卜列不属一f同一门的动物是()。大麻哈鱼B.海琢C.马面纯D.海参大多数海产鱼类不能在淡水中生存,因为…     

铝与钙调蛋白相互作用及其作用位点的研究

用500MHzNMR研究了铝与钙调蛋白的相互作用,主要研究了铝对钙调蛋白中芳香氨基酸残基(Tyr,His,Phe)构象变化的影响。实验结果表明,铝在钙饱和的钙调蛋白上存在着特异性的结合位点,结合位点数目至少为两个,第一结合位点可能位于钙调蛋白的N端结构域,第二结合位点靠近Ca~(2+)的Ⅲ结合域。Al~(3+)结合引起脱钙的钙调蛋白的构象变化不同于与Ca~(3+)结合引起的构象变化。Al~(3+)在CaM上的结合位点与Ca~(2+)的并不相同。柠檬酸等有机酸对铝的毒性有保护作用,这种保护作用是由于柠檬酸分子对铝的络合。     

豇豆品种资源的聚类分析

通过对来自国内外的１２０个豇豆品种１６个性状进行聚类分析,形成了豇豆品种的系统分类。豇豆可分为４个品种群和８个品种亚群,Ｉ．早期长荚丰产品种群（内含３个品种亚群,３３个品种）;ＩＩ．晚熟短荚低产品种类（含内３个品种亚群,２６个品种）;Ⅲ．小叶早熟中产品种群（内含２个品种）;Ⅳ大叶中晚熟中产品种群（内含２个品种亚群,５９个品种）。     

珍稀植物华顶杜鹃的种子萌发试验

珍稀植物华顶杜鹃的种子萌发试验丁炳扬何耀华缪晶黄涛（杭州大学生命科学学院,杭州３１００１２）ＴＨＥＧＥＲＭＩＮＡＴＩＯＮＥＸＰＥＲＩＭＥＮＴＯＦＴＨＥＳＥＥＤＳＯＦＲＨＯＤＯＤＥＮＤＲＯＮＨＵＡＤＩＮＧＥＮＳＥＤｉｎｇＢｉｎｇ－ｙａｎｇＨｅＹａｏ－ｈ...     

一种基于数字免疫原理的伤寒沙门菌高灵敏度检测方法

目的 设计一种基于数字化免疫显色原理的检测方法,实现伤寒沙门菌的高灵敏度快速检测.方法 以伤寒沙门菌为检测对象,选取氨基磁珠对目标细菌进行富集,以偶联特异性抗体的量子点对目标细菌进行特异性荧光标记;设计制作反应腔室,在液相条件下完成对目标细菌的富集和特异性荧光标记;通过荧光显微成像和荧光特征自动提取,实现对目标细菌的"...     

遮光条件下不同种源土沉香幼苗的光合特性与生长速率分析

以3个来源于广东茂名的土沉香[ Aquilaria sinensis (Lour.) Spreng.]种源(大白、小白和大黄)和1个来源于云南的土沉香种源的1年生幼苗为研究对象,对不同遮光条件下[相对光强100％(对照,自然光强)、50％、25％和5％]4个种源幼苗叶片的净光合速率(Pn)的光响应和CO2响应曲线、光合和气体交换参数、叶绿素含量和叶绿素a/b( Chla/b)值进行了分析,并比较了4个种源幼苗的相对生长速率(RGR).结果表明:4个种源的Pn均随光合光量子通量密度的增加而上升,且对照组各种源的Pn值均明显高于各处理组;4个种源的Pn值均随胞间CO2浓度的升高或相对光强的增大逐渐提高.随相对光强的降低,4个种源的最大光合速率、光补偿点、光饱和点、暗呼吸速率、最大电子传递速率、最大羧化速率和磷酸丙糖利用速率均下降或显著下降(P＜0.05),而表观量子效率则略有升高.在相对光强100％ ～ 25％条件下,随相对光强降低,4个种源的叶绿素含量显著提高、Chla/b值显著减小;大白和小白种源的RGR逐渐增大,大黄种源的RGR差异不显著,而云南种源的RGR显著减小.而在相对光强5％条件下,大黄和云南种源的叶绿素含量显著降低,Chla/b值显著增大,RGR显著减小;大白和小白种源幼苗全部死亡.由种源间的比较可见:4个种源的各项光合参数以及叶绿素含量、相对生长速率均有一定的差异,其中云南种源的各项指标总体上均最低.综合来看,土沉香为半阳生植物,对不同的光环境表现出相对较强的适应性.     

桂黔吊石苣苔的组织培养与快速繁殖

以桂黔吊石苣苔的茎段和叶片为外植体材料,对桂黔吊石苣苔进行离体培养与快速繁殖技术研究.结果表明：桂黔吊石苣苔茎段腋芽可直接诱导萌发,在 MS＋6-BA 1．0 mg·L-1＋IBA 0．1 mg·L-1培养基上萌发率最高,达75％;适宜的继代增殖及壮苗培养基为1/2MS＋NAA0．2 mg·L-1,繁殖系数为6．0/60 d,继代培养中茎段外植体可以诱导出愈伤组织,但诱导率较低,未能进一步分化成苗;最佳生根培养基为1/2MS＋6-BA 0．2 mg·L-1＋NAA 0．8 mg·L-1＋AC 0．1％＋香蕉5％,生根率达100％;在大棚中模拟桂黔吊石苣苔自然生境对生根苗进行移栽,成活率在95％以上.     

中国大陆最南端 徐闻珊瑚礁纪行

<正>阳春三月,我们乘坐的小车沿着雷州半岛南端的海岸一路前行前往徐闻,公路两侧是一望无际的"菠萝的海"。菠萝淡淡的清香溢入车内,沁人心脾。行前觉得"徐闻"这个地名文绉绉的,请教专家后知悉,"徐闻"得名有两种说法:一说其地近海,"海边潮至,庶徐徐闻乎";另一说则言其地处我国大陆之最南端,信息难以畅达,故谓之"徐闻"也。但这两种说法都涉及了它的地理特征:这是一块遥远的滨海之地。蓦地,路畔一行大字赫然入目:"徐闻是个好地方!"广东