一种有效的重复序列识别算法

重复序列的分析是基因组研究中的一个重要课题,进行这一研究的基础则是从基因组序列中快速有效地找出其中的重复序列。一种投影拼接算法,即利用随机投影获得候选片断集合,利用片断拼接对候选片断进行拼接,以发现基因组中的重复序列。分析了算法的计算复杂度,构造了半仿真测试数据,对算法的测试结果表明了其有效性。     

舒肝解郁胶囊联合阿戈美拉汀对抑郁症患者血清单胺类神经递质和神经功能相关因子的影响

摘要 目的：观察舒肝解郁胶囊联合阿戈美拉汀治疗抑郁症的疗效及对血清单胺类神经递质和神经功能相关因子的影响。方法：纳入我院2017年5月~2020年5月接诊的120例抑郁症患者,经双色球随机分组法将患者分为对照组和观察组,各为60例。对照组患者予以阿戈美拉汀治疗,观察组患者予以舒肝解郁胶囊联合阿戈美拉汀治疗。比较两组疗效、血清单胺类神经递质、神经功能相关因子、抑郁焦虑评分及不良反应发生率。结果：观察组的临床总有效率为93.33%（56/60）,高于对照组的73.33%（44/60）（P<0.05）。两组治疗6周后汉密尔顿抑郁量表（HAMD）、汉密尔顿焦虑量表（HAMA）评分较治疗前降低,且观察组较对照组低（P<0.05）。两组治疗6周后多巴胺（DA）、去甲肾上腺素（NE）、5-羟色胺（5-HT）水平较治疗前升高,且观察组高于对照组（P<0.05）。两组治疗6周后S100?茁、髓磷脂碱性蛋白（MBP）、神经元特异性烯醇化酶（NSE）水平较治疗前降低,且观察组低于对照组（P<0.05）。两组不良反应发生率对比无差异（P>0.05）。结论：舒肝解郁胶囊联合阿戈美拉汀治疗抑郁症,疗效显著,可有效调节血清单胺类神经递质和神经功能,改善抑郁症状,且安全可靠。     

重组人源性脂联素球状结构的表达、纯化与活性检测

目的:利用基因工程方法构建人源性脂联素球状结构(gAd)基因的高效原核表达体系,并对重组蛋白进行诱导表达、纯化、鉴定及活性检测.方法:从正常人脂肪组织里面提取总RNA,反转录合成cDNA,经PCR扩增、酶切后连入pET-22b(+)载体构建重组质粒pET-22b(+)-gAd,重组质粒转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞.经诱导剂诱导后目的蛋白以包涵体形式产生,采用强碱促溶包涵体并用丙酮沉淀蛋白的方法进行复性和纯化,得到高纯度的人源性gAd.运用SDS-PAGE、Western blotting对重组蛋白进行鉴定,通过对蛋白激酶(AMPK)的磷酸化水平和对小鼠的心肌缺血再灌注损伤的保护作用来检测纯化蛋白的生物学活性.结果:成功构建了原核表达载体pET-22b(+)-gAd,实现了人源性gAd在原核细胞中的表达,并对形成的包涵体变性、复性和纯化,纯化出的蛋白经过SDS-PAGE和Western分析证实为gAd;通过对AMPK的磷酸化水平的检测和对小鼠的心肌缺血再灌注损伤的保护作用证明纯化出的gAd具有高生物学活性.结论:成功构建、表达和纯化了无标签、高生物学活性的人源性脂联素球状结构(gAd),为其进一步的理论研究、生产开发奠定了基础.     

血清内毒素在急性胰腺炎时的变化及茵陈蒿汤的影响

取ＳＤ大鼠３６只（２００～２５０ｇ）,随机均分６组：正常组、茵陈蒿汤组、大黄组、栀子组、茵陈组和生理盐水组。用浓度为９亿的Ｏ＿（１１１）Ｂ４大肠杆菌诱发急性出血坏死性胰腺炎实验模型,术前１小时、术后４小时、术后第一、二天分别灌服中药或生理盐水,术前一天及术后第三天测外周及门脉血测血清内毒素。结果显示：胰炎时外周及门脉血清内毒素均明显升高,以门脉血更加显著,各中药组均能降低外周和门脉血内毒素,其中茵陈蒿汤组和大黄组的作用尤为显著。体外电镜观察亦表明茵陈篙汤和大黄能破坏内毒素的网状结构,从而说明胰炎时可伴发内毒素血症而中药茵陈蒿汤具有降低胰腺炎时血清内毒素的功效。     

空气压缩机低能耗运行的研究分析

文章首先阐述了空气压缩机的种类、用途及其使用选型,然后以中粮生化公司运行的两种空气压缩机为例,分析了活塞式空压机的效率和影响离心空压机的效率的有关因素,并对如何降低空压机供气系统阻力、降低空压机能耗提出改进措施。     

DNA 序列中模式发现的一种快速算法

模式发现是生物信息学的一个重要研究方向,但目前的大部分算法还不能保证获得最优的模式．文章推导了针对三个序列片段相似性关系的判据,将其作为剪枝规则,提出并实现了一种深度优先的穷举搜索算法——判据搜索算法(criterion search algorithm,CRISA),理论分析表明,对绝大多数模式发现问题,CRISA具有多项式的计算时间复杂度和线性的空间复杂度。对仿真的和实际的生物序列数据的测试也表明,CRISA能够快速而完全地识别出序列中所有的模式,具有优于其它算法的总体评价,能够应用于实际的模式发现问题。     

黄河源头地区土地覆盖的时空变化特征

以野外调查和遥感影像为主要信息源,结合统计资料和基础地理信息数据,研究了20世纪80年代中期以来黄河源头地区土地覆盖格局的空间特征以及动态变化趋势,探讨了导致黄河源区生态环境变化的主要影响因素。研究结果表明,黄河源头地区土地覆盖类型的斑块密度变化差异明显;土地利用类型的镶嵌格局在空间和时间上均有变化。占据优势的草地生态系统20年来遭受不同程度破坏,黄河源区的气候呈暖干化趋势,研究区域土地覆盖类型空间结构变化明显;高寒环境和气候演化趋势对土地覆盖的变化起决定性作用。     

无标签人源性脂联素球状结构的表达、纯化与活性检测

目的:利用基工程方法构建无标签人性脂联素球状结构(gAd)基的核表达载体,并对重组蛋白进行诱导表达、纯化及鉴定.方法:从正常人脂肪组织里提取总 RNA,反转录合成 cDNA,经 PCR 扩增、酶切后连入pET-22b(+)载体构建重组质粒 pET-22b(+)-gAd,转化大肠杆菌 BL21(DE3)感受态细胞,经低温、低浓度 IPTG 诱导使其可溶性表达,采用硫酸铵沉淀、凝胶过滤层析和离子交换层析三步分离纯化,得到不带任何标签的人性gAd;运用 SDS-PAGE、Western 印迹、HPLC 对重组蛋白进行鉴定,通过对 AMP 激活的蛋白激酶(AMPK)的磷酸化水平检测纯化蛋白的生物学活性.结果:构建了核表达载体 pET-22b(+)-gAd,实现了人性 gAd 在核细胞中的可溶性表达,纯化的蛋白经 SDS-PAGE 和 Western 印迹分析证实为 gAd,HPLC 分析蛋白纯度达到95%以上;通过对 AMPK磷酸化水平的检测,证明纯化的 gAd 具有高生物学活性.结论:重组表达和纯化了无标签、高生物学活性的人性脂联素球状结构,为其进一步的理论研究、生产开发奠定了基础.     

急性大肠杆菌性腹膜炎时肺的变化及腑安冲剂的影响

用Ｏ（１１１）Ｂ４大肠杆菌（９×１０８个／ｍｌ）与１０％硫酸钡佐剂给ＳＤ大鼠腹腔注射诱发急性腹膜炎为模型。随机分为三组：（１）模型组（２）正常对照组（３）模型＋中药治疗组,观察急性实验性腹膜炎时的肺损伤及腑安冲剂的保护作用。结果显示：（１）中药组内毒素、肿瘤坏死因子（ＴＮＦ）、肺匀浆的脂质过氧化产物均明显低于模型组,接近正常组;（２）中药组的还原型谷胱甘肽（ＧＳＨ）明显高于模型组（Ｐ＜０．０１）。（３）中药组肺系数,肺灌洗液蛋白及白细胞计数与模型组比均有显著差异（Ｐ＜０．０１）。提示腑安冲剂可能通过降低外周血内毒素、ＴＮＦ,抑制脂质过氧化物的产生与加强自由基的清除,从而显著减轻急性腹膜炎引起的肺水肿,保护肺功能。     

一种基于预测搜索的基因芯片优化方法

掩模板在高密度基因芯片的探针合成过程中起着重要的作用 ,由于其制造工艺复杂、造价较高 ,因此在不改变探针合成结果的条件下 ,需要尽可能的减少基因芯片探针合成过程中所用的掩模板数量。提出了一种新的预测搜索算法 ,对掩模板进行了优化设计 ,对设计结果的测试显示 ,其减少的掩模板数量超过了传统方法的 2 0 % ,表明了该算法的有效性