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TCP家族作为植物特有的转录因子,在植物发育的不同方面发挥着重要作用。为筛选烟草中TCP家族成员,本研究通过全基因组同源比对,鉴定烟草与拟南芥TCP家族同源序列。利用生物信息学的方法分析其理化性质、系统进化关系、顺式作用元件等;筛选AtTCP3/AtTCP4的同源基因,并利用RT-qPCR检测在20% PEG6000处理下的基因表达量变化。结果表明烟草中含有TCP家族成员63个,其氨基酸序列长度范围为89−596 aa,蛋白亲水性(grand average of hydropathicity, GRAVY)范围为−1.147−0.125,等电点(isoelectric point, pI)范围为4.42−9.94,内含子个数为0−3,亚细胞定位均位于细胞核。保守结构域和系统进化关系分析结果表明,烟草TCP家族可分为PCF、CIN和CYC/TB1这3个亚家族且每个亚家族具有稳定序列。基因启动子区顺式作用元件结果表明,TCP家族基因含有低温顺式作用元件(LTR)及多种胁迫及代谢调控相关的元件(MYB、MYC)等顺式作用元件。基因表达模式分析表明,AtTCP3/AtTCP4同源基因(NtTCP6、NtTCP28、NtTCP30、NtTCP33、NtTCP42、NtTCP57和NtTCP63)在20% PEG6000处理下表达量显著上调表达/下调表达,并发现NtTCP30和NtTCP57基因对干旱胁迫响应较为明显。研究结果剖析了烟草基因组中的TCP家族,为烟草抗旱基因功能研究及品种培育提供了候选基因。 相似文献
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麦类作物体细胞基因组原位杂交(GISH)效果影响因素的分析 总被引:8,自引:0,他引:8
以八倍体小滨麦、八倍体小黑麦、八倍体小偃麦、小麦一中间偃麦草双体异附加系为实验材料对影响麦类作物体细胞GISH技术实验效果的因素进行分析,研究结果表明:细胞分裂相多、染色体分散良好、无杂质影响的高质量的染色体制片是取得理想实验效果的基础;探针DNA浓度与封阻DNA浓度的比例及杂交后洗脱条件的控制是取得理想实验效果的关键。此外,还对麦类作物体细胞基因组原位杂交实验中出现的染色体丢失、外源染色体无杂交信号、杂交信号的强弱、杂交信号过多(杂交背景重)或过少、噪音信号及杂交污点产生的原因进行了分析,并提出了相应的解决方法或注意事项。 相似文献
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目的研究PI3K/AKT信号传导途径对人低分化鼻咽癌细胞系在CNE-2Z生长、增殖和凋亡的作用。方法应用wort mannin抑制PI3K的活性,绘制生长曲线、MTT观察wort mannin对CNE-2Z细胞生长、增殖的作用,以免疫细胞化学分别检测wort mannin处理培养后的CNE-2Z细胞中PI3K、AKT和bcl-2的表达,RT-PCR检测wort mannin处理后的细胞bcl-2 mRNA的表达情况,ELISA法检测wort mannin处理后的CNE-2Z细胞中的磷酸化的AKT的含量,流式细胞仪检测wort mannin处理培养后的CNE-2Z细胞的凋亡。结果 wort mannin对CNE-2Z细胞生长、增殖具有抑制作用,而且呈剂量依赖性。wort mannin作用后CNE-2Z细胞的PI3K和bcl-2的蛋白表达均减弱,而AKT的表达无明显变化。wort-mannin抑制CNE-2Z细胞bcl-2 mRNA的表达。wort mannin能显著抑制磷酸化的AKT的表达,并呈一定的剂量依赖性。Wort mannin还可以诱导CNE-2Z细胞的凋亡。结论 PI3K的抑制剂wort mannin可以有效抑制鼻咽癌CNE-2Z细胞的生长和增殖,诱导CNE-2Z细胞凋亡。 相似文献
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目的:探讨SOX2和OCT4蛋白在宫内膜样子宫和卵巢双发恶性肿瘤(double endometrioid endometrial and ovarian carcinomas,DEEOC)中的表达情况及意义。方法:收集青岛大学附属医院2007年-2016年30例DEEOC石蜡组织标本,采用免疫组化法检测SOX2和OCT4的表达,分析DEEOC两部位癌组织中及原发性、转移性DEEOC癌组织中SOX2和OCT4蛋白表达差异及相关性。结果:SOX2和OCT4在DEEOC两部位癌组织中的表达率明显高于相应的正常组织(P均0.001),SOX2在原发性DEEOC、转移性DEEOC两部位癌组织中表达均相当(P均0.05),OCT4在原发性DEEOC、转移性DEEOC中的表达也相当(P均0.05),且Pearson相关性分析显示双癌组织中的两种蛋白的表达均呈正相关性。转移性双癌两部位组织中的SOX2和OCT4的表达量都要明显高于原发性双癌(P均0.05)。结论:DEEOC癌组织中SOX2和OCT4均呈阳性表达,二者可能相互作用参与DEEOC肿瘤的发生、发展,在辅助区分原发性和转移性DEEOC也可能具有一定的指导意义。 相似文献
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应用分散和差速离心法分离嗜酸和耐酸链霉菌的试验及评价* 总被引:10,自引:1,他引:9
新的微生物资源的开发离不开菌种分离技术的改进和分离效率的提高。我们采用一种新的分离方法——分散和差速离心法(Dispersion and Differential Centrifugation,DDC),以传统的振荡法做对照,对12份酸性土壤样品进行了链霉菌的分离。结果表明DDC方法的分离效率是传统方法的2—20倍,且选择性好。用DDC方法共分离出链霉菌249株,归属于12个颜色类群,其中的45株代表菌株的形态和细胞壁类型均符合链霉菌的特征,最适生长pH均为4.5—5.5。结果表明应用DDC方法分离非常见的嗜酸和耐酸链霉菌是可行的。 相似文献