| 烟草TCP家族成员鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 王世泽,李云,韩玉翠,余世洲,王爽,刘勇,林小虎.烟草TCP家族成员鉴定及表达分析[J].生物工程学报,2024,40(1):226-238. |
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| 作者姓名： | 王世泽 李云 韩玉翠 余世洲 王爽 刘勇 林小虎 |
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| 作者单位： | 河北科技师范学院农学与生物科技学院 河北省作物逆境生物学重点实验室, 河北 秦皇岛 066004;贵州省烟草科学研究院, 贵州 贵阳 550009;贵州省烟草科学研究院, 贵州 贵阳 550009;河南农业大学烟草学院, 河南 郑州 450002 |
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| 基金项目： | 中国烟草总公司重大科技项目[110202101032(JY-09)]；中国烟草总公司贵州省公司科技项目(2023XM02)；贵州省烟草科学研究院科技项目(GZYKY2021-06) |
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| 摘 要： | TCP家族作为植物特有的转录因子，在植物发育的不同方面发挥着重要作用。为筛选烟草中TCP家族成员，本研究通过全基因组同源比对，鉴定烟草与拟南芥TCP家族同源序列。利用生物信息学的方法分析其理化性质、系统进化关系、顺式作用元件等；筛选AtTCP3/AtTCP4的同源基因，并利用RT-qPCR检测在20% PEG6000处理下的基因表达量变化。结果表明烟草中含有TCP家族成员63个，其氨基酸序列长度范围为89−596 aa，蛋白亲水性(grand average of hydropathicity, GRAVY)范围为−1.147−0.125，等电点(isoelectric point, pI)范围为4.42−9.94，内含子个数为0−3，亚细胞定位均位于细胞核。保守结构域和系统进化关系分析结果表明，烟草TCP家族可分为PCF、CIN和CYC/TB1这3个亚家族且每个亚家族具有稳定序列。基因启动子区顺式作用元件结果表明，TCP家族基因含有低温顺式作用元件(LTR)及多种胁迫及代谢调控相关的元件(MYB、MYC)等顺式作用元件。基因表达模式分析表明，AtTCP3/AtTCP4同源基因(NtTCP6、NtTCP28、NtTCP30、NtTCP33、NtTCP42、NtTCP57和NtTCP63)在20% PEG6000处理下表达量显著上调表达/下调表达，并发现NtTCP30和NtTCP57基因对干旱胁迫响应较为明显。研究结果剖析了烟草基因组中的TCP家族，为烟草抗旱基因功能研究及品种培育提供了候选基因。
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| 关 键 词： | 烟草 TCP家族 干旱胁迫 表达分析 |
| 收稿时间： | 2023/5/6 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2023/8/9 0:00:00 |
Identification and expression analysis of TCP family members in tobacco (Nicotiana tabacum L.) |
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| WANG Shize,LI Yun,HAN Yucui,YU Shizhou,WANG Shuang,LIU Yong,LIN Xiaohu.Identification and expression analysis of TCP family members in tobacco (Nicotiana tabacum L.)[J].Chinese Journal of Biotechnology,2024,40(1):226-238. |
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| Authors: | WANG Shize LI Yun HAN Yucui YU Shizhou WANG Shuang LIU Yong LIN Xiaohu |
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| Institution: | Hebei Key Laboratory of Crop Stress Biology, College of Agronomy and Biotechnology, Hebei Normal University of Science and Technology, Qinhuangdao 066004, Hebei, China;Guizhou Academy of Tobacco Science, Guiyang 550009, Guizhou, China;Guizhou Academy of Tobacco Science, Guiyang 550009, Guizhou, China;College of Tobacco Science, Henan Agricultural University, Zhengzhou 450002, Henan, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | tobacco TCP family drought stress expression analysis |
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