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组蛋白去乙酰化酶(HDACs)作为表观遗传酶类的重要一员,能够通过去乙酰化核内组蛋白的方式在细胞转录调控中发挥重要作用,然而,其在鱼类生理中的作用目前报道较少.本研究设计合成了斑马鱼HDAC8的shRNA,用EcoR Ⅰ和AgeⅠ酶切构建了pLKO.1-hdac8-shRNA重组质粒,同时构建了一个阴性对照重组质粒(nc),接着将pCMV-VSVG、pCMV-Dr8.91两个慢病毒包装质粒分别与设计好的重组质粒共转染到HEK-293T细胞中进行病毒包装.收集病毒并用其感染ZF4细胞,RT-qPCR检测表明ZF4细胞中hdac8成功被敲降.随后使用台盼蓝染色法检测ZF4细胞存活率,并进一步检测了细胞内凋亡相关基因bax、bcl2、caspase-3的表达情况.研究发现:与对照组(nc)细胞相比,敲降hdac8的细胞存活率显著下降(P<0.05),bax及caspase-3的表达量在敲降hdac8的细胞内显著上调,意味着敲降hdac8的细胞死亡的增加可能是通过上调凋亡水平引起的.本研究为后期对斑马鱼在生长发育过程中及环境压力下的凋亡机制的研究提供基础. 相似文献
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苗期水稻响应褐飞虱取食的基因差异表达分析 总被引:1,自引:0,他引:1
【目的】褐飞虱Nilaparvata lugens (St?l)是水稻的重要害虫之一,主要刺吸水稻韧皮部汁液为害,对水稻生产造成严重的产量和经济损失。为研究水稻响应褐飞虱取食的分子机制,对褐飞虱取食6 h后的苗期水稻进行转录组测序及基因差异表达分析。【方法】采用illumina二代测序技术获得褐飞虱取食前后水稻组织的转录组数据,利用RSEM软件进行基因表达定量和DEseq2进行差异表达分析;从差异表达基因中随机选取20个基因采用荧光定量PCR技术进行验证;采用GeneMerge软件对差异表达基因进行KEGG和GO富集分析。【结果】褐飞虱取食后,水稻转录组中的1 104个基因出现了差异表达,其中435个基因表达上调,669个基因表达下调。荧光定量PCR结果显示,20个差异表达基因中18个基因的表达变化趋势和测序结果一致,证明了转录组分析结果可靠。GO和KEGG富集分析表明,表达上调基因主要与水稻氧化应激、海藻糖合成及次生化合物代谢有关,显著富集在14个KEGG通路和30个GO功能分类中;而表达下调基因主要参与水稻纤维素、蛋白质及脂肪酸合成过程,显著富集在29个KEGG通路和26个GO功能分类。在差异表达基因中,分别有61个转录因子和13个水杨酸和茉莉酸信号通路相关基因。【结论】褐飞虱取食激发了水稻的应激反应和保护机制,同时还降低了营养合成的过程,是飞虱为害造成水稻减产的原因之一。本研究初步揭示了苗期水稻响应褐飞虱取食的差异表达基因,为研究水稻-褐飞虱互作机制以及褐飞虱抗性水稻品种培育提供了参考和依据。 相似文献
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敦煌西湖湿地鸟类栖息地重要性模糊综合评判 总被引:4,自引:1,他引:3
根据2007~2008年在甘肃敦煌西湖国家级自然保护区进行的湿地鸟类调查种类和数量数据,运用模糊综合评判法对保护区内的8块湿地进行了湿地鸟类栖息地重要性评价. 评判中隶属度的确定采用最佳因子值法,并分春、秋两种最佳因子值进行评判.结果表明:(1)春季各湿地均比秋季的重要性程度高,春季是管理的重点;(2)春秋两季南湖湿地重要性(0.938和0.966)都要远大于其它的湿地.春季盐池湾、羊水海子、南大湖的结果较相近,重要性程度次之,可持有相同程度的管理水平.党河水库、墩子湾、马圈湾、南园湖的重要性程度较低,只需一般水平的管理;(3)秋季各湿地水平除了南湖外普遍较低,羊水海子和盐池湾的重要性(0.340和0.269)相对较高些,但也只需一般水平的管理. 相似文献
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甘肃敦煌西湖湿地植物群落平均盖度与土壤含盐量耦合关系 总被引:7,自引:0,他引:7
实地调查了甘肃敦煌西湖国家级自然保护区的湿地植物群落和环境因子,综合比较了各种多样性指数及环境因子,并应用SPSS统计软件的多元方差分析功能筛选出自变量x(含盐量)和因变量y(平均盖度).应用了曲线参数估计法对24个湿地植物群落样方的平均盖度和土壤含盐量进行多次回归模型拟合,最终提出了最优的拟合模型为Logarithmic对数曲线模型,曲线方程:y=1.076-0.391lnx,P(Sig.=0.009)<0.01,并提出模型存在的不足及改进之处,旨在为我国西北干旱地区的湿地植物多样性保护提供科学依据. 相似文献
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报道了一种低分子量的人类抗菌肽hepcidin基因的克隆、表达以及纯化.试验证明在毕赤酵母中能成功分泌有活性的hepcidin,hepcidin在重组菌株中的表达量约为3 mg/L,Western blot显示2.2 kD的重组hepcidin条带,重组hepcidin通过凝胶过滤及反向高效液相色谱纯化,质谱验证,重组蛋白对金黄色葡萄球菌和枯草芽孢杆菌表现出抗菌活性. 相似文献
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海州湾水质污染空间分布及来源 总被引:2,自引:0,他引:2
有效识别海州湾海域水质特征,可为其海洋环境的保护和管理提供决策参考。依据2009年12月33个站位的环境调查数据,采用聚类分析划分调查站位类别并识别其空间相似性,通过因子分析探讨海水主要污染源组成和空间分布特征。空间聚类分析显示,海州湾南北两侧污染状况存在区域差异性(南高北低),各入海河口影响区域可划分为不同类型,连云港滨海新区北侧和龙王河口北侧的污染类型与其他站位具有明显差异。因子分析表明,影响海州湾水质的主成分有4类,包括来自临洪河口的陆域污染影响(营养盐类、铜、锌),海洋工程活动对沉积物的扰动(铅、铜、锌),临洪河口和岚山港区的组合影响(溶解氧、汞)和特定区域污染(铬),其方差贡献率分别为47.4%、16.4%、13.9%和9.1%。分析结果表明,海州湾水质具有明显空间分布特性,海洋环境调查站位的布设需兼顾到不同类型区域,方能全面反映海洋水质环境现状。 相似文献
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多巴胺D4受体基因与注意缺损多动障碍 总被引:6,自引:1,他引:5
为探讨注意缺损多动障碍(ADHD)与多巴胺D4受体基因(dopamine D4 receptor gene,DRD4)间的关系,采用Amp-FLP的方法检测了上海地区汉族人群中68例ADHD患及其父母DRD4的多态性,数据采用基于单体型的单体型相对风险(HHRR)及传递不平衡检验(TDT)进行遗传关联分析。结果表明HHRR分析和复等位基因的TDT检验,均未显示出与ADHD的遗传关联性(P>0.05)。提示上海地区人群中DRD4基因与ADHD无显性关联。 相似文献
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铜鱼线粒体控制区的序列变异和遗传多样性 总被引:6,自引:0,他引:6
采用PCR和DNA测序技术研究长江中上游野生铜鱼的遗传多样性和群体遗传学特征,从9个采样点共获得100尾铜鱼,用于分析的线粒体DNA控制区的片段序列为946bp。在100个序列中,共检测出变异位点47个(其中增添/缺失位点8个),单倍型41种。9个地理群体的平均单倍型多样性(Hd)和平均核苷酸多样性(Pi)分别为0.9257±0.0162和0.004178±0.002337,表现出较贫乏的遗传多样性。群体间的分化指数(FST值)、平均基因流(Nm)、分子方差分析(AMOVA)和平均K2-P遗传距离均表明9个铜鱼地理群体间存在广泛的基因交流,未明显发生群体遗传分化。另外,共享单倍型比例较高,约为34%(14/41)。单倍型的UPGMA分子系统树和简约网络图显示单倍型的聚类与地理分群没有相关性。上述结果表明9个铜鱼地理群体属于同一种群。
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