中国大陆地区埃可病毒25型全基因组进化与重组分析

埃可病毒25型（Echovirus 25,E25）属于肠道病毒B组（Enterovirus B, EV-B），其在临床上可引起包括手足口病（Hand, foot, and mouth disease, HFMD），无菌性脑膜炎（Aseptic meningitis, AM），急性弛缓性麻痹（Acute flaccid paralysis, AFP）等在内的多种疾病。本文从全国HFMD监测网络选取了2009-2018年的18株E25毒株进行全基因组测序，将所得全长序列及GenBank上目前已发表的E25全长序列，以及EV-B组其它原型株全长序列分别构建全基因组和各编码区的亲缘进化树，并依据不同进化分支选取具有代表性的两株E25毒株进行重组分析。结果显示，中国大陆地区E25在P1区具有更高的亲缘关系，而P2和P3区建树中各出现了两个分支，且在每个分支上，与多个EV-B组的原型株具有较高的核苷酸同源性，提示E25可能存在多种重组模式。此外所选的两株毒株均与EV-B的其它血清型流行株在P2及P3不同区域发生重组，且重组的模式不相同，因此中国大陆地区的E25至少存在两种重组模式，并且致病力可能与...