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柯萨奇病毒A组16型中国分离株(Cox.A16 SHZH00-1)全基因组序列测定及分析 总被引:14,自引:0,他引:14
对分离自2000年中国深圳地区手足口病患儿粪便标本的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,Cox.A16)病毒SHZH00—1株进行全基因组序列测定及分析后发现,Cox.A16SHZH00—1的基因组(未包括多聚腺苷酸尾)长度为7410bp,其中5’端非编码区(5’UTR)长为745bp,病毒基因组编码区全长6582个核苷酸,编码一个含2193个氨基酸残基的多聚蛋白,3’端非编码区长为83bp。Cox.A16SHZH00—1基因组的结构与Cox.A16亚洲地方株Tainan-5079-98(AFl77911)十分相近,整个基因组的核苷酸同源性为97.5%,氨基酸同源性为98.8%;而与Cox.A16国际标准株G10(U05876)差别较大,两者核苷酸同源性仅为79.1%,氨基酸同源性为94.5%。Cox.A16SHZH00—1与两株肠道病毒71型SHZH03(AY465356)和BrCr(U22521)比较,核苷酸同源性均不超过80%。 相似文献
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检测中国对虾非包涵体型杆状病毒的PCR方法的建立 总被引:5,自引:1,他引:4
中国对虾非体型杆状病毒(PcNOBV)是中国大陆养殖的中国对虾(Penaeuschinensis)暴发性流行病--白斑征的主要病原,与台湾流行的PmNOBⅢ、泰国的PmNOBⅡ及日本的RV-PJ(=PRDV)有相似的致病特征、形态学及组织病理学特征。为了角PcNOBV与PmNOBⅢ两种地域分布邻近的毒株基因水平的关系,并建立早期、敏感、特异的检测技术,利用氯化铯密度梯度超速离心技术分离纯化了PcN 相似文献
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腓骨肌萎缩症(Charcot-Marie-Tooth disease, CMT)是一种最常见的遗传性周围神经病,虽然常以腓骨肌萎缩和肢端骨骼畸形、运动与感觉障碍等为主要临床表现,但先天致病基因和后天影响因素的不同使该病具有高度的临床和遗传异质性;而对CMT类型的精细分类,更多是依据不同致病基因及其突变。随着近几年二代测序为代表的高通量测序技术的不断发展,已经确定了100多个CMT的致病基因和更多的新突变。本文主要阐述了CMT的遗传分型和临床特征,特别是四种常见CMT亚型的致病基因在神经细胞内参与的信号转导通路、CMT电生理和分子病理特征,以及CMT基因突变检测方法,以期为罕见病CMT的基础研究与临床诊断提供参考。 相似文献