过去20年中国耕地生长季起始期的时空变化

多时相遥感数据能够较好地描述区域尺度的植被物候和生长季节的变化特征.利用NDVI时序数据,采用非对称性高斯函数拟合方法重建平滑曲线,分别提取了我国20世纪80年代初、90年代初和21世纪初等3个时期为我国耕地第一生长季起始期,计算3个时期平均生长起始期,并分析了我国耕地第一生长季起始期的区域空间分异规律;然后,从区域和省份两个尺度分析了20世纪80年代初至90年代初和20世纪90年代初至21世纪初两个阶段我国耕地生长季起始期动态变化趋势和空间格局.结果表明,我国不同区域耕地第一生长季起始期存在十分明显的空间差异,清楚地呈现出一个从南向北逐渐推迟的空间特征;从不同区域看,在20世纪80年代初至90年代初和20世纪90年代初至21世纪初两个时期,我国耕地第一生长季起始期变化都是提前和推迟并存,不同区域变化程度不一;从不同省份看,在过去20年间,我国绝大多数省份耕地第一生长季起始期都表现为总体提前的趋势,但不同省份的起始期变化具有差异性.影响我国耕地生长季起始期变化的因素很多,如何区别气候变化等自然因子和人类活动因子对耕地生长季起始期变化的影响是一个值得深入研究的问题.     

基于物质流分析和数据包络分析的区域生态效率评价——以江苏省为例

区域生态效率(eco-efficiency)评价是考量区域可持发展的重要内容.基于物质流分析(material flow analysis, MFA)构建区域生态效率评价指标体系,并将污染物排放作为一种非期望输入引入到数据包络分析(data envelopment analysis, DEA)模型中,以江苏省(1990～2005年)为例进行生态效率分析评价.结果表明,江苏省的区域生态效率在1990～2005年期间呈现逐步上升的趋势.但是,同期的总物质投入(total material input, TMI)、物质需求总量(total material requirement, TMR)和污染物排放量也呈上升趋势.因此,江苏省社会经济发展和环境影响总体上呈现"弱脱钩(weak de-link)".     

沙地景观中矢量数据栅格化方法及尺度效应

针对景观生态学研究中的数据转换(矢量数据转换为栅格数据)问题,从斑块面积、周长、数量对转换方法及尺度的响应角度进行了详尽的分析.以库布齐沙漠地区的2003年1:10万的矢量数据为例,转换尺度以10m为起点,200m为终点,10m为间隔,利用最大面积值方法(RMA)和中心属性值方法(RCC)两种转换方法分别进行栅格化,讨论了面积、周长、斑块数量对不同尺度及不同转换方法的响应,同时还讨论了运算时间对转换方法及尺度的响应.得出了"30m大小的转换尺度为最佳尺度,最大面积值方法(RMA)优于中心属性值方法(RCC)"的结论.     

实验数据的统计分析与科研论文的撰写

几乎所有的实验的结果,包括有非常明显的实验效果的实验结果,都需要用适当的统计分析方法进行评价。数据的分析应主要围绕研究的目的进行,对实验的假设进行验证。同时,数据分析的主要目标是提取数据中所有能被解释的有用信息,考虑生物的变异和实验所产生的误差对研究结果的影响,尤其是防止抽样误差对于实验（治疗）效果的错误判断的重要工具。当然,也存在统计学有显著性差异,而不存在生物学意义的现象。因此,在撰写科研论文时,既要有正确的实验设计和使用正确的资料统计分析方法,又要准确描述和解释实验结果。     

基于信息论k—modes聚类法的基因表达数据分析

k-均值聚类算法是一种广泛应用于基因表达数据聚类分析中的迭代变换算法,它通常用距离法来表示基因间的关系,但不能有效的反应基因间的相互依赖的关系。为此,提出基于信息论的k-modes聚类算法,克服了以上缺点。另外,还引入了伪F统计量,一方面,可以对空间中有部分重叠的点进行有效的分类;另一方面,可以给出最佳聚类数目,从而弥补了k-modes聚类法的不足。使其成为一种非常有效的算法,从而达到较优的聚类效果。     

A platform to standardize,store, and visualize proteomics experimental data

With the development of functional genomics research, large-scale proteomics studies are now widespread, presenting significant challenges for data storage, exchange, and analysis. Here we present the Integrated Proteomics Exploring Database （IPED） as a platform for managing proteomics experimental data （both process and result data）. IPED is based on the schema of the Proteome Experimental Data Repository （PEDRo）, and complies with the General Proteomics Standard （GPS） drafted by the Proteomics Standards Committee of the Human Proteome Organization. In our work, we developed three components for the IPED platform： the IPED client editor, IPED server software, and IPED web interface. The client editor collects experimental data and generates an extensible markup language （XML） data file compliant with PEDRo and GPS; the server software parses the XML data file and loads information into a core database; and the web interface displays experimental results, to provide a convenient graphic representation of data. Given software convenience and data abundance, IPED is a powerful platform for data exchange and presents an important resource for the proteomics community. In its current release, IPED is available at http：//www. biosino.org/iped2.     

层析介质的寿命与层析介质的清洗验证

近20～30年中．生物技术在中国得到了迅猛的发展。随着生物制药技术的发展,生物药物的质量越来越得到重视。生物药物从研究到上市,其过程主要包括实验室成果转化、临床试验、由患者广泛应用。药物研发成功的关键是药物的有效性,同时药物的安全性则更为重要。因此在严格确保高质量的同时,确保其有效性及工艺的稳定性显得尤为重。     

美国能源部联合基因组研究所完成大豆基因组解读

2008年12月8日,美国能源部联合基因组研究所（DOE JGI）公布了完整的大豆基因组序列草图。该序列数据可广泛应用于新育种研究领域,为解决生物燃料与粮食战略问题提供支持。     

沙尔制药选择SAS药品研发解决方案处理临床试验数据

商业分析领域的市场领导者SAS公司日前宣布,全球专业生物制药公司沙尔（Shire）与SAS结成合作伙伴,选择利用SAS药品研发解决方案（SAS Drug Development）作为其临床试验数据的平台。从而使沙尔这样的客户在为全球的患者及其家人开发并提供药品时精力更集中,更高效。沙尔坚信该系统将为沙尔和SAS带来最大收益。     

Variation in the timing of river entry of Atlantic salmon （Salmo salar L. ） in the Baltic

The timing of river entry in the Atlantic salmon is known to depend on genetic, demographic and environmental factors, but little is known about the relative magnitude of among population and among year variation and covariation in this respect in natural state Atlantic salmon rives. To investigate this, variability in the timing of river entry in three historical Finnish Atlantic salmon populations were analyzed using salmon trap data collected during 1870- 1902. The analyses reveled that 1 ） the timing of river entry differed substantially and consistently among the rivers, and that 2） variation among the rivers was much larger than variation among years. Annual variations were not explained by regional environmental conditions, whereas in one river the timing of the local flood peak was a significant predictor of the timing of river entry. Differences in the timing of salmon entry to geographically closely situated rivers suggests that a regionally fixed opening date for coastal fisheries might not be the best management strategy as it may lead to uneven exploitation of salmon populations from different rivers [ Current Zoology 55 （5） ： 342 - 349, 2009] .