56个中国地方猪种微卫星基因座的遗传多样性

采用FA0—ISAG联合推荐的27个微卫星DNA标记对56个中国地方猪品种和3个引进猪种(杜洛克猪、长白猪、大白猪)进行遗传多样性分析,通过计算等位基因频率、有效等位基因数、平均遗传杂合度、基因分化系数、多态信息含量和遗传距离并进行系统聚类分析,评估其种内遗传变异和种间遗传关系。以聚类结果为基础,将56个中国地方猪种分为12类：Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ类都是《中国猪品种志》中的华北型猪种;Ⅳ类相当于其中的江海型猪种;Ⅴ、Ⅵ、Ⅶ、Ⅷ和Ⅸ类的品种大部分属于华中型;Ⅹ和Ⅺ类相当于华南型品种;Ⅻ类相当于西南型品种。提出保种场结合保护区是一种比较符合我国地方猪种实际状况的保种模式。研究结果可为我国地方猪种种质特性研究提供基础数据,为我国地方猪品种资源的合理保护和利用提供科学依据。     

奶牛乳铁蛋白基因5′侧翼区PCR-SSCP多态性分析

采用PCR-SSCP技术,对奶牛乳铁蛋白基因5′侧翼区1122bp序列进行多态性分析.在该区所划分的5个亚片段上,发现Blf 5′-1(227bp),Blf 5′-3(175bp)和Blf 5′-5(293bp)3个DNA片段存在多态.进一步对这3个片段进行测序分析,在Blf 5′-1序列中,发现位于转录起始位点上游-926和-915位分别有G→A及T→G点突变;在Blf 5′-3片段中,-478位存在G的插入;Blf 5′-5位点上,发生-28位的C颠换为A和 33位的G颠换为C两处突变.利用TFSEARCH (ver.1.3)软件对乳铁蛋白基因5′侧翼区潜在调控元件及蛋白质结合位点进行了预测,结果显示5′侧翼区的突变引起了蛋白质结合因子的变化.     

纯种与杂种鸡之间肝脏组织基因差异表达及其与肉用性状杂种优势的关系

以白洛克肉鸡 (EE)、中国丝羽乌骨鸡 (CC)、农大褐 (DD)和白来航 (AA) 4个纯种鸡为材料 ,进行 4× 4完全双列杂交 ,共得到 16种杂交组合。应用mRNA差异显示技术 (DDRT PCR)检测了 8周龄纯种和杂种鸡之间肝脏组织基因的差异表达。结果表明 ,在纯种和杂种间共有 8种 15类基因差异表达模式 ,杂种和纯种之间基因表达存在明显的差异。对各种基因差异表达模式与 10个肉用性状的杂种优势率进行相关分析发现 ,表达一致型P8(t1111)与肉用性状的杂种优势率相关不显著 (P >0 0 5) ,这说明杂种优势的形成与某些基因的差异表达有关 ;正交或反交特异表达型P4(t0 10 0、t0 0 10 )与 8周龄个体重、腿肌重、半净膛重、全净膛重相关显著 (P <0 0 5) ,与胸肌重相关极显著 (P <0 0 1) ;单亲特异表达型P1(t10 0 0、t0 0 0 1)与腹脂重相关显著 (P <0 0 5) ,与体斜长相关极显著 (P <0 0 1) ;双亲特异表达型P7(t10 0 1)与腿肌重、翅重、半净膛重、肌间脂宽的杂种优势率相关显著 (P <0 0 5) ;正交或反交单亲表达一致型P2 (t110 0、t0 0 11、t10 10、t0 10 1)与肌间脂宽的杂种优势率相关显著 (P <0 0 5) ;单亲表达一致型P5(t1110、t0 111)胫骨长的杂种优势率相关显著 (P <0 0 5)。     

应用改进模糊相似优先方法模拟林肯羊生态适宜区

自1955年Zcdch第一次从不相容现象出发提出模糊集概念以来,摸糊数学正迈进和渗透到自然科学和社会科学的各个领域。它在植物学、微生物学、海洋科学、生态学、气象学、抢质学、     

RT—PCR测定大鼠妊娠早期子宫孕激素受体基因的表达

孕激素在妊娠的建立和维持过程中起着非常重要的作用,但目前为止未见有关大鼠子宫 激素受体（ＰＲ）基因在该过程中表达情况的系统报道。本和反转偶联聚合酶链式反应（ＲＴ－ＰＣＲ）方法测定了大鼠动情周期和妊娠早期子宫孕激素受体基因的转录,结果表明：１．动情周期中,子吕ＰＲｍＲＮＡ水平在动情期最高,在动情后期最低,动情期水平约为动情后期的２倍。２．妊娠开始后,子宫ＰＲｍＲＮＡ水平迅速上地ｄ３－ｄ４（着床前）达     

畜禽遗传评定方法的研究进展

畜禽遗传评定是畜禽育种的重要内容。目前畜禽遗传评定方法中应用最广的是基于表型信息的BLUP动物模型。基因组学的发展和应用产生了大量分子遗传标记,结合分子遗传标记信息的遗传评定方法MBLUP随之产生。MBLUP将成为一种快速有效的畜禽遗传评定方法。本文主要介绍了畜禽遗传评定方法的研究进展和发展趋势。 Abstract:Genetic evaluation is one of the most important components in livestock breeding program.Best linear unbiased prediction (BLUP) Animal Model,which based on phenotypic information,has become the most widely accepted method for genetic evaluation of domestic livestock.Large numbers of molecular genetic markers have been discovered as the development and application of genomics.Some new methods (Marked Assisted BLUP,MBLUP) for genetic evaluation have being developed,which incorporating molecular genetic markers information into genetic evaluation.MBULP will be a rapid and efficient method for genetic evaluation of domestic livestock.The aim of the paper is to introduce the development and current situation of the methods for livestock genetic evaluation.     

鸡杂种与纯种间CIDH基因的差异表达及其与杂种优势的关系

运用银染mRNA差异显示技术进行鸡杂种优势分子遗传机理研究。在检测白洛克肉鸡(EE)和丝毛乌骨鸡(CC)纯种及其正反交杂种间的mRNA差异表达情况时,发现一个只在杂种表达的475bp的cDNA片段:CE15A15。经过反向Northern印记杂交和RT-PCR验证,发现该片段在杂种中表达增强。序列比对结果表明该片段与鸡部分cDNA序列(ID:AW198493)的相似程度高达97％,而这一序列又相似于墨西哥野鼠的细胞质异柠檬酸脱氢酶(CIDH)基因(ID:AF048831),说明CI15A15为鸡CIDH基因的部分cDNA。表型数据的统计分析表明,丝毛乌骨鸡(CC)和白洛克肉鸡(EE)正反交杂种(CE、EC)的活重和屠体性状与同期纯种相比都具有负优势,而脂肪性状则具有不同程度的正优势。由于CIDH直接参与了动物机体脂肪酸合成代谢,由此推断,该cDNA片段在鸡纯种和杂种中的差异表达可能与杂种优势形成有关。     

奶牛产奶性状与乳房炎相关基因CpG含量及分布特征的比较分析

DNA甲基化是表观遗传学的重要组成部分,基因启动子区及第一外显子区的CpG甲基化通常抑制该基因的表达,而去甲基化则促进基因表达。已有的研究发现荷斯坦牛的乳房炎指标SCC(Somatic cell count)与产奶量呈较强负相关。文章分析并比较了这两类性状的相关基因的启动子区、第一外显子、下游2 000 bp序列中CpG含量及分布特征。结果表明,乳房炎相关基因的启动子、第一外显子中CpG含量显著低于产奶性状相关基因,而两类性状基因下游2 000 bp序列中CpG含量无显著性差异。另外,文中提出了两个量化基因序列中CpG特征的指标,一个是CpG平均距离,用来衡量序列中的CpG分布;另一个是条件概率p(G|C),用以量化序列中二核苷酸CpG随碱基C出现的可能性,并对两类基因的启动子和第一外显子区域的这两个指标做了统计检验。研究结果对产奶性状与乳房炎相关基因的DNA甲基化调控研究奠定了基础。     

缅怀著名动物遗传学家吴仲贤教授

2011年5月12日,吴仲贤教授百年诞辰纪念会暨塑像揭幕仪式在位于北京西郊的中国农业大学隆重举行,柯炳生校长高度评价了吴仲贤教授的治学精神,农业部原常务副部长刘成果,农业部原副部长洪绂曾,原北京农业大学党委副书记吴汝焯,中国科学院院士吴常信,英国皇家科学院院士杨子恒,中国农业大学副校长马寅生,中国农     

利用Bayesian-MCMC方法进行畜禽复杂离散性状QTL定位

复杂离散性状由于表型数据呈离散分布并且提供信息量过小, 因此很难用常规的统计方法对此类性状的QTL进行定位研究. Bayesian-MCMC方法是复杂离散性状QTL定位的重要手段, 该方法通过所有先验信息来推导QTL参数的后验分布并利用Markov Chain随机过程进行抽样的方法对目标参数进行统计推断. 利用Monte Carlo方法, 针对畜禽远交群体模拟产生多个全同胞家系的2级分类复杂离散性状, 然后基于IBD方差组分的随机模型的定位策略, 同时利用MCMC的3种不同抽样技术(Gibbs抽样、Metropolis抽样和Reversible Jump MCMC抽样)产生相应QTL参数的后验样本, 并进行了目标参数的Bayesian统计推断. 结果表明: Bayesian-MCMC方法能够对不同家系结构和QTL效应水平下复杂离散性状QTL进行有效检测; 当家系含量增加时, QTL定位的精确性和准确性提高, 并可适用于效应更小QTL的检测.