葡萄、桃和可可基因组的进化分析

本研究以葡萄、桃和可可为研究对象,基于比较基因组学,利用基因同源共线性方法对基因组内的结构和基因组间同源信息进行比对分析,确定了物种基因组内和基因组间的同源片段。通过统计3个物种基因组间的同源共线基因的保留情况发现,葡萄基因组的保留情况最好,桃次之(为73.4%),可可最差(为68.9%),其丢失均可能是由于双子叶植物共有的三倍化导致基因组稳定性遭到破坏。另外,共线基因间的同义核苷酸替换率的频数分布证实,葡萄、桃和可可仅经历过一次古老的全基因组三倍化,并未经历最近的全基因组加倍,且可可基因组进化最快,葡萄基因组进化最保守;3个物种的分歧时间分别为:葡萄(~110 Mya)、可可(~90 Mya)、桃(~80 Mya)。本研究将为3个物种及双子叶植物基因组的结构、功能和进化等研究提供重要的理论依据。     

在烫伤条件下VEGF对大鼠皮肤eNOS基因表达的影响

目的:探讨大鼠烫伤愈合过程中VEGF对皮肤组织eNOS基因表达的影响。方法:采用了大鼠深II度烫伤模型,分别以VEGF和阿西替尼(VEGF抑制剂)干预,观察大鼠烫伤后愈合过程的组织学变化,PCR检测创面eNOS基因的表达。结果:肉眼观察VEGF组大鼠创面最早愈合,对照组大鼠愈合速度其次,阿西替尼组创面愈合最晚;HE染色结果显示伤后第2、8、21天VEGF组炎性细胞浸润程度、新生毛细血管数量均高于对照组和阿西替尼组,PCR结果显示烫伤后第2、8天VEGF组的eNOS基因的表达明显上调,且同时间点与对照组比较有统计学意义(P0.05)。结论:VEGF可诱导烫伤创面eNOS基因的表达,增加血管生成重要因子NO的生成,有利于创面愈合。     

红鳍东方鲀GPI基因对急性低盐胁迫的响应机制

为了获得红鳍东方鲀Takifugu rubripes葡萄糖-6-磷酸异构酶(Glucose-6-Phosphate Isomerase, GPI)的基因信息及其表达特性, 研究采用RT-PCR和实时荧光定量PCR (qPCR) 技术进行了GPI基因的克隆、组织表达分析及其在急性低盐胁迫下的基因响应研究。结果显示, 所获得的红鳍东方鲀GPI基因序列长1736 bp, 包含一个完整的开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)。ORF由1662个核苷酸组成, 编码553个氨基酸; 预测的氨基酸序列中有2个糖异构域(Sugar Isomerase Domains), 不存在信号肽和跨膜结构域。多序列比对结果表明物种间GPI具有较高的保守性。qPCR结果表明: GPI基因mRNA在红鳍东方鲀鳃、肌肉、脑、肠、肝及肾等组织中均有表达, 其中肌肉中表达量最高。在不同盐度胁迫下, 在鳃中, 各低盐组GPI mRNA相对表达量均呈现先升高后降低又回升的趋势; 在肾中, 各低盐组GPI mRNA相对表达量变化趋势各有不同。由此推测, GPI基因在红鳍东方鲀对急性低盐胁迫的响应中发挥一定作用。     

血清AFP、FT3联合NLR对人工肝治疗乙型肝炎病毒相关慢加急性肝衰竭患者短期预后的评估价值研究

摘要 目的：探讨血清甲胎蛋白（AFP）、游离三碘甲腺原氨酸（FT3）联合中性粒细胞/淋巴细胞比值（NLR）对人工肝治疗乙型肝炎病毒相关慢加急性肝衰竭（HBV-ACLF）患者短期预后的评估价值。方法：选取2018年1月~2021年7月期间我院收治的97例HBV-ACLF患者,均成功实施人工肝治疗,作为人工肝治疗组。将人工肝治疗组的患者根据入院后90 d是否生存分为生存组69例和死亡组28例。同期选取在我院行体检的健康志愿者70例作为对照组。对比人工肝治疗组、对照组AFP、FT3、NLR。对比生存组和死亡组血清AFP、FT3、NLR。多因素Logistic回归分析短期预后的影响因素,采用预测概率值的受试者工作特征（ROC）曲线分析血清AFP、FT3联合NLR比值对人工肝治疗HBV-ACLF患者短期预后的预测价值。结果：人工肝治疗组AFP、NLR高于对照组,FT3低于对照组,组间对比差异有统计学意义（P<0.05）。死亡组AFP、NLR高于生存组,FT3低于生存组,组间对比差异有统计学意义（P<0.05）。人工肝治疗HBV-ACLF患者的短期预后与感染、国际标准化比值（INR）、终末期肝病模型（MELD）、白细胞计数（WBC）、红细胞分布宽度（RDW）、总胆红素（TBIL）、肌酐（Cr）、血清钠、C反应蛋白（CRP）有关（P<0.05）。多因素Logistic回归分析显示,RDW、AFP、INR、NLR、TBIL均为人工肝治疗HBV-ACLF患者短期预后的危险因素,而FT3则为人工肝治疗HBV-ACLF患者短期预后的保护因素（P＜0.05）。AFP、FT3、NLR联合预测人工肝治疗HBV-ACLF患者短期预后的曲线下面积（AUC）大于AFP、FT3、NLR的单独预测。结论：RDW、AFP、INR、FT3、NLR、TBIL均为人工肝治疗HBV-ACLF患者短期预后的影响因素,且AFP、FT3、NLR联合预测此类患者短期预后转归的预测价值较高。     

种植水稻对池塘沉积物中养分和氨氧化古菌的影响

为科学管理和利用池塘长期养殖产生的沉积物,实行池塘养殖和种植适度轮换是利用底泥养分和改善池塘底质的重要途径。将基本情况完全相同的9个池塘停止养鱼,进行种植水稻改良底质试验,以空置为对照(CK)、设种稻不晒田(T1)和晒田(T2)两个处理,检测试验过程沉积物的主要化学性质和氨氧化古菌(Ammonia-oxidizing archaea, AOA)的丰度及水稻收获后AOA的群落多样性和结构差异。结果表明,与CK相比, T1(或T2)处理下沉积物中TN、TP和OM显著减少,分别降低了26.58%(31.04%)、58.84%(58.38%)和11.17%(16.11%); T2与T1相比,显示种稻过程中晒田可以加速沉积物中TP和OM的去除;沉积物硝化强度和AOA丰度整体上呈现先增后减的趋势,其中,与CK相比, T1、T2的沉积物硝化强度在水稻分蘖期和拔节孕穗期显著提高, AOA丰度在分蘖期显著增加;种植水稻可以显著提升沉积物AOA的α多样性和OTU数量,增加许多新的AOA种群, T1主要增加了Candidatus nitrosocosmicus cluster(占总序列的3.84%), T2...     

基于线粒体COI基因的大蚊属Tipula系统发育及长角大蚊亚属Tipula (Sivatipula)分类地位初步研究(双翅目:大蚊总科)

大蚊属Tipula Linnaeus,1758是大蚊科中种类最多的属,目前其单系性尚未得到全面验证.此外,长角大蚊亚属Tipula (Sivatipula) Alexander,1964因其极长的触角以及独有的精子泵结构,明显不同于大蚊属其他亚属,使其亚属的分类地位存在争议.本研究基于COI序列对19个大蚊属物种及5个其他属物种进行了系统发育分析,并计算了物种间的遗传距离.研究结果表明:(1)邻接树(NJ)和最大似然树(ML)均显示长角大蚊亚属与大蚊属其他亚属未形成单系,大蚊属的单系性没有得到支持;(2)基于遗传距离和系统发育分析并结合形态信息,结果显示长角大蚊亚属独立于大蚊属内其他亚属,应将其提升为属级分类单元.     

毛竹-多花黄精复合经营模式对土壤理化特性的影响

复合经营是提高毛竹林经营效益及其生态功能的有效途径, 为了探讨毛竹(Phyllostachys pubescens)–多花黄精(Polygonatum cyrtonema)不同复合模式对土壤理化特性的影响, 在安徽金寨县建立了不同立竹密度(M1: 1639株·hm–2; M2: 2095株·hm–2; M3: 2553株·hm–2; CK: 2870株·hm–2)的毛竹-多花黄精复合模式试验林, 进行比较分析。研究结果表明, 复合模式的土壤容重显著降低, 非毛管孔隙度、初渗速率和稳渗速率均显著提高。复合模式土壤0-30 cm土层有机碳含量平均高于对照13.2%, 两者间差异显著(p<0.05), 而土壤全氮含量没有显著差异; 复合模式土壤有效氮、有效磷、交换性镁平均分别高于对照32.6%、31.4%和35.1% (p<0.05)。然而交换性钾表聚性明显, 0-30 cm土层平均含量低于对照14.7%; 土壤交换性钙含量, 复合模式与对照之间没有显著差异, 表聚性不明显。综合各项指标可以看出, 不同复合模式效应存在一定差异, 其中复合模式M2在改善土壤肥力方面的效果明显优于其它模式和对照, 生产上可推广应用。      

钩吻脂氧合酶基因GeLOX1的鉴定及低温胁迫表达分析

近年来，钩吻（Gelsemium elegans）的药用和饲用价值日益凸显，但钩吻在生长过程中不耐低温，挖掘其低温响应基因，为钩吻的抗寒育种研究奠定基础。植物中，脂氧合酶（lipoxygenase, LOX）在种子老化、抗逆境胁迫等方面的生理生化过程中有重要影响。基于课题组构建的钩吻转录组数据库，挖掘响应低温胁迫的钩吻LOX基因，运用RT-PCR技术，从中克隆到一条GeLOX1的cNDA全长序列，对其进行生物信息学、亚细胞定位、基因表达、原核表达及平板胁迫等分析。结果显示，GeLOX1所编码蛋白的氨基酸长度为761 aa，蛋白相对分子质量为87.00 kD，预测为不稳定的亲水性蛋白，含有28个丝氨酸磷酸化位点，22个苏氨酸磷酸化位点和9个酪氨酸磷酸化位点。进化树分析结果表明，GeLOX1属于9-LOX家族的成员。亚细胞定位检测结果显示，GeLOX1蛋白定位于细胞质中。实时荧光定量PCR分析发现，GeLOX1在钩吻的根中高表达，且其在4℃低温胁迫下的表达量呈现下调的趋势。经原核表达诱导后，GeLOX1的重组蛋白在约111 kD处出现目标条带，且重组蛋白的积累量在诱导8 h时达到峰值。此外...