喉癌中差异表达的蛋白激酶及其抑制剂的生物信息学筛选

目的：筛选喉癌中差异表达的激酶基因以及调控这些差异表达激酶的激酶抑制剂,为喉癌的分子治疗提供新的靶点。方法： 利用PubMed 数据库和SAM 软件筛选喉癌中差异表达的激酶基因。体外培养人喉癌Hep-2和FaDu 细胞。实时定量聚合酶链反 应（Real-time PCR）检测目的激酶在喉癌细胞系中的表达,以验证全基因表达谱结果的准确性。利用KEGG数据库获得激酶调控 的通路。文献挖掘和人工筛选获得差异表达激酶的激酶抑制剂。结果：①在喉癌基因组表达谱中,共筛选出差异表达基因207个, P<0.05,其中激酶基因4 个,分别为CDC42、CDK7、SLK 和TXK。②Real-time PCR 结果显示在人喉癌Hep-2 和FaDu 细胞中这四 个差异基因也出现差异表达,P<0.05,证明全基因组的结果准确。③通路分析的结果显示4 个差异激酶共调控25 个通路。④文献 挖掘和人工筛选的结果显示共有10 个激酶抑制剂调控CDC42,7 个激酶抑制剂调控CDK7,1 个激酶抑制剂调控SLK,2 个激酶 抑制剂调控TXK。并且再次文献挖掘的结果显示在这20 个激酶抑制剂中,有9 个在癌症方面的研究较少,文献<10 篇。结论： 喉癌中共有四个激酶CDC42、CDK7、SLK 和TXK发生差异表达,并发挥促癌作用。它们的激酶抑制剂可能有潜在的抗癌作用, 为喉癌的分子治疗提供新的切入点。     

CDC42 抑制剂ML141对喉癌Hep-2 细胞增殖的抑制作用

目的:探讨CDC42抑制剂ML141对喉癌细胞增殖的抑制作用,为喉癌的分子治疗提供新的靶点。方法:体外培养人喉癌Hep-2细胞。实时定量聚合酶链反应(Real-time PCR)检测CDC42在Hep-2细胞中的表达。利用GLISA法检测ML141对CDC42活性的抑制效果。利用CCK8法检测ML141对Hep-2细胞增殖能力的抑制效果。结果:1Real-time PCR结果显示在人喉癌Hep-2细胞中CDC42显著高表达(P0.001),证明全基因组的结果准确。2GLISA结果显示表皮生长因子作用的Hep-2细胞中CDC42的活性明显高表达,但加入ML141的Hep-2细胞中CDC42的活性受到明显抑制。(P0.001)。3CCK8结果显示24 h,48h和72 h时,ML141处理的Hep-2细胞的增殖能力与对照组相比均受到明显抑制。(P0.001)。结论:促癌基因CDC42抑制剂ML141能够抑制人喉癌Hep-2细胞增殖,具有成为抗喉癌新药的潜力,为喉癌的分子治疗提供新的切入点。     

葡萄、桃和可可基因组的进化分析

本研究以葡萄、桃和可可为研究对象,基于比较基因组学,利用基因同源共线性方法对基因组内的结构和基因组间同源信息进行比对分析,确定了物种基因组内和基因组间的同源片段。通过统计3个物种基因组间的同源共线基因的保留情况发现,葡萄基因组的保留情况最好,桃次之(为73.4%),可可最差(为68.9%),其丢失均可能是由于双子叶植物共有的三倍化导致基因组稳定性遭到破坏。另外,共线基因间的同义核苷酸替换率的频数分布证实,葡萄、桃和可可仅经历过一次古老的全基因组三倍化,并未经历最近的全基因组加倍,且可可基因组进化最快,葡萄基因组进化最保守;3个物种的分歧时间分别为:葡萄(~110 Mya)、可可(~90 Mya)、桃(~80 Mya)。本研究将为3个物种及双子叶植物基因组的结构、功能和进化等研究提供重要的理论依据。     

芩蒿滴鼻液对变应性鼻炎患者鼻分泌物中SP, TNF-α, Annexin1及VCAM-1含量的影响

目的:探讨芩蒿滴鼻液对变应性鼻炎(AR)患者鼻分泌物中P物质(SP)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、膜联蛋白1(Annexin1)、血管细胞黏附分子-1(VCAM-1)含量的影响。方法:选取我院耳鼻喉科收治的AR患者92例,随机分为对照组和实验组两组。对照组46例患者予曲安奈德鼻喷雾剂治疗,实验组46例患者加用芩蒿滴鼻液治疗。另选取健康体检患者46例。采用酶联免疫法测定各组患者鼻分泌物中TNF-α、Annexin1及VCAM-1的含量,采用放射免疫法测定SP的含量。结果:治疗后,两组鼻分泌物中SP、TNF-α及VCAM-1含量均较治疗前显著下降,Annexin1含量明显升高(P0.05);与对照组比较,实验组鼻分泌物中SP、TNF-α及VCAM-1含量较低(P0.05),Annexin1含量较高(P0.05),实验组临床有效率(91.30%)较对照组(73.91%)显著升高,差异具有统计学意义(P0.05)。结论:芩蒿滴鼻液能够明显降低AR患者鼻分泌物中SP、TNF-α、VCAM-1的含量,上调Annexin1的含量。