Integrated analysis of ceRNA network and tumor-infiltrating immune cells in esophageal cancer

Background: Esophageal cancer (ESCA) is one of the most commonly diagnosed cancers in the world. Tumor immune microenvironment is closely related to tumor prognosis. The present study aimed at analyzing the competing endogenous RNA (ceRNA) network and tumor-infiltrating immune cells in ESCA.Methods: The expression profiles of mRNAs, lncRNAs, and miRNAs were downloaded from the Cancer Genome Atlas database. A ceRNA network was established based on the differentially expressed RNAs by Cytoscape. CIBERSORT was applied to estimate the proportion of immune cells in ESCA. Prognosis-associated genes and immune cells were applied to establish prognostic models basing on Lasso and multivariate Cox analyses. The survival curves were constructed with Kaplan–Meier method. The predictive efficacy of the prognostic models was evaluated by the receiver operating characteristic (ROC) curves.Results: The differentially expressed mRNAs, lncRNAs, and miRNAs were identified. We constructed the ceRNA network including 23 lncRNAs, 19 miRNAs, and 147 mRNAs. Five key molecules (HMGB3, HOXC8, HSPA1B, KLHL15, and RUNX3) were identified from the ceRNA network and five significant immune cells (plasma cells, T cells follicular helper, monocytes, dendritic cells activated, and neutrophils) were selected via CIBERSORT. The ROC curves based on key genes and significant immune cells all showed good sensitivity (AUC of 3-year survival: 0.739, AUC of 5-year survival: 0.899, AUC of 3-year survival: 0.824, AUC of 5-year survival: 0.876). There was certain correlation between five immune cells and five key molecules.Conclusion: The present study provides an effective bioinformatics basis for exploring the potential biomarkers of ESCA and predicting its prognosis.     

Improvement of Opal Multiplex Immunofluorescence Workflow for Human Tissue Sections

The Opal multiplex technique is an established methodology for the detection of multiple biomarkers in one section. The protocol encompasses iterative single stainings and heating-mediated removal of the primary and secondary antibodies after each staining round, leaving untouched the Opal fluorophores which are deposited onto the antigen of interest. According to our experience, repetitive heating of skin sections often results in tissue damage, indicating an urgent need for milder alternatives to strip immunoglobulins. In this study, we demonstrate that considerable heating-related damage was found not only in skin but also in tissues of different origin, mostly characterized by low cell density. Importantly, the morphology remained fully intact when sections were repetitively exposed to β-mercaptoethanol-containing stripping buffer instead of multiple heating cycles. However, target epitopes appeared sensitive at a differential degree to multiple treatments with stripping buffer, as shown by loss in staining intensity, but in all cases, the staining intensity could be restored by increment of the primary antibody concentrations. Application of β-mercaptoethanol-containing stripping buffer instead of heating for antibody removal markedly improved the quality of the Opal multiplex technique, as a substantial higher number of differently colored cells could be visualized within a well-conserved morphological context:     

土壤水分对土壤产生气态氮的厌氧微生物过程的影响

气态氮[一氧化氮(NO)、氧化亚氮(N₂O)和氮气(N₂)]的释放是土壤氮损失的一种重要途径。硝化和反硝化作用是土壤气态氮损失的主要微生物过程,但是异养硝化作用、共反硝化作用和厌氧氨氧化过程对土壤气态氮损失的贡献尚不清楚。本研究利用¹⁵N标记和配对法,结合硝化抑制剂双氰胺(DCD),通过土壤培养试验来量化厌氧条件下各种微生物过程对NO、N₂O和N₂产生的贡献。结果表明: 在厌氧条件下培养24 h后,土壤孔隙含水率为65%时,3种气体总的¹⁵N回收率最高,占加入¹⁵N总量的20.0%。反硝化过程对NO、N₂O和N₂产生的贡献率分别为49.9%～94.1%、29.0%～84.7%和58.2%～85.8%,是产生3种气体的主要过程。异养硝化过程也是产生NO和N₂O的重要过程,特别是在土壤孔隙含水率很低时(10%)对两种气体产生的贡献率分别为50.1%和42.8%。,共反硝化过程对N₂O产生的贡献率为10.6%～30.7%,共反硝化和厌氧氨氧化过程对N₂产生的总贡献率为14.2%～41.8%,表明共反硝化过程在N₂O和N₂产生中的作用不可忽视。¹⁵N标记和配对法是区分气态氮损失的各种微生物过程的有效手段。     

环丝氨酸联合莫西沙星治疗耐多药肺结核的疗效及对免疫功能和生活质量的影响

摘要 目的：探讨环丝氨酸联合莫西沙星治疗耐多药肺结核（MDR-TB）的疗效及对免疫功能和生活质量的影响。方法：选取2016年7月到2018年10月期间我院收治的MDR-TB患者86例作为研究对象,根据奇偶排序法将患者分为对照组（n=43,基础治疗联合莫西沙星治疗）和研究组（n=43,对照组基础上联合环丝氨酸治疗）,均治疗20个月。对比两组疗效、痰结核菌转阴率、病灶吸收率、空洞缩小率情况、免疫功能、生活质量及不良反应。结果：研究组治疗20个月后的总有效率高于对照组（P<0.05）。研究组治疗12个月后、治疗20个月后痰结核菌转阴率、病灶吸收率、空洞缩小率均高于对照组（P<0.05）。两组治疗20个月后心理功能、躯体功能、社会功能、物质生活评分均升高,且研究组高于对照组（P<0.05）。两组治疗20个月后CD8⁺较治疗前降低,且研究组低于对照组（P<0.05）,CD3⁺、CD4⁺/CD8⁺、CD4⁺较治疗前升高,且研究组高于对照组（P<0.05）。对比两组不良反应发生率无差异（P>0.05）。结论：环丝氨酸联合莫西沙星治疗MDR-TB,能够有效的促进患者机体免疫功能和生活质量的改善,并能够有效的促进临床转归,且用药安全性较高。     

消癌平注射液联合表柔比星新辅助化疗对三阴性乳腺癌患者免疫功能、生活质量及血清肿瘤标志物的影响

摘要 目的：探讨消癌平注射液联合表柔比星新辅助化疗对三阴性乳腺癌（TNBC）患者免疫功能、生活质量及血清肿瘤标志物的影响。方法：选取TNBC患者89例,按照随机数字表法分为对照组和研究组,对照组（n=44）患者给予表柔比星新辅助化疗治疗,研究组（n=45）患者给予消癌平注射液联合表柔比星新辅助化疗。对比两组疗效、免疫功能、生活质量、血清肿瘤标志物及不良反应。结果：研究组治疗12周后的临床总有效率为91.11%（41/45）,高于对照组的63.64%（28/44）（P<0.05）。两组治疗12周后健康调查简表（SF-36）量表各维度评分升高,且研究组较对照组高（P<0.05）。两组治疗12周后CD4+CD25+Treg、Th17/ Treg均降低,且研究组较对照组低（P<0.05）,Th17升高,且研究组较对照组高（P<0.05）。两组治疗12周后癌胚抗原（CEA）、糖类抗原199（CA199）、糖类抗原125（CA125）均降低,且研究组较对照组低（P<0.05）。两组不良反应发生率对比未见差异（P>0.05）。结论：消癌平注射液联合表柔比星新辅助化疗治疗TNBC,具有确切的治疗效果,可降低血清肿瘤标志物水平,改善患者免疫功能和生活质量。     

3.0 T磁共振T2×mapping成像技术定量评估膝关节骨性关节炎的临床价值及与WOMAC评分的相关性分析

摘要 目的：研究3.0 T磁共振T2×mapping成像技术定量评估膝关节骨性关节炎（OA）的临床价值及与西安大略和麦克马斯特大学骨关节炎指数（WOMAC）评分的相关性。方法：将我院于2017年4月～2019年12月期间收治的膝关节OA患者80例纳入研究。根据K-L分级标准将膝关节OA患者分成轻度组（K-L分级为Ⅰ～Ⅱ级）32例,重度组（K-L分级为Ⅲ～Ⅴ级）48例。另取同期于我院进行体检的健康者30例作为对照组。所有受试者均接受3.0 T磁共振T2×mapping扫描,比较各组膝关节不同部位软骨T2值、WOMAC评分以及血清炎症因子水平,以Pearson相关性分析膝关节OA患者膝关节不同部位软骨T2值和WOMAC评分的关系。结果：重度组膝关节不同部位软骨T2值均高于轻度组以及对照组,且轻度组膝关节不同部位软骨T2值均高于对照组（均P＜0.05）。重度组各项WOMAC评分及总分均高于轻度组以及对照组,且轻度组各项WOMAC评分及总分均高于对照组（均P＜0.05）。经Pearson相关性分析发现：膝关节OA患者膝关节不同部位软骨T2值和各项WOMAC评分及总分均呈正相关（均P＜0.05）。重度组血清白介素-1β（IL-1β）、白介素-18（IL-18）、肿瘤坏死因子α（TNF-α）均高于轻度组以及对照组,且轻度组血清IL-1β、IL-18、TNF-α均高于对照组（均P＜0.05）。结论：3.0 T磁共振T2×mapping成像技术定量评估膝关节OA的临床价值较高,且患者膝关节不同部位软骨T2值与WOMAC评分密切相关。     

无创性皮肤屏障功能检测在朗格汉斯细胞组织细胞增生症中的应用

摘要 目的：探讨无创性皮肤屏障功能检测在朗格汉斯细胞组织细胞增生症(Langerhans cell histiocytosis,LCH)中的应用价值。方法：研究时间为2017年1月到2020年12月,选择在本院诊治的朗格汉斯细胞组织细胞增多症患者72例作为LCH组,同期选择健康体检者72例作为对照组。采用无创性皮肤屏障功能检测皮肤水分、经皮水分丢失(Transdermal water loss,TEWL)、油脂水平,同时检测所有入选者的免疫功能、皮肤菌群并进行相关性分析。结果：LCH组的皮肤水分低于对照组(P<0.05),TEWL、油脂水平高于对照组(P<0.05)。LCH组的乳酸杆菌(La)阳性率低于对照组(P<0.05),表皮葡萄球菌(Se)、痤疮丙酸杆菌(Pa)、金黄色葡萄球菌(Sa)阳性率高于对照组(P<0.05)。LCH组的CD163、ki-67表达阳性率分别为77.8 %、52.8 %,高于对照组的19.4 %和6.9 %(P<0.05)。在LCH组中,Pearson相关性分析显示皮肤水分与乳酸杆菌呈现正相关性(P<0.05),TEWL、油脂与表皮葡萄球菌、痤疮丙酸杆菌、金黄色葡萄球菌、CD163、ki-67呈现正相关性(P<0.05)。结论：无创性皮肤屏障功能检测在朗格汉斯细胞组织细胞增生症中的应用可反映患者的皮肤水分与油脂状况,也可间接反映患者的皮肤微生态与免疫功能状况。     

Expansion of GARP-Expressing CD4+CD25−FoxP3+ T Cells and SATB1 Association with Activation and Coagulation in Immune Compromised HIV-1-Infected Individuals in South Africa

Virologica Sinica - Although antiretroviral treatment lowers the burden of human immunodeficiency virus (HIV)-related disease, it does not always result in immunological recovery. This manifests as...     

扶正方对Lewis肺癌小鼠免疫功能、PI3K/AKT信号通路和外周血IL-2、IL-6、INF-γ的影响

摘要 目的：观察扶正方对Lewis肺癌小鼠免疫功能、磷脂酰肌醇3激酶（PI3K）/蛋白激酶B（AKT）信号通路和外周血白细胞介素（IL）-2、IL-6、γ干扰素（INF-γ）的影响。方法：将40只Lewis肺癌小鼠随机分为模型组（M组）、扶正方低剂量组（A组）、扶正方高剂量组（B组）、顺铂组（S组）,每组10只,A组、B组分别给予扶正方0.4 mL/20 g、0.8 mL/20 g灌胃,M组给予生理盐水0.4 mL/20 g灌胃,S组给予顺铂1 mg/mL,0.4 mL灌胃,连续14d,比较各组小鼠一般情况、肿瘤重量,胸腺指数、脾脏指数、脾脏CD3⁺细胞、CD4⁺细胞、CD8⁺细胞比例细胞百分比,鼠肿瘤组织PI3K/AKT信号通路蛋白表达水平及外周血IL-2、IL-6、INF-γ水平。结果：A组、B组、S组小鼠肿瘤重量低于M组,S组小鼠肿瘤重量低于A组、B组（P<0.05）,治疗前各组小鼠体重比较无统计学差异（P>0.05）,治疗后A组、B组小鼠体重高于S组、M组（P<0.05）。A组、B组小鼠胸腺指数显著高于M组、S组（P<0.05）。A组、B组CD3⁺、CD4⁺、CD4⁺/CD8⁺显著高于M组、S组,CD8⁺显著低于M组、S组（P<0.05）,B组CD3⁺、CD4⁺、CD4⁺/CD8⁺显著高于A组,CD8⁺低于A组（P<0.05）。A组、B组、S组小鼠肿瘤组织PI3K蛋白、AKT蛋白表达水平显著低于M组（P<0.05）。A组、B组、S组小鼠外周血IL-2、INF-γ水平显著高于M组,IL-6水平显著低于M组（P<0.05）。结论：扶正方可以提升Lewis肺癌小鼠免疫功能,调节IL-2、IL-6、INF-γ细胞因子水平,抑制PI3K/AKT信号通路起到抗肺癌的作用。     

经脐单孔腹腔镜疝囊高位结扎术治疗腹股沟斜疝患儿的疗效及对血清炎性指标和免疫功能的影响

摘要 目的：观察经脐单孔腹腔镜疝囊高位结扎术治疗腹股沟斜疝患儿的疗效及对血清炎性指标和免疫功能的影响。方法：研究为回顾性研究,选取2018年1月~2020年12月期间在我院接受治疗的198例腹股沟斜疝患儿的临床资料,按照手术方式的差异分为传统组（97例）和微创组（101例）。传统组接受开放性腹股沟斜疝疝囊高位结扎术,微创组接受经脐单孔腹腔镜疝囊高位结扎术,观察两组手术相关指标、血清炎性指标和免疫功能变化情况,记录随访期间并发症发生率并作组间对比。结果：与传统组相比,微创组切口总长度更短,手术时间、住院时间缩短,术中出血量减少（P<0.05）。术后2 d组间对比,微创组免疫球蛋白M（IgM）、免疫球蛋白A（Ig A）、免疫球蛋白G（IgG）水平均高于传统组（P<0.05）。术后2 d组间对比,微创组血清白介素-6（IL-6）、肿瘤坏死因子-α（TNF-α）、C反应蛋白（CRP）、白细胞计数均低于传统组（P<0.05）。与传统组相比,微创组随访期间并发症发生率更低（P<0.05）。结论：经脐单孔腹腔镜疝囊高位结扎术治疗腹股沟斜疝患儿,具有创伤小、手术时间短、并发症少、术后恢复快等优势,且该术式引起的炎症反应及免疫抑制程度均较传统治疗更轻,是治疗此类患儿的良好选择。