癌症相关的DNA甲基化连锁区域

DNA甲基化是重要的表观遗传标记之一,在转录调控中起直接作用。DNA甲基化的异常与癌症的发生发展密切相关。高通量测序使得在单碱基分辨率下检测全基因组的DNA甲基化水平成为可能。本文基于临近CpGs位点甲基化水平的相关性挖掘DNA甲基化连锁区域。结果发现DNA甲基化连锁区域的甲基化水平和模式在癌症中存在异常,而且显著富集到分化/发育相关的生物学功能。DNA甲基化连锁区域的挖掘有助于对具有生物学功能的表观遗传标记的进一步理解,有助于对癌症诊断的表观遗传标记的挖掘。     

Resolving early Mid-Ordovician (Kundan) bioevents in the East Baltic based on brachiopods

Bed-by-bed sampling of brachiopods from selected Kundan Stage localities in the East Baltic has permitted the construction of α-diversity curves, unprecedented in detail from this particular stage and region. These α-diversity curves can be correlated between the investigated sections, along an east to west transect of some 200 km and indicate bioevents associated with intervals of increased palaeo-water depth. The highest peaks in α-diversity occur when biofacies analysis and sedimentological evidence indicate drowning events. The events involve mainly taxa endemic to the Baltic province at this time and thus, the radiation proceeded by a modest expansion of the brachiopod fauna into deeper-water environments, isolated at this time from major immigrations. In addition to increased α-diversity, β-diversity was signalled by new, deeper-water communities and the isolation of the province helped retain high values of γ-diversity.     

急性呼吸系统感染与气象因素的相关性分析研究

目的:分析研究急性呼吸系统感染与气象因素的相关性。方法:记录2011年1月-2012年12月上海市胸科医院急诊就诊的急性呼吸系统感染人数,并采用SPSS19.0与同期气象资料进行相关性分析。结果:发现急性呼吸系统感染具有冬季高发、夏季低发的特征。急性呼吸感染人数与平均气温、最高气温、最低气温呈显著负相关,而与日平均气压呈显著正相关。温度对呼吸系统感染数影响具有滞后效应。结论:气温、气压等气象因素与呼吸系统感染发病有明显相关。     

Examination of protein sequence homologies: II. SixEscherichia coli L7/L12-type ribosomal “A” protein sequnces from eukaryotes and metabacteria,contrasted with those from prokaryotes

Summary Four complete and three partial sequences ofE. coli L7/L12-type ribosomal A proteins obtained from four eukaryotes (Saccharomyces cerevisiae, Artemia salina, rat liver, and wheat germ), two metabacteria (Halobacterium cutirubrum andMethanobacterium thermoautotrophicum), and the prokaryoteEscherichia coli have been compared using a computer program that searches for homologous tertiary structures. Comparison matrices show that eukaryotic sequences sequentially match each other if deletions and/or insertions of certain residues (gaps) are assumed at specific sites corresponding to residues 36, 51, 72, and 94 ofS. cerevisiae protein YL44c. This is similar to what was previously found in prokaryotes. Metabacteria, which exhibit eukaryote-type sequences, must have separated from the eukaryotes in ancient times, because an additional deletion site is found in their sequences and their sequences have low correlation coefficients with those of all the other eukaryotes. When the eukaryote-type A proteins (110–111 residues) are compared withE. coli L7/L12 (120 residues) four groups of well-matching segments are found. It was deduced that the eukaryote-type A proteins had regenerated from the prokaryote types by a transposition and several deletions, resulting in the eukaryote-type lengths. The correspondence between the eukaryotic and prokaryotic proteins, as well as that among eukaryotic proteins themselves, is discussed in terms of protein evolution.In addition, ribosomal protein YL35 fromS. cerevisiae has been compared with RL37 from rat liver, with results indicating five well-matching parts separated by four gaps, one of which consists of 20 residues. These results contrasts with those previously reported by Lin et al. No prokaryotic counterparts to these ribosomal proteins have yet been identified.     

老年支气管哮喘患者血清25-羟维生素D3浓度与免疫功能及肺功能的相关性研究

目的:研究老年支气管哮喘患者血清25-羟维生素D3[25-(OH)D3]浓度与免疫功能及肺功能的关系。方法:选取2016年1月至2017年12月我院收治的老年支气管哮喘患者96例作为研究组,根据肺功能检查结果分为轻度哮喘组(n=30)、中度哮喘组(n=38)和重度哮喘组(n=28),另选取同期在我院进行体检的健康老年人40例作为对照组。比较各组血清25-(OH)D3浓度、第一秒最大呼气量占用力肺活量百分比(FEV1/FVC)、FEV1占预计值百分比(FEV1%pred)、CD4~+、CD8~+、CD4~+/CD8~+以及血清免疫球蛋白A(IgA)、免疫球蛋白M(IgM)、免疫球蛋白G(IgG)水平,并分析血清25-(OH)D3与免疫功能指标及肺功能指标的相关性。结果:研究组血清25-(OH)D3浓度、FEV1%pred水平均低于对照组(P0.05),两组FEV1/FVC水平比较差异无统计学意义(P0.05)。研究组CD4~+、CD4~+/CD8~+、血清IgA、IgM、IgG水平均低于对照组,CD8~+水平高于对照组(P0.05)。重度哮喘组血清25-(OH)D3、IgA、IgM、IgG水平、FEV1%pred、CD4~+、CD4~+/CD8~+均低于中度哮喘组和轻度哮喘组,中度哮喘组又低于轻度哮喘组(P0.05),重度哮喘组CD8~+水平高于中度哮喘组和轻度哮喘组,中度哮喘组又高于轻度哮喘组(P0.05)。经Pearson相关性分析可得:老年支气管哮喘患者血清25-(OH)D3与FEV1%pred、CD4~+、CD4~+/CD8~+、IgA、IgM、IgG均呈正相关(P0.05),与CD8~+呈负相关(P0.05)。结论:老年支气管哮喘患者的血清25-(OH)D3浓度显著降低,且与肺功能和免疫功能相关,25-(OH)D3浓度的检测可用于评估患者病情严重程度。     

胃癌患者外周血调节性T细胞水平与免疫抑制状态及病理特征的关系研究

目的:探讨胃癌患者外周血中CD4~+CD25~+调节性T细胞(Treg)水平与免疫抑制状态和病理特征的关系。方法:选择2016年1月至2017年6月我院收治的胃癌患者73例作为胃癌组,另选同期在本院进行体格检查的健康者41例作为对照组,采用流式细胞仪检测其外周血中CD4~+CD25~+Treg水平,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测血清γ-干扰素(IFN-γ)、白细胞介素-2(IL-2)、白细胞介素-4(IL-4)、白细胞介素-10(IL-10)水平,分析CD4~+CD25~+Treg水平与IFN-γ、IL-2、IL-4和IL-10的相关性及与病理特征的关系。结果:胃癌组CD4~+CD25~+Treg比例、IL-4和IL-10水平为(19.43±4.36)%、(9.76±2.41)pg/mL和(22.18±5.26)pg/mL,高于对照组的(10.34±2.16)%、(7.16±2.07)pg/mL和(9.52±3.47)pg/mL,差异有统计学意义(P0.05);胃癌组IFN-γ和IL-2水平为(6.87±2.24)pg/mL和(2.43±0.54)pg/mL,低于对照组的(13.86±3.18)pg/mL和(12.79±2.16)pg/mL,差异有统计学意义(P0.05)。CD4~+CD25~+Treg比例与IFN-γ和IL-2呈负相关关系(P0.05),与IL-4和IL-10呈正相关关系(P0.05)。CD4~+CD25~+Treg比例与胃癌患者的TNM分期、淋巴结转移有关(P0.05),与病理类型、肿瘤直径、分化程度和肿瘤位置无关(P0.05)。结论:胃癌患者外周血Treg水平增高,与免疫状态有明显的相关性,其参与了肿瘤的发生与发展过程。     

IL-17和VEGF在慢性鼻-鼻窦炎患者鼻息肉组织中的表达及相关性研究

目的:探讨慢性鼻-鼻窦炎患者鼻息肉组织中白介素-17(IL-17)、血管内皮生长因子(VEGF)的表达,并分析IL-17、VEGF表达水平的相关性。方法:以我院2015年1月~2017年12月期间收治的慢性鼻-鼻窦炎患者95例为研究对象,按患者有无鼻息肉分为伴鼻息肉(观察1组)49例和不伴鼻息肉(观察2组)46例。另选取同期在我院进行治疗的鼻中隔偏曲患者40例为对照组。所有患者均进行鼻内镜手术治疗,并在术中取其较窄侧的鼻甲黏膜作为检测标本,采用免疫组化SP法检测各组织标本中的IL-17、VEGF的表达水平,并分析IL-17、VEGF表达水平的相关性。结果:观察1组患者IL-17、VEGF的阳性表达率分别为93.88%(46/49)、85.71%(42/49),均高于观察2组患者IL-17、VEGF的阳性表达率[76.09%(35/46)、65.22%(30/46)]以及对照组患者IL-17、VEGF的阳性表达率[5.00%(2/40)、2.50%(1/40)],差异均具有统计学意义(P0.05)。观察1组患者IL-17、VEGF的表达水平分别为(38.92±5.34)个/LP、(33.21±4.87)个/LP,均高于观察2组患者IL-17、VEGF的表达水平[(28.19±4.56)个/LP、(21.28±4.03)个/LP]以及对照组患者IL-17、VEGF的表达水平[(9.31±2.76)个/LP、(7.19±1.95)个/LP],差异均具有统计学意义(P0.05)。经Spearman相关性分析结果显示,观察1组患者、观察2组患者中,IL-17与VEGF的表达水平呈正相关性(P0.05)。结论:慢性鼻-鼻窦炎患者鼻息肉组织中IL-17、VEGF的表达显著升高,且IL-17与VEGF表达水平呈明显的正相关性,表明IL-17、VEGF可能共同参与鼻息肉的发生与发展过程。     

肾脏肿瘤患者CT灌注参数与肾功能生化检测指标的相关性研究

目的:探讨肾脏肿瘤患者CT灌注参数与肾功能生化检测指标的相关性。方法:选取河北省第六人民医院2013年3月至2018年1月期间收治的35例肾脏肿瘤患者作为观察组,另选取同期来我院体检的35例健康者作为对照组,均对两组受试者实施CT灌注成像,获取等效血容量(Equiv BV)、表面渗透性(Ps)、血流量(BF)等CT灌注参数,并检测两组受试者血尿素氮(BUN)、血肌酐(Scr)、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)等肾功能生化指标,对比两组受试者上述指标检测结果,采用Pearson相关分析CT灌注参数与肾功能生化指标的相关性。结果:与对照组相比,观察组CT灌注参数Equiv BV、Ps、BF均降低,肾功能生化指标BUN、Scr、TC、TG水平均升高,有统计学差异(P0.05)。Pearson相关分析结果显示,CT灌注参数Equiv BV、Ps、BF与肾功能生化指标TC、BUN均呈负相关(P0.05),与Scr、TG无相关性(P0.05)。结论:肾脏肿瘤患者的CT灌注参数Equiv BV、Ps、BF均较低,BUN、Scr、TC、TG水平均较高,且CT灌注参数与BUN、TC水平呈负相关性,可作为评估肾脏肿瘤患者肾功能的辅助方法。     

先天性心脏病患儿围术期输血与术后肺损伤的相关性研究

目的:研究先天性心脏病患儿围术期输血与术后发生肺损伤的相关性。方法:选择我院诊治的120例先天性心脏病患儿,均在体外循环下进行手术矫治。根据患儿术后是否出现肺损伤分为无肺损伤组(n=97例)与肺损伤组(n=23例)。比较两组一般资料,比较不同围术期输血浆量及输血量患儿的术后肺损伤发病率;采用多因素logistic回归对术后肺损伤与围术期输血浆量、围术期输血量、最低红细胞压积(30%)、体外循环时间(80 min)、年龄(≤1岁)以及最低温度之间的相关性进行分析。结果:无肺损伤组与肺损伤组患儿性别间无显著差异(P0.05);肺损伤组患儿年龄、体质量均显著低于无肺损伤组患儿(P0.05),而围术期输血浆量、围术期输血量、最低血红积压、体外循环时间均显著高于无肺损伤组患儿(P0.05)。随着患儿围术期输血浆量及输血量的增加,患儿术后肺损伤的发病率越高(P0.05);多因素logistic回归分析显示围术期输血浆量、围术期输血量、最低红细胞压积(30%)、体外循环时间(80 min)以及年龄(≤1岁)是患儿发生术后肺损伤的独立危险因素(P0.05)。结论:围术期输血浆量以及输血量与先天性心脏病患儿术后肺损伤的发生紧密相关,围术期输血浆量以及输血量越多,肺损伤的发生风险就越高,建议临床上开展多种节约用血措施。     

Investigating the role of the human CIA2A-CIAO1 complex in the maturation of aconitase

Background

The CIA2A protein, in complex with CIAO1, has been proposed to be exclusively implicated in the maturation of cytosolic aconitase. However, how the CIA2A-CIAO1 complex generates active aconitase is still unknown and the available structural information has not provided any crucial insights into the molecular function of CIA2A.