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癌症相关的DNA甲基化连锁区域
引用本文:王丽波,王芳,张岩.癌症相关的DNA甲基化连锁区域[J].生物信息学,2014,12(3):213-217.
作者姓名:王丽波  王芳  张岩
作者单位:哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院,黑龙江 哈尔滨 150086;哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院,黑龙江 哈尔滨 150086;哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院,黑龙江 哈尔滨 150086
基金项目:哈尔滨医科大学大学生创业基金资助。
摘    要:DNA甲基化是重要的表观遗传标记之一,在转录调控中起直接作用。DNA甲基化的异常与癌症的发生发展密切相关。高通量测序使得在单碱基分辨率下检测全基因组的DNA甲基化水平成为可能。本文基于临近CpGs位点甲基化水平的相关性挖掘DNA甲基化连锁区域。结果发现DNA甲基化连锁区域的甲基化水平和模式在癌症中存在异常,而且显著富集到分化/发育相关的生物学功能。DNA甲基化连锁区域的挖掘有助于对具有生物学功能的表观遗传标记的进一步理解,有助于对癌症诊断的表观遗传标记的挖掘。

关 键 词:DNA甲基化  连锁不平衡  癌症  相关系数
收稿时间:2013/11/1 0:00:00
修稿时间:2013/11/22 0:00:00

DNA methylation linkage disequilibrium block are associated with cancer
WANG Libo,WANG Fang and ZHANG Yan.DNA methylation linkage disequilibrium block are associated with cancer[J].China Journal of Bioinformation,2014,12(3):213-217.
Authors:WANG Libo  WANG Fang and ZHANG Yan
Institution:Department of Bioinformatics, Harbin Medical University, Harbin 150086, China;Department of Bioinformatics, Harbin Medical University, Harbin 150086, China;Department of Bioinformatics, Harbin Medical University, Harbin 150086, China
Abstract:
Keywords:DNA methylation  Linkage disequilibrium  Cancer  Correlation coefficient
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