基于Hi-C数据的染色体三维分析计算方法

真核生物的染色质在细胞核中高度折叠且有序排列,这种三维结构对基因转录和DNA复制等细胞功能发挥至关重要。近年来Hi-C数据的涌现,使得研究染色质三维交互作用及其空间结构成为了可能。自2009年Hi-C被开发以来,已经出现了许多用于处理Hi-C数据的生物信息学工具,从原始序列比对到接触矩阵的可视化,均提供了系统的Hi-C数据处理过程或解决某一个特定问题的方法。本研究全面介绍了传统的Hi-C数据处理工作流程,以及近十年来新兴的Hi-C数据处理工具以及其未来发展方向。     

Knowledge-Domain Semantic Searching and Recommendation Based on Improved Ant Colony Algorithm

To obtain accurate search results and advocate the use of human effort in discovering knowledge, we propose a method based on Ant Colony Algorithm （ACA）. The proposed method simulates the behavior of ants searching for food. Specific features such as the behavior of ants searching for food, their established search paths, and the ant ＂neighborhood＂ profile are investigated. The investigation results reveal that the behavior of people searching for useful information resembles that of ants searching for food. We also use semantic annotation and the decreasing matrix dimension approach to accelerate the food searching process an.d shorten the distance between the query starting points and the ultimate answers. A user behavior model is constructed based on personal and domain ontologies. Experimental evaluation with the enhanced ACA has two parts： （1） estimating the efficiency of information retrieval with user interests considered and （2） identifying how to weigh usage and rate user data during recommendation.     

Alien woody plant invasions in natural forests across China

外来木本植物在我国天然林中的入侵 外来植物入侵已经成为一个主要的全球性环境问题，造成了严重的经济和生态破坏。中国区域内部分地区已有关于严重入侵情况的报道，但是大多是小尺度上的研究，全国范围天然林中的外来植物入侵情况仍不清楚。本文基于全国天然林的3573个样方数据，绘制了外来木本植物入侵在我国各地天然林中的空间分布格局，探究了可能的环境和社会经济控制因素。研究结果显示，只有271个样方被外来木本植物入侵，占样方总数的7.58%；在所有调查的2825种木本植物中，只有5个外来物种(占比0.177%)。人类活动和气候因素都对入侵格局产生影响。由于我国天然林多位于偏远山区，人为干扰较轻，外来木本植物入侵的报道少于北美森林和欧洲林地。然而，随着交通运输的发展和山区经济活动的增加，在不久的将来可能会有更多。因此，需要积极的管理和政策制定来防止或减缓入侵进程，降低人类活动的干扰，监测外来物种的入侵情况并及时做出应对。     

基于快速沃尔什变换的分子子序列识别

提出了一种基于快速沃尔什变换的分子子序列识别的方法。这种方法不仅能快速识别出子序列并确定子序列的位置，而且极大地降低了CPU运行时间和计算复杂度，结合实例对这种方法进行了分析。     

医学信息的虚拟存储及其系统模型的构建

本文引入了医学信息的虚拟存储新理念，用以解决海量医学数据的存储难题，并提出了在上海广电集团所建立的上海远程医学网络平台上的具体设计方案，包括建立虚拟映射，数据访问中数据传输技术的研究以及存储管理的设想。     

《科学》：研究揭示三类抗生素潜在杀伤机制

近日来自麻省理工学院和波士顿大学的研究人员揭开了三类主要的抗生素潜在的杀伤机制：药物生成了一些破坏性分子，通过一连串细胞事件对细胞DNA造成了致命性的损伤。相关论文发表在4月20日的《科学》（Science）杂志上。     

科学家发现染色质结构调节DNA突变新机制

记者从中山大学获悉,由该校生命科学学院教授贺雄雷领衔的团队,近期在染色质结构如何调节DNA突变工作上取得重要进展,相关成果发表在3月9日的《科学》杂志上。这是近10年来中山大学首次以第一作者的身份在《科学》杂志上发表论文。据研究人员介绍,突变是生物演化的基础,也是疾病     

《癌细胞》：控制血管再生可抑制癌细胞生长

英国西英格兰大学布里斯托尔分校和布里斯托尔大学等机构联合发现。在一种特殊肿瘤的基因变异中。血管再生方式发生改变。调控血管再生的主开关被打开。为癌细胞建造运输营养的血管通道。而瞄准这一主开关就可能预防或阻止癌细胞再造血管，切断其营养供给途径。相关论文发表在最新的《癌细胞》期刊上，为研究癌症疗法开辟了新方向。     

《微生物学免疫学进展》关于稿件优先数字出版的启事

<正>为缩短学术论文发表周期,提高学术论文的时效性和影响力,争取创新性科研成果的首发权,《微生物学免疫学进展》于2012年1月与中国知网(CNKI)签订了《学术期刊优先数字出版合作协议》。"优先数字出版"是以印刷版期刊录用稿件为出版内容,先于印刷版期刊出版日期的数字出版方式,属     

基于聚类分析法的护理单元分类研究

目的 探讨聚类分析法在确定护理单元分类中的应用，客观、公正的评价护理单元，在医护分开核算模式下，为护理绩效奖金分配及人力资源配置提供参考依据。方法 利用自设调查表及某公司提供的量表，抽样统计护理人员对护理单元分类的主观评价，应用聚类分析法，结合客观业务数据，确定不同护理单元的分类。结果 将全院78个护理单元分为1类至5类共5个类别，1类护理单元9个，2类护理单元21个，3类护理单元22个，4类护理单元12个，5类护理单元14个。结论 调整后的护理单元聚类值作为护理单元分类系数，能够全面、客观、相对公平的反映不同护理单元的护理工作负荷、难度及风险，可以作为医院护理绩效考评奖金分配及科室管理的依据。