基于复杂网络的蛋白质结构域组进化分析

结构域重组与序列复制、变异一起,推动了生命的进化。文章应用复杂网络理论比较分析了不同复杂程度的真核生物体中蛋白质结构域组的进化规律。结果表明大量的结构域(约34%)被基因组共享,而结构域的相邻二元组合却具有很大的物种特异性。结构域组合网络呈现无尺度特性,其幂率分布及平均连接度在一定程度上反映了物种的复杂性;网络的聚集系数远高于相同度分布的随机网络(P=0.0096),聚集系数与度呈现幂率分布,这说明网络服从模块化层次式组织规律。最后以人类基因组为例,初步探索了网络模块与功能的关系,发现网络模块中的结构域具有不同程度的功能一致性。     

经皮肾镜钬激光碎石治疗肾结石的护理配合

随着各种先进设备的应用,泌尿系结石的治疗也朝着微创方面发展。钬激光通过光纤传递,汽化结石表面的水形成空泡,将能量传递至结石,引起结石碎裂,能安全有效地粉碎泌尿系结石。经皮肾穿刺取石术是近年来开展治疗肾输尿管上段结石的新技术,它具有损伤小、出血少、恢复快、并发症少等优点。     

内容和运动方向感知计算模型

对视野中的物体及运动方向进行感知是视觉感知的基本问题之一,较高级视皮层从V1区的简单细胞开始分为两个通路：“What通路”和“Where通路”．前者对物体的形状、颜色、纹理等内容感知,后者对空间运动速度和方向等感知．本文利用仿脑视觉信息处理计算结构,研究视觉内容和运动方向上的感知计算模型、计算机理和学习算法．该计算模型是一个三层的神经网络,第一层是视觉信号输入层,用于接收外界图像刺激．第二层是神经信息内部表象层,与第一层的网络联结是通过神经元稀疏表象原理自适应形成神经元的感受野．为此,引入Kullback_Leibler散度描述神经元响应的独立性,极小化该代价函数导出网络联结权值的学习算法．从自然图像块中学习得到图像基函数,这些基函数具有局部性、朝向性和带通滤波性．这些性质与生理实验结果中的V1区简单细胞感受野特征相吻合．将这些基函数作为神经元的感受野,并在第三层对较高级视皮层的内容感知和运动感知神经元进行建模．在理想刺激中加入一定量的噪声后,该模型对内容和运动方向的感知仍有较高的准确率和较好的鲁棒性．最后给出的实验仿真结果说明模型的可行性和学习算法的简单有效性．     

基因组分型技术的发展和应用

伴随着人类基因组计划、人类单倍型图谱和人类拷贝数变异图谱的完成, 基因分型技术获得了长足的发展, 同时促进了对复杂性状疾病的研究. 本文结合国家人类基因组南方研究中心的发展和研究项目, 介绍了目前国际上广泛应用的几种基因分型技术, 及国内外复杂性状疾病遗传研究的突破和进展.     

复杂生态系统稳定性的补偿模糊神经网络建模

以环境因素、植物功能群、植食动物功能群、捕食动物功能群和分解者功能群为5组输入。建立实现模糊参数自动调整和补偿模糊推理的复杂生态系统稳定性的补偿模糊神经网络模型,评价复杂生态系统的稳定性,通过计算机仿真,验证了所提出的方法具有学习效率高、评价精确度高、泛化能力强的优点．     

复杂疾病关联研究中的若干问题

关联研究广泛应用于阐述心血管疾病、2型糖尿病、原发性高血压和肥胖等人类复杂疾病的遗传学基础。文中就关联研究中混杂的识别与控制、候选基因的选择、中间表型的应用、单体型分析方法的应用,以及结果的判定等问题进行了讨论。人群分层是关联研究混杂的主要来源之一。选择患者亲属做对照、基因组对照和选择遗传背景较为一致的隔离人群都可以减少混杂。候选基因的选择可以基于与疾病间的生物学联系或是该基因与疾病某已知相关基因的同源性。适当的应用中间表型和单体型分析方法可以增加关联研究有意义发现的机会。本文认为,优化研究设计、足够的样本含量、正确选择对照,结合先进的数据分析方法,关联研究必将为困扰人类的常见疾病的易感性研究发挥更大的作用。     

任务负载程度影响内源性注意与外源性注意的相互作用

目的:探讨内源性注意与外源性注意的相互作用机制.方法采用Yantis的非突现范式.结果实验一研究发现在较简单的探测任务下,内源性注意与外源性注意没有交互作用,互相独立.实验二研究发现在较复杂的辨别任务下二者存在交互作用.结论二个实验结果验证了Berger等人提出的理论,即任务负载程度决定内源性注意与外源性注意的相互作用,在低负载即简单任务下,内源性注意与外源性注意互相独立,而在高负载即复杂任务下,二者才存在相互作用.     

遗传风险评分在复杂疾病遗传学研究中的应用

心血管疾病、2型糖尿病、原发性高血压、哮喘、肥胖、肿瘤等复杂疾病在全球范围内流行,并成为人类死亡的主要原因。越来越多的人开始关注遗传易感性在复杂疾病发病机制中的作用。至今,与复杂疾病相关的易感基因和基因序列变异仍未完全清楚。人们希望通过遗传关联研究来阐明复杂疾病的遗传基础。近年来,全基因组关联研究和候选基因研究发现了大量与复杂疾病有关的基因序列变异。这些与复杂疾病有因果和(或)关联关系的基因序列变异的发现促进了复杂疾病预测和防治方法的产生和发展。遗传风险评分(Genetic risk score,GRS)作为探索单核苷酸多态(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)与复杂疾病临床表型之间关系的新兴方法,综合了若干SNPs的微弱效应,使基因多态对疾病的预测性大幅度提升。该方法在许多复杂疾病遗传学研究中得到成功应用。本文重点介绍了GRS的计算方法和评价标准,简要列举了运用GRS取得的系列成果,并对运用过程中所存在的局限性进行了探讨,最后对遗传风险评分的未来发展方向进行了展望。     

同卵双胞胎在复杂性状DNA甲基化调控机制研究中的应用

同卵双胞胎来源于同一个受精卵,DNA序列基本一致,但在某些重要表型上如复杂疾病,并不完全一样。利用表型不一致的同卵双胞胎进行研究,能在遗传背景、母体效应、年龄性别效应等一致的基础上,深入研究分析复杂性状的表观调控机制。而DNA甲基化是最为稳定的一类表观遗传修饰。在人类中,利用同卵双胞胎对印记异常疾病、精神类疾病、自身免疫病及癌症等疾病的DNA甲基化调控研究已经揭示了多个致病基因,为研究疾病的表观调控以及表观遗传学药物的应用打下了基础。本文着重对同卵双胞胎DNA甲基化状态、DNA甲基化遗传力计算以及复杂性状DNA甲基化调控的研究应用及其进展展开综述,以期为复杂性状表观调控机制研究提供借鉴和参考。     

VCTDSA联合CT灌乌司他丁联合硝苯地平控释片对ESWL术后肾功能的保护作用

目的：观察乌司他丁（商品名天普洛安）和硝苯地平控释片（商品名拜新同）对体外冲击波碎石术（ESWL）所致急性肾功能损害的保护作用。方法：将80例接受ESWL治疗的肾结石患者,随机分为天普洛安组、拜新同组、天普洛安和拜新同联合组以及对照组,每组20例。检测并比较ESWL前1d和后1、3、5d患者尿丙二醛（MDA）、N-乙酰-β-1）．氨基葡萄糖苷酶／肌酐（NAG／Cr）和24h尿B2-微球蛋白（p2-MG）的变化。结果：EWSL术后第1天,对照组MDA、NAG／Cr和β2-MG水平均明显高于术前（P〈0．05）,且随着术后时间的延长,患者MDA、NAG／Cr和β2-MG水平呈逐渐下降趋势,术后第1、3、5天治疗组MDA、NAG／Cr和132．MG数值均明显低于相同时点对照组（P〈0．05）。术后第1、3天,联合用药组MDA、NAG／Cr和[32-MG水平明显低于单独用药的两组（乌司他丁组和拜新同组）（P〈0．05）,第5天联合用药组MDA、NAG／Cr和β2-MG水平与单独用药的两组（乌司他丁组和拜新同组）比较均无明显差异（P〉0．05）,单独用药的两组（乌司他丁组和拜新N组）之间在相同时点MDA、NAG／Cr和β2-MG水平无明显差异。结论：乌司他丁可显著减轻ESWL所致的肾损伤,与钙离子拮抗剂联合用药效果更佳。