"基因电脑克隆"软件SiClone的并行优化研究与实现

生物信息学中,发现、鉴别新基因是承上启下的一步,它既承接了过往如“基因组测序”的工作,又是未来“后基因时代”研究的基石．“基因电脑克隆”是利用计算手段发现、鉴别新基因的方法,SiClone软件实现了“基因电脑克隆”功能．本文对SiClone软件操作的数据库提出并行处理方案,并详述了基于MPI(message passing interface)平台实现的并行优化版本PSiClone．根据已得到的EST数据库,展示了软件并行版PSiClone的运行性能,试验数据库EST序列条数仅仅是NCBI(The National Center for Biotechnology Information)dbEST庞大数据库的很小部分,这也暗示我们软件的并行工作对于大数据库的比较和运算将更有应用前景．     

毛盖图敖包——巴尔虎人的圣山

正270年前,巴尔虎蒙古人的一位德高望重的先哲来到大兴安岭,第一眼看到毛盖图山时就被这大山的气魄所震撼,认定这是圣灵之地,于是设立敖包开始祭祀蒙古人心中至高无上的神——长生天。"长生天"是蒙古民族的最高天神,因蒙古人以"苍天"(苍穹)为永恒神,故谓"长生     

人类基因组及后基因组研究进展及其应用与开发研究现状

人类对自身基因组的研究,随着人类基因组工作草图的绘制完成和对基因功能研究的深入已加快进入了实质性、关键性的开发利用阶段。本文概述了人类基因组及后基因组的研究进展及依此开展基因治疗及基因（组）药物研制等应用开发研究的现状。     

后基因组时代基因功能分析的策略

人类基因组计划的完成标志着生命科学已经开始迈进后基因组时代,大规模基因的功能研究正成为生命科学研究的热点。基因功能的分析方法日趋成熟和多样化,综述了基因敲除、反义技术、“dominantnegative”策略(“显性失活”策略)、基因诱导超表达、RNA干涉以及生物信息学等基因功能分析策略的特异性及其优缺点。     

功能蛋白质组学

科学背景及意义２０世纪中期以来,随着ＤＮＡ双螺旋结构的提出和蛋白质空间结构的解析,开始了分子生物学时代,对遗传信息载体ＤＮＡ和生命功能的体现者蛋白质的研究,成为生命科学研究的主要内容。９０年代初期开始实施的人类基因组计划,在经过各国科学家８年多的努力下,已经取得了巨大的成就,第一个多细胞生物-线虫基因组的ＤＮＡ全序列测定在１９９８年年底已经完成;人类所有基因的部分序列测定（ＥＳＴ）已经完成;...     

“人类基因组计划”自启动至“后基因组计划”的转折

“人类基因组计划”自启动至“后基因组计划”的转折杨焕明（中国医学科学院中国协和医科大学教授）（中国“人类基因组计划”重大项目秘书长）今年是“人类基因组计划”（ＨｕｍａｎＧｅｎｏｍｅＰｒｏｊｅｃｔ,ＨＧＰ）正式提出十周年。对这一可与“曼哈顿原子弹计划”、“阿波罗登月计划”相媲美的创举作一历史性的回顾,纵览十年来这一计划的成果、瞻望这一计划的前景,对于我国抓住机遇,接受挑战是很有必要的。     

湘南地区晚奥陶世的江西笔石(Jiangxigraptus)*

本文对甘肃宝积山盆地中侏罗世植物群地质时代及植物区系进行了探讨, 共统计植物大化石 18 属 53 种, 主要包括银杏纲 10 属 24 种, 真蕨纲 5 属 22 种, 苏铁纲 1 属 3 种, 松柏纲 1 属 2 种, 楔叶纲 1 属 2 种。该植物群在组成特征上表现为银杏类、真蕨类植物繁盛, 其他植物类群相对贫乏。基于该植物群特征与国内其他植物群的对比, 提出其地质时代为中侏罗世 Aalenian 期–Bajocian 期。通过哈曼、欧式距离、罗杰斯–塔尼莫特和索卡尔–施尼斯 4 种方法对宝积山盆地及中国北方其余 11 个中侏罗世植物群进行系统聚类分析, 在此基础上进一步划分了中国北方植物区系。通过计算属、种相似性系数,探讨宝积山邻近植物区系间的亲缘关系, 结果表明宝积山植物区系与同属西北地区的华亭植物区系关系较为亲近。     

代谢物组开拓的生物技术产业

代谢物组分析在为进一步推进人体基因组分析加快实用转化的后基因组研究当中备受注目。哺乳类的代谢产物不仅与基因或者转录产物的数量相比少得多，而且现有的相关知识也比较丰富，还能够实现动态的模拟模式，这也有利于分析的进行。而且，与基因情报相结合，还能够应用于药品的副作用机制以及加工食品的剖析等。     

青海南部奇异蚌动物群生态环境与时代的探讨*

一、前言奇异蚌(Peregrinoconcha)动物群最早发现于云南景星群。近来又相继在青海南部温泉地区(文世宣,1979),西藏东部八宿地区被发现(陈金华等,1983;文世宣,1985)。迄今仅见于东特提斯的云南、藏东和青南中生代地层产出,是一类地方性色彩很浓的区域性双壳类动物群。但对于这一动物群所代表的地层时代、沉积环境颇多争议。1984-1985年。     

滇东曲靖翠峰山群下部花鳞鱼类微体化石的再研究

基于从云南曲靖翠峰山群下部西山村组和西屯组获得的许多花鳞鱼类微体化石新材料,建立1新属包含4新种,1老种。根据新属在形态学和古组织学构造显示的花鳞鱼类志留纪属和泥盆组属的过渡性质,认为曲靖地区含该类鱼化石的地层时代似应为Pridolian中、晚期。曲靖地区志留——泥盆纪界线似应从翠峰山群西屯组中部通过。建立了曲靖地区从Ludiovian到Emsian早期的三个脊椎动物组合。