人类基因组结构变异

基因组结构变异通常是指基因组内大于1 kb的DNA片段缺失、插入、重复、倒位、易位以及DNA拷贝数目变化(CNVs)。人类基因组结构变异涉及数千片段不连续的基因组区域, 含数百万DNA碱基对, 可含数个基因及调控序列, 多种基因功能因此缺失或改变, 导致机体表型变化、疾病易感性改变或发生疾病。对基因组结构变异的研究, 有助于用动态的观点全面分析基因组遗传变异得到整合的基因型, 理解结构变异的潜在医学作用及机体整体功能的复杂性。文章从人类基因组结构变异的类型、研究方法, 对个体表型、疾病及生物进化的影响等方面综合阐述人类基因组结构变异的最新研究进展。     

人类基因组单体型图初步绘就

由美国、中国、日本等国200多位科学家参加的"国际人类基因组单体型图计划(HapMap)"日前取得阶段成果,科学家于26日公布了第一阶段人类基因组单体型图。科学家说,这份描述人类基因组中最常见差异的图谱,将大大促进疾病和人类进化的研究。人类基因组拥有大约     

人类腺病毒分子生物学及用作基因工程载体的特性

首先从分类地位,毒粒结构,基因组结构,基因组转录调节及复制繁殖周期等方面对人类腺发子生物学进展作了概述,然后论述了人类腺病毒用作基因工程载体的特性。人类腺病毒不仅是用作研究真核基因表达调控机制的良好模型,而且是基因工程的重要载体,人类腺病毒载体除具有组建多价重组口服活疫苗的前景外,还可以作为一种表达载体获得高水平的外源蛋白,研究组织行异性表达和建立稳定的细胞系,以及在机体组织中转移表达报告基因以治     

人类基因组研究新进展

人类基因组研究新进展柴建华（复旦大学遗传学研究所人类基因组实验室上海２００４３３）人类基因组研究在全世界范围内展开已经是第八个年头了。研究任务分为两个：一是染色体ＤＮＡ的大片段克隆、排序和核耷酸顺序分析;另一个是全部基因的顺序识别及功能研究,包括突变...     

人类基因组SNPs的研究现状及应用前景

基因组DNA是生物体各种生理、病理性状的物质基础,人类DNA序列变异约90%表现为单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs),这是一种常见的遗传变异类型,在人类基因组中广泛存在,被认为是人类疾病易感性和药物反应的决定性因素。本文主要介绍了SNPs的分类及特点、人类基因组SNPs的研究现状、SNPs在实践中的应用,以及SNPs在遗传作图、医药、遗传易感性、个体化医疗等方面的研究前景,并探讨了当前SNPs研究中存在的问题。     

基因组分析与人类X染色体物理图谱

基因组分析与人类Ｘ染色体物理图谱柴建华（复旦大学遗传学研究所上海２００４３３）人类基因组分析自１９８７年首先在美国开始以来,已经过了６年多时间。美国已经有了１４个人类基因组研究中心,英、法、德、日等国及我国也投入了这项研究,已经取得了长足进展。人类基因组研究的总任务有两个：１）“读出”人类基因组全部ＡＴＣＧ语言,即全基因组核苷酸顺序测定;２）“读懂”人类基因组全部ＡＴＣＧ语,即人类全部基因的编码及功能的研究。     

人类疱疹疾病6型的分子生物学研究进展

对人类疱疹病毒６型（ＨＨＶ－６）的分子生物学性质及特点的研究,有利于人们在分子水平上加强对这种病毒的防治和对其科研价值的认识,本文综述了近几年来国外对ＨＨＶ－６基因组结构,病毒ＤＮＡ复制、转录及反式激活作用及病毒蛋白等方面的研究进展。     

人类Y染色体常染色质部分DNA YAC重叠克隆构建

人类基因组研究的目标在于人类基因组全部DNA的核苷酸顺序的测定,及在此基础上的对所有基因的编码及其生化功能的研究。全基因组DNA的完全的物理图谱构成,包括全基因组DNA的大片段克隆,及覆盖完整基因组的克隆重叠排序是达成这一目标的首要步骤。     

人类基因组研究进展及其产业化前景

人类基因组研究关系到人类生存与健康的各个方面 ,成为医药生物技术产业创新的重要源头 ,将产生巨大的社会效益和经济效益。 2 0世纪末启动的人类基因组计划被公认为是生命科学发展史上的里程碑 ,随着人类基因组、水稻基因组、拟南芥基因组及其它重要微生物等 5 0多种生物基因组全序列测定工作的完成 ,目前国际基因组研究开发的总体趋势已发生了变化 ,功能基因组研究成为竞争的焦点。我国在人类基因组研究方面已取得令人瞩目的成绩 ,如在世界上首次克隆了人神经性高频耳聋、遗传性乳光牙等一批疾病基因 ,收集、保存了一批宝贵的遗传资源 ,建立了国家级的、在国际上具有初步竞争实力的人类基因组研究基地等。综述了近年来人类基因组研究、开发现状及我国在该领域所具备的一些工作基础 ,并对加速我国人类基因组研究提出了一些建议。     

单卵子高精度全基因组测序首度完成——或对人类生殖史产生里程碑式影响

<正>12月20日,《细胞》杂志发布世界首个人类女性个人遗传图谱。由北京大学生物动态光学成像中心汤富酬研究组、谢晓亮研究组和北京大学第三医院乔杰研究组共同组成的团队,应用单细胞基因组高通量测序技术,首次详细描绘了人类单个卵子的基因组,并将这种方法应用到人类体外辅助生殖研究中。据悉,通过对单个卵子全基因组进行高精度分析,研究人员成功地对二倍体的人类基因组进行分型,确定了卵母细胞减数分裂中的同源重组位点,首次建立了人类女性     

荧光标记的染色体原位杂交及其在人类基因组研究中的应用

FISH技术是80年代开始发展起来的一种新的定位技术.在人类基因组研究中得到了广泛的应用.通过中期染色体的FISH可以进行SCP,Cosmid和YAC的染色体定位,嵌合克隆的鉴别;通过间期核的FISH可以在50kb的分辨率下进行基因作图;最新的研究进展已可以进行伸展的染色质丝(chromatin fibre)的FISH,直接测量基因的长度,从而达到高精度基因作图的目的.总之,随着FISH技术本身的发展,它将在人类基因组研究中发挥更大的作用.     

Evolution of MIR Elements Located in the Coding Regions of Human Genome

A search for new members of the mammalian interspersed repeat (MIR) family has been done over the coding regions of human genome from GenBank-116. Only 254 nucleotide sequences contained MIRs in coding regions, of which 45 MIR copies were unknown before, including 17 that occurred in translated gene regions. The program developed by the authors has been demonstrated to surpass the CENSOR program in the search power. The evolution of the MIR copies located in translated regions of human genome is discussed.     

人类人工染色体作为转基因载体的应用前景

自1997年首次成功构建人类人工染色体(human artificial chromosome,HAC)以来,对其理论、方法学问题的研究一直就是人们关注的焦点,并引起了科学家们的极大兴趣,目前已能采用不同的方法获得多种类型的HAC。与酵母人工染色体（YAC）、细菌人工染色体（BAC）等相比,HAC不整合到细胞的基因组中,以一个独立的功能性染色体单位而存在,并在细胞中进行正常的有丝分裂和减数分裂。迄今的研究表明：HAC可以携带大片段基因组DNA,是研究人类基因表达和调控、染色体功能基本单元的重要工具,也是建立HAC动物模型的重要手段。在未来的基因治疗方面有着广阔的应用前景。     

VH gene segments in the mouse and human genomes

We have examined the mouse genome sequence to determine its VH gene segment repertoire. In all, 141 segments are mapped to a 3 Mb region of chromosome 12. There is evidence that 92 of these are functional in the mouse strain used for the genome sequence, C57BL/6J; 12 are functional in other mouse strains, and 37 are pseudogenes. The mouse VH gene segment repertoire is therefore twice the size of that in humans. The mouse and human loci bear no large-scale similarity to each other. The 104 functional segments belong to one of the 15 known sequence subgroups, which have been further clustered into eight sets here. Seven of these sets, comprising 101 sequences, are related to five of the human VH families and have the same canonical structures in their hypervariable regions. Duplication of members of one set in the distal half of the locus is mainly responsible for the larger size of the mouse repertoire. Phylogenetic analysis of the VH segments indicates that most of the sequences in the human and mouse VH loci have arisen subsequent to the divergence of the two organisms from their common ancestor.     

人β_2m转基因小鼠的制备及鉴定(英文)

 制备人 β2m转基因小鼠 ,研究HLA B2 70 4基因的表达 .应用显微注射将人 β2m基因注入C5 7BL 6×昆明鼠和昆明鼠×昆明鼠F1代受精卵 .出生动物及其后代经PCR筛选 ,采用斑点杂交和Southern杂交对阳性鼠基因组DNA标本进行进一步鉴定和测定整合拷贝数 ,利用RT PCR检测阳性鼠中人 β2m转基因的表达 .6只原代仔鼠及 7只它们的下一代鼠 (F1)带有人 β2m基因 .由微注射基因后移卵出生的 86只小鼠中 ,C5 7BL 6×昆明鼠杂交仔鼠 35只 ,其中 4只阳性 (11 4 % ) ,昆明鼠×昆明鼠杂交仔鼠 5 1只 ,其中 2只阳性 (3 9% ) ,含有人 β2m基因的原代鼠×昆明鼠杂交仔鼠 2 0只 ,其中 7只阳性 .整合的转基因均为单拷贝 .Southern杂交证实上述阳性鼠确有转基因整合 .阳性鼠的皮肤、结肠、睾丸和脾脏组织中均有人β2m转基因mRNA的表达 .在转基因动物制备中 ,C5 7BL 6×昆明鼠F1代明显优于昆明鼠×昆明鼠F1代 .与人HLA B2 70 4基因相比 ,人 β2m基因不易整合 ,其整合率与整合拷贝数均较低 .得到的人 β2m转基因小鼠能够将人 β2m基困传给下一代 ,并可与人HLA B2 70 4转基因鼠交配 ,研究它的致病性     

基因功能研究方法浅介

随着人类基因组计划的进展,数据库中积累了越来越多未知功能的基因序列,分析这些基因的功能将成为基因组计划的主要任务。本介绍了几种研究特定基因功能的方法及程序。     

综述:基于人多潜能干细胞的人类疾病研究与治疗

人多潜能干细胞(hPSC)包括人胚胎干细胞(hESC)和诱导性多潜能干细胞(hiPSC),理论上具有分化成为人类所有细胞类型的能力.基于hPSC的基因打靶技术,不但可以纠正人基因组中的遗传突变用于细胞治疗,还可以通过反向遗传学的方式向hPSC引入疾病特异的突变.将携带人类疾病遗传基因的hPSC分化为特定的细胞类型,在理论上可以在体外模拟人类疾病的发生,研究人类疾病发生的机理,并建立体外筛选平台寻找治疗性药物.基因编辑和干细胞技术的结合将为人类疾病的机制研究和再生医学治疗带来革命性的突破.     

基因表达谱聚类/分类技术研究及展望

随着人类及多种模式生物全基因组测序基本完成,人类基因组计划的研究进入后基因组时代.后基因组时代研究的焦点已经从测序转向功能研究。聚类/分类技术作为分析基因表达谱和识别基因功能的重要工具之一,近年来获得很大的发展。对目前基因表达谱聚类/分类技术及它们的发展,进行了综述性的研究,分析了它们的优缺点,结合我们的研究,提出了解决问题的思路和方法,为基因表达谱的进一步研究提供了新的途径。     

The Human Obesity Gene Map: The 2004 Update

This paper presents the eleventh update of the human obesity gene map, which incorporates published results up to the end of October 2004. Evidence from single‐gene mutation obesity cases, Mendelian disorders exhibiting obesity as a clinical feature, transgenic and knockout murine models relevant to obesity, quantitative trait loci (QTLs) from animal cross‐breeding experiments, association studies with candidate genes, and linkages from genome scans is reviewed. As of October 2004, 173 human obesity cases due to single‐gene mutations in 10 different genes have been reported, and 49 loci related to Mendelian syndromes relevant to human obesity have been mapped to a genomic region, and causal genes or strong candidates have been identified for most of these syndromes. There are 166 genes which, when mutated or expressed as transgenes in the mouse, result in phenotypes that affect body weight and adiposity. The number of QTLs reported from animal models currently reaches 221. The number of human obesity QTLs derived from genome scans continues to grow, and we have now 204 QTLs for obesity‐related phenotypes from 50 genome‐wide scans. A total of 38 genomic regions harbor QTLs replicated among two to four studies. The number of studies reporting associations between DNA sequence variation in specific genes and obesity phenotypes has also increased considerably with 358 findings of positive associations with 113 candidate genes. Among them, 18 genes are supported by at least five positive studies. The obesity gene map shows putative loci on all chromosomes except Y. Overall, >600 genes, markers, and chromosomal regions have been associated or linked with human obesity phenotypes. The electronic version of the map with links to useful publications and genomic and other relevant sites can be found at http:obesitygene.pbrc.edu .     

基于人多潜能干细胞的人类疾病研究与治疗

人多潜能干细胞(hPSC)包括人胚胎干细胞(hESC)和诱导性多潜能干细胞(hiPSC),理论上具有分化成为人类所有细胞类型的能力.基于hPSC的基因打靶技术,不但可以纠正人基因组中的遗传突变用于细胞治疗,还可以通过反向遗传学的方式向hPSC引入疾病特异的突变.将携带人类疾病遗传基因的hPSC分化为特定的细胞类型,在理论上可以在体外模拟人类疾病的发生,研究人类疾病发生的机理,并建立体外筛选平台寻找治疗性药物.基因编辑和干细胞技术的结合将为人类疾病的机制研究和再生医学治疗带来革命性的突破.