Construction and characterization of different MutS fusion proteins as recognition elements of DNA chip for detection of DNA mutations

Three MutS fusion systems were designed as the mutation recognition and signal elements of DNA chips for detection of DNA mutations. The expression vectors containing the encoding sequences of three recombinant proteins, Trx-His6-GFP-(Ser-Gly)6-MutS (THGLM), Trx-His6-(Ser-Gly)6-Strep tagII-(Ser-Gly)6-MutS (THLSLM) and Trx-His6-(Ser-Gly)6-MutS (THLM), were constructed by gene slicing in vitro. THGLM, THLSLM and THLM were then expressed in Escherichia coli AD494(DE3), respectively. SDS-PAGE analysis revealed that each of the expected proteins was approximately 30% of the total bacterial proteins. The recombinant proteins were purified to the purity over 90% by immobilized metal (Co2+) chelation affinity chromatography. Bioactivity assay indicated that three fusion proteins retained the mismatch-binding activity and the functions of other fusion partners. DNA chips arrayed both mismatched and unpaired DNA oligonucleotides as well as rpoB gene from Mycobacterium tuberculosis were prepared. THGLM, THLSLM and THLM that was labeled with Fluorolinktrade mark Cy3 reactive dye, were then used as both mutation recognition and labeling elements of DNA chips. The resulting DNA chips were used to detect the mismatched and unpaired mutations in the synthesized oligonucleotides and single base mutation in rpoB gene of M. tuberculosis that is resistant to rifamycin.     

果寡糖和甘露寡糖对断奶仔猪免疫机能的影响

研究探讨了果寡糖和甘露寡糖对断奶仔猪免疫机能的影响。实验采用随机区组设计法将48头健康、体重一致的35日龄断奶杜洛克仔猪分为4组,每组3次重复,每个重复4头进行为期28天的饲养实验。4个处理组分别为:基础日粮 0.5%果寡糖(FOS组)、基础日粮 0.3%甘露寡糖(MOS组)、基础日粮 0.45%果寡糖 0.25%甘露寡糖(F M组)、基础日粮 75 mg/kg金霉素 40 mg/kg洛克沙生(ABT组)。实验结果表明:(1)寡糖组免疫器官指数较ABT组大(P>0.05)。(2)在断奶后第7天,FOS组(0.32±0.49)、MOS组(0.32±0.04)和F M组(0.32±0.07)均较ABT组(0.20±0.01)显著提高了血清免疫球蛋白A(IgA)的浓度(P<0.05),同时FOS组(3.50±0.49)较ABT组(2.68±0.47)显著提高了IgG浓度(P<0.05);F M组显著提高了断奶后第21天IgG浓度(P<0.05);MOS组显著提高了断奶后第21天IgM浓度(P<0.05)。(3)与ABT组相比,FOS显著提高了断奶后第7天胸腺(21.33±6.03对37.33±4.04)、脾脏(19.67±2.08对30.33±8.73)、淋巴结(24.67±4.16对37.67±2.52)CD4 T淋巴细胞百分数(P<0.05);FOS组(21.33±4.04对32.00±5.29)、MOS组(21.33±4.04对37.33±3.21)、F M组(21.33±4.04对32.00±3.60)显著提高了断奶后第28天胸腺CD4 T淋巴细胞百分数(P<0.05);MOS组(20.67±3.51对29.67±5.51)显著提高了断奶后第7天胸腺CD8 T淋巴细胞百分数;F M组(17.00±1.00对22.67±3.06)显著提高了断奶后第7天脾脏CD8 T淋巴细胞百分数(P<0.05);各寡糖组对断奶后第28天CD4 、CD8 T淋巴细胞百分数影响不显著(P>0.05);ABT组(34.33±5.03)在断奶后第7天较F M组(20.67±6.43)显著提高了淋巴结CD8 T淋巴细胞百分数(P<0.05);在断奶后第7天,FOS组(1.42±0.32)、MOS组(1.52±0.46)、F M组(1.51±0.30)淋巴结CD4 与CD8 比值显著(P<0.05)大于ABT组(0.71±0.03);在断奶后第28天,FOS组(1.36±0.21)和MOS组(1.34±0.16)脾脏CD4 与CD8 比值显著(P=0.01)大于ABT组(0.94±0.29),除此之外,各寡糖组CD4 与CD8 比值较寡糖组大(P>0.05),寡糖组间差异不显著。     

牛肝菌类一新种——蔚青华牛肝菌

蔚青华牛肝菌,其盖表有绒毛,柄等粗而细长,具棱纹无网纹,担孢子长短兼存,6–16μm兼之。本种庆祝著名真菌学家蔚青王云章教授,欣逢公百年华诞,其对西南菌学研究和人才培养,屡蒙厚贶,感不胜言,谨以此名,敬寄慕念。     

金鱼藻对铜绿微囊藻生长的抑制作用研究

研究了金鱼藻对铜绿微囊藻生长的抑制效应。结果表明：高浓度的金鱼藻种植水抽滤液和植株研磨水提液对铜绿微囊藻的生长有极明显的抑制作用;低浓度则几乎没有抑制作用。同一浓度下,金鱼藻植株研磨液的抑制效应比种植水更为明显,抑制效应持续时间也更长。20℃培养下的金鱼藻,其植株研磨液的抑制效应最明显。高浓度的嫩枝嫩叶部位的金鱼藻植株研磨液对铜绿微囊藻的生长有更明显的抑制作用,低浓度的老茎老叶部位的金鱼藻植株研磨液对其生长则表现出一定的促进作用。     

海南霸王岭不同森林类型附生兰科植物的多样性和分布

附生兰科植物是热带林附生植物的主要类群之一,对于维持热带林生态系统的物种多样性及生态功能具有重要的作用。以海南岛霸王岭国家级自然保护区内的6种热带原始林类型(热带季雨林、低地雨林、热带针叶林、山地雨林、山地常绿林及山顶矮林)中的附生兰科植物为研究对象,通过样带调查(每个森林类型设置12个10m×50m的样带,记录每个样带内胸径(DBH)≥5cm的树木及藤本上附生兰科植物的物种名称、株数及附生位置)分析了附生兰科植物的物种多样性、附生位置及其在不同森林类型中的分布规律。结果表明:1)3.6hm2森林调查样带内共记录到附生兰科植物9634株,分属于26属60种;2)除趋势对应分析(DCA)结果表明,6种森林类型中的附生兰科植物可分成5组(其中,山地常绿林与山顶矮林内的附生兰科植物归为一组);3)分布海拔范围相临近的森林类型的附生兰科植物具有较高的相似性,山地常绿林和山顶矮林附生兰科植物的相似性最高(88.9%);4)6种森林类型中,较高海拔的3种森林类型(山地雨林、山地常绿林和山顶矮林)中,附生兰科植物的丰富度和多度均显著高于其在较低海拔的3种森林类型(热带季雨林、低地雨林和热带针叶林),其中,附生兰科植物在山地常绿林内的丰富度和多度均最高;5)热带季雨林、低地雨林、热带针叶林及山地雨林内,宿主冠区附生兰科植物的多度均高于干区;山地常绿林内两者之间无显著差异;而山顶矮林干区的附生兰科植物的多度高于冠区;6)调查木上附生兰科植物的发生率在高海拔森林类型均高于其在低海拔森林类型,各森林类型内附生兰科植物的多度及物种丰富度与宿主胸径均存在显著正相关关系。     

Potassium Channel Modulation by a Toxin Domain in Matrix Metalloprotease 23

Peptide toxins found in a wide array of venoms block K⁺ channels, causing profound physiological and pathological effects. Here we describe the first functional K⁺ channel-blocking toxin domain in a mammalian protein. MMP23 (matrix metalloprotease 23) contains a domain (MMP23_TxD) that is evolutionarily related to peptide toxins from sea anemones. MMP23_TxD shows close structural similarity to the sea anemone toxins BgK and ShK. Moreover, this domain blocks K⁺ channels in the nanomolar to low micromolar range (Kv1.6 > Kv1.3 > Kv1.1 = Kv3.2 > Kv1.4, in decreasing order of potency) while sparing other K⁺ channels (Kv1.2, Kv1.5, Kv1.7, and KCa3.1). Full-length MMP23 suppresses K⁺ channels by co-localizing with and trapping MMP23_TxD-sensitive channels in the ER. Our results provide clues to the structure and function of the vast family of proteins that contain domains related to sea anemone toxins. Evolutionary pressure to maintain a channel-modulatory function may contribute to the conservation of this domain throughout the plant and animal kingdoms.     

柞蚕感染微孢子虫后血淋巴免疫应答蛋白质的分离与鉴定

了解柞蚕Antheraea pernyi感染微孢子虫初期血淋巴内免疫系统及刺激应答相关蛋白质种类, 本研究以柞蚕5龄雌幼虫的起蚕（结束4眠, 刚完成蜕皮的幼虫）添食柞蚕微孢子虫Nosema pernyi为材料, 对感染后血淋巴利用SDS-PAGE进行分离后, 利用LC-MS/MS质谱技术和蛋白质组学分析对差异蛋白质条带进行鉴定。结果显示： 感染微孢子虫144 h后, 血淋巴中分子量约为44 kD （AP44）和28 kD （AP28）的蛋白质条带表达量增高。质谱分析AP28和AP44蛋白质条带样品, 共鉴定117个不重复蛋白质, 其中2个样品共有蛋白质12个, AP28独有蛋白质52个, AP44独有蛋白质53个。对质谱数据利用COG数据库进行搜寻鉴定, 显示AP28和AP44的鉴定蛋白质中涉及柞蚕免疫系统及刺激应答生物过程的蛋白质共有29个, 其中AP28中包括热激蛋白、 泛素样蛋白、 泛素结合酶E2、 保幼激素环氧水解酶、 微管结合蛋白、 溶菌酶、 ADP-核糖基化因子、 防御蛋白、 肽聚糖识别蛋白等15个, AP44中包括DRK、 酚氧化酶原、 类免疫球蛋白等10个; 二者共有热激蛋白hsp21.4、 酚氧化酶原、 抗菌肽等4个。本研究结果可以为今后研究柞蚕对微孢子虫的免疫应答及防御机制提供参考。     

Analysis of genetic polymorphism of Athetis lepigone (Lepidoptera:Noctuidae ) populations from China based on mtDNA CO Ⅰ gene sequences

二点委夜蛾Athetis lepigone 是2005年首次在河北省发现危害夏玉米苗的新害虫,2011年7月在河北、河南、山东、山西、安徽和江苏6省47市夏玉米苗期大面积暴发成灾,严重威胁玉米生产.为了从种群水平探讨该虫暴发成灾的机制,我们通过分析线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ (mtCO Ⅰ)基因序列来研究不同地区二点委夜蛾种群的进化关系.本研究采集了河北、河南、山东和山西等地的19个不同地理种群样本,用同源序列比对的方法分析样本mtCO Ⅰ基因片段,利用DnaSP 5.0软件和Arlequin 3.5软件对不同地理种群间的mtCO Ⅰ单倍型多样性分析和Tajima's D中性检测,建立了单倍型邻接(N-J)系统发育进化树和单倍型网络图.结果表明,在203头个体的658 bp mtCO Ⅰ基因片段中,得到17种单倍型和18个变异位点,河北省的二点委夜蛾的单倍型多态性最丰富,而河南、山东和山西3省采集的二点委夜蛾样品其单倍型均有与河北种群单倍型一致的类型.二点委夜蛾不同地理种群间基因流水平较高,种群间没有明显的遗传分化,并且在较近的历史时期未经历明显的种群扩张.