2003～2007年中国风疹病毒基因特征分析

本研究用Vero细胞或Vero/SLAM细胞从我国10个省(直辖市、自治区,下同)2003～2007年风疹暴发和散发病例的咽拭子标本中分离到57株风疹病毒,用RT-PCR方法扩增了57株风疹病毒E1基因1 107个核苷酸的片段,并对该PCR产物进行序列测定和分析.结果提示,在基于WHO基因定型靶序列739个核苷酸片段构建的基因亲缘关系树上,其中55株风疹病毒株属于1E基因型,相对于其他国家的1E基因型,形成一个独立分支;另外2株风疹病毒属于2B基因型.57株风疹病毒大部分核苷酸的突变为无义突变,氨基酸序列高度保守,除了2株风疹病毒在E1蛋白血凝抑制和中和位点区域第212位氨基酸由Thr变为Ser,其他病毒株均无重要抗原位点的改变;所有我国已分离到的1E基因型风疹病毒在E1蛋白第338位氨基酸共享突变位点(Leu338→Phe338),而其他基因型以及其他国家的1E基因型风疹病毒在该位点均未发生突变,提示该氨基酸(Phe338)可能是我国1E基因型风疹病毒所特有.2003～2007年在我国10个省均分离到1E基因型,而2B基因型只在2006年从四川省的越南输入病例中分离到,提示1E为绝对优势基因型,2B基因型为输入基因型.与1979～1984年和1999～2002年我国流行的风疹基因型不同,发生了基因型的更替,近年我国风疹的流行是由1E基因型为主的风疹野病毒的多个传播链引起.     

污染环境下单种群模型生存阈值

本论文研究了污染环境下毒素对单种群生存的影响。在环境容纳量较小的假设下建立了生物种群模型,在该模型中不但考虑了环境毒素浓度对生物个体生存的影响,还考虑了生物个体从食物链中吸收的毒素对其影响。通过研究得到种群一致持续生存和若平均持续生存的充分条件,同时得到种群持续生存依赖于模型参数和生物个体体内毒素净化率的某些充分条件．     

IL-18通过MyD88依赖信号途径调控CSF-1表达

IL-18是IL-1家族的一个成员,最初发现被命名为IFN-γ诱导因子.现在研究表明,IL-18是炎症反应的重要标志,参与许多慢性炎症和自身免疫性疾病炎性反应.证明了IL-18在JurkatT淋巴细胞的炎症反应中能够调节CSF-1的表达,其信号机制是IL-18通过MyD88-NF-κB-CSF-1信号途径上调CSF-1的基因转录.     

文蛤的生物沉积和呼吸排泄过程及其在双台子河口水层-底栖系统中的耦合作用

为揭示河口埋栖性双壳贝类优势种类在水层——底栖系统中的生态耦合作用,利用生物沉积物捕集器和封闭式代谢瓶,于双台子河口现场研究了文蛤主要生理生态过程如生物沉积速率、耗氧率、排氨率和排磷率的季节变化。结果表明,文蛤的生物沉积速率、耗氧率、排氨率及排磷率均具有明显的季节变化:夏季最高,冬季最低。二龄及三龄文蛤个体的生物沉积速率周年变化分别为0.02—0.30 g-1个-1d-1、0.06—0.60 g-1个-1d-1;耗氧率变化分别为0.45—16.64 mg-1个-1d-1、1.03—30.51 mg-1个-1d-1;排氨率季节变化分别为0.001—0.14 mg-1个-1d-1、0.002—0.28 mg-1个-1d-1;排磷率季节变化分别为0.002—0.069 mg-1个-1d-1、0.003—0.16 mg-1个-1d-1。文蛤的生物沉积速率及呼吸排泄速率均受龄期制约:在同一季节,文蛤的单位个体生物沉积速率及呼吸和排泄速率均表现为二龄三龄。方差分析显示,季节、龄期及两者交互作用对文蛤生物沉积速率、耗氧率、排氨率及排磷率均有显著影响。基于不同季节双台子河口文蛤生物量(0.67个/m2、2.4 g/m2),估算出文蛤种群每年向该河口排放大约5321.90 t生物沉积物(干重)、1.43 t NH+4-N和0.93 t PO3-4-P,并且消耗大约221.59 t O2。研究结果表明,文蛤通过生物沉积及呼吸排泄作用,大大加强了双台子河口沉积物-水界面的物质交换通量,在双台子河口水层-底栖系统耦合作用中扮演着重要生态角色。     

双源CT 冠状动脉血管成像诊断心肌桥的价值探讨

目的：研究双源CT 冠状动脉血管成像诊断心肌桥的临床价值。方法：选择260 例具有典型心前区不适的患者进行双源CT 冠脉血管成像检查,观察其发生部位,测量其长度和深度并进行分析。结果：260 例受检患者中,62例共70 段存在心肌桥,检出率 达20.76%,高于文献报道的检出率18.2%。所有心肌桥均发生于左前降支,其中近段17 段(24.4%),中段43 段(61.4%),远段10 段 (14.2%)。心肌桥平均长度为15.8± 6.4mm,深度为1.4± 0.85mm。结论：双源CT 冠状动脉血管成像因其便捷无创,不受心率严格 限制且价格低廉可作为心肌桥筛查的理想检查手段。     

番茄SlMYB86基因的原核表达及缺氮胁迫下的表达分析北大核心CSCD

MYB转录因子参与植物细胞形态与模式建成、次级代谢的调控以及生物和非生物胁迫应答等反应。该研究采用RT-PCR方法扩增了番茄SlMYB86基因,并进行了聚类分析和保守域序列分析,构建原核表达载体和诱导纯化蛋白,利用qRT-PCR和Western blot检测SlMYB86在缺氮复氮下的表达水平,为深入探究番茄MYB86转录因子在缺氮胁迫下的功能奠定基础。结果表明:(1)番茄SlMYB86与番茄SlMYB26在进化树上属于同一分支,亲缘关系较近,且SlMYB86含有2个Myb_DNA-binding保守结构域,属于R2R3-MYB型转录因子。(2)qRT-PCR分析发现,SlMYB86基因在番茄根和叶中均有表达,缺氮胁迫下SlMYB86表达较对照显著增加。(3)成功构建pET-28a-SlMYB86原核表达载体并转化E.coli BL21(DE3),SDS-PAGE和Western blot结果表明,SlMYB86蛋白的最佳诱导条件为0.5 mmol/L的IPTG、37℃诱导8 h;目的蛋白相对分子量大约为41 kD,与预期大小一致,并获得较高纯度的SlMYB86原核蛋白。(4)将纯化的SlMYB86蛋白免疫小白鼠获得抗体,利用该抗体进行Western blot分析发现,番茄中SlMYB86蛋白在缺氮胁迫后表达上调,表明番茄SlMYB86基因参与了缺氮胁迫的应答。     

Cofilin蛋白功能及活性调节

Cofilin是普遍存在于真核细胞的一种肌动蛋白结合蛋白. Cofilin的基本功能是在细胞内结合和解聚F肌动蛋白（F-actin）,其活性是通过磷酸化、去磷酸化、磷酸肌醇、pH改变等进行调节.cofilin介导了细胞内的信号途径,从而调节肌动蛋白骨架的重组,对肌肉形态发育起到重要作用.目前,在各种有机体中发现了许多特征性的cofilin蛋白同系物.其中鼠和人有2种cofilin蛋白：cofilin-1（non-muscle cofilin）和cofilin-2（muscle cofilin）.本文根据目前对cofilin的研究结果,从cofilin蛋白结构、功能、活性调节、在肌肉发育中的作用及相关疾病等方面进行阐述.     

Invasion in a heterogeneous world: resistance,coexistence or hostile takeover?

We review and synthesize recent developments in the study of the invasion of communities in heterogeneous environments, considering both the invasibility of the community and impacts to the community. We consider both empirical and theoretical studies. For each of three major kinds of environmental heterogeneity (temporal, spatial and invader-driven), we find evidence that heterogeneity is critical to the invasibility of the community, the rate of spread, and the impacts on the community following invasion. We propose an environmental heterogeneity hypothesis of invasions, whereby heterogeneity both increases invasion success and reduces the impact to native species in the community, because it promotes invasion and coexistence mechanisms that are not possible in homogeneous environments. This hypothesis could help to explain recent findings that diversity is often increased as a result of biological invasions. It could also explain the scale dependence of the diversity–invasibility relationship. Despite the undoubted importance of heterogeneity to the invasion of communities, it has been studied remarkably little and new research is needed that simultaneously considers invasion, environmental heterogeneity and community characteristics. As a young field, there is an unrivalled opportunity for theoreticians and experimenters to work together to build a tractable theory informed by data.     

应用稳定性同位素技术（δ13C、δ15N）研究长江中游干流主要鱼类的营养级

应用稳定性同位素技术（δ13C、δ15N）对2011年3月至2013年12月采自长江中游干流宜昌、荆州、石首、监利、城陵矶、鄂州、九江和湖口江段的44种鱼类及3种水生无脊椎动物进行了营养级研究。长江中游干流鱼类的δ13C值范围﹣33.83‰（鳙Aristichthys nobilis） ~ ﹣17.36‰（南方鲇Silurus meridionalis）,δ15N值范围4.83‰（泥鳅Misgurnus anguillicaudatus）~ 15.13‰（翘嘴鲌Culter alburnus）。以梨形环棱螺（Bellamya purificata）的δ15N均值5.48‰作为营养级基准线（营养级 = 2）,计算出该江段水生动物的营养级处于2.42 ~ 4.88,主要集中在2.83 ~ 3.61之间,鱼类平均营养级为3.28。营养级大于2.83的鱼类种类数量占了总生物种数的80.85%。大刺鳅（Mastacembelus armatus）和长春鳊（Parabramis pekinensis）营养级最低,分别为2.42 ± 0.49和2.56 ± 0.52,营养层级大于4.0的高级消费者为太湖新银鱼（Neosalanx taihuensis）、短颌鲚（Coilia brachygnathus）、鳙和长蛇鮈（Saurogobio dumerili）,分别为4.88 ± 0.01、4.37 ± 0.27、4.32 ± 0.35和4.09 ± 0.78,小黄黝鱼（Micropercops swinhonis)、鱤（Elopichthys bambusa）、鱖（Siniperca chuatsi）、翘嘴鲌、青鱼（Mylopharyngodon piceus）和南方鲇的营养级分别3.99、3.92 ± 0.16、3.89 ± 0.27、3.87 ± 0.62、3.59 ± 0.69和3.59 ± 0.57。本研究旨为长江中游渔业资源评估及其合理利用提供基础科学资料,为进一步研究长江中游干流渔业资源营养结构的动态变化及受人为活动干扰影响等提供科学参考依据。     

Fibroblast growth factor family aberrations in cancers: clinical and molecular characteristics

Fibroblast growth factor ligands and receptors (FGF and FGFR) play critical roles in tumorigenesis, and several drugs have been developed to target them. We report the biologic correlates of FGF/FGFR abnormalities in diverse malignancies. The medical records of patients with cancers that underwent targeted next generation sequencing (182 or 236 cancer-related genes) were reviewed. The following FGF/FGFR genes were tested: FGF3, 4, 6, 7, 10, 12, 14, 19, 23 and FGFR1, 2, 3, and 4. Of 391 patients, 56 (14.3%) had aberrant FGF (N = 38, all amplifications) and/or FGFR (N = 22 including 5 mutations and one FGFR3-TACC3 fusion). FGF/FGFR aberrations were most frequent in breast cancers (26/81, 32.1%, p = 0.0003). In multivariate analysis, FGF/FGFR abnormalities were independently associated with CCND1/2, RICTOR, ZNF703, RPTOR, AKT2, and CDK8 alterations (all P < 0.02), as well as with an increased median number of alterations (P < 0.0001). FGF3, FGF4, FGF19 and CCND1 were co-amplified in 22 of 391 patients (5.6%, P < 0.0001), most likely because they co-localize on the same chromosomal region (11q13). There was no significant difference in time to metastasis or overall survival when comparing patients harboring FGF/FGFR alterations versus those not. Overall, FGF/FGFR was one of the most frequently aberrant pathways in our population comprising patients with diverse malignancies. These aberrations frequently co-exist with anomalies in a variety of other genes, suggesting that tailored combination therapy may be necessary in these patients.