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21.
张思嘉  蔡挺  张顺 《生物信息学》2022,20(4):247-256
基于SNP突变数据与mRNA表达谱关联分析,构建一种肝癌分子分型方法并对比不同分型预后的差异,并对不同分型肝癌的发生发展机制进一步研究。首先通过TCGA数据库收集359例肝细胞癌患者的SNP突变数据和mRNA表达数据,采用Wilcoxon秩和检验,筛选突变后差异表达基因,并通过生物信息学工具String和Cytoscape 构建差异表达基因的蛋白互作网络,筛选连接度最高的10个Hub基因。利用Consensus Cluster Plus软件包,基于Hub基因mRNA表达水平构建NMF分子分型模型,再结合生存数据评估各分型患者的预后。最后利用加权基因共表达网络分析(WGCNA),识别与肝癌分子分型相关的模块,并针对关键模块的基因进行通路富集,从而对不同分型肝癌的基因表达谱进行比较。结果:NMF模型将肝癌分为高危、低危2个分型,其中CDKN2A和FOXO1基因对分型贡献度高。生存分析显示低危组患者的生存情况显著优于高危组,高危组富集多个与肿瘤细胞侵蚀、转移、复发过程相关的信号通路,低危组则与细胞周期和胰液分泌相关。本研究在无先验性信息的前提下,基于突变后显著差异表达的Hub基因表达水平构建的肝癌分子分型对肝癌患者预后评估具有一定的指导意义,其中CDKN2A和FOXO1突变是肝癌患者的不良预后因素,针对二者的靶向药研发,可能为肝癌患者提供新的治疗策略。  相似文献   
22.
目的:对原发性肝细胞肝癌(HCC)肝部分切除术后行经肝动脉化疗栓塞(TACE)的病人和未行TACE病人影响其预后的多种因素进行分析和评价,为肝切除术后是否行TACE治疗寻找筛选条件。方法:对我院2003~2008年期间在我院肝胆外科行原发性肝细胞肝癌手术治疗221例(术后介入治疗103例,术后非介入治疗118例)患者进行全面随访了解患者的预后情况,分别对术后接受介入治疗和非介入治疗两组通过Kaplan-Meier及COX回归分析影响预后的因素,包括:年龄、性别、血清HBsAg、肿瘤直径、肿瘤大体分型、有无癌栓形成,肿瘤分期(TNM)共7项指标。结果:在1年生存期内介入治疗组中的性别、年龄、血清HBsAg、肿瘤直径、肿瘤大体分型无统计学意义(p〉0.05),有无癌栓形成及肿瘤分期有意义(p〈0.05);非介入组内年龄、性别、血清HBsAg无统计学意义,肿瘤直径、肿瘤大体分型、有无癌栓形成,肿瘤分期有意义;在3年生存期内介入治疗组中的以上指标无统计学意义,而非介入组在肿瘤直径、有癌栓形成及肿瘤分期方面与统计学意义。结论:对于肿瘤直径〉5cm及术后病理证实为低分化的患者给予积极TACE治疗可明显提高近期生存率。  相似文献   
23.
目的:对原发性肝细胞肝癌(HCC)肝部分切除术后行经肝动脉化疗栓塞(TACE)的病人和未行TACE病人影响其预后的多种因素进行分析和评价,为肝切除术后是否行TACE治疗寻找筛选条件。方法:对我院2003~2008年期间在我院肝胆外科行原发性肝细胞肝癌手术治疗221例(术后介入治疗103例,术后非介入治疗118例)患者进行全面随访了解患者的预后情况,分别对术后接受介入治疗和非介入治疗两组通过Kaplan-Meier及COX回归分析影响预后的因素,包括:年龄、性别、血清HBsAg、肿瘤直径、肿瘤大体分型、有无癌栓形成,肿瘤分期(TNM)共7项指标。结果:在1年生存期内介入治疗组中的性别、年龄、血清HBsAg、肿瘤直径、肿瘤大体分型无统计学意义(p>0.05),有无癌栓形成及肿瘤分期有意义(p<0.05);非介入组内年龄、性别、血清HBsAg无统计学意义,肿瘤直径、肿瘤大体分型、有无癌栓形成,肿瘤分期有意义;在3年生存期内介入治疗组中的以上指标无统计学意义,而非介入组在肿瘤直径、有癌栓形成及肿瘤分期方面与统计学意义。结论:对于肿瘤直径>5cm及术后病理证实为低分化的患者给予积极TACE治疗可明显提高近期生存率。  相似文献   
24.
痢疾志贺氏菌1型(简称志贺氏1型)通常不发酵乳糖,1983年和1984年云南省不少地区相继发生以志贺氏1型为主的痢疾流行,经抽取不同地区的患者粪便标本分离的60株细菌进行鉴定,全部菌株均迟缓发酵乳糖。国内  相似文献   
25.
摘要:目的 比较3MTM PetrifilmTM快速菌落总数测试片(RAC)法与食品中菌落总数检测国标方法(GB 4789.2?2010)检测熟肉样品、人工污染熟肉样品中的菌落总数结果的一致性。方法 分别用两种方法对129份熟肉样品和166份人工污染熟肉样品进行菌落总数项目的检测,并对3MTM PetrifilmTM快速菌落测试片法与国标方法的实验结果进行配对资料t检验、线性回归分析以及对数值差值绝对值(|dlog|)汇总分析。结果 第一部分:两种方法检测熟肉样品、人工污染熟肉样品的菌落总数检测结果t=1.5704、P=0.1188,差异无统计学意义;相关系数R2值分别为0.897、0.964;|dlog|≤0.500所占百分比分别为97.7%、100.0%。第二部分:两种方法检测295份样品,t=1.1336,P=0.2586;相关系数R2=0.992;|dlog|≤0.500的结果百分率为99.0%。结论 在检测熟肉样品、人工污染熟肉样品时,3MTM PetrifilmTM快速菌落总数测试片法与国标方法检测结果的一致性较好。  相似文献   
26.
为了提高猪体细胞核移植重构胚发育潜力,本研究对体外成熟28 h、32 h、36 h、40 h、44 h、48 h、52 h和56 h的猪卵母细胞分别进行去核构建重构胚.研究结果表明,成熟44 h的卵母细胞核移植后有较高的融合率(58.99%)、卵裂率(67.52%)和囊胚率(22.78%),而成熟48 h的卵母细胞则分别为56.51%、65.73%和15.96%;且卵龄为44 h的卵母细胞核移植后分裂率与囊胚率显著高于卵龄为40 h、36 h、32 h、28 h的卵母细胞的分裂率与囊胚率(P<0.05).卵龄为48 h的卵母细胞融合率高于卵龄为52 h卵母细胞的融合率(P<0.05).同时我们还探讨了不同去核方法(盲吸法、Hochest33342染色法和Spindle-view system)对猪体细胞核移植重构胚发育能力的影响.研究结果发现,盲吸法、Hoechest33342染色法和Spindle-view system法的去核率分别达到76.33%,100.00%和98.40%.Hoechest染色法去核率显著高于盲吸法的去核率(P>0.05),而与Spindle-view法去核率没有差异(P>0.05).三种方法在融合率和囊胚率方面差异不显著(P>0.05),但Hoechest染色法的分裂率较低,差异显著(P<0.05).进一步的研究表明,细胞质内注射进行核移植构建重构胚的分裂率和囊胚率分别为68.13%和6.44%;透明带下注射法则为60.37%和8.08%,两者差异不显著(P<0.05);两者均可运用于猪体细胞的核移植,这为建立有效的猪体细胞核移植体系提供了参考.  相似文献   
27.
目的:观察经皮椎体成形术(PVP)联合射频消融(RFA)治疗脊柱转移瘤的临床疗效,并分析术后预后的影响因素。方法:回顾性分析2016年5月~2019年5月期间广州中医药大学第一附属医院和广州中医药大学第三附属医院的60例脊柱转移瘤患者的临床资料。在60例患者中,行PVP治疗的患者28例纳为PVP组,行PVP联合RFA治疗的患者32例纳为联合组。术前、术后6个月采用视觉疼痛模拟评分(VAS)、ODI指数、卡式功能(KPS)评分评价患者的疼痛、运动功能、生活质量。统计患者生存情况,对脊柱转移瘤患者的术后预后进行单因素分析,并进行COX多因素分析,观察影响预后的危险因素。结果:联合组术后6个月VAS、ODI评分低于PVP组,KPS评分高于PVP组(P<0.05)。联合组骨水泥总外渗率、术后6个月肿瘤复发率均低于PVP组(P<0.05)。Kaplan-Meier生存曲线显示,两组术后生存率比较无显著性差异(P>0.05),两组随访患者术后生存时间基本一致。经单因素分析表明,术后局部放疗、脊柱外骨转移、内脏转移、原发肿瘤性质及确诊至转移时间在两组间的对比,差异有统计学意义(P<0.05)。COX回归模型分析结果显示影响脊柱转移瘤患者术后预后的危险因素包括确诊至转移时间≤20个月、术后无局部放疗、原发肿瘤进展迅速、脊柱外骨转移、有内脏转移(P<0.05)。结论:PVP联合RFA治疗脊柱转移瘤患者,可有效提高患者运动功能及生活质量,减轻疼痛。但其术后预后受多种因素影响,需采取针对性预防措施。  相似文献   
28.
29.
摘要 目的:探讨脑胶质瘤组织微小RNA(miR)-211、miR-374、miR-510表达水平与临床病理特征及预后的关系。方法:选择2013年8月至2015年8月我院诊治的83例脑胶质瘤患者作为研究对象,选择同期由于脑外伤在我院行内减压术切除的正常脑组织样本31份作为对照样本。采用荧光定量PCR检测miR-211、miR-374、miR-510表达水平,生存分析采用Kaplan-Meier法,应用Cox比例风险回归模型分析预后的影响因素。结果:与正常脑组织相比,脑胶质瘤组织中miR-211、miR-374表达水平明显下降,miR-510表达水平明显升高(P<0.05)。脑胶质瘤组织miR-211、miR-374、miR-510表达均与WHO分级和卡氏功能状态量表(KPS)评分有关(P<0.05)。miR-211、miR-374低表达患者的5年总生存率明显低于高表达患者,miR-510低表达患者的5年总生存率明显高于高表达患者(P<0.05)。WHO分级、KPS评分、miR-211、miR-374和miR-510表达是脑胶质瘤患者预后的影响因素(P<0.05)。结论:脑胶质瘤组织中miR-211和miR-374表达下调,而miR-510表达上调,miR-211、miR-374和miR-510表达均与WHO分级、KPS评分和预后相关,检测miR-211、miR-374和miR-51在脑胶质瘤患者的诊断和治疗中具有一定临床意义。  相似文献   
30.
通过营养液栽培,研究不同矿质营养的缺乏对黄瓜叶片组织生理生化特性的影响。结果表明,缺铜对植株生理影响最大,在各处理中,叶片组织的可溶性糖含量最低,木质素含量也处于较低水平,而相对电导度则最高,所测定的4种保护酶(POD、PPO、PAL、SOD)活性也最低。其次是锌,缺锌造成了相对电导度的增加,可溶性糖含量和木质素含量的下降,除PAL活性外,其余3种酶活性也处于次低的位置。缺锰主要导致了叶片组织可溶性糖含量、木质素含量以及PAL活性的较大幅度的下降。缺钙主要降低了叶片组织中可溶性糖含量和SOD活性。比较而言,硼和铁的缺乏影响较小。  相似文献   
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