Conservation of ribosomal protein gene ordering in 16 complete genomes

The organization of ribosomal proteins in 16 prokaryotic genomes was studied as an example of comparative genome analyses of gene systems. Hypothetical ribosomal protein-containing operons were constructed. These operons also contained putative genes and other non-ribosomal genes. The correspondences among these genes across different organisms were clarified by sequence homology computations. In this way a cross tabulation of 70 ribosomal proteins genes was constructed. On average, these were organized into 9-14 operons in each genome. There were also 25 non-ribosomal or putative genes in these mainly ribosomal protein operons. Hence the table contains 95 genes in total. It was found that: (i) the conservation of the block of about 20 r-proteins in the L3 and L4 operons across almost the entire eubacteria and ar-chaebacteria is remarkable; (ii) some operons only belong to eubacteria or archaebacte-ria; (iii) although the ribosomal protein operons are highly conserved within domain, there are fine variat     

牦牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPS)的生物信息学分析

GGPS是萜类化合物合成的一个重要分支点酶,同时也是合成GGPP的催化酶。本课题共选择了9个不同科的植物,对其GGPS核苷酸及氨基酸序列的理化性质、蛋白质结构功能以及亲缘进化关系等进行详细的分析。结果表明,九个科植物GGPS核苷酸序列长度均大于1 000 bp小于2 000 bp;GGPS氨基酸都不含有信号肽,不存在跨膜结构域;GGPS蛋白的二级结构中α螺旋和无规卷曲是主要结构,且无β-折叠结构,延伸链和β-转角则分散于整个蛋白中。通过生物信息学方法进行合理预测,为进一步研究GGPS的酶学特性提供了重要理论依据。     

NO和H2O2诱导大豆根尖和边缘细胞耐铝反应的作用

 NO和H₂O₂是参与植物抗非生物胁迫反应的重要信号分子, 为了确定NO和H₂O₂在大豆(Glycine max)根尖和根边缘细胞(root border cells, RBCs)耐铝反应中的作用及其相互关系, 以‘浙春3号’大豆为材料, 研究了铝毒胁迫下大豆根尖内源NO和H₂O₂的变化, 以及外源NO和H₂O₂诱导大豆根尖和RBCs的耐铝反应。结果表明, 50 μmol·L^–1 Al处理48 h显著抑制大豆根的伸长, 提高Al在根尖的积累, 同时显著增加根尖内源NO和H₂O₂含量。施加0.25 mmol·L^–1外源NO供体亚硝基铁氰化钠(Na₂[Fe(CN)₅NO]·2H₂O, sodium nitroprusside, SNP)和0.1 mmol·L^–1H₂O₂, 能有效地缓解Al对大豆根伸长的抑制、根尖Al积累和RBCs 的死亡, 该缓解作用可以被0.05 mmol·L^–1 NO清除剂2-(4- 羧基苯)-4,4,5,5- 四甲基咪唑-1- 氧-3- 氧化物, 钾盐(C₁₄H₁₆N₂O₄·K, carboxy-PTIO, cPTIO)和150 U·mL^–1 H₂O₂清除酶(catalase, CAT)逆转。并且外源NO能够显著促进根尖H₂O₂的积累, 而外源H₂O₂对根尖NO的含量无显著影响。这表明NO和H₂O₂是诱导大豆根尖及RBCs耐铝反应的两种信号分子, NO可能通过调控H₂O₂的形成, 进而诱导大豆根尖及RBCs的耐铝反应。     

贝莱斯芽孢杆菌BG-2对厚皮甜瓜贮藏品质及防御酶活性的影响

【背景】厚皮甜瓜白霉病主要由尖孢镰刀菌引起,严重影响厚皮甜瓜品质,从而造成经济损失。【目的】研究贝莱斯芽孢杆菌BG-2对尖孢镰刀菌的抑制作用,以及对采后厚皮甜瓜贮藏品质的影响。【方法】以贝莱斯芽孢杆菌为供试菌株,研究其对2种不同贮藏温度（25℃和4℃）下厚皮甜瓜果实腐烂率、失重率、果肉硬度、可滴定酸、可溶性固形物含量和维生素C含量的影响,同时测定过氧化氢酶（catalase,CAT）、过氧化物酶（peroxidase,POD）和超氧化物歧化酶（superoxide dismutase,SOD）防御酶活性,进而探究Bacillus velezensis BG-2对尖孢镰刀菌的抑制作用及对厚皮甜瓜贮藏品质的影响。【结果】贝莱斯芽孢杆菌BG-2菌悬液能有效抑制尖孢镰刀菌的生长,菌悬液浓度为1×10⁷ CFU/mL时抑菌圈直径为（20.45±0.39） mm,抑菌效价为144.48 mm/mL;同时,B. velezensis BG-2能有效减缓果肉硬度、维生素C含量、可溶性固形物含量和可滴定酸的下降,抑制果实失重和腐烂,能较好地保持果实的品质,抑制防御酶活性的下降。【结论】B. velezensis BG-2能显著抑制尖孢镰刀菌的生长,延缓厚皮甜瓜的后熟,维持采后甜瓜果实较高的品质和防御酶活性,对甜瓜腐烂有较好的防治效果。     

高度城市化地区屋顶绿化径流调控效益评价——以厦门岛为例

屋顶绿化的降雨径流调控效益对城市水安全与可持续发展具有重要作用,尤其是在土地资源紧缺与环境问题突出的高度城市化地区,然而目前针对城市尺度进行屋顶绿化降雨径流调控效益的研究较少。以厦门岛142 km~2的典型高度城市化地区为研究对象,采用ArcGIS与SCS-CN水文模型,研究了四种屋顶绿化实施场景在四种不同重现期(2、5、10、20年)降雨事件下各汇水区屋顶绿化的降雨径流调控效益,并依其空间分异特征制定差异化生态建设策略。结果显示,(1)平均地表径流减少率随城市屋顶绿化量的增加从0.91%增加至4.51%,随降雨强度的增加从2.86%下降到2.01%。屋顶绿化对南部城市核心区中山路商圈汇水区的地表径流削减作用最为显著,在2年重现期降雨事件和100%屋顶绿化实施场景下地表径流减少了8.84%。(2)厦门岛易积水区域主要分布在高崎机场、西北部港口、筼筜湖、五缘湾和环岛路;在四种屋顶绿化实施场景下,平均积水深度降低1.68、4.68、6.45、14.43 cm,平均积水面积减少6.11、16.89、23.29、52.06 hm~2,而随着降雨强度的增加,积水面积减少率幅度降低,屋顶绿化对中低...     

右美托咪定联合不同剂量咪达唑仑对非小细胞肺癌手术患者血流动力学和炎症介质、认知功能的影响

摘要 目的：探讨右美托咪定联合不同剂量咪达唑仑对非小细胞肺癌（NSCLC）手术患者血流动力学和术后炎症介质、认知功能的影响。方法：纳入2019年1月-2021年2月期间来郑州大学第一附属医院接受手术治疗的NSCLC患者（n=120）,按照麻醉方案的不同分为低剂量组（n=60）和高剂量组（n=60）,两组均予以右美托咪定,在此基础上,低剂量组予以0.05 mg/kg咪达唑仑,高剂量组予以0.10 mg/kg咪达唑仑。对比两组患者的血流动力学、炎症介质、认知功能、苏醒质量和不良反应发生率。结果：两组麻醉诱导后10 min（T1）~拔管后5 min（T3）时间点心率（HR）、平均动脉压（MAP）升高后下降,且拔管即刻（T2）、T3时间点高剂量组低于低剂量组（P<0.05）。高剂量组的苏醒后疼痛视觉模拟评分（VAS）评分低于低剂量组,睁眼时间、拔管时间、麻醉恢复室（PACU）停留时间均短于低剂量组（P<0.05）。两组术前、术后3 d、术后7 d白介素-1（IL-1）、C反应蛋白（CRP）、肿瘤坏死因子-α（TNF-α）升高后下降,且术后3 d、术后7 d高剂量组低于低剂量组（P<0.05）。两组术后1 d、术后3 d、术后7 d简易精神状态量表（MMSE）评分组间对比未见统计学差异（P>0.05）。两组不良反应发生率组间对比无统计学差异（P>0.05）。结论：与0.05 mg/kg咪达唑仑相比,右美托咪联合0.10 mg/kg咪达唑仑定用于NSCLC手术患者,维持血流动力学稳定、提高苏醒质量、减轻炎症应激的效果更为显著,且不增加认知功能损害和不良反应发生率。     

一株红假单胞菌的分离及对Cu2+的去除

【背景】重金属污染对环境和人类的健康构成了重大威胁,因此,重金属污染的治理迫在眉睫。生物治理因成本低、处理效果好和无二次污染等优点,在处理重金属污染时被优先选择。【目的】从辽河入海口深13 m的水体中,利用紫色非硫细菌富集培养基筛选产色素能力强并对高浓度Cu~(2+)有高效去除能力的菌株。【方法】采用形态学、生理生化特性和分子生物学方法鉴定菌种;采用二乙基二硫代氨基甲酸钠分光光度法测定Cu~(2+)的含量。【结果】鉴定菌株为红假单胞菌属,将其命名为Rhodopseudomonas sp. gh32。菌株gh32的最适生长温度和最适pH分别为30°C和7.0,其在pH 5.0-10.0范围内可正常生长,在3 mmol/L的CuSO4溶液中能够正常生长,能利用葡萄糖、甘露糖和果糖等单糖和硫化氢。菌株gh32在24h内对Cu~(2+)的去除率均在99%以上,处理能力为1 331 g/g干菌重或167.6 g/g湿菌重。【结论】菌株gh32对Cu~(2+)具有较强的耐受性和很好的去除效果,是治理含Cu~(2+)废水的潜力菌株。本研究为生物治理重金属废水提供了支持。     

化肥减量配施有机肥对棉田土壤微生物生物量、酶活性和棉花产量的影响

在甘肃河西走廊棉区进行连续3年的定位施肥试验,研究了化肥减量20%～40%并配施不同有机肥对棉田土壤微生物生物量、酶活性和棉花产量的影响。结果表明:与单施化肥相比,化肥减量配施有机肥能显著提高土壤细菌和放线菌数量,降低土壤真菌数量,化肥减量配施普通有机肥加生物有机肥(COBF₂)处理土壤细菌最多,较单施化肥(CF)在棉花蕾期、铃期和吐絮期分别提高了84.6%、57.1%和43.5%,化肥减量配施生物有机肥(CBF₂)处理放线菌数量最多,较CF在棉花蕾期、铃期和吐絮期分别提高了28.2%、32.7%和32.2%,CBF₂土壤真菌数量最低,较CF在棉花蕾期、铃期和吐絮期分别降低了35.8%、29.3%和13.4%。化肥减量配施有机肥提高了土壤细菌/真菌、放线菌/真菌和脲酶、过氧化氢酶、蔗糖酶、碱性磷酸酶活性,其中COBF₂对酶活性的提升最有效。化肥减量配施有机肥提高了棉花单株铃数,对棉花长势、地上干物质积累有一定的促进作用,COBF₂棉花产量最高,籽棉和皮棉产量分别较CF提高了14.2%和10.9%,增产显著。综合分析土壤微生物生物量、酶活性和棉花产量,COBF₂处理,即化肥减量40%配施1800 kg·hm^-2普通有机肥和600 kg·hm^-2生物有机肥效果最佳。