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葡萄转录组已在各种组织、发育阶段、生物胁迫、非生物胁迫和其他条件下被测定。目前,仍没有简单实用的网络工具来探索这些宝贵的数据。本文从美国国立生物技术信息中心的基因表达数据库(NCBI GEO)下载1019个基因表达芯片数据,进行权重基因共表达网络分析(WGCNA)。鉴定到41个基因共表达模块。功能富集分析发现这些模块具有不同的功能,并与实验/表型相关。通过模块内连接度筛选枢纽基因,这些基因可能具有重要功能。通过关联推定(Guilt-by-association)原理对模块内功能未知的基因进行功能预测。最后,构建了免费的网络工具VitisMod,为葡萄的基因功能研究提供新资源,网址为:http://bioinformatics.fafu.edu.cn/grape。 相似文献
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“三烊湿地与高新园区”一节“网络互动式教学案例”专题课。需要2课时,是在学生学习了“生物多样性”一节内容和完成了“调查环境污染对生物的影响”研究性课题以后的一节网络互动式探究课。主要内容是:通过回顾“生物多样性”的知识以及评价自己的研究性课题的案例,找优点和差距;再以“三蛘湿地与高新园区”的问题为切人点.学会利用已有的知识,来解决现实生活中的问题,学会利用网络工具,学会利用浩如烟海的信息资源来学习,通过网络平台进行讨论,解决实际问题.正确理解自己的责任。 相似文献
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