Taqman多重实时荧光PCR同步定量检测6种动物源性成分方法的建立

旨在建立一种可同时检测猪、牛、羊、鸡、鸭、鹅6种动物源性成分的六重实时荧光定量PCR方法。根据猪、牛、羊、鸡、鸭、鹅细胞核基因组保守序列,参照序列比对结果选择差异位点设计6对特异性引物和6条以不同荧光素标记的Taqman探针。通过对PCR反应体系和反应条件的优化筛选,建立能同步定量检测猪、牛、羊、鸡、鸭、鹅源性成分的六重实时荧光PCR方法。应用此方法分别对18种不同源性动物DNA和200份不同来源样品进行猪、牛、羊、鸡、鸭、鹅源性成分检测,结果表明,所建立的六重实时荧光PCR方法灵敏度高,对六种动物的最低核酸检测量分别为0.049ng、0.048ng、0.085ng、0.13ng、0.162ng、0.074ng(50μl体系);特异性强,对狗、兔、鼠、驴、马、骆驼等其他12种动物无特异性扩增;200份样品的检测结果表明六重qPCR检测方法敏感,同一反应体系下实现一次对6种动物快速定量检测,耗时短、效率高、适用性广,可用于肉品、奶品、皮毛和饲料等动物产品猪、牛、羊、鸡、鸭、鹅源性成分单一或混合物种的鉴别诊断。     

鸡Sepp1基因及其蛋白理化性质和分子结构的生物信息学分析

硒是人和动物生命必需的微量元素,硒的生物学功能是通过硒蛋白来实现的,硒蛋白P(Selenoprotein P,Sepp1)是机体含量最多的硒蛋白。利用生物信息学相关分析软件和比较基因组学的方法,对鸡Sepp1基因序列和氨基酸序列进行理化性质和结构特征进行分析和预测,并与猪、人、鼠、羊、狗等物种进行比较。结果显示,鸡Sepp1的CDS序列和编码的蛋白质与禽类动物相似,但和哺乳类动物之间差别较大;Sepp1的功能特性与硒半胱氨酸含量有关,不同物种Sepp1中硒半胱氨酸含量存在着差异;鸡Sepp1蛋白在第170-200位氨基酸残基区域具有特定理化性质和分子结构,推测该序列可作为调控鸡Sepp1功能的靶位点。研究结果为以后深入研究鸡Sepp1的机体功能、开发富集Se的动物功能性食品提供理论参考。     

476株空肠弯曲菌血清学分型

本文用Penner氏被动血凝法,对476株空肠弯曲菌进行血清学分型,分型率为69.33%,共检出30种不同血清型,其中人源菌有17个型,鸡源菌有19个型,鸭源菌有16个型,猪源菌有17个型。其中常见型与国外报道的完全不同,与国内上海、苏州等地区报道的材料也有不同,说明空肠弯曲菌的血清型分布存在着明显的地区性差异。但发现当地的动物源菌株的血清型与人源菌血清型的关系密切,鸡、鸭、猪的血清型与当地人源菌血清型相同者分别占89.7、81.4和94.07%,因此认为这三种宿主动物是莆田地区人类空肠弯曲菌肠炎的主要传     

双向血清抗原比测定可以用于动物学分类

为探讨新的生物学分类方法,以人、牛、羊、猪、鹿和鸡共计6种不同动物的血清为抗原分别制备了其相应的6种抗血清,并进行每两种动物间的双向交叉血清定量免疫反应,计算出每两种动物血清间的抗原比值,以抗原比值为量度绘出6种动物的树状分类图。结果表明：抗原比分类与和自然分类及文献报道的核苷酸序列分类相吻合,说明抗原比测定可以用于动物学分类,对其理论意义进行了讨论。     

不同宿主源弯曲菌黏附侵袭肠上皮细胞及在鸡肠道内定殖的比较

【背景】弯曲菌(Campylobacter)是重要的人畜共患病原菌,可在多种动物肠道定殖,但不同宿主源弯曲菌对肠上皮细胞的黏附侵袭特征及在鸡肠道内的定殖能力并不明确。【目的】探究不同宿主源弯曲菌对不同宿主肠上皮细胞黏附侵袭及在鸡肠道内定殖能力的差异性。【方法】利用 5株来自不同宿主源弯曲菌,包括人源、鸡源、鸭源和牛源空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni)及猪源结肠弯曲菌(Campylobacter coli),在对菌株PCR鉴定、运动力及生物膜形成能力测定的基础上,分别测定各菌株对人源肠上皮细胞Caco-2、猪源肠上皮细胞IPEC-J2和大鼠源肠上皮细胞IEC-6的黏附能力,通过庆大霉素保护试验测定菌株对肠上皮细胞的侵袭能力,比较黏附量和侵袭量的差异;将5株弯曲菌分别口服攻毒鸡,于攻毒后不同日龄(different days post inoculation,DPI)采集肠道样品测定弯曲菌的菌落数,比较不同弯曲菌在鸡肠道内定殖的差异。【结果】人源弯曲菌运动力显著高于其他4株动物源弯曲菌,而牛源和猪源弯曲菌生物膜形成能力显著高于其他菌株。黏附侵袭测定结果显示,人源弯曲菌对Caco-2细胞的黏附能力显著高于动物源弯曲菌,但侵袭能力显著低于动物源弯曲菌;鸭源和牛源弯曲菌对IPEC-J2细胞的黏附能力显著低于其他菌株,而且鸭源弯曲菌的侵袭能力显著低于其他菌株;不同菌株对IEC-6细胞的黏附能力无显著差异,但鸡源弯曲菌侵袭能力显著低于其他菌株。不同弯曲菌口服攻毒鸡后1、3和6d动物源弯曲菌定殖水平显著高于人源,在攻毒后10d和15d仅牛源弯曲菌显著高于人源,于攻毒后15d所有菌株达到约8-10Log₁₀(CFU/g)的稳定定殖水平。【结论】来源于不同宿主的弯曲菌对不同宿主肠上皮细胞均具有黏附侵袭能力,同时可在鸡肠道内稳定定殖,提示弯曲菌在不同动物间传播和适应性定殖的特征,对开展弯曲菌针对性防控措施具有一定的借鉴意义。     

几种经济动物着丝粒间接免疫荧光的研究

检定间期细胞核中的着丝粒,除少数植物间期细胞核外,一直是一个问题。本工作用抗着丝粒抗血清,借间接免疫荧光染色法,对经济动物牛、羊、猪、兔和鸡的间期核进行了研究,发现在这些动物的间期核中都可检测出着丝粒,这为今后的着丝粒实验研究提供了基础。     

lncRNA调控畜禽抗病力性状研究进展

长链非编码RNA(longnon-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA分子。lncRNA虽然不具备蛋白编码能力,但可通过转录调控、转录后调控及表观遗传修饰调控等方式影响基因的表达,进而影响性状的表型。在现代畜牧业生产中,除提高生长发育和产量性状外,研究免疫因子、细胞因子等抗病力相关指标及性状的调控机制,对提高和改善畜禽的健康、福利及公共卫生尤为重要。近年来,利用lncRNA研究鸡(Gallus gallus)、猪(Sus scrofa)、牛(Bos taurus)等重要畜禽的抗病力性状的调控机制取得了一定进展,为将表观遗传标记应用于动物抗病遗传育种打下了一定的基础。本文介绍了lncRNA的生物学功能和产生机制,着重阐述了lncRNA对畜禽抗病力性状的调控作用及研究进展,以期为lncRNA在畜禽抗病遗传育种方面的研究及应用提供科学依据。     

鸡单核苷酸多态性与高清晰度QTL图谱的构建

作为一种重要的经济动物和模式动物, 鸡SNP多样性的研究以及鸡主要经济性状QTL定位的研究近年来成绩斐然。文章综述了上述研究成果, 并就SNP标记在鸡QTL精细定位方面的研究前景进行了展望。     

家养动物选择信号研究进展

家养动物在人类生活中占有重要地位,它们都经历驯化而来,在自然和人工选择下,适应了当地环境和人类需要,形成了各类品种。驯化、自然和人工选择都会在基因组上留下选择信号。对这些选择信号研究,可以直接挖掘到功能基因,是目前最重要的功能基因筛选策略之一。当前已经对猪、鸡、牛、羊、狗等家养动物开展了选择信号研究,并挖掘了大量功能基因。本文主要概述了选择信号的种类和检测方法,简述其在家养动物中的研究,并讨论了选择信号分析的关键问题及其研究前景。     

鱼类的基因转移

1982年美国科学家Palmiter等人在世界上首次运用基因工程技术将人的生长激素基因导入小鼠受精卵,获得了具有快速生长效应的“超级鼠”,其成熟大小为一般小鼠的两倍。虽然“超级鼠”没有什么实际应用价值,但这一实验的成功却为运用基因工程技术培育具有优良性状(如快速生长,抗病及抗寒等)的经济动物投下了希望的曙光。果然,在Palmiter等的结果宣布不久,一个世界范围的转基因动物研究已经兴起,相继开展了猪、兔、鸡、羊等的转基因研究,并都取得了令人鼓舞的进展。我们知道,鱼类是我国人民的主要蛋白质食物     

干细胞生物学研究进展

自从1981年小鼠胚胎干细胞(Embryonicstemcell,ES细胞)分离培养成功以来,人们又致力于羊、猪、牛等大型动物胚胎干细胞研究,因为ES细胞在培养细胞与个体发育和体细胞与生殖细胞之间架起了桥梁。ES细胞可以作为遗传物质的载体来改造动物和研究基因对胚胎发育的影响。人体胚胎干细胞培养成功是干细胞生物学技术又一重大突破,它与动物体细胞克隆技术相结合,给组织器官工程带来美好前景。1　人体胚胎干细胞Thomson和Gearhart2个研究小组分别采用不同教材成功培养人体ES细胞,如图1示:图1　　根据鼠ES细胞研究结果,推测人体ES细胞基础和临床…     

表观遗传标记在猪分子育种中的研究与应用前景

家畜动物的表型是由基因组、表观基因组和环境等多种因素相互影响共同作用决定的。近年来,随着遗传育种领域的迅速发展,表观遗传标记在猪分子育种中的研究受到越来越多科研人员的关注。表观遗传学是研究基因表达发生可遗传的改变而DNA序列不发生改变的一门生物学分支学科,其遗传标记主要包括DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA、印记基因等。越来越多的研究表明,表观遗传标记在猪的遗传性状中发挥着重要作用,主要通过调控与性状相关基因的表达进而达到改变生物表型的目的。然而,在当前猪分子育种领域,表观遗传标记的作用还没有得到足够的重视,影响猪重要性状的机制还没有得到深度解析,因此在实际应用中还缺乏足够的科学依据和可操作性。本文从营养、疾病、重要经济性状以及隔代遗传几个方面综述了表观遗传标记在猪分子育种中的研究现状、应用前景以及遇到的挑战,以期为表观遗传标记在猪分子育种中的应用提供较全面的理论依据。     

牦牛CAPN2基因的电子克隆及生物信息学分析

目的:对牦牛CAPN2基因进行电子克隆和序列分析,以期为进一步研究牦牛该基因与其肉质性状相关性以及基因结构和表达奠定理论基础。方法:利用人的CAPNA2基因cDNA序列为探针,在EST数据库进行同源性筛选,运用CAP3进行拼接得到完整序列并结合生物信息学进行序列分析。结果:牦牛CAPN2基因全长3 200bp,包含一个2 103bp的开放阅读框,共编码700个氨基酸;牦牛CAPN2的核苷酸序列与普通牛、羊、马、猪、小鼠、鸡、人相应序列间的一致性分别为99%、97%、90%、87%、85%、79%、90%。经聚类分析,牦牛首先与普通牛聚在一起,然后与羊、猪聚为一类;人与小鼠聚为一类;这两类相聚为一大类后,再依次与马、鸡相聚,其结果与以往的生物学分类结果一致。牦牛CAPN2基因编码蛋白的分子式为C3569H5503N255O1082S26,相对分子质量为79 935.2,理论等电点PI为4.86。结论:牦牛与普通牛、羊、马、猪、小鼠、鸡、人在CAPN2基因的编码序列具有较高有一致性。该基因编码的蛋白为位于细胞质中的水溶性蛋白。     

鸡基因组计划及在遗传学研究中的应用

鸡,以其独特的生物学特性,成为研究许多生物学问题的重要模式生物。而在长期选育中形成的肉鸡和蛋鸡两大品系则是研究许多遗传性状的分子机制的理想模型。鸡基因组计划的完成,极大推动了以鸡作为模式生物的研究与开发工作。本文重点介绍了鸡基因组学的研究进展,和利用基因组相关信息对鸡的不同品系的数量性状进行遗传学研究的方法策略;并阐明了以鸡作为模式生物,利用基因组学的信息进行发育和遗传学研究的广阔前景。     

新疆动物源大肠杆菌小菌落变异体生物学特性分析

【背景】小菌落变异体(small colony variants, SCVs)在细菌耐药和持续残留等过程中发挥着重要作用，但目前国内鲜有动物源大肠杆菌(Escherichiacoli,EC)SCVs的相关报道。【目的】对新疆动物源EC-SCVs的生物学特性进行对比研究分析，为国内EC-SCVs的相关研究提供基础数据。【方法】使用氨基糖苷类抗生素对新疆动物源大肠杆菌进行诱导，使其形成SCVs。然后对野生株和诱导株进行培养特征、生化特性、药物敏感性、运动力、生物被膜和溶血活性等生物学特性检测。【结果】经卡那霉素和庆大霉素诱导，从牛、羊和马源大肠杆菌中得到5株EC-SCVs(2株为血红素依赖型，3株未知其营养依赖型)。与野生株相比，EC-SCVs的生化特性改变，所有EC-SCVs转变为不利用醋酸盐，在不同培养基中的培养特征也存在差异。并且对氨基糖苷类抗生素的耐受性增强，生物被膜形成能力增强，但运动力下降。除血红素依赖型EC-SCVs的溶血活性增强外，其他SCVs的溶血活性并无差异。【结论】动物源EC-SCVs的生物学特性与野生株相比有较大差异，这些生物学特性的改变可能会给大肠杆菌致病或耐药等...     

黄牛起源和分类的研究现状及有待解决的问题

1　中国畜禽遗传资源多态性研究现状中国是畜禽遗传资源大国 ,全国共有 598个畜禽品种 ,地方品种占品种总数的 77%。至今对家养畜禽遗传多样性的认识 ,主要还是停留在体型特点和性状描述上。虽然生物技术已有了长足的进展 ,但至今没有对任何一个家养畜禽种——牛、羊、猪、马、鸡和鸭等作过全面、系统的品种间亲缘关系分析 ,也没有对哪一个畜禽种做过系统、全面的起源研究。中国固有的地方畜禽品种具有许多优良的性状 ,如太湖猪和寒羊的多胎性、地方品种优良的肉质、抗逆性、抗病性、小体型、性早熟以及其它许多特异性状。地方品种不仅是发…     

绵(山)羊基因组信息研究新进展

与猪、牛等家畜相比,绵(山)羊基因组研究相对较慢,商品化芯片尚未诞生,制约了绵(山)羊基因功能及经济性能的研究。主要对绵(山)羊基因图谱、基因序列、基因标记等基因组信息的最新研究现状进行综述,旨在为绵(山)羊基因芯片技术的开发提供信息依据、为主要经济性状的遗传改良提供理论基础。     

组学视角下养殖动物消化道微生物组结构与功能研究进展北大核心

养殖动物消化道中含有大量的微生物,不仅参与动物对营养物质的消化和吸收,还对宿主生长发育及免疫起重要调节作用。动物消化道微生物组研究是目前国内外的热点领域,取得了一系列重要研究进展。深入了解养殖动物消化道微生物组的结构与功能,将为今后调控和应用消化道微生物、提高动物生产性能、改善动物胃肠道健康和实现绿色健康养殖奠定理论基础。本文以4种代表性养殖动物(牛、羊、猪和鸡)为主体,对组学视角下其消化道微生物群落结构、功能等研究进展进行总结和分析;并对未来研究方向进行展望。     

鸡基因组研究进展

随着人类基因组计划实施而开展的动物基因组计划受到了科学界和各国政府的支持. 无论是作为一种实验用模式生物,还是作为一种农业经济动物,鸡都有着独特的生物学特性和经济学价值,因此,开展鸡基因组研究是十分有意义的. 综述了近年来鸡基因组研究（包括鸡基因组的有关参数、遗传连锁图、物理图谱、比较定位、表达序列标签和数量性状座位定位等方面）所取得的成就并对其前景进行了讨论.     

DNA微阵列在猪遗传育种中的应用

DNA微阵列是高通量﹑微型化﹑自动化研究生物大分子功能的高新技术,目前已经广泛应用于动植物生物学过程的基因表达研究中。猪既是重要的经济动物,又是常用的实验动物,应用DNA微阵列对其重要经济性状主效基因的寻找和各种疾病遗传机制的探索已经成为今后该领域的一个十分重要的发展方向。