华南虎、东北虎、孟加拉虎的D-100p和ND5序列及其在系统进化分析中的应用

本文采用PCR和质粒克隆测序方法,获得了华南虎线粒体D-loop区的480bp序列和东北虎、孟加拉虎线粒体D-loop区的503bp序列;同时还获得了这三个虎亚种和金钱豹线粒体ND5基因5’端309bp的部分序列。根据D-loop序列分析,华南虎与孟加拉虎、东北虎的平均距离(p-distance)分别为0．11088和O．11087,而东北虎与孟加拉虎间的平均距离为0．00994;根据ND5序列分析,华南虎与孟加拉虎、东北虎的平均距离分别为0．11434和0．11758,而东北虎与孟加拉虎间的平均距离为0．00324。三个虎亚种的mtDNA D-loop和ND5序列比较表明,华南虎是这三个虎亚种中最为古老的亚种。     

华南虎、东北虎、孟加拉虎的D-loop和ND5序列及其在系统进化分析中的应用

本文采用PCR和质粒克隆测序方法,获得了华南虎线粒体D-loop区的480 bp序列和东北虎、孟加拉虎线粒体D-loop区的503 bp序列;同时还获得了这三个虎亚种和金钱豹线粒体ND5基因5'端309 bp的部分序列.根据D-loop序列分析,华南虎与孟加拉虎、东北虎的平均距离(p-distance)分别为0.110 88和0.110 87,而东北虎与孟加拉虎间的平均距离为0.009 94;根据ND5序列分析,华南虎与孟加拉虎、东北虎的平均距离分别为0.114 34和0.117 58,而东北虎与孟加拉虎间的平均距离为0.003 24.三个虎亚种的mtDNA D-loop和ND5序列比较表明,华南虎是这三个虎亚种中最为古老的亚种.     

中国及其他分布区域野生虎的系统地理学和遗传起源研究进展

世界野生虎(Pantheratigris)传统上被划分为8个亚种,其中3个亚种已于20世纪灭绝,而剩余种群的生存仍然受到偷猎、栖息地丧失和片断化的威胁。作为唯一栖息着4个现存虎亚种的国家,中国在世界虎的保护事业中负有重要责任,然而其野生和圈养虎的分类地位却仍然不确定。最近一项研究(Luoetal,2004)从所有现存野生虎分布地区(包括中国)采集了134份“基准样品”(即原产野外或有确定地域起源的个体生物样品),对虎的系统地理学、种群结构以及遗传起源进行了全面分析。所用的分子标记包括四千碱基对的线粒体DNA、30个核基因组微卫星位点,以及MHC-DRB基因。研究结果表明,虽然虎的整体遗传多态性较低,但是种群分化程度很高,它们被划分为6个,而不是5个现存亚种(1)西伯利亚虎(P.t.altaica);(2)苏门答腊虎(P.t.sumatrae);(3)孟加拉虎(P.t.tigris);(4)华南虎(P.t.amoyensis);(5)印支虎(P.t.corbetti);(6)新定义的亚种马来虎,暂命名为P.t.Jacksoni。由于所研究样本量有限,目前暂定的华南虎亚种还需进一步确定。现有华南虎圈养种群包括遗传关系相距较远的两支一支与印支虎(P.t.corbetti)无异;而另一支则与其他种群均相距甚远,可能代表了真正的华南虎(P.t.amoyensis)。利用分子生物学方法对中国动物园中圈养虎的遗传起源调查亟待进行,以确认该圈养种群整体的遗传独特性或者非独特性。换言之,这将是确认华南虎是否仍然存在的关键。     

中国及其他分布区域野生虎的系统地理学和遗传起源研究进展

世界野生虎(Panthera tigris)传统上被划分为8个亚种，其中3个亚种已于20世纪灭绝，而剩余种群的生存仍然受到偷猎、栖息地丧失和片断化的威胁。作为唯一栖息着4个现存虎亚种的国家，中国在世界虎的保护事业中负有重要责任，然而其野生和圈养虎的分类地位却仍然不确定。最近一项研究(Luo et al，2004)从所有现存野生虎分布地区(包括中国)采集了134份“基准样品”(即原产野外或有确定地域起源的个体生物样品)，对虎的系统地理学、种群结构以及遗传起源进行了全面分析。所用的分子标记包括四千碱基对的线粒体DNA、30个核基因组微卫星位点，以及MHCDRB基因。研究结果表明，虽然虎的整体遗传多态性较低，但是种群分化程度很高，它们被划分为6个，而不是5个现存亚种：(1)西伯利亚虎(P. t. altaica)；(2)苏门答腊虎(P. t. sumatrae)；(3)孟加拉虎(P. t. tigris)；(4)华南虎(P. t. amoyensis)；(5)印支虎(P. t. corbetti)；(6)新定义的亚种马来虎，暂命名为P. t. Jacksoni。由于所研究样本量有限，目前暂定的华南虎亚种还需进一步确定。现有华南虎圈养种群包括遗传关系相距较远的两支：一支与印支虎(P. t. corbetti)无异；而另一支则与其他种群均相距甚远，可能代表了真正的华南虎(P. t. amoyensis)。利用分子生物学方法对中国动物园中圈养虎的遗传起源调查亟待进行，以确认该圈养种群整体的遗传独特性或者非独特性。换言之，这将是确认华南虎是否仍然存在的关键。     

中国圈养林麝微卫星DNA多样性研究

本文利用13对微卫星标记,对我国3个核心种源地（巴山、秦岭、川西高原）圈养林麝种群进行遗传多样性和遗传结构分析。在167份样品中共检测到142个等位基因（Na）,每个位点等位基因数介于7~16,均值为10.92,平均有效等位基因数（Ne）为6.3730,期望杂合度（He）和观测杂合度（Ho）均值分别为0.8302和0.3897。这些圈养林麝种群遗传多样性水平较高,但较低的观测杂合度表明圈养群体存在近交现象。两两群体间的Fst 值和AMOVA分析结果均表明种群之间分化程度不明显。群体遗传结构分析显示,全部样本聚为3个遗传簇（最佳K值=3）,其主体与3个地理来源相符,但种群间存在基因渗透现象。本研究中的秦岭种群遗传变异最为丰富,可以作为种质改良的基因池。     

圈养华南虎的个性评估及其性别差异

个性研究在动物生态研究和迁地保护中发挥着重要作用.华南虎(Panthera tigris amoyensis)作为最濒危的虎亚种,目前仍然缺乏对其个性特征的研究探索.本文通过个性特征主观评价法对6只圈养华南虎进行个性评估,并对比不同性别的华南虎个性特征的差异,使用新异物体测验进一步验证个性特征主观评价法的结果.最终提取...     

三个虹鳟养殖群体遗传结构的微卫星分析

利用20个微卫星标记对3个虹鳟(Oncorhynchus mykiss)养殖群体进行遗传结构分析。结果表明,(1)3个群体检测的平均等位基因数为3·6～4·1,平均观测杂合度为0·5224～0·6328,平均期望杂合度为0·4736～0·5522,平均多态信息含量为0·4354～0·5084,说明这几个群体多态性属于偏高水平,遗传多样性高。通过d值,确定了Hard-Weinberg平衡的偏离情况,发现AY039638、AY039646在3个群体中都表现为不平衡。对3个群体的遗传距离进行了估算,并进行聚类分析,本溪的两个群体先聚为一支,再与渤海群体相聚,显示出明显的地理特征。(2)本溪虹鳟群体在位点AF352770出现部分等位基因消失的现象;AF352754在本溪群体中表现为位点消失,可作为区分本溪群体和渤海群体的分子标记。(3)综合评价3个群体,渤海站虹鳟群体的遗传多样性最高,与前人研究结果一致。     

成绩·危机·希望 中俄东北虎保护

在世界的13个老虎分布国中,中国拥有世界上最多的老虎亚种,即东北虎、华南虎、印度支那虎和孟加拉虎四个亚种。据估计,东北虎约18-22只,主要分布在黑龙江、吉林省的东部,沿中俄边界一线;华南虎在新中国成立初曾经分布于中国的福建、广东、江西、浙江、湖北、湖南等省,现在已经野外功能性灭绝,所能见的华南虎多为人工饲养的,     

圈养华南虎食物通过消化管时间的初步测定

采用苹果皮作标记物 ,对 4只圈养成年健康华南虎的食物通过消化管的时间进行试验性测定 ,结果平均值为 18 36± 3 5 8h (13 83～ 2 2 5 7h) ,其中 9∶30投喂的为 2 1 97± 0 74h ,16∶4 0投喂的为 15 2 0± 0 87h ,牛肉、混合饲料间和虎个体间差异均不显著。     

华南虎圈养种群的统计分析

对《华南虎谱系》307 只登录个体的统计表明, 其圈养的历史有46 年。在人工繁殖的38 年中产122 胎287仔。现存圈养华南虎分散在全国22 家单位, 有57 只个体, 性比M∶F = 1185 , 能成功繁殖后代的个体仅5 只(只占818 %) , 是一个衰退的种群。通过SPARKS 和GENES 软件分析发现: 从1977 年开始, 圈养种群的基因多样性便逐渐下降而近交系数却不断增加。     

The year of the tiger and the year of tiger genomes!

Tigers are endangered apex predators. They typify endangered species because they are elusive, rare, and face numerous threats across their range. Tigers also symbolize conservation. However, it is very difficult to study tigers because of their stated nature. Also, tiger conservation is a geopolitically sensitive topic, making it difficult to use the studies to propose evidence-based management that allows their recovery, especially in the context of conservation genetics. Zhang et al. (Mol. Ecol. Resour., 2022) have created very valuable and rare resources to aid the community in conserving tigers. First, they present chromosome level genome assemblies of a South China tiger and an Amur tiger. Second, they present whole genome sequences of 16 captive South China tigers. Additionally, by using the assemblies they model the demographic history of these populations, estimate inbreeding and the potential threats they face in captivity. This approach is particularly important because genetic management is now the only remaining option for South China tigers, because they are extinct in the wild. In other words, captive individuals are our only hope for some day restoring the wild populations of South China tigers.     

华南虎现状及谱系分析

华南虎目前处于极危状态。野生个体已极为少见,只有中国一些动物园内饲养着 53只。按其亲缘关系分为上海系和贵阳系,上海系的华南虎携带优秀的多子基因,但其子代的生活力不强;而贵阳系的虎虽然产子率不高,但子代的生活力很强,现存的6只贵阳系华南虎具有极高的基因保存与基因研究价值,应建立基因库。这些虎分散饲养于22个单位,大大降低了适龄虎的交配繁殖机会,浪费了本已有限的珍贵资源,是抑制其种群发展的最主要因素。目前其种群的年龄结构非常合理,育龄虎占种群的62.3％,幼龄虎为28.3％,高龄虎很少,仅为9.4％,今后种群的发展乐观。     

华南虎血液及生物化学某些指标的测定

用血液及生物化学的常规测定方法对６１例华南虎的血液常规,３０余例血液生化指标进行了分析测定,经生物学统计获得了华南虎的血液和生物化学的参考值。     

Weights of gaur (Bos gaurus) and banteng (Bos javanicus) killed by tigers in Thailand

The primary prey of tigers across much of South‐East Asia has been depleted, reducing the ability of already limited habitat to support tigers. To better understand the extent to which two of the largest prey species, gaur (Bos gaurus) and banteng (Bos javanicus), contribute to the tiger's diet, we estimated the average size of these species killed by tigers. This information is needed to more accurately calculate biomass of these species in the tiger's diet and to devise strategies to increase tiger carrying capacity where habitat is fragmented and limited in west‐central Thailand. We used temporally clumped locations of 24 satellite radio‐collared tigers to identify their kill sites and obtained mandibles from 82 gaur and 79 banteng. Kills were aged by teeth eruption sequence, sectioning the M1 molar and counting cementum annuli. Of all gaur killed, 45.2% were adults; of all banteng killed, 55.7% were adults. The average weight of banteng killed was 423.9 kg, which was similar to the 397.9 kg average weight for gaur. The mean weight of both prey species is 3.5–4.5 times greater than the predicted 1:1 preferred prey to predator ratio. In the absence of medium‐sized prey, killing these larger animals may be especially critical for female tigers provisioning nearly independent young when male offspring are already larger than the mother. This is the first study to present data on the average weights of gaur and banteng killed in South‐East Asia, and these results suggest that these are key prey species to target in tiger prey recovery efforts.     

中国野生东北虎数量监测方法有效性评估

虎数量监测是虎保护的核心内容之一。野生虎现存数量少、领域宽广,加之习性机警,很难对其数量和种群变化趋势做出准确的评估。合适的虎数量监测方法随着监测目标、监测尺度、虎密度、猎物密度、气候及其它环境因素的变化而不同。2002—2011年,用东北虎信息收集网络法,样线调查法,猎物生物量和捕食者关系法,对东北虎数量进行监测。(1)用老虎信息收集网络法研究2006年完达山东部地区东北虎的种群现状,结果显示东完达山地区2006年东北虎数量为6—9只,由1只成年雄虎,2—3只成年雌虎,2—4只亚成体虎和1只小于1岁的幼体虎组成;(2)用猎物生物量和捕食者关系法得到东完达山地区2002年东北虎的密度为0.356只/100 km2,能容纳22—27只东北虎;(3)用样线法在黑龙江的老爷岭南部和吉林省大龙岭北部面积1735.99 km2的区域内设置样线64条,总长609 km,没有发现东北虎足迹链。样线调查的结果表明,在2011年2—3月该调查区域东北虎的数量为0只。监测结果表明,用猎物生物量和捕食者关系得到东北虎数量远远超过现实数量,人们对有蹄类的盗猎和猎套对老虎的伤害可能是其主要原因;样线法调查得出的结果低于现实种群,主要原因是老虎数量极低和调查者对野生虎行为学了解甚少,较难在野外有效的发现虎信息;且样线法监测仅应用于当东北虎以一定的密度(即有定居虎)存在的情况下(多数监测样线能发现虎信息)。虽然和样线法一样存在着诸如专家估计密度和真实密度之间的关系,老虎足迹数量和老虎真实密度间关系不确定,保守估计等内在缺点,在目前中国东北地区野生东北虎种群密度极低,且多是穿越于中俄边境地区的游荡个体的现状下,信息收集网络法是一种高效,可行东北虎监测方法。因此,建议建立更广泛的监测信息收集网络,培训监测人员,严格执行信息收集程序,减少专家估计误差以完善此监测方法。此外,其他监测方法,如占有法、基于标志重捕远红外照相法、粪便DNA法、足迹数码信息法、警犬法等,应根据各种方法的理论前提、误差来源、适用范围和老虎是否定居及密度等具体情况有选择地加以应用,且有些方法可能成为未来中国野生东北虎种群的有效监测工具。     

圈养华南虎钩端螺旋体感染情况调查

钩端螺旋体病(Leptospirosis)为致病性钩端螺旋体引起的人畜共患传染病,在世界范围内分布(Levett,2001),可感染鼠科、猴科和犬科等多种动物(Desvars et al.,2012).人或动物通过接触带菌动物的粪便、尿液污染的水和土壤而感染(娄银莹等,2019),可造成黄疸、急性肾功能衰竭、出血性素质...     

Phylogeography and genetic ancestry of tigers (Panthera tigris)

Eight traditional subspecies of tiger (Panthera tigris),of which three recently became extinct, are commonly recognized on the basis of geographic isolation and morphological characteristics. To investigate the species' evolutionary history and to establish objective methods for subspecies recognition, voucher specimens of blood, skin, hair, and/or skin biopsies from 134 tigers with verified geographic origins or heritage across the whole distribution range were examined for three molecular markers: (1) 4.0 kb of mitochondrial DNA (mtDNA) sequence; (2) allele variation in the nuclear major histocompatibility complex class II DRB gene; and (3) composite nuclear microsatellite genotypes based on 30 loci. Relatively low genetic variation with mtDNA,DRB,and microsatellite loci was found, but significant population subdivision was nonetheless apparent among five living subspecies. In addition, a distinct partition of the Indochinese subspecies P. t. corbetti in to northern Indochinese and Malayan Peninsula populations was discovered. Population genetic structure would suggest recognition of six taxonomic units or subspecies: (1) Amur tiger P. t. altaica; (2) northern Indochinese tiger P. t. corbetti; (3) South China tiger P. t. amoyensis; (4) Malayan tiger P. t. jacksoni, named for the tiger conservationist Peter Jackson; (5) Sumatran tiger P. t. sumatrae; and (6) Bengal tiger P. t. tigris. The proposed South China tiger lineage is tentative due to limited sampling. The age of the most recent common ancestor for tiger mtDNA was estimated to be 72,000-108,000 y, relatively younger than some other Panthera species. A combination of population expansions, reduced gene flow, and genetic drift following the last genetic diminution, and the recent anthropogenic range contraction, have led to the distinct genetic partitions. These results provide an explicit basis for subspecies recognition and will lead to the improved management and conservation of these recently isolated but distinct geographic populations of tigers.