生物及生化分析方法在食品分析中的应用

生物及生化分析方法在食品分析中的应用龚镥,卢大用,曹静懿（上海大学生命科学学院,上海２０１８００）本文概述厂在食品分析中所涉及的生物及生化分析方法的原理、优缺点和应用,并对近年来国内外在这方面的工作进行了简要的评述,以期引起同行们的关注。１．生物及生...     

滴水湖浮游动物群落结构及其与环境因子的关系

为研究上海市滴水湖浮游动物群落结构及其与环境因子的关系,于2012年1—12月对滴水湖进行了一年调查采样。共检出浮游动物33属61种,其中轮虫22属45种,枝角类4属7种,桡足类7属9种。优势种包括10种轮虫,桡足类为中华窄腹剑水蚤(Limnoithona sinensis)和无节幼体,枝角类不形成优势种。浮游动物年均密度为1200个/L,年均生物量为1.67mg/L,种类数、密度和生物量均为春夏两季相对较高。Shannon-Wiener多样性指数H'和Margalef丰富度指数D年均值分别为1.61和1.01,多样性季节差异显著而各样点间差异不显著。相关性分析和多元回归分析显示,水温是影响滴水湖浮游动物群落结构变化的决定性因子,冗余分析(RDA)显示TN、TP、叶绿素a和p H也是影响浮游动物群落变化的重要因素,表明滴水湖浮游动物群落结构的季节变化与水体营养状况密切相关。综合运用水质理化因子、综合营养状态指数、多样性指数及浮游动物优势种对滴水湖进行水质污染水平和富营养化评价,得出2012年滴水湖水质状况属于α-中污型,营养程度为中富营养水平。     

国际生物技术专利计量分析

目的:通过对近10年全球生物技术专利的文献计量分析,了解其年度分布、国家/地区分布、机构分布和技术热点分布等,结合产业现状,讨论我国在生物技术专利方面的实力和在全球的位置,以期为我国生物技术的研发和产业发展提供参考。方法:在Derwent Innovation Index数据库中检索2001～2010年的生物技术专利,用TDA软件进行数据分析。结果:国际生物技术专利的数量从1996～2002年呈快速增长趋势,2002年后缓慢下降;生物技术专利中的80%分布在美国、日本和中国,集中程度高;申请数排名前20位的专利权人主要分布在美国、日本和中国;专利的技术热点有方法研究、生物医药和治疗研究、生物大分子研究等。美国、日本、欧洲研究机构的专利基础性较中国强,且更加注重产品开发。结论:我国的生物技术专利数量排名靠前值得欣喜,然而在专利的基础性及专利应用于产品转化方面,与美、日、欧等发达国家/地区仍有差距,我国生物技术研发应更加重视基础性研究,同时不断推动生物技术专利的转化。     

鮸形态性状与体质量的关系

为了研究鮸的形态性状与体质量之间的关系,测量了524尾12月龄左右鮸的体质量(Y, g)和8个形态性状(cm),包括全长(X₁)、体长(X₂)、头长(X₃)、躯干长(X₄)、尾长(X₅)、尾柄长(X₆)、尾柄高(X₇)和体高(X₈).采用相关分析、回归分析、通径分析以及模型拟合等方法对其进行分析.结果表明: 鮸所有性状两两之间存在极显著正相关关系,相关系数在0.834～0.941.经共线性诊断排除了体长这一具有严重共线性的性状后,采用逐步引入-剔除法进行多元回归并进行显著性检验,成功筛选出全长(X₁)、躯干长(X₄)、尾柄高(X₇)和体高(X₈)4个统计检验极显著的形态性状,并建立多元回归方程:Y ＝-444.188 +7.943X₁ +12.861X₄ +38.254X₇ + 42.722X₈.通径分析结果显示,4个形态性状中,体高对体质量的直接作用最大(通径系数=0.351),全长次之(通径系数=0.335).对全长和体高与体质量之间的函数关系进行曲线模型拟合得出,在6个拟合模型中,幂函数模型拟合效果最好,方程为:y=0.013 x^2.891(全长); y=2.028 x^2.751(体高).经适合性检验得知,全长比体高通过幂函数对体质量的预测效果更好.研究结果可为鮸的形态性状在选择育种中的有效利用提供重要参考.     

影响水稻光合日变化的酶和相关因素的分析

水稻叶片的最大光合速率出现在上午１０：００时,Ｒｕｂｉｓｃｏ初始活力也在此时达到最大,然后逐渐降低,下午１４：００时略上升后又下降．Ｒｕｂｉｓｃｏ初始活力与光合速率之间极显著相关,相关系数为 ０．９４７４．运用相关性分析、回归分析、通径分析,对晴（有时有云）天气水稻叶片的光合速度、光合关键酶及有关因素的日变化进行综合评估,结果发现中午光合下降主要来自气孔限制,同时Ｒｕｂｉｓｃｏ活性也下降;Ｒｕｂｉｓｃｏ活性是影响光合日变化的又一重要生化因子．体内Ｒｕｂｉｓｃｏ活性受Ｒｕｂｉｓｃｏ活化酶的调节．     

马腺疫病变与流行的调查与防治

养马业的安全、高产、优质、高效、生态方向发展是我国养马生产可持续发展的必经之道。当时近几年我国许多地方的马只陆续大规模严重发病,发病率及死亡率较高,给许多马场造成了重大的经济损失。其中马腺疫病变在当前比较流行,防止也比较困难。本文为此也提出了相关对策,要根据规模化养马场的马腺疫病变流行特点和传播规律,确定加强饲养管理,采取综合性防治措施,正确合理选用药物,以降低由马腺疫造成的经济损失,保障畜牧业健康可持续发展。     

微流控分析芯片在医学领域的应用

微全分析系统(μ_TAS)又称为芯片实验室,自从Manz等于20世纪90年代首次提出这一概念以来,经过十余年的发展μ_TAS已成为生物分析的一个独立领域并被学术界所认可。微流控分析芯片作为μ_TAS发展的主要方向以其快速、高效分析,低消耗和微型化等特点发展非常迅速。在此结合微流控分析芯片在医学领域的应用状况,着重从基因检测、蛋白质分析和细胞分析等方面,对该技术在医学领域里的应用及其未来发展趋势作一综述。     

氨基酸分析的准确度和精确度（续）

氨基酸分析的准确度和精确度（续）ＲｉｃｈａｒｄＬＤａｖｉｅｓ,ＤＲｏｂｉｎＢａｉｇｅｎｔ,ＭａｌｃｏｌｍＳＬｅｖｉｔｔ,ＹａｓｉｎＭｏｌｌａｈ,ＣａｒｌＪＲａｙｎｅｒ和ＡｌｉｓｏｎＢＦｒｅｎｓｈａｍ著张林生译魏景刚校西北农业大学实验中心陕西杨陵７１２...     

河流搬运花粉的初步研究

为进一步认识华北平原不同沉积相的孢粉组合特征和冲积物孢粉的沉积机制,作者对华北平原两条较大的河流——黄河、滦河的表层水样进行了孢粉分析１　材料和方法１．１　取样工具为容积１０００ｍＬ的塑料桶。将河流表层水灌入桶内,加盖封好带回实验室。将水样倒入２０００ｍＬ烧杯内,滴入现代石松孢子１３０００粒,以进行孢粉浓度计算［１］,同时加入少许冰醋酸,加速沉淀。将沉淀物置于离心杯中,用２．１和１．９的重液进行浮选,最后制成活动片在显微镜下进行鉴定、统计。１．２　冲积物的采集用一个圆筒形的铲,拴上绳子抛入河底,…     

油棕鲜果穗产量构成因素的相关性和回归分析

为明确油棕鲜果穗产量构成因素之间的关系,利用相关性、回归和通径等分析方法,对58株油棕单株鲜果穗产量与其它性状相关性进行了研究。结果表明:油棕鲜果穗产量与鲜果穗重和每株果穗数的相关性最为密切。另外,在油棕高产品种选育过程中,应着重对平均果穗重、每株果穗数、果实大小和含油量等性状进行选择,并综合权衡这些产量性状之间的相互作用。产量性状变异和相关性分析表明,平均种壳厚度变异程度最大(88.34%),平均果长变异最小(11.99%),鲜果穗产量与鲜果穗重、每株果穗数、平均果重呈极显著正相关关系(0.882**,0.714**,0.439**),与平均果长呈显著正相关关系(0.334*)。多元线性回归和通径分析结果表明,通过比较多元线性回归方程的相关参数,建立了可实用的最优多元线性回归方程x_1=-281.511+2.787x_4+3.455x_5-2.672x_6+0.411x_7+6.690x_8+3.664x_9,平均鲜果穗重和每株果穗数对单株鲜果穗产量的直接作用最大(0.670,0.439),其它性状对单株产量的直接作用较小,平均果重和平均果长对单株鲜果穗产量的间接作用最大(0.335,0.322)。该研究结果为油棕高产品种选育提供了依据。     

《生物技术通报》2011年文献计量分析

运用文献计量学的相关理论和方法,对《生物技术通报》2011年所刊论文从载文、作者和引文三个方面的载文量等多项指标进行统计分析,为主办单位掌握期刊现状,提高办刊质量提供依据,也为本刊读者进行文献阅读和投稿提供信息参考.     

城市物质流分析框架及其指标体系构建

借鉴国内外物质流分析的研究成果,结合我国城市物质代谢特点,建立了城市物质流分析的框架及指标体系。该框架以城市社会经济系统物质通量的变化为核心,增加了对城市社会经济系统可持续能力的考察以及对城市和区域循环经济贡献的关注。论文识别了城市物质流分析中系统边界界定等关键问题,并提出了解决方法;指标体系在借鉴国家层面物质流分析指标体系的基础上,注重对城市经济系统内部循环及不同城市经济系统间的物质循环的考察,增加了再生资源输入量、内部资源回收量、可回收废物输出量、新鲜水输入量、中水回用量等指标,用于表征城市可持续发展的能力及实践成果。     

肺音信号分析系统研制

本文研制的肺音信号检测与分析系统,具有肺音信号采集、肺音图显示、肺音信号的 时域分析等项功能。     

家蚕浓核病毒 Bm DNV-3(中国株)VD1基因组结构与转录分析

为了进一步认识家蚕浓核病毒BmDNV-3(中国株)VD1基因组的结构和功能,VD1被分离、纯化、克隆到pUC119载体上,完成了基因组全序列的测定。序列分析显示VD1基因组全长为6543个核苷酸,末端拥有224个核苷酸反向重复序列(ITRs)。VD1基因组正链含有3个大的开放阅读框(ORF1-3),负链含有1个大的开放阅读框(ORF4)。比较BmDNV-3的VD1和BmDNV-2(Yamanashiisolate)的VD1基因组全序列,两者同源性为98.4%,并且有107个碱基的替代和1个碱基插入,氨基酸突变集中在VD1ORF3和VD1ORF4。Northern杂交结果显示VD1的左边正链上有1.1kb和1.5kb两个转录本,右边的负链上有一个3.3kb转录本。3′和5′-RACE结果显示1.1kb转录本开始于nt290,结束于nt1437;1.5kb转录本开始于nt1423,结束于nt2931;3.3kb转录本开始于nt6287,结束于nt2922。正链上1.5kb转录本和负链上3.3kb转录本拥有10个核苷酸的3′端的共同序列。研究结果显示该病毒基因转录与已报道的其它浓核病毒存在较大的差异性。     

ISM法在中学生物学教材分析中的应用及案例分析

教材分析是开展有效教学的前提,而ISM（InterpretiveStructualModel）法是实现教材结构化和序列化的有效方法。以普通高中生物学教材中具体案例为依托．展示应用ISM法进行教材分析的基本原理和操作程序,力图为提高教材分析的科学性提供参考。     

个人基因分析市场不断扩大或可用于新药研制

通过互联网等途径实施面向个人的基因分析服务正在扩大。将匿名化的分析数据与个人的健康信息缀合起来，可能用于将来的新药研制上。但是，个人基因分析尚在发展过程中，并不能确保评价结果具有科学根据。     

肺形侧耳变温结实相关基因Ppcsl-1的克隆及功能预测

CSL（CBF1/RBP-Jκ/suppressor of hairless/LAG-1）转录因子家族在真菌发育和细胞分化过程中扮演重要角色。前期研究已构建了肺形侧耳变温结实相关消减杂交文库,并从中筛选到一个代表csl基因部分序列的EST。通过TAIL PCR（thermal asymmetric interlaced PCR）技术克隆了该基因（Pleurotus pulmonarius csl-1,简写为 Ppcsl-1）,并利用RACE（rapid-amplification of cDNA ends）技术获得该基因的cDNA全长。Ppcsl-1 cDNA全长2 991bp,编码一个996个氨基酸组成的蛋白（命名为PpCSL-1）。进化分析显示在担子菌CSL中,PpCSL-1与糙皮侧耳Pleurotus ostreatus CSL（PoCSL）亲缘关系最近。荧光定量检测结果表明Ppcsl-1在菌丝经过5℃ 12h冷处理之后的表达量最高,表明其有可能被冷刺激诱导表达并在开启子实体形成的过程中起重要作用。     

克拉玛依油田石油污染土壤细菌群落结构与环境因子的关系

【目的】以16S rRNA为分子标记,探讨克拉玛依油田石油污染土壤中细菌群落多样性和系统发育,并分析环境因子对群落分布的影响,为生物降解石油污染物提供理论基础。【方法】在克拉玛依油田分别采集深度为5、20、50 cm的石油污染土壤样品,测定环境参数;提取石油污染土壤细菌群落基因组DNA,分别构建3个土层细菌16S rRNA基因文库,利用限制性片段长度多态性分析(Restriction fragment length polymorphisms RFLP)技术初步分群,确定各文库中的代表菌株并测定16S rRNA基因序列;利用软件Biodap计算各群落多样性和丰富度指数,以Neighbor-Joining法构建3个土层细菌的系统发育树;运用软件CANOCO 4.5结合不同样品环境因子的差异进行典型对应分析(CCA),并探讨了环境因子对细菌多样性的影响。【结果】环境参数结果表明20 cm土层总磷(TP)、总氮(TN)含量最低,50 cm含量最高;5 cm土层中有机碳(TOC)含量最高,50 cm含量最低。基于16S rRNA序列的生物多样性和物种丰富度指数表明20 cm土层生物多样性和丰富度指数较高,而50 cm土层各项指数均较低。各土层供试序列RFLP聚类分析表明,克拉玛依油田石油污染土壤细菌种群具有丰富的多样性。Neighbor-Joining构建的系统发育分析表明,石油污染土壤被分为5个类群(I–V),分别为变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicute)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、浮霉状菌门(Planctomycetes),其中群Ⅰ占78.57%,广泛分布于不同的生态环境;其中来自5 cm土层代表菌的69.23%分布于群Ⅰ。CCA分析结果显示TN、TP和TOC对大部分细菌影响较大;TOC含量对Pseudomonas影响明显。【结论】克拉玛依油田石油污染土壤细菌群落具有丰富的多样性;环境因子是影响石油污染土壤细菌群落空间分布的重要因素。     

采用数据挖掘技术对湖北省人类狂犬病开展生物信息学研究

狂犬病作为一种急性人畜共患疾病,其致死率接近100%。而湖北省作为我国中部狂犬病高发地之一,开展该省狂犬病的流行病学调查不仅有助于了解我国当前面临的狂犬病疫情风险,还能为当地及全国狂犬病防控工作提供有效的参考意见。首先运用描述性分析发现湖北省狂犬病发病人数随时间呈下降趋势,而狂犬病暴露人数则呈上升趋势,且近年来中西部地区狂犬病发病人数较东部地区略为突出,而男性狂犬病发病人数明显多于女性,且中老年群体感染人数多。同时,利用时间序列方法对狂犬病发病与暴露人数的时间序列数据予以分析,证实二者存在季节周期性且具有一定互相关性。研究所构建的风险模型预测未来三年狂犬病发病人数呈稳定趋势,但狂犬病暴露人数却会增加。然后,通过面板回归与差异显著性分析,发现湖北省的狂犬病年发病人数受到人口、GDP、气温和降水的综合影响,且不同海拔和坡度地区的狂犬病发病人数具有显著性差异。最后,讨论了研究存在的局限性以及未来的研究方向。     

手术室工作流程现状分析

目的 通过具体的手术室流程分析，探索医院手术室流程科学合理的管理方法。方法 运用现场调研法对手术室的流程进行考察分析，并应用流程图的方法显化现有手术室的流程，对现有流程采用德尔菲法和FTA的方法进行分析。结果 得到手术室工作流程的问题报告。结论 手术室的流程问题主要有：等待浪费，沟通失效，操作行为不当，管理技术不当，设施布局不合理。