小麦族四个属模式种的醇溶蛋白分析

利用酸性聚丙烯酰胺凝胶电泳 (APAGE)对小麦族披碱草属、鹅观草属、猬草属和仲彬草属 4个属的模式种进行了醇溶蛋白电泳分析 ,结果表明 :(1 ) 4个模式种具有明显的醇溶蛋白遗传多样性 ,其种间醇溶蛋白多态性高达 92 .3 % ;(2 ) Elymus sibiricus和 H ystrix patula具有相似的醇溶蛋白带型 ,而 Roegneria caucasica和Kengyilia gobicola的带型基本相似 ,其醇溶蛋白图谱能够反映一定的系统关系 ;(3 )不同收集地的 E. sibiricus材料间也存在明显的醇溶蛋白遗传差异 ,新疆的 E. sibiricus具有较丰富的醇溶蛋白带纹 ,而甘肃的 E. sibiricus的醇溶蛋白带纹较少。     

偃麦草属植物醇溶蛋白和谷蛋白多态性及系统学研究

运用酸性聚丙烯酰胺凝胶电泳(A-PAGE)和十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)对偃麦草属(Elytrigia)24个物种的醇溶蛋白和谷蛋白进行了研究。以中国春为参照,按醇溶蛋白和谷蛋白电泳图谱条带迁移距离大小和条带多态性对供试材料进行聚类分析。结果显示,24份供试材料均呈现不同的醇溶蛋白和谷蛋白电泳图谱,共分离出醇溶蛋白带纹83条和谷蛋白带纹53条,多态性均达100%,并且在相同染色体组组成的物种中,染色体数目越多,其蛋白带纹越多;偃麦草属24个物种的醇溶蛋白和谷蛋白图谱均有明显差异,蛋白图谱可作为鉴定偃麦草属物种的指纹图谱。聚类分析结果显示,在材料间的醇溶蛋白遗传相似性系数为0.66时,24份材料被划分为6个主要类群,含E和St基因组的物种具有较近的亲缘关系;在谷蛋白遗传相似性系数为0.62时,24份材料被聚为4大类。聚类结果表明,染色体组成未知的物种Et.pachynera可能为异源多倍体物种。     

波斯小麦醇溶蛋白遗传多样性分析

应用APAGE技术对来源于16个国家(地区)96份波斯小麦材料进行醇溶蛋白遗传多样性分析,结果表明,波斯小麦具有丰富的醇溶蛋白等位变异,共分离出55条迁移率不同的带纹。每份材料可电泳出13～26条,平均18.6条,带纹多态性为100%。96份材料共出现了75种电泳图谱类型,其中31份材料共同拥有10种图谱,剩余的65份材料的电泳图谱各不相同。供试材料间GS值变异范围为0.176～1.000,平均值为0.538。聚类分析表明,在GS值0.538水平上供试材料可聚为五大类群,且遗传聚类关系与材料的地理来源有一定的相关性。     

鹅观草属三个物种及其居群间的醇溶蛋白分析

利用酸性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术(APAGE)对小麦族鹅观草属3个物种:毛叶鹅观草、纤毛鹅观草和竖立鹅观草进行了醇溶蛋白电泳分析,23份材料电泳分离出22条相对迁移率不同的谱带,其中3条(16.6%)共同带,19条(83.4%)具多态性,每个材料可分离出9～16条谱带。结果表明:(1)三个物种具有相似的醇溶蛋白带型,但存在明显的种间差异;(2)同种不同居群间也存在遗传差异;(3)种间差异大于种内差异。     

鹅观草种质资源醇溶蛋白遗传多样性研究

以8个地理类群的90份鹅观草野生种质材料为研究对象,采用A-PAGE(酸性聚丙烯酰胺)凝胶电泳技术进行蛋白质水平遗传多样性检测.研究结果表明,来源于不同居群的鹅观草共分离出26条谱带,每个材料可以分离出5～26条迁移率不同的谱带, 平均谱带数为16.39条,其中平均多态性谱带为12.65条,多态性比例为77.22%;基于供试材料醇溶蛋白每个位点谱带出现的频率,分别计算了地理类群内多样性指数(0.345)和总多样性指数(0.471),类群间的遗传分化系数为26.8%,表明鹅观草变异的73.2% 来源于类群内;90份供试材料醇溶蛋白的Jaccard遗传相似系数变异范围为0.133 3～1.000,平均遗传相似系数为0.395 7;利用种子醇溶蛋白可将90份材料分为12类,鹅观草种质资源之间的亲缘关系呈现出一定的地域性规律;不同地理类群间的遗传多样性指数从高到低的排列顺序依次为云南＞四川＞内蒙古＞新疆＞山西＞甘肃＞宁夏＞河北.因此在进行鹅观草种质资源收集和原地保护时,建议对云南和四川地区的鹅观草种质资源应给予极大关注.     

野生垂穗鹅观草醇溶蛋白遗传多样性研究

利用酸性聚丙烯酰胺凝胶电泳(Acid-polyacrylamidegel electrophoresis)法对来源于内蒙古、山西、甘肃、新疆、云南、四川和西藏的25份垂穗鹅观草材料进行醇溶蛋白检测。研究结果表明,供试材料可分离出30条相对迁移率不同的谱带,每份材料可电泳出11～22条谱带,其中只有1条(3.45%)带纹是25份材料共有的,其余29条谱带均具有不同程度的多态性,多态性谱带数目占分离出总条带的96.67%,说明野生垂穗鹅观草具有较丰富的遗传多样性。聚类分析发现,材料的遗传相似系数(GS)变异范围为0.111～0.9286,平均值为0.4821。在GS值为0.4821的水平上供试材料可聚为6个类群,某些具有相同地理来源的材料聚成一类或亚类,即醇溶蛋白图谱类型与材料的生态地理环境具有相关性。     

应用ISSR标记研究仲彬草属植物的遗传变异

利用ISSR标记对仲彬草属14个种和1个变种共32份材料进行了研究。结果表明:仲彬草属材料间ISSR标记多态性较高,变异较大。12个引物共扩增出593条带,其中535条(90.2%)具有多态性,每个引物可扩增出11~80条多态性带,平均44.6条。ISSR标记遗传相似系数在种间变化范围为0.430~0.866,平均值为0.620。从聚类分析得知,ISSR标记能将32份仲彬草属材料完全分开,32份材料聚为4类。同种不同居群的材料分别聚在一起,亲缘关系较近,同时,在分子水平上种内不同居群间也存在分化;种间存在明显的遗传差异;形态相似、地理分布一致的物种倾向于聚类在一起,有一定的亲缘关系。因此,ISSR分子标记能有效地评价仲彬草属物种的亲缘关系。     

普通小麦品种间醇溶蛋白遗传多样性分析

采用酸性聚丙烯酰胺凝胶电泳(A—PAGE)对43个不同来源的普通小麦品种进行了醇溶蛋白位点特异性检测,分析了不同基因型间醇溶蛋白的遗传差异和遗传多样性。结果表明：43个供试品种在醇溶蛋白带型上差异显著。醇溶蛋白电泳共分离出51条迁移率不同的带,其中有4条稳定表达带(均为100％表达)．47条具有多态性,占97．6％。供试品种间遗传距离(GD)在0．35～0．82之间,平均值为0．58,遗传变异较大。聚类分析可将其分为5大类。分析认为：供试品种醇溶蛋白变异丰富,存在广泛的遗传多样性。     

野生垂穗披碱草种质的醇溶蛋白遗传多样性分析

用酸性聚丙烯酰胺凝胶电泳(A-PAGE) 对采集自中国新疆、青海、四川、西藏四省区的33份垂穗披碱草Elymus nutans材料进行醇溶蛋白分析,获得下述结果:（1）供试材料共分离出38条带纹,多态率达92.10%。4个电泳分区（α、β、γ、ω）的平均Shannon指数为0.55,Nei-Li遗传相似系数（GS）变异范围为0.36~0.93,平均值为0.63。这些结果说明供试野生垂穗披碱草材料具有较为丰富的醇溶蛋白遗传多样性。（2）对所有材料的聚类分析和主成分分析发现,在GS值为0.67的水平上供试材料可聚成7个类群,绝大部分来自于相同或相似生态地理环境的材料聚成一类,即醇溶蛋白图谱类型与材料的生态地理环境具有一定的相关性。（3）基于Shannon 多样性指数估算了5个垂穗披碱草地理类群内和类群间的遗传分化,发现类群内遗传变异占总变异的42.94 %,而类群间的遗传变异占总变异的57.06 %。这可能与该草以自花传粉为主的繁育系统有关。（4）对各地理类群基于Nei氏无偏估计的遗传一致度的聚类分析表明,各地理类群间的遗传分化与其所处的地理生态环境具有较高的相关性。 .     

山羊草Aegilops kotschyi及其供体种Ae.longissima和Ae.umbellulata的醇溶蛋白研究

采用酸性聚丙烯酰胺凝胶电泳(APAGE)法对11份A担心Aegilops kotschyi及其S^1染色体组供体种Ae.longissima2份和U染色体组供体种Ae.umbellulata6份进行了醇溶蛋白位点的研究。结果表明：11份Ae.kotschyi共分离出32条带,31条具有多态性,占96．88％,每份材料可以分离出10-17条谱带,其中仅1条(3．12％)是共有带;11份Ae.kotschyi的遗传距离的变异范围在0-0.704之间,平均为0．409;11份Ae.kotschyi分离出的多数醇溶蛋白谱带均与其染色体组供体种Ae.longissi-ma及Ae.umbellulata相同,但仍有8条谱带未在两供体种中找到;11份Ae.kotschyi的醇溶蛋白多态性(96．88％)明显高于Ae.longissima(52．94％)与Ae.umbellulata(88．89％)11份Ae.kotschyi中有4份表现出了一定的特征带,分析知可能在γ区发生了较大的变异。     

ISSR and DAMD markers revealed high genetic variability within Flavoparmelia caperata in Western Himalaya (India)

Flavoparmelia caperata (L.) Hale is medicinally very important and possesses antifungal and antibacterial activities. F. caperata is the only species found in India. Inter simple sequence repeat (ISSR) and Directed amplification of minisatellite DNA (DAMD) methods were used to analyze the genetic variability within F. caperata from the Western Himalayan region of India. Eleven ISSR and 10 DAMD primers produced 139 and 117 polymorphic bands, and detected 91.44 and 82.34 % polymorphisms, respectively. Cumulative band data generated for ISSR and DAMD markers resulted in 86.86 % polymorphism across all the accessions of F. caperata. The average Polymorphic information content (PIC) value obtained with ISSR, DAMD, and cumulative band data were 0.28, 0.27, and 0.27, respectively. The clustering of the F. caperata accessions in the UPGMA dendrogram showed that these accessions are intermingled with each other in different subclusters irrespective of their geographical affiliations. The pattern of genetic variations within F. caperata accessions could be due to free exchange of spores that might have taken place among these accessions in the wild. ISSR and DAMD markers efficiently and reliably resulted in discrete banding patterns and polymorphic profiles. These markers despite targeting different regions of genome, revealed almost similar levels of polymorphism across all the accessions. The wide range of genetic distance and high level of polymorphism detected by ISSR and DAMD reflected a high genetic variability among the different accessions of F. caperata.     

Comparison of RFLP and RAPD markers to estimating genetic relationships within and among cruciferous species

Restriction fragment length polymorphism (RFLP) and random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers are being used widely for evaluating genetic relationships of crop germplasm. Differences in the properties of these two markers could result in different estimates of genetic relationships among some accessions. Nuclear RFLP markers detected by genomic DNA and cDNA clones and RAPD markers were compared for evaluating genetic relationships among 18 accessions from six cultivated Brassica species and one accession from Raphanus sativus. Based on comparisons of genetic-similarity matrices and cophenetic values, RAPD markers were very similar to RFLP markers for estimating intraspecific genetic relationships; however, the two marker types gave different results for interspecific genetic relationships. The presence of amplified mitochondrial and chloroplast DNA fragments in the RAPD data set did not appear to account for differences in RAPD- and RFLP-based dendrograms. However, hybridization tests of RAPD fragments with similar molecular weights demonstrated that some fragments, scored as identical, were not homologous. In all these cases, the differences occurred at the interspecific level. Our results suggest that RAPD data may be less reliable than RFLP data when estimating genetic relationships of accessions from more than one species.