长链非编码RNA与肿瘤和干细胞

人类基因组包含20 000多种蛋白质编码基因,只占总基因的2%左右,而90%以上的转录子是长链非编码RNA(Long non-coding RNAs,lnc RNAs)。lnc RNAs是广泛存在于哺乳动物基因组中的长度在200-100 000 nt之间,且不具有蛋白质编码功能的转录本。研究发现其在许多类型的肿瘤中存在异常表达,具有潜在的致癌或抑癌作用,并作为重要的调控分子参与各种生物学过程,与肿瘤的发生、发展密不可分。此外,lnc RNAs在维持干细胞全能性、调控干细胞基因表达、调节干细胞自我更新和分化等方面发挥了至关重要的作用,是继micro RNA后肿瘤研究的新热点。针对lnc RNAs在肿瘤和干细胞生物学中的功能及相关机制作一综述,旨在为肿瘤的诊断、治疗、预后等方面提供新思路。     

微小RNA通过调控肿瘤血管形成影响肿瘤转移

肿瘤转移的过程是一个连续的、相互关联的级联事件,整个过程受多因素、多基因调控。血管形成是肿瘤转移的前提和基础,抑制肿瘤血管生成是控制肿瘤转移的一个可行策略。微小RNA(micro RNAs,mi RNAs)是一类非编码的小分子RNA,可在转录后水平调控肿瘤血管生成,在肿瘤的转移过程中起着至关重要的作用。本文主要就mi RNAs调控肿瘤血管形成参与肿瘤转移过程中的最新研究进展进行了综述。     

miR-365在肿瘤中的研究进展

在了解肿瘤信号通路方面虽已取得了实质性的进展,但由于肿瘤的致瘤通路、耐药性等方面的复杂性,导致仍然缺乏治疗肿瘤的有效手段。micro RNAs(mi RNAs)的发现为解决这个问题提供了新的希望。mi R-365作为mi RNAs中的重要一员,在肿瘤中频繁的异常表达已经证明其与肿瘤的发生发展及预后息息相关。因此深入研究mi R-365在肿瘤中的表达特点及与相关基因的调控关系将为了解肿瘤细胞周期、增殖、凋亡等生物学功能提供更有效的视点,为肿瘤的临床治疗提供潜在的治疗靶点。现就mi R-365在肿瘤中的表达及与信号通路之间的调控作一简要综述,以揭示mi R-365在肿瘤细胞内的表达调控情况。     

国家自然科学基金资助非编码RNAs与肿瘤研究

现总结2010—2017年国家自然科学基金委员会医学科学部肿瘤学代码下非编码RNAs(non-coding RNAs,ncRNAs)相关研究的申请、资助情况;展示自然科学基金资助下,中国在ncRNAs与肿瘤研究领域的现状和发展趋势;分析ncRNAs在肿瘤领域的前沿科学方向以及存在的问题。     

长链非编码RNAs(LncRNAs)在人类乳腺癌中的研究现状

长链非编码RNA(long non-coding RNAs,Lnc RNAs)的发现改变了我们对转录和转录后调控的认识。随着高通量测序等新技术的发展,Lnc RNAs已成为癌症研究的焦点,Lnc RNAs的生物学功能逐渐得到了解,多项研究表明,Lnc RNAs可直接或间接地调节基因表达以及细胞生物学功能。Lnc RNAs的组织特异性表达特征可用于区分正常组织与乳腺癌组织以及肿瘤发展的不同阶段,提示Lnc RNAs有望为乳腺癌的早期诊断、疗效预测以及治疗提供新的分子靶标。因此,该文就Lnc RNAs的功能以及在乳腺癌中的研究现状进行综述。     

miR-124 在消化系统肿瘤研究中的进展

消化系统肿瘤严重危害人类健康,是导致死亡的主要原因,其一直是科学研究的一个重点,也是难点。Micro RNA(mi RNA)是一类广泛存在于生物体内的内源性、非编码、单链小分子RNA,参与调控生物体的几乎所有生命活动,包括多种生理和病理活动。目前研究认为,mi RNAs参与肿瘤的发生和进展。mi R-124是mi RNAs家族的一员,是一个相当保守的mi RNA,在多种肿瘤包括消化系统肿瘤的细胞或组织中均表达下调,扮演着类似抑癌基因的角色,在该类肿瘤的发生、发展以及预后中发挥重要作用。本文就mi R-124在消化系统肿瘤研究中的进展作一综述。     

LncRNA AL133467.1作为miR-661的ceRNA抑制乳腺癌细胞增殖和侵袭

长非编码RNAs((long non-coding RNAs,lncRNAs)在多种肿瘤中异常表达并参与肿瘤的发生发展.然而,众多lncRNAs在肿瘤的表达及功能尚未完全阐明.本文通过分析TCGT数据库113例正常乳腺组织和1109例乳腺癌组织发现,LneRNA AL133467.1在乳腺癌组织中低表达,并与乳腺癌患者...     

小核仁RNAs及其衍生RNAs的研究进展

小核仁RNAs(small nucleolarRNAs,snoRNAs)是一类发现较早且位于核仁内的小非编码RNAs,在核糖体RNAs(ribosomalRNAs,rRNAs)、信使RNAs(messengerRNAs,mRNAs)、小核RNAs(small nuclearRNAs,snRNAs)的成熟及修饰中均发挥重要作用。snoRNAs的功能及其作用途径一直以来均是学术界的研究热点。目前,snoRNAs对rRNAs的化学修饰作用已得到广泛认可。另外,有研究表明snoRNAs与一些遗传疾病以及肿瘤性疾病的发生发展存在密切关联。近年来研究发现,部分snoRNAs经切割可生成更小的、有功能的RNAs,即小核仁RNAs衍生RNAs(snoRNAs derivedRNAs,sdRNAs),这些sdRNAs中部分具有微小RNAs(microRNAs,miRNAs)的特征,可发挥类似miRNA的作用,这一发现极大地拓展了snoRNAs的作用机制方式。结合国内外研究现状,在总结snoRNAs的结构和基本功能的基础上对sdRNAs与miRNAs之间的相关性进行了综述,以期为后续的相关研究提供参考。     

miR-451与人类肿瘤关系的研究进展

Micro RNAs(miRNA)是一类在转录后水平调控基因表达的小分子非编码RNAs,通过调节细胞的增殖、分化、凋亡使机体维一个动态平衡。近年来,大量研究表明许多miRNA可作为原癌基因或者抑癌基因参与肿瘤的发生、发展,进一步研究发现,通过检测和调控这些miRNA,可用于肿瘤的早期诊断和治疗。最近一系列研究发现miRNA-451(miR-451)在许多肿瘤中存在差异性表达,与这些肿瘤的发生、发展、治疗有着密切的联系。本文对人类肿瘤中miR-451表达、调控的相关研究做一综述,为miR-451在肿瘤的诊断、治疗及预后中的应用提供重要资料。     

循环miRNAs在几种肝病检测中的研究进展

micro RNAs(mi RNAs)是一类单链非编码的内源性小RNA分子,参与细胞、组织甚至个体的生长发育。以往人们主要研究的是肝脏组织中mi RNAs在肝脏相关疾病检测中的应用,随着2008年血液中mi RNAs的发现,循环mi RNAs在疾病检测中的研究逐渐成为热点。micro RNAs普遍存在于血液中,与肝癌、肝硬化等多种肝脏疾病的发生发展密切相关。本文介绍了循环mi RNAs的来源及其特异性、稳定性等特性,简述了循环mi RNAs传统和最新的检测方法及特点,总结了循环mi RNAs在肝癌、肝炎、肝硬化、药物性肝损伤等肝脏疾病检测中的研究进展。近年研究表明循环mi RNAs检测具有采样方便、稳定性好、灵敏度高、可连续监测等优势,在肝脏相关疾病的诊断和预测中发挥了越来越重要的作用,其临床意义及应用前景已引起高度关注。本文重点综述在前人的研究结果中有望成为肝脏相关疾病诊断和预后判断的循环mi RNAs分子标志物发现目前的很多研究只是停留在实验室阶段,尚缺乏简单有效的诊断方法和统一的诊断标准,未来研究的热点应集中在如何进一步提高有潜力的mi RNAs分子标志物的敏感性、特异性和标准化,使其真正应用于临床诊断。     

Long noncoding RNAs biomarker-based cancer assessment

Cancer diagnosis have mainly relied on the incorporation of molecular biomarkers as part of routine diagnostic tool. The molecular alteration ranges from those involving DNA, RNA, noncoding RNAs (microRNAs and long noncoding RNAs [lncRNAs]) and proteins. lncRNAs are recently discovered noncoding endogenous RNAs that critically regulates the development, invasion, and metastasis of cancer cells. They are dysregulated in different types of malignancies and have the potential to serve as diagnostic markers for cancer. The expression of noncoding RNAs is altered following many diseases, and besides, some of them can be secreted from the cells into the circulation following the apoptotic and necrotic cell death. These secreted noncoding RNAs are known as cell free RNA. These RNAs can be secreted from the cell through the apoptotic body, extracellular vesicles including microvesicle and exosome, and bind to proteins. Since, lncRNAs display high organ and cell specificity, can be found in the blood, urine, tumor tissue, or other tissues or bodily fluids of some patients with cancer, this review summarizes the most significant and up-to-date findings of research on lncRNAs involvement in different cancers, focusing on the potential of cancer-related lncRNAs as biomarkers for diagnosis, prognosis, and therapy.     

环状RNA在胃癌与结直肠癌中的功能和作为临床标志物的潜力

环状RNA（circRNA）是一种广泛存在于生物体内的新型内源性RNA。CircRNA由RNA前体可变剪接产生,比线性RNA有更好的稳定性,是最近几年RNA领域的明星分子。CircRNA来源于内含子或外显子,可充当miRNA海绵或者结合蛋白质来参与基因表达调控,甚至已发现有circRNA能编码蛋白质。越来越多的研究表明,circRNA在肿瘤（如：食管癌、肝癌、胃癌、结直肠癌和膀胱癌等）的发生发展中发挥了重要作用。近年来,circRNA在胃癌、结直肠癌的研究逐渐增加,circRNA可能成为新的生物学标志物发挥诊断和预后的作用。本文将主要介绍circRNA 在胃癌及结直肠癌的功能和作为临床标志物的研究进展。     

Identification of novel dysregulated circular RNAs in early-stage breast cancer

Breast cancer is a major cause of cancer-related death in women worldwide. Non-coding RNAs are a potential resource to be used as an early diagnostic biomarker for breast cancer. Circular RNAs are a recently identified group of non-coding RNA with a significant role in disease development with potential utility in diagnosis/prognosis in cancer. In this study, we identified 26 differentially expressed circular RNAs associated with early-stage breast cancer. RNA sequencing and two circRNA detection tools (find_circ and DCC) were used to understand the circRNA expression signature in breast cancer. We identified hsa_circ_0006743 (circJMJD1C) and hsa_circ_0002496 (circAPPBP1) to be significantly up-regulated in early-stage breast cancer tissues. Co-expression analysis identified four pairs of circRNA-miRNA (hsa_circ_0023990 : hsa-miR-548b-3p, hsa_circ_0016601 : hsa_miR-1246, hsa_circ_0001946 : hsa-miR-1299 and hsa_circ_0000117:hsa-miR-502-5p) having potential interaction. The miRNA target prediction and network analysis revealed mRNA possibly regulated by circRNAs. We have thus identified circRNAs of diagnostic implications in breast cancer and also observed circRNA-miRNA interaction which could be involved in breast cancer development.     

nc2Cancer:一个研究与癌症相关人类非编码RNA的数据库

伴随着高通量测序技术的飞速发展,许多新型的非编码RNA陆续被发现,比如长链非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(Circular RNA)。先前的研究已经表明这些非编码RNA在基因表达调控过程中起着很重要的作用,并且与癌症的发生有着很密切的联系。但是,由于研究者们仍然对它们行使何种功能知之甚少,鉴定这些非编码RNA是否与人类癌症存在密切的相互关系仍然是一个巨大的挑战。为了促进这一领域的研究,这篇文章的作者分析了大规模的RNA相互作用数据,然后建立了数据库nc2Cancer(http://www.bioinfo.tsinghua.edu.cn/nc2Cancer/index.php)。这个数据库的目标便是提供非编码RNA与癌症之间的全面关系。现在,该nc2Cancer数据库包括了三种类型的非编码RNA分子:长链非编码RNA,环状RNA以及由假基因转录而成的RNA。这项研究将有助于研究者更好地去理解非编码RNA的功能以及它们在人类癌症发生过程中所起到的作用。     

Chimeric RNAs as potential biomarkers for tumor diagnosis

Cancers claim millions of lives each year. Early detection that can enable a higher chance of cure is of paramount importance to cancer patients. However, diagnostic tools for many forms of tumors have been lacking. Over the last few years, studies of chimeric RNAs as biomarkers have emerged. Numerous reports using bioinformatics and screening methodologies have described more than 30,000 expressed sequence tags (EST) or cDNA sequences as putative chimeric RNAs. While cancer cells have been well known to contain fusion genes derived from chromosomal translocations, rearrangements or deletions, recent studies suggest that trans-splicing in cells may be another source of chimeric RNA production. Unlike cis-splicing, trans-splicing takes place between two pre-mRNA molecules, which are in most cases derived from two different genes, generating a chimeric non-co-linear RNA. It is possible that trans-splicing occurs in normal cells at high frequencies but the resulting chimeric RNAs exist only at low levels. However the levels of certain RNA chimeras may be elevated in cancers, leading to the formation of fusion genes. In light of the fact that chimeric RNAs have been shown to be overrepresented in various tumors, studies of the mechanisms that produce chimeric RNAs and identification of signature RNA chimeras as biomarkers present an opportunity for the development of diagnoses for early tumor detection. [BMB reports 2012; 45(3): 133-140].