植物TFⅢ A型锌指蛋白

在植物中发现的锌指蛋白可以分成几种类型[1] 。其中经典的锌指蛋白是ＴＦⅢＡ型锌指蛋白 ,又称Ｃｙｓ2 /Ｈｉｓ2 或Ｃ2Ｈ2 ,模体为ＣＸ2— 4ＣＸ3 ＦＸ5 ＬＸ2 ＨＸ3— 5 Ｈ ,其中的两个Ｃｙｓ和两个Ｈｉｓ与锌原子形成配位键 ,进而形成包含一个β发夹和一个α螺旋的紧密指状结构 (图 1 ) [2 ] 。曾经认为锌指结构主要介导蛋白质与ＤＮＡ的互作 ,其中α螺旋与ＤＮＡ的大沟发生接触 ,然而最近发现有的转录因子中的一些ＴＦⅢＡ锌指只与蛋白质发生互作 ,而同一转录因子中的其他ＴＦⅢＡ锌指则与ＤＮＡ发生互作。第一个在植物中发现的ＴＦⅢＡ…     

转录因子YY1的作用机制

转录因子Ｙｉｎ Ｙａｎｇ 1 (ＹＹ1 ,又称ＮＦ Ｅ1、δ、ＵＣＲＢＰ、ＣＦ1 )是锌指类转录因子ＧＬ1 Ｋｒ櫣ｐｐｌ家族中的一员 ,广泛地存在于人、鼠、非洲爪蟾中[1、2 ] 。ＹＹ1蛋白含有 41 4个氨基酸残基 ,分子量为 6 5ｋＤ。在靠近Ｎ 末端处有一个酸性区域 ,紧接着是连续 1 2个组氨酸的序列和一段富含Ｇｌｙ和Ａｌａ的区域 ,在Ｃ 末端含有与ＲＥＸ 1蛋白相似序列的Ｃ2 Ｈ2 锌指结构。ＹＹ1因子最初是作为腺伴随病毒(ＡＡＶ)的Ｐ5 启动子和免疫球蛋白 (Ｉｇ)ｋ3′增强子的阻抑因子分离到的 ,后来又相继证实ｃ ｆｏｓ、ｃ ｍｙｃ、ｓｕｒ…     

C_2H_2型锌指蛋白研究进展

遗传信息的实现过程离不开基因表达的调控 ,至今为止发现的转录调控因子中有很多含有锌指模体 (ｚｉｎｃ ｆｉｎｇｅｒｍｏｔｉｆ)结构。锌指蛋白是指含有通过结合Ｚｎ2 稳定的短的可以自我折叠形成“手指”结构的一类蛋白质。由于其自身的结构特点 ,可以选择性的结合特异的靶结构 ,使锌指蛋白在基因的表达调控、细胞分化、胚胎发育等生命过程中发挥重要作用。自从 1 983年在爪蟾卵母细胞中发现第一个具有基因转录调控作用的锌指蛋白ＴＦⅢＡ以来 ,在多种生物中发现的锌指基因已有约 50 0多个 ,其中人基因组中的锌指蛋白基因达 2 0 0多个。…     

KRAB型锌指蛋白(KZNF)的研究进展

KRAB型锌指蛋白是哺乳动物中最大的转录调控因子家族, 它的多数成员在基因组上成簇分布。其结构特征是N端含有KRAB结构域, C端含有多个C2H2型锌指结构。KRAB结构域为一蛋白质-蛋白质相互作用区, 可以与多种协同转录抑制因子和转录因子结合, 使KRAB型锌指蛋白作为转录因子和/或转录调控因子发挥依赖于DNA结合的转录抑制功能, 在胚胎发育、细胞分化、细胞转化及细胞周期的调控中发挥重要功能。     

真核生物中锌指蛋白的结构与功能

真核生物中的许多蛋白质分子包含锌指结构区,这类蛋白称为锌指蛋白.锌指蛋白因其包含特殊的指状结构,在对DNA、蛋白质和RNA的识别和结合中起重要作用.许多锌指蛋白的锌指结构域包含能与DNA特异结合的区域,并与某些效应结构域（如KRAB、SCAN、BTB/POZ、SNAG、SANT和PLAG等）相连,这类锌指蛋白常作为转录因子起作用,可调控靶基因的转录.一些锌指蛋白包含蛋白质识别结构域（如LIM锌指、MYND锌指、PHD锌指和RING锌指等）,它们能够特异地介导蛋白质之间的相互作用,因此被称作蛋白适配器.此外,某些锌指蛋白还可以结合RNA,起转录后调控作用.本文就锌指蛋白与DNA、RNA以及蛋白质分子间的相互作用作一综述.     

锌指蛋白结构及功能研究进展

锌指蛋白是一类具有手指状结构域的转录因子,对基因调控起重要的作用。根据其保守结构域的不同,可将锌指蛋白主要分为C2H2型、C4型和C6型。锌指通过与靶分子DNA、RNA、DNA-RNA的序列特异性结合,以及与自身或其他锌指蛋白的结合,在转录和翻译水平上调控基因的表达。我们简要综述了近年来锌指蛋白结构、分类及其与核酸及蛋白质相互作用等方面的研究进展。     

胡杨锌指蛋白基因克隆及其结构分析

锌指蛋白属于核转录因子家族,在原核生物与真核生物基因转录调控中发挥作用。分析了耐盐锌指蛋白Alfin-1基因在苜蓿与拟南芥中的保守性后,设计了一对引物。以胡杨水培叶片为材料,从总RNA中通过RT-PCR分离得到一个锌指蛋白基因,其cDNA长924bp。分析其氨基酸序列表明,存在一个典型的Cys2/His2锌指结构,从第556位开始有一个富含G的启动子结合位点GTGGGG。由于具有相同功能的转录因子在结构和DNA结合区的氨基酸序列上具有保守性,因此,从结构分析上可以推测该基因与Alfin-1在功能上是有一定的相关性。     

植物WRKY转录因子

ＲＫＹ蛋白是最近才鉴定的只存在于植物中的一类新的转录因子[1] 。这些蛋白中含有保守的 6 0个氨基酸的ＷＲＫＹ结构域。由于在这个结构域中 ,Ｎ端包含了极为保守的氨基酸序列ＷＲＫＹＧＱＫ而得名。同时该结构域中还含有一类新的类似锌指的模体 ,因而也可能是一类新的锌指蛋白[2 ] 。几乎所有的ＷＲＫＹ蛋白对Ｗ框 :(Ｔ) (Ｔ)ＴＧＡＣ(Ｃ/Ｔ)都具有结合特性 ,因而是一个ＤＮＡ结合蛋白。从白薯、野燕麦、大麦和南芥中克隆了第一批ＷＲＫＹｃＤＮＡ ,就是根据ＷＲＫＹ蛋白能专性与Ｗ框结合的特性而成功克隆的。另外在欧芹、烟草[3 ] 等植物…     

一种特异识别SV40启动子的人工转录因子的构建

转录因子是真核表达调控中非常重要的一类反式作用因子,通常由DNA结合域与效应域两部分组成,而锌指结构是DNA结合域的常见组成单元。人工转录因子就是基于转录因子的这种结构特点,人为地选择针对特定序列的DNA结合域与具有特定作用的效应域组合而成。利用噬菌体展示技术,筛选到与SV40启动子上9bp序列特异结合的锌指结构,再连接KOX1的KRAB域构建了一种人工转录因子。转染实验表明它对SV40下游的报告基因的表达有很显著的抑制作用。     

SOX9基因与性别决定的关系

1 .性别决定简介[1～ 5 ]哺乳动物包括人类的性别决定问题一直是科学史上的一个难解之谜。科学家们经过异常艰苦的研究才逐步揭开性别决定的神秘面纱。位于男性Ｙ染色体上的ＳＲＹ(ｓｅｘｄｅ ｔｅｒｍｉｎｇｒｅｇｉｏｎｏｆＹｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ)基因是当前被确定的睾丸决定因子 (ＴＤＦ)的主要侯选基因 ,它是哺乳动物中睾丸发育的主要诱导者。ＳＲＹ基因编码的蛋白质含有与ＤＮＡ结合的模体 ,称为ＨＭＧ盒 (与高速泳动类蛋白质相关的一种模体 )。ＨＭＧ盒存在于很多转录因子中。ＳＲＹ蛋白的ＨＭＧ盒与特定的ＤＮＡ序列结合 ,表明它在…