我国地方品种鸡分离到的一个禽白血病病毒新亚群的鉴定

为探明我国地方品种鸡群禽白血病病毒(Avian leukosis virus,ALV)的特点,通过接种DF-1细胞及细胞培养上清液p27抗原的检测,从芦花鸡中分离得到三株外源性ALV禽白血病病毒,分别是JS11C1、JS11C2和JS11C3,并对其进行亚群鉴定分析。用PCR方法扩增env基因测序,并与已知鸡源各亚群ALV的囊膜蛋白(gp85)作氨基酸同源性比较。这三株ALV的env基因的gp85大小为1 005bp,编码335个氨基酸;env基因的gp37大小为609bp,编码203个氨基酸。三个毒株之间gp85的同源性为91.9%～97.0%。与A、B、C、D和E五个经典亚群在GenBank中已发表的18个毒株的gp85的同源性仅在77.7%～84.6%间,显著低于鸡群中常见的A、B、E各亚群内的同源性范围(分别为88.2%～98.5%,91.6%～98.8%和97.9%～99.4%),而与J亚群参考株的同源性更是只有34.2%～36.5%。上述结果表明,芦花鸡分离到的三株病毒可能是不同于鸡源ALV已知6个亚群的一个新亚群,按国际上对ALV亚群分类的习惯,初步将其定名为K亚群。     

二株B亚群禽白血病病毒全基因组序列及其在细胞上的复制性比较

本研究比较了从山东地方品系鸡群分离到的二株B亚型禽白血病病毒(ALV)SDAU09E3和SDAU09C2的全基因组序列及它们在细胞培养上的复制动态。这二株ALV-B的同源性为95.4%,与GenBank中3株B亚群参考株之间的同源性也均在91.0%～94.9%间,而与其它亚群参考株的同源性均低于87.9%。与亚群无关的gag、pol基因和LTR的核苷酸序列比较表明,这二株ALV-Bgp85基因的gag和pol基因与所有比较的参考株的同源性均在93%以上。LTR与其他外源性ALV参考株的LTR间的同源性在72.6%～88.3%范围内,但与E亚群内源性ALV的LTR的同源性只有51.5%。然而,这二个ALV-B的LTR的同源性也只有74.8%,远低于其他基因组部分的同源性,特别是它们的LTR的U3区同源性只有68.8%,二者在二个CAAT分布上也显著不同。对这二株ALV-B在DF-1细胞上的复制动态比较表明,它们在细胞培养上清液中的TCID50值非常类似,但SDAU09E3株核衣壳蛋白p27抗原的含量显著高于SDAU09C2株。这表明,同一亚群的不同毒株在复制过程中,所表达的p27抗原量与所形成的具有传染性的病毒量间没有平行关系。这一差异与LTR-U3区的相关性则有待应用感染性克隆技术来做进一步深入研究。     

蛋鸡J亚群白血病病毒的分离鉴定及序列分析

通过接种鸡胚成纤维细胞((CEF)及特异性单抗的间接荧光抗体反应(IFA),从中国商品代蛋鸡群中首次分离到J亚群白血病病毒(ALV-J).对其env基因编码的氨基酸序列及3'-末端(3'-Ter)序列与国内外来源于白羽肉鸡的毒株作了比较分析.结果显示,这两株病毒的gp85基因编码的氨基酸序列与国外5个毒株同源性仅为83.4%～87.3%,与国内来源于白羽肉鸡的8株病毒同源性也仅为86.4%～89.6%.gp37基因编码的氨基酸序列与5个国外毒株同源性为91.8%～97.0%,与8个国内毒株同源性为93.9%～95.9%.另外,国内来源于白羽肉鸡的各毒株的3'-Ter序列在"E"区均有明显缺失,但本次分离的来源于蛋鸡群的毒株在"E"区没有缺失突变.与所列出的13株国内外毒株相比,这两个毒株在3'-Ter的缺失最少,较接近于原型株HPRS-103.显然这两株病毒的来源不同于国内白羽肉鸡.     

山东省脑膜炎和脑炎病例中埃可病毒6型的基因特征分析

为分析山东省脑膜炎和脑炎病例中埃可病毒6型(Echovirus 6,E6)的基因特征,本研究对山东省2007~2012年间采集的脑膜炎和脑炎病例脑脊液标本进行了病毒分离,阳性分离物采用血清学和分子生物学方法鉴定型别,与国内外其他E6进行同源性分析,并构建VP1完整编码区系统进化树。本研究共分离到6株E6病毒,同源性分析显示:这6株分离株之间核苷酸和氨基酸同源性分别为78.6%~99.8%和95.5%~100.0%,与原型株(D’Amori)核苷酸和氨基酸同源性分别为为76.9%~78.4%和92.3%~95.1%。系统进化树分析显示:山东省E6分离株可分为A、B、C和D 4个基因簇,这6株分离株属于A、B、D 3个簇。山东省E6分离株之间存在较大的遗传差异,E6在山东的循环存在不同的传播链。     

12株猪瘟病毒E2基因主要抗原区域的序列差异分析

用RTPCR扩增了12个不同时期分离的HCV毒株E2基因主要抗原区域的cDNA片段并对其进行了序列测定。应用DNAstar序列分析软件对所测的12个HCV毒株与国内外已知的6个毒株Alfort株、Ald株、Brescia株、Gpe株、C株、CW株及早期已测定的HCLV株、HCVSM株和北京顺义株(BJSY2/96)3个毒株的相应片段进行了同源性比较分析。E2基因主要区域长度均为224 bp,包括从HCV 2485到2708位的E2基因B、C区域。所测的疫苗株HCLV与国外测得的疫苗株C株核苷酸及氨基酸同源性分别为991%和100%,表明目前应用的疫苗株是稳定的;用目前我国流行的部分野毒株对HCLV株免疫猪的攻击试验表明,HCLV对野毒株均具有很好的免疫力,这与序列分析结果相吻合。根据系统树分析,可将HCV分为两大群,5株90年代的野毒株及1株80年代的野毒株(其中北京3株、河南2株、广东1株)均与国内外C株、标准株属同一群(即第一群),其核苷酸及氨基酸的同源性分别为857%～100%和838%～100%;与Alfort株同属第二群的有6个野毒株(广西北海、辽宁、河北黄骅、吉林、深圳光明、四川成都),其中80年代与90年代的野毒株各有三株,核苷酸及氨基酸的同源性分别为843%～100%和851%～100%;21株HCV的核苷酸及氨基酸的同源性分别为781%～100%和784%～100%。两群之间的特征性差异表现在713和729位氨基酸位点的不同,经分析发现猪瘟野毒株具有复杂性与多样性。     

禽白血病重组毒FJ15TH0株不同感染方式对SPF鸡感染状态及组织病毒载量的影响

为揭示禽白血病病毒(ALV)自然重组毒FJ15TH0感染SPF鸡群的不同方式对其感染状态和病毒组织分布的影响,本研究设计动物试验分别模拟垂直传播和生长早中期水平传播,动态检测各组病毒血症、泄殖腔排毒、抗体反应及不同内脏组织病毒载量,为制定地方鸡群中ALV感染的防控和净化措施提供可靠的流行病学依据。结果表明胚内接种模拟垂直传播组除2只实验鸡外均产生免疫耐受,持续带毒排毒而无抗体产生;1日龄和D组均未表现泄殖腔排毒,在接触病毒后2~3w后C组63.6%实验动物表现一过性病毒血症,D组未表现病毒血症,暴露后5~11w期间C组9.1%~25%鸡出现一过性血清抗体,D组在暴露后3~5w期间14.3%~42.8%实验鸡产生一过性血清抗体。11w时剖杀实验鸡,荧光定量RT-PCR检测各组各实验鸡不同组织的gp85mRNA及病毒粒子的基因组RNA含量,结果显示垂直感染组表现泄殖腔排毒者gp85检测均为阳性,该分离株对肾脏和法氏囊的组织亲嗜性最强,而对肝脏和脾脏的亲嗜性较低;而同居感染组实验鸡均表现为gp85mRNA检测阴性,表明该重组毒水平感染能力较弱。     

在抗体免疫选择压作用下鸡J亚群白血病病毒gp85基因的变异

将鸡J亚群白血病病毒(ALV-J)中国分离株NX0101接种到已长成单层鸡胚成纤维细胞(CEF)的六孔细胞培养板上, 分为A组(培养基中无抗体)和B组(培养基中含抗体), 每组设3个独立的传代系列. 分别对第10代、20代和30代病毒的囊膜糖蛋白基因(env)进行了克隆和测序. 序列比较结果表明: 原始病毒与无抗体A组不同传代系列的不同代次之间gp85氨基酸序列同源性为97.7%~99.7%; 而原始病毒与有抗体B组不同传代系列的不同代次之间gp85的氨基酸序列同源性为93.8%~96.1%. 对gp85高变区上有义突变(NS)与沉默突变(S)的比例计算分析表明, 无抗体A组三个传代系列在110~120, 141~151和189~194 aa这3个高变区域上NS/S的值分别为2(8/4), 1(3/3)和1.3(4/3); 有抗体B组三个传代系列在110~120, 140~150和188~193 aa这3个高变区域上NS/S的值分别为4.1(13/3), 4.7(14/3)和3.3(11/3). 该结果是在严格实验条件下显示特异性抗体这一免疫选择压对gp85基因变异的影响.     

黄羽肉鸡J亚群白血病病毒的分子生物学特性和致病性

通过接种鸡胚成纤维细胞(CEF)、聚合酶链式反应(PCR)技术及特异性单抗的间接荧光抗体反应(IFA),首次从中国地方品系-黄羽肉鸡中分离到J亚群白血病病毒(ALV-J),并对其gp85基因和3′Ter序列及其致病性作了比较分析。结果显示,GD0510A、GD0510B和GD0512的gp85基因编码的氨基酸序列与国内毒株HN0001同源性最高,分别为94.1%、92.5%和95.8%,GD0510A和GD0512的3′Ter核酸序列与国内毒株同源性比较高。分离到的两株ALV-J(GD0510A和GD0512)感染1日龄肉鸡后出现明显生长抑制(P<0.05),并诱发中枢免疫器官法氏囊和胸腺萎缩。两株病毒单独感染均能降低鸡体对新城疫病毒和禽流感病毒(AIV-H5)疫苗的抗体滴度,GD0512感染鸡后能明显抑制感染鸡对新城疫病毒疫苗的免疫反应(P<0.05),而GD0510A感染鸡后在4w时也能明显抑制感染鸡对禽流感病毒(AIV-H5)疫苗的免疫反应(P<0.05)。研究证实在我国地方品系黄羽肉鸡存在ALV-J的感染,分子生物学特性研究表明该毒株可能是来自白羽肉鸡且能造成感染鸡的免疫抑制。     

鸡内源性类J亚群禽白血病病毒gp85基因的克隆及分析

为深入探讨J亚群禽白血病病毒(Avian leukosis virus subgroup J,ALV-J)的亚群特性,利用ALV-J gp85基因两侧的序列片段为引物,从正常SPF蛋鸡、商品肉鸡和DF1细胞基因组中完整地扩增了内源性类ALV-J gp85基因。肉鸡和DF1细胞内源性类ALV-J gp85基因同源性达99．9％;SPF蛋鸡内源性类ALV-J gp85基因与肉鸡和DF1细胞的内源性类ALV-J gp85基因之间同源性达95．6％、95．3％。三种不同来源的内源性类ALV-J gp85基因DNA与IMC10200株ALV-J的gp85基因的同源性分别为91．8％、94．1％、94．0％;与ALV-J原型株HPRS-103gp85基因的同源性分别为95．6％、98．3％、99．9％。内源性类ALV-J gp85序列与外源性ALV-J gp85基因具有相似或一致的ORF和Jameson-Worrlf抗原表位优势。     

病毒性脑炎病例中埃可病毒11型病毒的基因特征分析

分析埃可病毒11型(Echovirus 11,ECHO 11)福建龙岩分离株的分子生物学特征。收集龙岩市第一医院2011年1~12月临床诊断为病毒性脑炎或中枢神经系统感染的住院病例脑脊液标本进行病毒分离鉴定,从7株经血清中和鉴定的ECHO 11分离株中,选取4株测定VP1完整编码区序列,与GenBank上已发表的ECHO 11型病毒VP1区进行同源性比较及遗传进化分析。4株ECHO 11分离株VPl区序列长度为600个核苷酸,编码200个氨基酸;4株之间的核苷酸同源性为100%,氨基酸同源性为99%~100%;与1953年Gregory原型株之间的核苷酸同源性为75%~76%,氨基酸同源性为90%;与2007年荷兰株(GU393773)之间核苷酸的同源性为94%~95%,氨基酸同源性为98%~99%,同源性最高;与国内2010年山东株之间核苷酸的同源性为74%,氨基酸同源性为88%~89%。系统进化树分析显示,4株龙岩分离株同属D5型,其与D5型病毒株(GU393713)之间核苷酸的同源性为93%,氨基酸同源性为99%。国内分离株之间相对较低的相似性提示国内ECHO 11病毒可能存在不同的传播链。     

Isolation and identification of a subgroup A avian leukosis virus from imported meat-type grand-parent chickens

An exogenous avian leukosis virus (ALV) strain SDAU09C1 was isolated in DF-1 cells from one of 240 imported 1-day-old white meat-type grand parent breeder chicks. Inoculation of SDAU09C1 in ALV-free chickens induced antibody reactions specific to subgroup A or B. But gp85 amino acid sequence comparisons indicated that SDAU09C1 fell into subgroup A; it had homology of 88.8%–90.3% to 6 reference strains of subgroup A, much higher compared to other subgroups including subgroup B. This is the first report for ALV of subgroup A isolated from imported breeders.     

Isolation and Identification of a Subgroup A Avian Leukosis Virus from Imported Meat-type Grand-parent Chickens

An exogenous avian leukosis virus (ALV) strain SDAU09C1 was isolated in DF-1 cells from one of 240 imported 1-day-old white meat-type grand parent breeder chicks. Inoculation of SDAU09C1 in ALV-free chickens induced antibody reactions specific to subgroup A or B. But gp85 amino acid sequence comparisons indicated that SDAU09C1 fell into subgroup A; it had homology of 88.8%-90.3% to 6 reference strains of subgroup A, much higher compared to other subgroups including subgroup B. This is the first report for A...     

禽白血病A亚群病毒gp85的单因子血清制备及其特异性鉴定

【目的】为了研究出一种能够针对A亚群禽白血病的快速特异性诊断试剂。【方法】将A亚群禽白血病病毒(ALV-A)SDAU09E1株接种于DF1细胞上,以感染细胞DNA为模板,通过PCR方法扩增出1023bp的ALV-A-gp85基因。将其正确阅读框架插入表达载体PET-32a(+)中,实现在BL21(Rosetta)宿主菌中表达。将纯化的融合蛋白常规免疫小鼠,制备得抗血清。【结果】实验成功获得52.8kDa的重组融合蛋白,且具有良好的免疫原性。间接免疫荧光试验(IFA)表明该血清可与ALV-A和ALV-B反应,但不与ALV-J反应。【结论】该实验首次在国内外研制出能用于鉴别性检测经典的A/B亚群ALV的单因子血清,可与ALV-J特异性单抗互补作用于外源性ALV感染的鉴别性诊断。我国鸡群同时受经典的ALV-A/B和新出现的ALV-J困扰,鉴别诊断非常必要,研究这种试剂具有较高的实用价值。     

禽白血病病毒J亚群env基因的克隆和序列分析

应用多聚酶链反应（PCR）的方法增出ADOL－4817毒株的囊膜蛋白env基因,并克隆进大肠杆菌。经核酸序列分析证明,env基因的大小为1746bp,其中gp85和gp37mh 1554bp组成,可翻译成517个氨基酸,分子量为57.7kD。根据糖基化位点N－X－S／T的特点,发现ADOL－4817的env蛋白有15个潜在的糖基化位点。同源性分析证明,ADOL－4817的env基因与其它ALV－J的env基因序列同源性为88.8％－92.4%,而与外源性ALVs的相应序列的同源性仅为40.5％－51.4％,然而,与内源性的EAV－HP毒株的类env基因的同源性高达91.2％;另外,ADOL－4817毒株的gp37d C末端多了13个氨基酸,这些结果提示,ALV－J的env基因存在广泛的变异性,env基因可能来源于内源性和外源性ALVs的重组。     

鸡的J亚群白血病病毒的分离及部分序列比较

通过接种鸡胚成纤维细胞、聚合酶链式反应（ＰＣＲ）技术及特异性单抗的间接荧光抗体反应（ＩＦＡ）,从某大型肉用型种鸡场的疑似Ｊ亚群白血病的病鸡中,以及２５个临床健康的商品代肉鸡群的２群中,分离鉴定出Ｊ亚群禽白血病病毒（ＡＬＶ－Ｊ）。在用抗ＡＬＶ－Ｊ ｇｐ８５单克隆抗体ＪＥ９的ＩＦＡ中,来自病鸡群的两株病毒ＳＤ９９０１和ＳＤ９９０２呈强阳性反应,来自临床健康肉鸡群的ＹＺ９９０１和ＹＺ９９０２株呈弱阳性反     

The Unique Envelope Gene of the Subgroup J Avian Leukosis Virus Derives from ev/J Proviruses, a Novel Family of Avian Endogenous Viruses

A new subgroup of avian leukosis virus (ALV), designated subgroup J, was identified recently. Viruses of this subgroup do not cross-interfere with viruses of the avian A, B, C, D, and E subgroups, are not neutralized by antisera raised against the other virus subgroups, and have a broader host range than the A to E subgroups. Sequence comparisons reveal that while the subgroup J envelope gene includes some regions that are related to those found in env genes of the A to E subgroups, the majority of the subgroup J gene is composed of sequences either that are more similar to those of a member (E51) of the ancient endogenous avian virus (EAV) family of proviruses or that appear unique to subgroup J viruses. These data led to the suggestion that the ALV-J env gene might have arisen by multiple recombination events between one or more endogenous and exogenous viruses. We initiated studies to investigate the origin of the subgroup J envelope gene and in particular to determine the identity of endogenous sequences that may have contributed to its generation. Here we report the identification of a novel family of avian endogenous viruses that include env coding sequences that are over 95% identical to both the gp85 and gp37 coding regions of subgroup J viruses. We call these viruses the ev/J family. We also report the isolation of ev/J-encoded cDNAs, indicating that at least some members of this family are expressed. These data support the hypothesis that the subgroup J envelope gene was acquired by recombination with expressed endogenous sequences and are consistent with acquisition of this gene by only one recombination event.     

禽白血病病毒J亚群env基因的克隆和序列分析

应用多聚酶链反应（PCR）的方法扩增出ADOL-4817毒株的囊膜蛋白env基因,并克隆进大肠杆菌。经核酸序列分析证明,env基因的大小为1746 bp,其中gp85和gp37由1554 bp组成,可翻译成517个氨基酸,分子量为57.7 D。根据糖基化位点N-X-S/T的特点,发现ADOL-4817的env蛋白有15个潜在的糖基化位点。同源性分析证明,ADOL-4817的env基因与其它ALV-J的env基因序列同源性为88.8%～92.4%,而与外源性ALVs的相应序列的同源性仅为40.5%～51.4%,然而,与内源性的EAV-HP毒株的类env基因的同源性高达91.2%;另外,ADOL-4817毒株的gp37在C末端多了13个氨基酸。这些结果提示,ALV-J的env基因存在广泛的变异性,env基因可能来源于内源性和外源性ALVs的重组。     

SPF鸡胚中内源性白血病病毒全基因序列鉴定与分析

摘要:以国内某3家SPF鸡场的SPF鸡胚成纤维细胞提取的基因组DNA为模板,参照已发表的序列,设计合成了4对检测内源性白血病病毒引物,分别检测gag基因、pol基因、env基因和LTR片段,结果显示4者检出阳性率很高(gag,29/46;pol,27/46;env,24/46;LTR,31/46).设计合成了8对引物,选取4片段检测均为阳性的样品之一,经PCR成功扩增出了8段连续的、相互部分重叠的目的DNA片段,分别连接入T载体进行克隆测序.用DNAstar软件对测序结果进行拼接,从一个鸡胚得到了内源性白血病病毒前病毒全基因组序列.比较分析发现,该序列env基因与已知的E亚群内源性病毒代表株env基因的核苷酸序列同源性在98.5%以上,全基因组序列同源性在99.1%以上,而与其他亚群代表株同源性相对较低,env基因同源性仅为56.3%～91.5%.