5种常见植物DNA提取效率的比较

以小麦、玉米、甘蓝、花生、菠菜的幼嫩叶片为实验材料,采用高盐低pH值法、SDS法和CTAB法3种不同的DNA提取方法,提取其总DNA,用琼脂糖凝胶电泳检测和紫外分光光度法对所得DNA进行比较分析.结果表明:玉米和菠菜采用SDS法提取基因组DNA效果明显优于CTAB和高盐低pH法.CTAB法对高脂肪花生的DNA提取,所得浓度较高.而高盐低pH值法建议减少使用.     

梨不同DNA提取方法的效果研究

以7个梨品种为实验材料,比较分析了SDS法、CTAB法、SDSCTAB法、改良的CTAB法、高盐低pH值法、分步离心法对梨总DNA提取的效果。结果表明:利用以上6种方法提取的梨总DNA在纯度和量上有很大的差别。所得到的平均DNA量从大到小依次为:分步离心法、SDS法、SDSCTAB法、改良的CTAB法、CTAB法、高盐低pH值法。DNA提取纯度依次为分步离心法、SDSCTAB法、改良的CTAB法、高盐低pH值法、CTAB法、SDS法。RAPD和自交不亲和基因(S基因)特异性引物扩增实验结果都比较理想,但分步离心法和SDSCTAB法提取的DNA双酶切效果较好。分步离心法提取的梨总DNA更适用于后续的分子生物学实验操作。     

高粱基因组DNA提取方法的比较与优化

目的：比较CTAB法和高盐低pH法提取高粱总DNA效果,进一步优化建立高盐低pH值法提取高粱基因组DNA的方法。方法：采用CTAB法、高盐低pH法对高粱叶片DNA进行提取,并从电泳结果、纯度、得率三方面进行比较研究。通过提取缓冲液中SDS浓度的优化,不同组织器官的DNA提取纯化以及不同沉淀方法的优化,比较不同方法对高粱基因组DNA提取的影响。结果：高盐低pH法DNA平均得率为689.36μg/g,略小于CTAB法的718.26μg/g,但其A260/A230平均值为1.854,比CTAB法的2.164更接近标准要求。高盐低pH法提取高粱基因组DNA的适宜条件确定如下：提取液中含有2%SDS、2%PVP、2%β-巯基乙醇;水浴时间30min;沉淀方法采用0.7体积异丙醇室温沉淀的沉淀方法。结论：综合考虑高盐低pH法是提取高粱基因组DNA的最佳方法。     

DNA提取方法对一串红不同部位DNA提取的比较

本文以一串红的叶片、茎段、花为材料,分别采用高盐低pH法、十二烷基硫酸钠(SDS)法、改良十六烷基三乙基溴化铵(CTAB)法、核DNA法和十六烷基三乙基溴化铵(CTAB)区室法等5种不同方法对其进行了基因组DNA提取效果的比较分析.结果表明,除用高盐低pH法在一串红花中未提取出DNA外,其它均可提取出DNA,都能进行RAPD扩增.5种方法在一串红DNA提取中,提取效果由高到低依次为:核DNA法、改良CTAB法、SDS法、CTAB区室法、高盐低pH法;3个部位提取结果显示:叶片较容易得到高质量的DNA,茎段次之,花最差.     

狭叶坡垒基因组总DNA的提取和纯化方法研究

以狭叶坡垒叶片为材料,对基因组总DNA的提取和纯化方法进行了研究,并对改良CTAB法、高盐低pH法和改良SDS法进行比较.结果表明,改良的CTAB法更适合狭叶坡垒基因组总DNA的提取,且硅胶干燥30 d的叶样和新鲜叶样所得的DNA几乎没有区别.再对改良CTAB法的水浴时间进行探索,发现150 min是较为合适的水浴时间.对比酚纯化法和试剂盒纯化法,发现试剂盒纯化损失的DNA少,得率高,是一种简便、快速、安全的纯化方法.     

野老鹳草DNA的提取方法及RAPD分析

目的：以野老鹳草（Geranium carolinianum L．）的茎、叶为材料,研究野老鹳草DNA的提取方法及RAPD的分析。方法：采用CATB法、高盐低pH法和SDS法分别提取野老鹳草的基因纽DNA,并对3种方法进行了一些改进。通过RAPD分析所提取的DNA,比较所用的提取方法。结果：比较DNA产量、质量等,确定了高盐低pH法较佳。结论：干燥的材料和新鲜的材料均可提取得到DNA,高盐低pH法提取的效果优于CTAB和SDS法。     

美花石斛基因组DNA提取方法的比较

采用CTAB法、尿素法、高盐低pH法、SDS法和陈大明法等5种方法提取美花石斛(Dendrobium loddigesii Rolfe)基因组总DNA,通过电泳、紫外光谱分析和RAPD-PCR扩增等检测手段,比较分析了DNA质量。DNA条带显示改良CTAB法和改良尿素法较好。     

短序十大功劳基因组总DNA提取方法研究

以短序大功劳嫩叶为材料,采用CTAB法、CTAB改良法1、CTAB改良法2、SDS法和试剂盒法五种方法提取短序十大功劳基因组总DNA,用分光光度计和琼脂糖凝胶电泳方法检测所得总DNA的纯度和得率,用ISSR-PCR扩增的方法检测所得总DNA的质量。结果表明,五种方法均能从短序大功劳叶片中提取到基因组DNA,但不同方法提取得的基因组DNA的纯度、浓度和得率存在明显的差异。CTAB改良法2和试剂盒法提取的DNA纯度高,可直接用于下游分子生物学实验,CTAB法、CTAB改良法1和SDS法提取的总DNA质量较差,不利于下游的分子生物学实验;五种方法提取的总DNA的得率在10.836~451.709μg/g之间,呈CTAB法>SDS法>CTAB改良法1>CTAB改良法2>试剂盒法的现象。此实验获得的结果可以为短序十大功劳分子生物学研究提供基础。     

改进的SDS-CTAB法提取濒危植物连香树总DNA

对珍稀濒危植物连香树(Cercidiphyllum japonicum)的6种总DNA提取方法进行了对比试验,结果表明改进的SDS-CTAB法更适合于连香树总DNA提取。该方法提取的DNA经紫外消光值检测,其A260/A280为1.8532,优于CTAB法(1.4872)、SDS法(1.3552)、PVP法(1.5079)、尿素法(1.1858)和高盐低pH法(1.4534)。琼脂糖凝胶电泳和PCR扩增结果也得出同样的结论。     

麦冬基因组DNA提取方法研究

为了从富含多糖、多酚的顽拗植物麦冬中分离出高质量基因组DNA,分别建立了改良CTAB法和改良SDS法。通过使用核分离液和CTAB/NaCl溶液、提取液中加入0.35倍体积无水乙醇等最大限度地除去杂质。将两种方法提取的8种麦冬DNA与两种离心柱式试剂盒提取的DNA在纯度、产率等方面进行对比,并进行双酶切和SRAP分析。麦冬类植物SRAP反应体系的建立尚属首次。结果表明,改良CTAB法和改良SDS法均能从8种麦冬叶片中提取到高质量的基因组DNA,改良CTAB法提取纯度更高,提取幼叶DNA纯度可以与离心柱式试剂盒媲美,能够满足多种分子生物学试验要求。在后续试验中,用改良CTAB法从20多种沿阶草族植物中提取到了高纯度DNA。该方法通用性好,提取的DNA纯度高,对其他顽拗类植物基因组DNA的提取具有借鉴意义。     

鸢尾属部分植物种质资源的RAPD分析

采用RAPD分子标记技术,从100个随机引物中筛选出多态性强、重复性好且稳定性高的引物18个,对38份野生鸢尾属材料进行扩增,共扩增出409条带,其中多态性带405条,多态性比率为99.0%,表明野生鸢尾属植物种间有丰富的遗传多态性;根据DNA谱带计算物种间遗传距离,聚类分析结果将鸢尾属38份材料划分为6组,其结果与传统生物学特性划分的6个亚属的分类结果基本一致;物种特有RAPD标记分析表明,利用18个引物可以较好地将鸢尾属38种植物区分开,其中9个材料得到了单一标记的扩增带,表明运用RAPD分子标记对研究鸢尾属植物特异性基因及标记的筛选等有一定的理论和实际应用价值。     

基于rbcL序列试论鸢尾属部分物种间的系统发育关系

选用叶绿体rbcL基因对鸢尾属植物的分类和系统发育进行了分析。以雄黄兰为外类群,对21份鸢尾属材料和GenBank下载的共49条序列采用最大简约法构建系统进化树,探讨了鸢尾属的分类系统。针对有争议的物种,聚类结果表明：马蔺与白花马蔺关系较远;扁竹兰和蝴蝶花亲缘关系较扇形鸢尾近;细锐果鸢尾和锐果鸢尾亲缘关系近,大锐果鸢尾较之远;四川鸢尾和薄叶鸢尾聚类近;西伯利亚鸢尾系内物种间聚类复杂,亲缘关系不清楚。     

德国鸢尾对Cd胁迫的生理生态响应及积累特性

通过盆栽研究了Cd胁迫下德国鸢尾的生长状况、生态效应、生理特性及吸收和富集Cd的能力.结果表明:德国鸢尾对小于5 mg/kg的Cd有较强的耐性,适用于城区土壤修复;Cd浓度大于5 mg/kg时抑制德国鸢尾生长,降低了其生态效应.随着Cd浓度的增大,德国鸢尾根系活力、叶绿素含量和含水量逐渐降低,游离脯氨酸和可溶性糖含量先升高后降低,细胞膜透性逐渐升高.Cd在德国鸢尾体内分布为根系＞地上部分,随着Cd浓度的增大,德国鸢尾根系和地上部分Cd积累浓度逐渐升高、富集系数和转运系数逐渐降低;Cd浓度为20 mg/kg时德国鸢尾对Cd的积累量最大,为2.122 mg/plant.     

射干和鸢尾的挥发性成分

射干和鸢尾的挥发性成分秦民坚王强徐珞珊徐国钧（中国药科大学,南京２１００３８）田中俊弘（岐阜药科大学,日本国岐阜市５０２）ＶｏｌａｔｉｌｅｃｏｎｓｔｉｔｕｅｎｔｓｏｆＢｅｌａｍｃａｎｄａｃｈｉｎｅｎｓｉｓａｎｄＩｒｉｓｔｅｃｔｏｒｕｍＱｉｎＭｉｎＪ...     

Phytochemical Analysis and Total Antioxidant Capacity of Rhizome,Above‐Ground Vegetative Parts and Flower of Three Iris Species

This study was aimed at investigating the phytochemical composition and antioxidant capacity of rhizomes, above‐ground vegetative parts and flowers of three Iris species: Iris humilis Georgi , Iris pumila L. and Iris variegata L. UHPLC‐Orbitrap MS analysis was used for determination of phytochemical profile. Total pigments, phenolics, flavonoids, soluble sugars and starch content as well as ABTS antioxidant capacity were also determined. In total, 52 phenolics compounds were identified with 9 compounds (derivatives of iriflophenone, apigenin C‐glycosides, luteolin O‐glycoside, isoflavones derivatives of iristectorigenin, dichotomitin, nigracin and irilone) never reported before in Iris spp. Differences in phenolic composition profile, pigments, soluble sugar, starch, total phenolics and flavonoids content and total antioxidant capacity were found among Iris species and different part of plants. Significant correlation between total phenolic content and antioxidant capacity was determined. The obtained results are comparable with those obtained for medical plants. These findings could be useful for fingerprinting characterization of Iris species and estimation of possible use in pharmaceutical industries.     

临床标本细菌基因组DNA提取方法探讨

目的优化细菌基因组DNA提取方法,使其适合临床细菌分子生物学检测需要。方法分别采用专用DNA提取液法、热裂解法、溶菌酶法、热裂解法与碱性裂解法组合改良法,对纯培养细菌和临床标本中细菌基因组DNA进行提取。结果专用DNA提取液法、溶菌酶法提取成功率为100%,热裂解法革兰阳性菌提取成功率为0%,革兰阴性菌成功率为100%,碱性裂解液法在NaOH浓度大于4 mmol时提取成功,临床标本在NaOH溶液超过20 mmol/L并含2%SDS时细菌基因组DNA的提取成功率为100%。结论热裂解法与碱性裂解法组合改良法提取细菌基因组DNA方便快速、简单实用,适用临床标本检测。     

中国鸢尾属植物根茎中异黄酮类成分分布的初步研究及其系统学意义

本文对鸢尾属Iris 22个种(基本上包括了各个亚属的代表)及其近缘属植物射干属Belamcanda的 射干 B．chinensis(L．)DC．进行了根茎的异黄酮类成分的比较分析研究。结果表明,鸢尾属植物和射干 中普遍具有异黄酮类成分,这是它们的特征性成分之一。根据化学成分的特征,鸢尾属可以分为两大类 群：只含异黄酮甙元的类群和既含异黄酮甙又含甙元的类群。从化学成分的分布特征来看,无附属物亚 属subgen．Limniris只含异黄酮甙元,是一个比较自然的类群。鸡冠状附属物亚属subgen．Crossiris,除小 花鸢尾 I．speculatrix Hance外,是一个较自然的类群。野鸢尾亚属subgen．Pardanthopsis和射干属的成分 非常相似,有着密切的亲缘关系,是鸢尾属中原始的类群。从化学成分特征来看,野鸢尾亚属与琴瓣鸢 尾亚属subgen．Xyridion、鸡冠状附属物亚属、须毛状附属物亚属subgen．Iris都有着一定的联系。根据化 学成分、孢粉学、细胞学等特征,认为：华夏鸢尾I．cathayensis Migo和长白鸢尾I．mandshurica Maxim．为无附属物亚属与须毛状附属物亚属两亚属之间的过渡类型。小花鸢尾是无附属物亚属向鸡冠状附属物亚属过渡的中间类型。扁竹兰I．confusa Sealy和扇形鸢尾I．wattii Baker可能是同一个种。     

A preliminary study on the distribution pattern of isoflavones in rhizomes of Iris from China and its systematic significance

A comparative isoflavonoid analysis of 22 species of Iris, representing almost all the subgenera, and one species of its allied genus Balamcanda, B. chinensis (L.) DC. was carried out by TLC, with iridin, tectoridin, irigenin, tectorigenin, irisfloretin, dichotomin, wogonin, rhamnazin, apocynin, androsin being used as authentic compounds. The results show that the isoflavones are the characteristic constituents of Iris and Belamcanda. According to the distribution pattern of isoflavones, the Iris species here studied can be divided into 2 groups; one contains isoflavonoid aglycons, while the other contains both glycosides and isoflavonoid aglycons. From the point view of chemosystematics, subgen. Limniris contains isoflavonoid aglycons only and might be a natural group; subgen. Crossiris might be also a natural group when Iris speculatrix Hance is excluded; subgen. Pardanthopsis is similar to B. chinensis in the chemical constituent might be a primitive group in Iris and has close relationship with subgen. Crossiris, subgen. Xyridion and subgen. Iris. Based on the evidence from phytochemistry, palynology and cytology, Iris cathayensis Migo and I. mandshurica Pall. are considered intermediate groups between subgen. Limniris and subgen. Iris and I. speculatrix Hance an intermediate group between subgen. Limniris and subgen.Crossiris, while I. confusa Sealy and I. wattii Baker might be conspecific.     

胡椒叶片基因组DNA提取方法比较

目的：研究建立胡椒叶片中提取高质量DNA的方法。方法：采用各种CTAB法和SDS法的改良方法,提取胡椒叶片中的总DNA,并对DNA进行紫外和电泳检测。结果：改良CTAB法4和5提取的DNA经电泳检测,有一条明亮主带,且无拖尾现象,样品槽无荧光出现,说明抽出的DNA纯度较高,一致性好;测定其OD260和OD280值,并计算其比值,OD260/OD280值在1.8-2.0之间,提取率在51.667-60.000μg/g之间,获得的基因组DNA质量高。结论：改良CTAB法4和法5可从胡椒幼叶中提取高质量DNA。