关于激素命名与译名问题的商榷

在动物和人体内,目前已发现数十种激素,如果算上它们的代谢物和大量人工合成的类似物,约有数千种之多。类固醇激素的化学命名规则在五十年代初期确定之后,1969年又发表了订正草案(IUPAC-IUB,1969),1972年再次确定下来(IUPAC-IUB,1972)。命名规则对具有生物活性的重要类固醇激素保留俗名,采用半系统命名法。但对蛋白质和多肽激素,多年来一直没有统一的命名法规可循。一般多以分泌部位或功能命名,致使一种激素有多种名称,如垂体促乳素有9个同物异名。随着激素种类的发     

国际植物命名法规中的术语介绍

现今,国际上已普遍接受国际植物命名法规(International code of botanical nomenclature)作为管理植物学(包括藻类学和真菌学)科学命名的规则。该规则由历届国际植物学大会的命名法分会会议修订,因而每六年出版一次修订版。最新版的维也纳法规     

国际两大植物命名体系及其相互关系

根据国际生物科学联盟的相关规则,全世界野生或自然起源植物的拉丁学名均由《国际植物命名法规》加以规范和管理,因人类有意活动选择、引种、培育和生产的栽培植物的名称由《国际栽培植物命名法规》加以规范和管理。这是目前世界公认的关于国际植物命名规则的两大法规体系。对两大国际植物命名体系及其相互关系进行扼要梳理,目的是为从事相关专业的组织或个人提供帮助。     

我国古植物命名中若干值得重视的问题——兼述维也纳法规中有关的规定

根据2006年发表的新版国际植物命名法规(维也纳法规)的有关规则和条款,讨论我国古植物命名中一些值得重视的和存在的问题,着重在分类单元名称的合格发表、模式指定以及拉丁属、种名称构成和性别等几个方面.文中也介绍了新法规中对古植物形态分类单元(morphotaxa)定义的改变和相关规则的更动情况,以及有关在学位论文和电子版文档中发表分类单元名称等新规则.文后附有古植物命名的一些重要规则生效的日期和相关说明.     

植物的命名

世界上的植物形形色色,种类繁多,各地的劳动人民在长期自然发展中,用各种不同的语言为当地植物取了一定的名称。但不同的国家及民族之间的方言差异甚大。就是同一国家同一民族内,植物的同物异名、同名异物的现象也是十分普遍的。这对植物的识别、利用造成很大困难。本文仅就植物拉丁名命名的重要规则作一简要介绍。     

关于栽培植物的命名问题

介绍了栽培植物命名规则,包括其分类等级和命名体系。简要介绍了《中国梅花品种图志》、《中国桂花品种图志》等著作的作者提出和遵循的关于栽培植物品种中文名命名的原则和意见,并对我国栽培植物品种中文名命名中存在的主要问题进行了简要评述。     

国际植物命名法规简介(Ⅵ)

一个正确名称必须要符合有关命名模式和优先律的规定。本篇介绍这两方面的一些主要规则。一、命名模式(Nomenclatural type)分类群名称的应用是凭籍命名模式来决     

中国药用真菌名录及部分名称的修订

近年来,我国对药用真菌的研究和利用越来越重视,相关报道逐年增加。针对有些种类鉴定有误、拉丁学名使用没有严格遵守最新国际植物命名法规、命名人缩写不规范等问题,作者系统考证了我国药用真菌的名称,共收录473种,对每种名称按新近的研究成果和最新命名法规(维也纳法规)进行了订正,对过去的错误报道或不存在的名称进行了修正,将曾报道的、但应作为其他种的同物异名者列在其正名之后,所有名称定名人的缩写全部按国际植物命名法规的要求加以规范化。每种名称之后还列举了该种的主要药用功能或价值,并引证了主要参考文献。     

SLAⅠ类基因最新命名进展

介绍了国际动物遗传学会（ISAG）SLA命名委员会2004年制定的依据基因测序及进化树分析的SLAⅠ类基因系统命名法,详细叙述了对SLAⅠ类基因座、等位基因组、等位基因及单倍型的命名规则,其中概括介绍了命名新等位基因对基因序列的具体要求。SLAⅠ类基因系统命名法对于人类移植免疫学、猪免疫遗传及抗病育种具有重要意义。     

人类染色体的国际命名规则

人类染色体研究的发展很快,提供了大量的知识,积累了丰富的资料,但因而也造成了染色体记载法的混乱。为了制定染色体的标准记载法,使国际上统一起来,以便互相交流,促进发展,国际上一直在不断地制定染色体的通用命名规则。第一次国际命名规则会议于1960年4月在美国科罗拉多州的丹佛市举行。会议第一次制定了染色体国际命名的基本规则。以染色体的臂比(arm ratio)、着丝点指数(Centromeric index)、相对长度(relative length)(表1)的值作为标准,把常染色体按大小顺序,从     

菌寄生真菌纤细齿梗孢FUS3/KSS1类MAPK基因的克隆和序列分析

采用RACE技术和TAIL-PCR相接合,克隆得到菌寄生真菌纤细齿梗孢的一个丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶基因,命名为omk1(GenBank accesion No.EU479712),其cDNA编码区1068bp,编码355个氨基酸的多肽;omk1基因编码区包含2个内含子,分别长57bp和73bp,内含子边界符合GT-AG规则。序列比对和分析显示该基因属于FUS3/KSS1类MAPK基因;RT-PCR显示该基因在孢子萌发和菌丝生长阶段均表达。该基因的克隆将为进一步研究该菌识别寄主信号的分子机理奠定基础。     

DPSN：扩增子测序引物标准化命名数据库

扩增子测序是目前用来衡量微生物多样性时使用最广泛的测序手段。因为其扩增的需要,所以选择合适的特定引物是必需的,且其对结果影响甚大。probeBase是目前最常用的记录了人工校正后的rRNA探针和引物的数据库。然而,我们发现probeBase中63.58%的引物存在不同程度的注释错误,包括命名重复、命名无规律以及匹配位置错误等。更严重的是,目前主流的短命名方式不具有唯一性,导致对应关系模糊不清。因此,我们定义了更简单可行的短命名标准并开发了新的引物科学命名数据库（DPSN）,并对probeBase里的所有173个引物进行了校正,并新加入了4个新的改良引物以及38个针对大亚基的新引物。新的短命名规则包含3个基本要素：在正链5''端的位置、版本号和方向。此外在前面加入了识别大/小亚基以及主要针对的菌界的标志。使用DPSN,可以快速查找感兴趣区域对应的引物并比较不同版本的差异选择合适的引物。同时还能建立命名与序列的明确一一对应关系,避免歧义。     

美国SECURE规则评析及其对中国的启示

美国农业部动植物卫生检疫局在最近一次生物技术法规的修订中,将原有的关于监管利用基因工程开发的生物体的进口、州际移动和环境释放一章的规定进行了较大幅度的修改,并将之命名为SECURE规则。这一规则采用了新的安全评价方法,将评价的重心从原来的生产方法转移到了产品的特性上。此外,新的规则还通过豁免程序和监管状态审查等程序的设立,进一步简化了监管方式。但SECURE规则也存在着部门立法之间的协调不足、配套机制建设不完善等问题,可能给新规则的实施带来一定的挑战。我国作为转基因技术大国,在农业生物技术及其产品监管的立法上可以批判性地借鉴美国最新的立法实践,为我国生物技术产业的发展提供法治保障。     

对几个植物名称的厘定与辨析

为正确理解和规范使用植物的各种名称,按照《国际植物命名法规》和《国际栽培植物命名法规》的规则,对几组常见且容易混淆的植物名称进行了厘定和辨析。     

国际生物命名法规的协调与统一

根据林奈双名制原则,不同的生物学科曾先后制定出相应的命名法规,使各自学科的生物命名规范化。现行的国际生物命名法规有5个,即动物命名法规、植物命名法规、细菌命名法规、栽培植物命名法规以及病毒命名法规（草案）。这些法规经过不断地修改,逐渐使生物的命名严谨和完善。在制定这些法规时,拟定者虽参考了其它生物命名的原则、规则和条例,但主要是考虑自身学科内生物的实际情况而定的,因此,上述5个不同的命名法规之间存在着一定的差异,自然会出现一些混乱。为了使国际生物命名的统一化,在国际科协（ICSU）的支持下,1994年国…     

第十五届国际动物学会议采用的国际动物学命名法则

动物的学名一般都认为瑞典科学家林奈在他1758年出版的“自然系统”一书中创始应用,但是林奈只对植物提出了命名规则,而对动物则没有。现在的国际动物学命名法则有其一段发展过程:当1889年第一届国际动物学会议在巴黎开会时,当时的秘书长Blanchard教授曾提出一系列的有关动物的命名规则,可是未被采用。1892年第二届国际动物学会议在莫斯科召开时,才加以讨论。1895年第三届会议在荷兰     

深圳植物学大会有关菌物命名法的重要决定（英文）

2017年7月在深圳召开的第十九届国际植物学大会是该国际会议第一次在亚洲举行的大会。在大会正式日程之前一整周的命名法分会上,代表们专门就有关藻类、菌物与植物的命名法规问题进行了大量的讨论并做出了相关的决定。本文总结了有关菌物命名的相关讨论和决议。(1)菌物命名法管理:会议讨论了菌物命名法管理特别小组委员会的报告(2016),主要涉及菌物命名法分会要在国际菌物学大会上进行(其程序与国际植物学大会上的命名法分会并行,但提案表决不设机构投票权),有关菌物命名法规的提案要在《IMI Fungus》上发表、指导性电子邮件投票的参加人员、菌物命名法分会的官员为主席和秘书以及菌物命名法委员会要在国际菌物学大会选举等问题。这个一揽子的提案获得65.8%的赞成票通过,带来了具有里程碑意义的变化,决定了此后在国际命名法规中如何引入、修改或删除与菌物命名相关的规则。(2)保护名:这是在深圳会议上通过的关于菌物保护名的非常重要的议题,凡列入这些名单上的菌物名称可得到保护,不受未列入名单的其他名称的影响。(3)多型性菌物:有关废除以形态类型命名的多型性菌物名称在上一届国际植物学大会(2011)上就已通过,但保留了有关有性型名称对无性型具有优先权的规则。在这次深圳会议上,这个规则(57.2)也被彻底清除。现在确定菌物名称的使用不再以其为无性型或有性型模式所标定的名称来决定,而完全遵循发表日期的优先律。(4)地衣型真菌:地衣型真菌从来不受多型性真菌名称的影响,但由于上届大会上保留了有性型对无性型的优先权(规则57.2),有几位地衣学家为了避免在地衣方面引起争论,当时在会上提出地衣的名称不受这一规则管辖。随着深圳大会清除了规则57.2,任何有关地衣的特殊规定都一起消失。(5)模式标定:包括有模式注册、培养物作为模式、DNA序列作为模式、解释模式、图片后选模式等问题。从2019年1月1日起,指定菌物名称的后选模式、新模式或解释模式必须在3个认可的菌物名称注册网站(即Fungal Names,Index Fungorum或Myco Bank)上注册,获得注册号。从2019年1月1日开始,任何被指定为模式的培养物都必须指明是保留在代谢不活跃的状态,如果没有这个说明,该模式标定将被作为不合格发表。有关DNA序列作为模式的提案没有得到通过,但成立了一个专门委员会对这个问题进行研究。指定解释模式必须是因为现有的模式明显模糊不清才有必要进行。在没有实物标本情况下是否必须指定图片作为后选模式,而不管图片能否显示鉴别特征的问题没有得到解决,但由新成立的模式标定专门委员会进一步研究。(6)作者引证:关于删除名称作者引证中冒号":"的提案没有得到通过,但同意推荐可以"nom.sanct."作为替代使用,以表明其认可名称的地位。(7)同名:从2019年1月1日起,新发表的菌物名称如果与已有的细菌或原生动物名称相同将被判定为不合格的名称。(8)注册:此次大会除了规定后标定的模式必须注册外,没有其他注册问题的变化。(9)特型(special forms):有关接受那些以特型发表、符合基原名要求的名称的提案在会上获得通过。     

2018版《国际藻类、菌物和植物命名法规》（深圳法规）的主要变化

《国际藻类、菌物和植物命名法规》是世界植物学家处理植物名称时必须遵守的规则,在每次的国际植物学大会之后都会做适当修订并予以颁布,新版《法规》一旦颁布就替代了前期各版《法规》。概要介绍了2018年6月26日正式出版的《深圳法规》与前一版《墨尔本法规》相比出现的主要变化,主要从结构上的变化、新增条款、相关条款的变化、术语的变化等方面进行了阐述。     

动态

经过彻底修改过的国际动物命名法规(第三版),自1985年2月公布之日起生效,以前所有版本同时废止。法规正文从绪言开始,接着是18章88条法规条文,各条文包括强制性的规则,其中部分附有荐则和实例。后面有6个附录和详细的词汇及索引。是当今国际动物命名的最新统一规则。该书已由朱弘复教授等译成中文,科学出版社即将于近期出版。     

基于决策树的代偿期和失代偿期肝硬化自动诊断的方法

决策树方法因结构简单、便于理解和具有较高的分类精度而在数据挖掘中被广泛采用.本文利用改进的决策树算法C4.5从201例肝硬化病例中自动地提取相应的肝硬化状态识别规则,得到决策树分类模型并归纳出代偿性肝硬化和失代偿性肝硬化的诊断规则,识别正确率为84.6%.实验结果表明决策树能较好的自动从肝硬化病例中归纳出代偿性和失代偿性肝硬化的诊断规则.