登革病毒感染性转录体技术

登革病毒 (Ｄｅｎｇｕｅｖｉｒｕｓ)属黄病毒科黄病毒属 ,基因组结构为单股正链ＲＮＡ ,全长约 1 0～ 1 1ｋｂ。登革病毒在复制过程中不形成ＤＮＡ中间体 ,因此要在基因水平研究其特征存在一定困难 ,因为突变、重组、克隆等分子生物学技术都是在ＤＮＡ水平上的操作。体外转录制备感染性ＲＮＡ(感染性转录体 )技术提供了解决这一难题的新途径[1]。该技术是把病毒ＲＮＡ逆转录成ｃＤＮＡ ,并置于ＲＮＡ聚合酶启动子的下游 ,在ＲＮＡ聚合酶的作用下体外转录出全长正链ＲＮＡ ,经转染易感细胞后复制出子代病毒颗粒。由于这种子代病毒来自ｃＤＮ…     

水稻蜡质基因第一内含子碱基突变引起其RNA二级结构的可能变化

通过体外转录得到籼稻品种２３２蜡质基因第一内含于５’端４３０ｂｐ的ｓｓＲＮＡ分子,以及在此区域发生了自然突变的粳稻品种寒丰蜡质基因经一内含子５’端同样长度的ｓｓＲＮＡ分子。部分变性胶电泳结果表明两种ｓｓＲＮＡ分子的迁移速率不同。将两种ｓｓＲＮＡ分子的核酸序列用计算机分析,表明此两种ｓｓＲＮＡ分子能形成不同的茎－环结构,自由能值也有差异。对突变引起的这些不同与两种水稻品种蜡质基因转录本剪接的差异进行     

核糖核酸可含胸腺嘧啶吗

一般国内教材告诉读者：脱氧核糖核酸（ＤＮＡ）含ＡＴＣＧ４种碱基,而核糖核酸（ＲＮＡ）则含ＡＵＣＧ４种碱基。从碱基组成看,两者之间仅有一个碱基的差别,ＤＮＡ中的Ｔ在ＲＮＡ中被Ｕ取代,而Ｕ和Ｔ两者在化学结构上仅相差一个甲基。可是转移核糖核酸（ｔＲＮＡ）的ＲＮＡ,在其二级结构中有一个ＴΨＣ环的结构,其Ｔ指的是胸腺嘧啶核苷酸,那核糖核酸（ＲＮＡ）也可含胸腺嘧啶Ｔ,这与通常的观点有所不同;而事实上是怎么回事呢？一般国内参考书在讲述ｔＲＮＡ转录及转录后加工时,均提到碱基的多种加工修饰方式：如还原反应、脱氨基…     

原核表达系统的真核化

Ｔ7噬菌体ＲＮＡ聚合酶显著的特点是只识别其自身ＤＮＡ序列中特定的启动子[1] ;而Ｔ7噬菌体启动子属于组成型的启动子 ,又只能被相应的Ｔ7噬菌体的ＲＮＡ聚合酶 (约 10 0ｋＤ的单链蛋白质 )所识别 ,并且被Ｔ7ＲＮＡ聚合酶所启始的转录非常活跃[2 ,3] ,宿主细胞的ＲＮＡ聚合酶所进行的转录根本无法同其竞争 ,这样宿主细胞中几乎所有的转录都被Ｔ7ＲＮＡ聚合酶所操纵。另外 ,Ｔ7ＲＮＡ聚合酶几乎能完整地转录在Ｔ7启动子下游的所有ＤＮＡ序列。基于这些优点 ,1986年Ｓｔｕｄｉｅｒ和Ｍｏｆｆａｔ建立了一套新的原核表达系统———Ｔ7ＲＮＡ聚…     

双链RNA病毒的复制机制

本文对双链ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）病毒复制机制的研究进展进行了综述。根据ｄｓＲＮＡ病毒复制周期,分以下几方面对其复制的有关分子进行分析：转录、转录本释放和“满头”复制模型、（＋）ＲＮＡ转译、病毒包装、（－）ＲＮＡ合成等。此外,还简要分析了宿主基因及其产物在病毒复制中的作用。     

爱滋病的反义抑制治疗

爱滋病的反义抑制治疗黄建生，王昌才，任大明（广州第一军医大学生物化学教研室，广州５１０５１５）（复旦大学遗传所国家重点实验室，上海２００４３３）关键词反义ＲＮＡ，爱滋病（ＡＩＤＳ）反义ＲＮＡ是一种与ｍＲＮＡ互补的ＲＮＡ分子，是反义基因的转录产物，它能...     

HCV5＇端非编码区cDNA的体外转录

采用逆转录聚合酶链反应（ＲＴ－ＰＣＲ）从广东省一例慢性丙型肝炎病人血清中获得丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）５＇端非编码区（５＇ＮＣＲ）３０２ｂｐ的ｃＤＮＡ片段,经补齐和提纯后插入ｐＵＣ１９质粒,获得的重组体ｐＵＮ进行序列测定。将ｐＵＮ的目的基因亚克隆进体外转录载体ｐＳＰＯＲＴＩ多克隆位点的ＥｏｏＲＩ和ＰｓｔＩ切点之间,所得重组体ｐＳＮ线性化后由Ｔ＿７ＲＮＡ多聚酶及ＳＰ６ＲＮＡ多聚酶引导体外转录反应,产物经凝胶电泳及特异引物ＲＴ－ＰＣＲ,证实ＳＰ６引导的是正义ＲＮＡ,Ｔ７合成的是反义ＲＮＡ,其大小分别力４２９ｂｐ和３６２ｂｐ。并证实所得ＲＮＡ力ＨＣＶ５＇ＮＣＲｃＤＮＡ转录而来。获得的ＨＣＶ５＇ＮＣＲｃＤＮＡ和ＲＮＡ在常规逆转录和ＰＣＲ步骤中用于设立有效的模板对照,对消除假用性及评估试剂有重要意义。同时,ＨＣＶ５＇ＮＣＲ体外转录载体的构建可用于制各ＲＮＡ探针和反义ＲＮＡ,改进后还可作为定量ＰＣＲ的竞争性模板。     

乙型肝炎病毒的核心启动子各区段功能的研究

将一系列核心启动子区的缺失突变引入乙肝病毒（ＨＢＶ）线性转录单元,从病毒的抗原,ＲＮＡ以及子代ＤＮＡ等各个水平,分析了各缺失突变对前基因组ＲＮＡ和前核心ＲＮＡ转录的影响,对核心启动子各片段的功能进行了深入的研究。Ｃ片段缺失后检测不到ｅ抗原和前核心ＲＮＡ,却仍有核心抗原和前基因组ＲＮＡ的合成以及病毒子代ＤＮＡ的复制;而Ｂ３片段缺失后ｅ抗原和核心抗原均有显著下降,但仍能检测到两种ｍＲＮＡ的合成和病毒子     

真核普通转录因子

三类真核ＲＮＡ聚合酶分别选择性地转录细胞核基因,其转录特异并不决定于ＲＮＡ聚合酶本身,而是取决于被转录基的启动子元件及能识别并结合这些元件的普通转录因子,它们与ＲＮＡ聚合酶相互作用,在启动子区组装成转录起始复合物,从而起动转灵,已知的三类普遍转寻因子中,大多数为相应ＲＮＡ聚合酶所专用,只有少数因子中的个别亚基是三类酶所通用。本简述这三类普通转录因子的结构,性质及其在转录中的功能。     

SAR与植物转基因沉默的消除

随着转基因技术在各个应用领域的深入和发展,转基因沉默现象已引起越来越多的人关注。转基因沉默主要发生在转录或转录后水平,涉及核酸的三种相互作用,即：ＤＮＡ－ＤＮＡ、ＤＮＡ－ＲＮＡ、ＲＮＡ－ＲＮＡ。这是植物基因表达调控的具体表现之一,也是外源基因插入后生物体的一种自我保护。ＳＡＲ协同转基因进行转化,可以消弱宿主ＤＮＡ对外源基因的不利影响。实验证明,在稳定整合的转基因植物中,ＳＡＲ提高了整体表达水平,并降低了不同转化体之间的差异。这是消除植物转基因沉默的一条有效途径。     

Partially edited mRNAs for cytochrome b and subunit III of cytochrome oxidase from Leishmania tarentolae mitochondria: RNA editing intermediates

Partially edited mRNAs were selected by the polymerase chain reaction and sequenced. In the case of cytochrome b, 102 out of 106 clones displayed patterns of editing that were consistent with a strictly progressive 3' to 5' editing process, as predicted by the guide RNA model of RNA editing. In the case of cytochrome oxidase subunit III (COIII), 177 out of 304 clones displayed strictly progressive 3' to 5' patterns of editing. However, the remaining 127 COIII clones displayed unexpected patterns in which upstream editing preceded downstream editing, uridines were inserted at sites not normally edited, and purine residues were deleted. We suggest that many of these RNAs are produced by normal 3' to 5' editing of the COIII mRNA with incorrect guide RNA molecules.     

Molecular and Functional Diversity of RNA Editing in Plant Mitochondria

RNA editing is a fundamental biochemical process relating to the modification of nucleotides in messenger RNAs of functional genes in cells. RNA editing leads to re-establishment of conserved amino acid residues for functional proteins in nuclei, chloroplasts, and mitochondria. Identification of RNA editing factors that contributes to target site recognition increases our understanding of RNA editing mechanisms. Significant progress has been made in recent years in RNA editing studies for both animal and plant cells. RNA editing in nuclei and mitochondria of animal cells and in chloroplast of plant cells has been extensively documented and reviewed. RNA editing has been also extensively documented on plant mitochondria. However, functional diversity of RNA editing factors in plant mitochondria is not overviewed. Here, we review the biological significance of RNA editing, recent progress on the molecular mechanisms of RNA editing process, and function diversity of editing factors in plant mitochondrial research. We will focus on: (1) pentatricopeptide repeat proteins in Arabidopsis and in crop plants; (2) the progress of RNA editing process in plant mitochondria; (3) RNA editing-related RNA splicing; (4) RNA editing associated flower development; (5) RNA editing modulated male sterile; (6) RNA editing-regulated cell signaling; and (7) RNA editing involving abiotic stress. Advances described in this review will be valuable in expanding our understanding in RNA editing. The diverse functions of RNA editing in plant mitochondria will shed light on the investigation of molecular mechanisms that underlies plant development and abiotic stress tolerance.