用做标记的两种酵母菌完整染色体DNA的简化制备法

已知分子量在小的染色体ＤＮＡ分子标记是脉冲电泳研究中用以估算样本染色ＤＮＡ分子大小必不可和的参照物。对用做标记的啤酒酵母和粟酒裂殖酵母完整染色体ＤＮＡ几种制备方法的比较研究以及改进研究表明,液氮冷冻研磨法,凝胶包埋法以及凝胶包埋破壁法效果均很好,都得到大量染色体ＤＮＡ,且彼此此间无明显差异。     

黑木耳电泳核型分析

采用等高锁状均质电场（ＣＨＥＦ）凝胶电泳技术,对黑木耳（Ａｕｒｉｃｕｌａｒｉａ ａｕｒｉｃｕｌａ）电泳核型进行分析,以酿酒酵母（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）菌株ＹＰＨ７５５和粟酒裂殖酵母（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｐｏｍｂｅ）菌株ＡＳ２．２１４的染色体ＤＮＡ大小作为分子量标记,估计黑木耳基因组中至少包含９条ＤＮＡ分子量在８５０ｋｂ至５８００ｋｂ之间的染色体,     

黑木耳电泳核型分析

采用等高锁状均质电场（ＣＨＥＦ）凝胶电泳技术,对黑木耳（Ａｕｒｉｃｕｌａｒｉａ　ａｕｒｉｃｕｌａ）电泳核型进行分析,以酿酒酵母（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ　ｃｅｒｉｖｉｓｉａｅ）菌株ＹＰＨ７５５和祭酒裂殖酵母（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ　ｐｏｍｂｅ）菌株ＡＳ２．２１４的染色体ＤＮＡ大小作为分子量标记,估计黑木耳基因组中至少包含９条ＤＮＡ分子量在８５０ｋｂ至５８００ｋｂ之间的染色体,多数染色体ＤＮＡ分子量在１０００ｋｂ至３４００ｋｂ之间,基因组大小在２２Ｍｂ以上。     

一种新的脉冲电泳分子量标记*

在脉冲电泳（ｐｕｌｓｅｄ－ｆｉｅｌｄ　ｇｅｌ　ｅｌｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ,ＰＦＧＥ）研究中,经常使用的分子量标记有啤酒酵母（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ　ｃｅｒｅｖｅｓｌａｅ）和粟酒裂殖酵母（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ　ｐｏｍｂｅ）的染色体完整ＤＮＡ。其中,啤酒酵母（如菌株ＹＮＮ２９５）有１６条染色体,分子量变化范围为０．２５Ｍｂ～２．２Ｍｂ（ＭｃＣｌｕｓｋｅｙｅｌａｌ,１９９０）,适于作为小于２．２Ｍｂ的染色体ＤＮＡ的分子量标记;粟酒裂殖酵母（如菌株９７２ｈ－）有３条染色体,分子量…     

脉冲电泳核型分析在酿酒酵母菌分类学研究中的应用

根据酵母属（ Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ Ｍｅｙｅｎ ｅｘ Ｒｅｅｓｓ） 分类学研究最新进展,核实并更新了保藏于中国普通微生物菌种保藏中心的该属菌株的种类归属。在形态和生理生化性状,包括对６ 种糖的发酵能力、对１８ 种碳源和３ 种氮源化合物的同化能力、在无维生素培养基中和３７ ℃下的生长情况、对放线菌素酮的抗性等常规分类学研究的基础上,对部分疑难菌株进行了脉冲电泳核型比较分析。酿酒酵母（ Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ） 、贝酵母（ Ｓ．Ｂａｙａｎｕｓ） 和巴氏酵母（ Ｓ．Ｐａｓｔｏｒｉａｎｕｓ） 三者与少孢酵母（ Ｓ．Ｅｘｉｇｕｕｓ） 在电泳核型上具有明显的差异,主要表现在前三者染色体ＤＮＡ 分子的大小范围均为２２５ ～２２００ ｋｂ ,而Ｓ．Ｅｘｉｇｕｕｓ 缺少小于３６５ ｋｂ 的染色体ＤＮＡ 分子。Ｓ．Ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ 的模式和权威菌株具有１２ ～１４ 条染色体ＤＮＡ 带;Ｓ．Ｂａｙａｎｕｓ 和Ｓ．Ｐａｓｔｏｒｉａｎｕｓ 的模式菌株均有１７ 条带,但在带型上存在一定差异。原归于Ｓ．Ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ 的株菌ＡＳ２－１００ 具有１６ 条带,与Ｓ．Ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ 区别明显而与Ｓ．…     

一株种间融合的三倍体杂种酵母减数分裂产物的遗传学分析

通过原生质体融合技术将二倍体酿酒酵母（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅｒｅｖｉｓｉａｅｖａｒ．ｅｌｌｏｐｓｉｏｄｅｕｓ）与单倍体糖化酵母（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｄｉａｓｔａｔｉｃｕｓ）构建成遗传上稳定的种间三倍体融合杂种。实验结果表明,这种融合杂种象有性杂种一样能诱导产孢;对其完整和非完整四分子的遗传分析,证明了通过遗传标记互补选择法获得的种间三倍体融合杂种ＨＵ－ＫＤＦ－２４０在产孢过程中,标记基因发生了分离和交换,出现了亲二型和重组类型;四分子对可溶性淀粉的发酵和不发酵分离比为１∶２,而原养型与营养缺陷型的分离比是１∶１。     

细胞衰老揭秘

细胞衰老揭秘为研究Ｗｅｒｎｅｒｓ综合征发病的基因机制,分子生物学家Ｇｕａｒｅｎｔｅ和Ｄａｖｉｄｓｉｎｃｌａｉｒ利用酵母Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ进行研究。这是因为Ｗｅｒｎｅｒｓ的特征是早衰,而酵母Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅ...     

12株酵母菌的亲缘关系分析

克隆了９株假线酵母和１株克鲁维酵母的２５ＳｒＤＮＡ片段,测定其５′端部分苷酸序列与报道的Ｃａｎｄｉｄａａｌｂｉｃａｎｓ及Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ２５ＳｒＤＮＡ相应区域的核苷酸序列比较,采用ｎｅｉｇｈｂｏｒ－ｊｏｉｎｉｎｇ和ｂｏｏｔ－ｓｔｒａｐ法分析并绘制系统树,结果提示ＣａｎｄｉｄａｋｅｆｙｒＣＢＳ８３４与Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ ｃｉｃｅｒｉｓｐｏｒｕｓＣＢＳ４８５７亲缘     

具有不同碳源利用方式的酿酒酵母菌株的脉冲电泳核型分析

根据酵母属（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ　ＭｅｙｅｎｅｘＲｅｅｓｓ）分类学研究的最新进展,对保藏于中国普通微生物菌种保藏中心的酿酒酵母（Ｓ．ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅＭｅｙｅｎｅｘＨａｎｓｅｎ）菌株进行了系统的分类学研究。在表型性状,包括形态、对６种糖类化合物的发酵反应、对１８种碳源和３种氨源化合物的同化反应、在无维生素培养基中和在３５℃及３７℃下的生长情况、对放线菌素酮的抗性等研究的基础上,主要以发酵反应的异同为主将所研究的４０株酿酒酵母菌分成了４组。其中两组２６株与该种的最新标准描述相符,而另两组１４株在蔗糖的发酵和同化及麦芽糖的同华能力上与标准描述不符。进一步的脉冲电泳核型比较分析表明,在生理生化性状上可以清楚分开的４个组,在脉冲电泳核型上却没有相应的区别。典型的酿酒酵母菌株有１２－１５条染色体ＤＮＡ带,大小范围为２２５－２,２００Ｋｂ。在个别生理生化性状上与酿酒酵母的标准描述不符的两组菌,却具有与典型酿酒酵母菌株相同的脉冲电泳核型,证实它们应属于这个种。而菌株ＡＳ２．１４２１虽然其表型性状与酿酒酵母的标准描述完全相符,却具有与典型酿酒酵母菌株差异明显的脉冲电泳核型。该株菌染色体ＤＮＡ分子的大小范围与酿酒酵母?     

酿酒酵母属的分类学研究进展

由于酵母菌的巨大经济价值,国内外对这类微生物从基础到应用各方面的研究一直都非常活跃,而其中最基础的学科,酵母菌分类学,亦经历了巨大变化。了解当前最具有经济重要性的酿酒酵母菌的属种概念及其分类方法,无疑对更好地掌握和利用这类酵母菌具有重要意义。１酿酒酵母属的建立及其早期分类学研究 酿酒酵母属（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ　Ｍｅｙｅｎ　ｅｘ　Ｒｅｅｓｓ）的分类学研究历史可追溯到一个半世纪以前,Ｍｅｙｅｎ于１８３８年首次提出了Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ这一属名,并将啤酒酵母命名为Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅ…     

稻曲病菌厚垣孢子不同破壁方法的比较

为了探究稻曲病菌[Ustiloginoidea virens(Cooke)Takahashi]厚垣孢子的最佳破壁方法,研究采用4种破壁法对该病菌黄色和黑色厚垣孢子进行破壁,血球计数板计算破壁效果,并用考马斯亮蓝法测定不同破壁方法中厚垣孢子壁内可溶性蛋白含量。结果表明,在普通光学显微镜下观察,破壁后厚垣孢子多数为碎片,少数为孢壁内空圆球。4种破壁方法中液氮研磨-超声破碎法破壁效果最好,黄色和黑色厚垣孢子的破壁率均可达98%以上,用该法破壁测得的黄色和黑色厚垣孢子壁内可溶性蛋白质含量也最高。由此可见,液氮研磨-超声波破碎法是一种稻曲病菌厚垣孢子破壁的有效、简便、适宜在实验室应用的方法。     

高水分、富含淀粉植物组织的扫描电镜制备技术优化

应用常规高真空扫描电子显微镜观察生物样品必须经过脱水和干燥处理,但无论采用临界点干燥还是冷冻干燥方法,都存在样品表面不同程度失真的问题。植物高水分、富含淀粉组织样品经处理后,容易出现淀粉流失、细胞壁变形等现象,从而造成扫描图像粗糙,无法获得真实的细胞内部结构。本文通过对CO_2临界点干燥、化学固定样品冷冻干燥和新鲜样品冷冻干燥3种扫描电镜样品制备技术中后期制样进行机械断裂和液氮脆断改进,优化出两种植物高水分、富含淀粉组织的扫描电镜样品制备方法:(1)样品首先进行FAA化学固定,经冷冻干燥后用液氮脆断,对断面喷金镀膜和扫描电镜观察。利用该方法所得细胞结构完整,细胞壁整齐,淀粉粒和蛋白轮廓明确,可用于分析淀粉粒和蛋白颗粒在细胞内的分布。(2)新鲜样品直接进行冷冻干燥,经液氮脆断后对断面喷金镀膜和扫描电镜观察。利用该方法所得细胞壁整齐,淀粉粒轮廓更清晰,并且无蛋白颗粒干扰,用于分析淀粉粒在细胞内的分布更加理想。     

The pavement lining of the vessels in the earthworm (Lumbricus terrestris)]

Effect of some preparatory methods to make ready earthworm tissues for electron microscopical investigation has been studied in order to reveal structural components of the vascular wall. The method for an immediate fixation of the earthworm tissues in liquid nitrogen with a subsequent additional fixation in cooled 2.5% glutar aldehyde, applied in combination with OsO4-thiocarbohydroside-OsO4 method is optimal. This method of samples preparation gives a reliable information concerning existence of an internal--endothelial--lining in the earthworm vessels. A conclusion is made on a qualitatively new level of cell differentiation of the internal vascular lining in the earthworm, which is called phase of blast transformation of endotheliocytes.     

The effect of cryopreservation on the cytogenetic characteristics of a cell subline of skin fibroblasts from the Indian muntjac

After thawing cells, previously cryopreserved in the presence of dimethyl sulfoxide (DMSO), a decrease in their viability and increase in unscheduled DNA synthesis was observed. In 7 days, these parameters restored to the control level. Cryopreservation without DMSO resulted in the decrease in both cell viability and replicative and unscheduled DNA synthesis. In 14 days, these characteristics were seen to return to the normal level. Cryopreservation of cells without DMSO and their preservation in liquid nitrogen induced the frequency of chromosomal aberrations, mostly chromosomal breaks. The frequency of chromosomal aberrations increased with the duration of cell preservation in liquid nitrogen. The normal level was achieved following 7 days after cell thawing. Cells treated with DMSO only (without cryopreservation) display an increased number of chromosomal and chromatid breaks and translocations. Nonrandom distribution of chromosomal aberrations was observed, with particular chromosomes being involved in the appearance of dicentrics and translocations. The data obtained indicate that cryoprotective activity of DMSO is probably associated with the cell repair systems. The detected antimutagenic and mutagenic activity of DMSO may presumably reflect various conditions for its interaction with cells (with or without cryopreservation), as well as it may be specific for the muntjac cell line used in the present work.     

酵母双杂交相关方法的改良及应用

对酵母双杂交实验过程中较为耗时的阳性克隆鉴定过程进行改进,以期建立一种快速有效的鉴定方法。分别采用液氮冻融法、超声破碎法、渗透压破壁法以及煮沸裂解法裂解酵母细胞,获得质粒作为PCR模板,直接测序鉴定筛选到的相互作用蛋白。以液氮冻融法和超声破碎法裂解细胞获得的质粒为模板进行PCR,得到特异的产物,测序鉴定结果明确,与经典的鉴定方法相比效果相当,但更加经济快捷;而渗透压破壁法和煮沸裂解法则效果不好。说明前两种方法可代替常规方法用于阳性克隆的鉴定,从而加快酵母双杂交实验中大量阳性克隆的筛查工作。     

Chromosome and cell wall segregation in Streptococcus faecium ATCC 9790.

Segregation was studied by measuring the positions of autoradiographic grain clusters in chains formed from single cells containing on average less than one radiolabeled chromosome strand. The degree to which chromosomal and cell wall material cosegregated was quantified by using the methods of S. Cooper and M. Weinberger, dividing the number of chains labeled at the middle. This analysis indicated that in contrast to chromosomal segregation in Escherichia coli and, in some studies, to that in gram-positive rods, chromosomal segregation in Streptococcus faecium was slightly nonrandom and did not vary with growth rate. Results were not significantly affected by strand exchange. In contrast, labeled cell wall segregated predominantly nonrandomly.     

Cellophane based mini-prep method for DNA extraction from the filamentous fungus Trichoderma reesei

Background  

Methods for the extraction of DNA from filamentous fungi are frequently laborious and time consuming because most of the available protocols include maceration in liquid nitrogen after the mycelium has been grown in a liquid culture. This paper describes a new method to replace those steps, which involves the growth of the mycelium on cellophane disks overlaid on solid medium and the use of glass beads for cell wall disruption.     

基于液氮研磨法的流式细胞术检测马铃薯倍性的研究

染色体组倍性鉴定是马铃薯种质资源评价的重要内容,流式细胞仪能够快速、准确地对细胞核DNA含量进行测定,从而广泛用于检测植物染色体组倍性。建立适于马铃薯倍性鉴定的高通量流式细胞术体系,对马铃薯育种工作提供依据。以20份马铃薯合作88孤雌诱导后代为材料,用液氮研磨法制备叶片细胞核悬液,并将其与传统刀片切碎法制备的细胞核悬液进行比较,对已知四倍体马铃薯合作88和二倍体马铃薯IVP101进行染色体倍性测定,结果发现这两种方法在倍性测定结果之间无明显差异,但是液氮研磨法操作简单、耗时少。基于液氮研磨法的流式细胞术可快速、准确检测其倍性。另外,在液氮研磨法中,对细胞核悬液染色时间的长短(从15 min到12 h)并不会影响倍性测定结果,从而方便研究人员在实际操作中灵活选择染色时间。     

植物挥发性物质提取的一种简易方法--液氮冷凝法

介绍了植物挥发物提取的一种简易方法——液氮冷凝法。利用液氮的制冷原理对植物挥发性物质进行提取收集,当携带植物挥发性物质的纯净空气带动供试植物组织的挥发性物质通过一置有U形玻璃管的液氮罐时,由于液氮的低温作用,挥发性物质在U形管内壁上遇冷凝结。该提取装置简单,由硅胶柱、活性碳柱、流量计、锥形瓶、U形管、液罐及各种连接管构成,容易组装。利用该装置提取的挥发性物质可以用于生测,去除水分后还可用于电生理以及挥发性物质化学组成分析等。     

新生隐球菌总RNA抽提方法的实验研究

目的探讨快速获取高质量的新生隐球菌总RNA的实验方法。方法选取新生隐球菌的荚膜株、荚膜缺陷株,分别设计采用4种方法提取总RNA:酸洗玻璃珠法、液氮研磨法、异硫氰酸胍一步法、冷酸洗玻璃珠联合Yeast RNA kit法。用紫外线分光光度计测量其OD260、OD280的值,并且进行琼脂糖凝胶电泳,同时应用定量PCR法鉴定RNA质量。结果酸洗玻璃珠法、液氮研磨法、异硫氰酸胍一步法、冷酸洗玻璃珠联合Yeast RNA kit法的RNA产量分别为0.2μg/105细胞、0.4μg/105细胞、0.1μg/105细胞、0.6μg/105细胞。结论冷酸洗玻璃珠联合Yeast RNA kit法提取的RNA均一性和完整性最好,是简便、快捷地提取具有荚膜和细胞壁双重屏障的新生隐球菌RNA的理想方法。