华重楼内生菌SS02的分离与抗菌活性的初步研究

从华重楼（Paris polyphylla var．Chinensis Franch）的地下块茎中分离到一株内生细菌（SS02）,试验表明其发酵液对13种作物致病菌的生长有抑制作用。形态和生理生化特征表明SS02属于芽孢杆菌属（Bacillus sp．）细菌。扩增、测序得到SS02的部分16SrDNA序列,GenBank接收号AY842144。用Blastn调出与菌株16SrDNA同源的序列,用Clustalw进行多重序列对比,用Phylip按Neighbor—Joining法构建16SrDNA系统发育树。菌株SS02与Paenibacillus daejeonensis处于同一分支,相似性为97．7％,将其鉴定为Paenibacillus daejeonensisSS02。     

华重楼内生菌SS02的分离与抗菌活性的初步研究*

从华重楼(Parispolyphyllavar·ChinensisFranch)的地下块茎中分离到一株内生细菌(SS02),试验表明其发酵液对13种作物致病菌的生长有抑制作用。形态和生理生化特征表明SS02属于芽孢杆菌属(Bacillus sp·)细菌。扩增、测序得到SS02的部分16SrDNA序列,GenBank接收号AY842144。用Blastn调出与菌株16SrDNA同源的序列,用Clustalw进行多重序列对比,用Phylip按Neighbor-Joining法构建1     

一株产重楼皂甙内生细菌的分离与鉴定

从产自四川彭州的华重楼(Parispolyphyllavar·chinensisFranch)地下块茎中分离得到16株菌。经以薯蓣皂甙元为标准对照的薄层层析分析,表明其中编号为SNUS-1(AY842149)的菌株能分泌重楼皂甙或其类似化合物。16SrDNA序列(约1,500bp)系统发育分析表明:菌株SNUS-1与Pseudomonastolassii(AF255336)和Pseudomonastolassii(D84028)的遗传距离分别为0和0·003,在系统进化树上三者又严格聚为一族,结合形态及生理特征确定其为托氏假单孢菌(Pseudomonastolassii)。     

采用未培养技术对荷斯坦奶牛瘤胃细菌多样性进行初步分析

采用未培养(Culture independent)技术直接从荷斯坦奶牛瘤胃液中提取瘤胃细菌微生物混合DNA(也叫元基因组DNA),利用细菌16SrDNA通用引物27F与1492R,扩增瘤胃混合微生物的16SrDNA,根据16SrDNA序列对瘤胃细菌多样性进行初步分析。通过16SrDNA序列同源性分析,发现有多于一半以上的序列与可培养的菌株的同源性小于90%,属于不可培养的菌株。选用45条测得序列与已知序列构建系统发育树,分析结果表明,它们分属于两大类LGCGPB(the lowG CGram positivebac teria)和CFB(Cytophaga_Flexibacter $CBacteroides group),剩下的克隆尚难确定其分类地位,可能是代表新属和种的序列,这些序列已向GenBank提交并得到序列号(AY986777_AY986791)。     

海南温泉嗜热菌的16S rDNA分析

目的:确定24株海南温泉嗜热菌菌株的分类地位。方法:Blastn分析菌株16S rDNA序列同源性;邻接法构建菌株16SrDNA序列系统发育进化树并分析菌株的进化位置;Clustax比对分析菌株的相似度和进化距离。结果:菌株LY5和LY4的16SrDNA序列与Geobacillus pallidus strain B1,partial sequence(GenBank:HM030740.1)的16S rDNA序列同源性分别为98%和97%,其他菌株的16S rDNA序列与Geobacillus subterraneus,strain R-35641(GenBank:FN428689.1)的16S rDNA序列的同源性均大于96%。Clustax比对分析表明26株菌16S rDNA序列前段(1～70bp)、中段(70bp～1 420bp)、后段(1 420～1 484bp)的相似度分别为40%、100%和60%,进化距离分析表明菌株GT7、LY4和LY5与其他菌株进化距离较远,其余菌株之间进化距离差异不明显。综上所述,初步将24株温泉嗜热菌鉴定为土芽孢杆菌属(Geobacillus sp.)。结论:16S rDNA序列分析可用于温泉嗜热菌的鉴定。     

一株产纤维素酶细菌的筛选、鉴定及其纤维素酶的部分特性

目的:分离堆肥中具有产纤维素酶酶活的菌株并进行鉴定,同时进行该菌株纤维素酶酶特性的研究.方法:采用刚果红平板法进行筛选得到菌株,利用16SrDNA通用引物对其基因组DNA进行扩增,测序得到CCH-1的部分16SrDNA序列,经Blastn调出与菌株16SrDNA同源的序列,用软件MEGA 4.0按照Neighbor-Joining方法构建16SrDNA系统发育树,并采用DNS法测定所产纤维素酶酶活.结果:GCH-1的生理生化指标与蜡质芽胞杆菌理化指标相符,与Bacillus cereus IAM 12605(T)处于同一分支,相似性为99.8%.CCH-1菌株发酵48h能达到最大产酶量,所产纤维素酶在40℃有最高酶活力,酶活力分别为0.581μ/mL,GCH-1菌株产生的纤维素酶酶系在pH 7.0～9.0能够保持较高的相对酶活力,超过85%相对活力.结论:GCH-1初步鉴定为蜡质芽孢杆菌(Bacillus cereus),能够产胞外纤维素酶.     

一株玉米小斑病拮抗菌的分离、筛选及鉴定

目的：分离对玉米小斑病菌（Bipolaris maydis）有拮抗作用的内生菌株并进行菌种鉴定。方法：经表面消毒用碾碎法从水浮莲（Pistia strotiotes）中分离内生菌,用平板扩散法筛选出对玉米小斑病菌（Bipolaris maydis）有明显拮抗作用的内生菌株XJ-PL-YB-50,利用16SrDNA通用引物对其基因组DNA进行扩增,并测序得到XJPL-YB-50的部分16SrDNA序列,GenBank接收号为EU262981。经Blastn调出与菌株16SrDNA同源的序列,用软件MEGA3．1按照Neighbor-Joining方法构建16SrDNA系统发育树。结果：XJPL-YB-50的主要生理生化指标与Bacillus subtilis相符,与Bacillus subtilis AB271744处于同一分支,相似性为100％,G＋Cm01％为47．7％。结论：水浮莲内生菌XJPL-YB-50对玉米小斑病菌有明显拮抗作用,并最终鉴定为枯草芽孢杆菌Bacillus subtilis。     

厚荚相思树根瘤菌HJ06菌株的16S rDNA全序列和nifA基因片段分析

对厚荚相思(Acaciacrassicarpa)根瘤菌HJ06菌株的16SrDNA全序列和nifA基因片段进行了测定。结果表明,HJ06菌株在以16SrDNA序列构建的系统发育树状图中位于根瘤菌属(Rhizobium)分支中,与根瘤菌属各个种的相似性达95%以上;从HJ06菌株克隆出的585bpnifA基因片段与Klebsiellapneumoniae的同源性达到99.3%,与Klebsiellaoxytoca的NifF,NifL,NifA,NifB蛋白基因的同源性为97.8%。     

产薯蓣皂甙华重楼内生菌的筛选与鉴定

从华重楼(Paris polyphylla chinensis Franch)的地下块茎中分离出107株内生菌,经TLC筛选检测,菌株RZ03和RZ07可产生薯蓣皂甙。进行了形态和生理生化鉴定并将菌株的16S rDNA序列分别与用BLAST调出GenBank EMBL DDBJ中的相关序列比较,用ClustalW绘制系统发育树,RZ03与DQ019167(Exiguobac-terium acetylicum)同源性为99%,鉴定为Exiguobacterium acetylicum,RZ03、RZ07与DQ207730(Bacillus subtilis)序列同源性为99%,初步鉴定为Bacillus subtilisRZ07。     

一株海洋细菌的初步鉴定及其产黑色素相关新基因(簇)的分离

对分离自近海沼泽地大米草根际的一株供试海洋细菌MWYL1进行了形态观察、生理特性检测以及16SrDNA序列分析。实验结果表明:该菌株属于海洋单胞菌属(Marinomonas),革兰氏染色呈阴性,直杆状,好氧生长,适于28℃生长。基于16SrDNA序列的Blast分析表明,菌株MWYL1与Marinomonas pontica和Marinomonas dokdonensis的序列相似性分别为97%和95%。通过基因组fosmid文库的构建,直接分离到一个产生黑色素的克隆,进一步亚克隆和测序后获得与黑色素产生相关的功能新基因(簇),并且对其进行了生物信息学的初步分析。     

蚤休、重楼和王孙

经过历史考证,作者确认:首载于《神农本草经》的蚤休为重楼属的Paris polyphyllaSmith var. chinensis (Fr.)Hara;首载于《滇南本草》中的重楼为重楼属的Paris polyphyllaSmith var. yunnanensis (Fr.) Hand. -Mazz.;《植物名实图考》中的王孙则是三白草科的三白草Saururus chinensis (Lour.) Bail.     

重楼属的四个新异名

将小重楼Paris polyphylla Smith var．minora S．F．Wang、长药隔重楼P.polyhylla Smith var．pseudothibetica H．Li处理为金线重楼P.delavayi Franch．的异名;将广东重楼P.polyphylla Smith var．kwantungensis（R．H．Miau）S．C．Chen＆S．Y.Liang处理为多叶重楼P.polyphylla Smith的异名;将文县重楼P.wenxianensis Z．X．Peng＆R．N．Zhao处理为黑籽重楼P.thibetica Franch．的异名。     

镧对华重楼生长及皂苷含量的影响

本研究以4年生华重楼（Paris polyphylla Smith var. chinensis（Franch.）Hara）为实验材料,分别采用0、5、20、80、160 mg/L的加镧营养液培养华重楼植株,通过比较不同营养生长指标及采用HPLC法测定根茎皂苷组分,研究不同施镧水平对华重楼生长及皂苷含量的影响。结果显示,镧对华重楼生长及皂苷含量均有显著影响,随着镧溶液浓度的增加,华重楼皂苷含量呈上升趋势,但当镧含量达到160.00 mg/L时,则会对华重楼的生长产生抑制作用,导致株高降低、比叶面积升高。研究结果表明80.00 mg/L的施镧水平最有利于华重楼的营养生长及根茎皂苷积累。     

中国重楼属(延龄草科)一新变种——攀西直瓣重楼

描述了延龄草科一新变种--攀西直瓣重楼(Paris polyphylla Smith var.panxiensis J.L.Liu),并绘制了形态图.新变种以其叶片狭长、条形而与狭叶重楼(Paris polyphylla Smith var.stenophylla Franch.)和小重楼(Paris polyphylla Smith var.minor S.F.Wang)相近似,但又以花瓣线状圆柱形、直立、不弯曲、远短于萼片、向上逐渐增粗呈棒状、先端圆形或钝圆,花药药隔明显头状突起而有明显区别.     

多叶重楼遗传多样性的RAPD分析

应用RAPD技术检测了多叶重楼(Paris polyphyfzo)2个变种4个居群的遗传多样性,并与1个凌云重楼(P．cronquistii)居群进行了比较。选择的16个随机引物在5个居群中共检测到246个多态位点。在居群水平上,滇重楼2个居群的多态位点百分比(PP鳓分别为57．43％和54．67%,Shannon指数分别为0．3080和0．2830;七叶一枝花2个居群的PPB分别为56．33％和57．75%,Shannon指数分别为0、3080和0．3293。在变种水平上,滇重楼的PPB为75．14％,Shannon指数为0．3922,遗传分化系数(Gst)为0．3085;七叶一枝花的PPB为80．31％,Shannon指数为0．3992,遗传分化系数(Gst)为0．3726;在种的水平PPB达92．05%,遗传分化系数Gst达0．5151。聚类分析显示滇重楼和七叶一枝花有较近的亲缘关系,而与凌云重楼遗传距离较远。此结果从分子水平上支持了过去将滇重楼和七叶一枝花划分为1个种下2个变种的形态分类观点。     

重楼属和延龄草核型的一致性

本文报道的重楼属3个种和变种与延龄草的核型基本一致,表明它们之间的亲缘关系很近,其核型简式为:延龄草(T. tschonoskii)2n=10=4m 2m(SAT) 2st(SAT) 2t(SAT) 1B;五指莲(Paris axialis)2n=10=6m 2t 2t(SAT) 2B;狭叶重楼(P. polyphylla var. stenophylla)2n=10=2m(SAT) 4m 2st 2t;小重楼(P.polyphylla var.minora)2n=10=4m 2sm 4t.     

一株菲降解细菌的分离鉴定及其特性

通过选择性富集培养,从沈抚灌区石油污染土壤中分离到1株菲降解细菌.试验证明该菌株能以菲为唯一碳源和能源生长.经形态学、生理生化鉴定和16S rRNA基因序列比对分析,确定该菌株属于不动杆菌属,命名为Acinetobacter sp. L2. 系统发育进化分析发现,L2菌株与Acinetobacter sp. DG880［AY258108］亲源关系最近.L2菌株培养7 d后对菲的降解率达96.3%.邻苯二酚2,3-双加氧酶活力测定表明,L2菌株可能含有菲降解基因.