2022年海南省新型冠状病毒奥密克戎（BA.1.1）变异株基因特征分析

为进一步积累和完善海南省新型冠状病毒（Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2）奥密克戎（Omicron）变异株病原学特点的认识,本研究对2022年海南省14例感染奥密克戎（BA.1.1）变异株病例进行新冠病毒基因特征分析。应用Illumina公司MiSeqDX深度测序平台进行全基因组序列测定,Nextclade在线分析平台和DNASTAR 7.0.1生物信息学软件进行多序列比对和基因组特征分析,采用MEGA 10.1.8邻位归并法（Neighbour-joining）绘制系统进化树,结合流行病学调查进行回顾性溯源分析。海南省14例病例感染的奥密克戎（BA.1.1）变异株基因组高度相似,同武汉参考序列（GenBank No.NC＿045512）相比,存在63或64个核苷酸突变位点,39个核苷酸位点缺失,22204位点有9个核苷酸插入,引起43个氨基酸突变和16个氨基酸位点缺失。刺突（Spike, S）蛋白存在32个氨基酸突变位点,S1蛋白RBD区R346K是VOC/Omicron(BA.1.1)变异株特征性突变...     

新型冠状病毒突变株Omicron核酸检测的TaqMan探针设计

Omicron（奥密克戎）作为最新的新型冠状病毒（SARS-CoV-2）突变株，其带有大量的突变位点，且突变位点主要位于S蛋白上，这不仅会增加再次感染病毒的风险，同时也会大幅降低疫苗和抗体疗法的的效果。Omicron携带的突变虽不影响国内现使用的核酸检测试剂，但这些检测试剂不能有效地鉴别出Omicron突变株。本研究通过对Omicron以及其他SARS-CoV-2突变株的基因序列进行分析，设计了能特异性检测Omicron突变株的TaqMan探针。同时，该探针可与现有的核酸检测体系进行结合，实现SARS-CoV-2核酸检测和Omicron突变株鉴别的双重功能。     

呼吸系统流感病毒感染通过菌群介导的Th17细胞依赖的炎症诱导肠道免疫损伤

<正>流感是一种发生于多种禽类和哺乳动物的感染性呼吸系统疾病。临床上最普遍的症状包括咳嗽、发热和头痛等,同时还经常伴有腹痛、呕吐和腹泻等胃肠道感染样症状。但是为什么主要发生于肺部的流感病毒感染会引起肠道的损伤?其中的机制目前还不清楚。在这篇2014年11月17日发表于《实验医学杂志》(Journal of Experimental Medicine)的文章中,作者使用PR8流感病毒鼻内感染C57小鼠,发现确实存在肺部损伤和肠道损伤,而肝和肾脏组织没有看到明显的病变。为了证明肠道损伤是否是由于     

053肠聚集性大肠埃希菌的聚集黏附性菌毛引起肠上皮细胞的炎性反应

肠聚集性大肠埃希菌（大肠杆菌）是导致腹泻的病原菌，在发展中国家儿童中常引起水样腹泻。最近，有学者认为肠聚集性大肠杆菌是引起旅行者腹泻的最主要原因。感染肠聚集性大肠杆菌后，最典型的症状是黏性水样便，同时伴有发热、恶心、呕吐等。肠聚集性大肠杆菌的发病机制包括3步：①黏附到肠黏膜；②诱导黏液生物膜的产生与沉积；③炎症反应和细胞因子的释放。肠聚集性大肠杆菌黏附在人的肠黏膜上需要聚集黏附性菌毛（AAf），     

微囊藻毒素-LR对小鼠肠道消化酶的影响

微囊藻毒素-LR（MCLR）是一类对动物和人类健康影响很大的蓝藻毒素。已有调查认为MCLR能导致某些胃肠道疾病,相关实验室资料也证实MCLR能在肠道积累并引起肠道损伤。研究对小鼠连续腹腔染毒MCLR 28d,观察肠道病理水平及超微结构的变化,并测定肠黏膜刷状缘膜酶活性。结果显示,小肠绒毛受损较严重,绒毛数量减少、部分脱落至肠腔,固有层及黏膜下层水肿、充血;电镜观察发现肠细胞细胞质电子密度降低,伴有线粒体肿胀、细胞核变形现象;肠黏膜二糖酶（蔗糖酶、麦芽糖酶、乳糖酶）、碱性磷酸酶及-谷氨酰转移酶活性均呈下降趋势。在亚慢性MCLR染毒条件下,肠道的消化功能可能受到抑制,进而导致机体对营养物质吸收不良。研究对理解蓝藻毒素引起的胃肠道不适（如恶心、呕吐、腹痛、腹泻）提供了新的证据。       

布拉酵母防治病原微生物感染的机制及效果

肠杆菌科细菌、霍乱弧菌、难辨梭菌、幽门螺杆菌和原虫等病原体感染是引起腹泻的主要原因.布拉酵母作为一种益生菌,通过抗微生物、免疫调节、肠道屏障、增加肠道营养等方面维持肠道微生态平衡.该酵母用于治疗肠杆菌科细菌、霍乱弧菌等病原菌感染引起的急性腹泻,能显著降低腹泻频率,缩短腹泻时间;而作为辅助药物联合抗生素治疗难辨梭菌、幽门螺杆菌和原虫等顽固性病原微生物感染,具有提高根除率、减少副作用、降低复发率的作用.本研究综述了布拉酵母对若干腹泻病原体的防治机制和临床应用研究进展.     

肠道真菌研究进展

摘要：肠道真菌是肠道微生物的重要组成部分，在肠道正常菌群中所占比例极小，主要包括假丝酵母属（Candida）、隐球酵母属（Cryptococcus）、青霉属（Penicillium）、曲霉属（Aspergillus）、红酵母属（Rhodotorula）等，对维持肠道微生态稳态和机体健康具有重要作用，也与抗生素相关性腹泻（AAD）、乙型肝炎、炎症性肠病（IBD）等疾病的发病机制息息相关。本文主要总结了目前已发现的肠道真菌属及其对人体的影响机制以及肠道真菌相关的研究方法，为肠道真菌在疾病的诊断和治疗方面的进一步研究提供依据与思路。     

灵芝孢子粉对重症急性胰腺炎大鼠肠道微生态失调的调整作用

目的探讨灵芝孢子粉对重症急性胰腺炎（SAP）导致的肠道微生态失调的调整作用。方法采用胆胰管逆行注射5％牛磺胆酸钠法造成SAP模型;SD大鼠随机分为假手术组、模型组、奥曲肽治疗组、灵芝孢子粉治疗组及灵芝孢子粉奥曲肽联合治疗组;于给药7d后处死大鼠,进行肠道菌群、肝脏及胰腺细菌易位检测。结果SAP时出现明显的肠道菌群紊乱,细菌易位。经治疗后发现,灵芝孢子粉能够扶植双歧杆菌、乳酸杆菌的生长,使肠杆菌的数量减少,并可控制细菌易位。将灵芝孢子粉与奥曲肽合用作用更佳,与其他治疗组相比差异有显著性（P〈0．05）。结论灵芝孢子粉可调整SAP时出现的肠道微生态失调,其与奥曲肽联合应用治疗SAP可降低感染率,取得较好的疗效。     

《自然》:痢疾变形虫可吃掉活肠道细胞

<正>溶组织内阿米巴(痢疾变形虫)能通过咬食和吞掉细胞碎片攻击人类肠道,并在发展中国家引发致命腹泻。4月10日的《自然》杂志报告了它们吞下肠道细胞的过程,或将对治疗溶组织内阿米巴感染提供新目标。溶组织内阿米巴带来的感染会导致严重组织损伤,出现肠道溃疡或脓肿,但人们之前并不清楚溶组织内阿米巴是如何杀死细胞的。曾有人认为溶组织内阿米巴是先杀死细胞再将其吞下的,但美国弗吉尼亚大学的William Petri及研究团队得出了相反结论。他们使用实时显微镜成像,用     

江苏省300例艾滋病人群联合检测 HCV、TP、HIV的结果分析

摘要 目的：探究江苏省2017年至2019年度艾滋病哨点监测人群丙型肝炎病毒（Hepatitis C virus,HCV）、梅毒螺旋体（Treponema Pallidum,TP）以及人类免疫缺陷病毒（Treponema Pallidum,HIV）感染状况,以期为制定对应的疾患干预手段提供临床数据支撑。方法：严格按照《全国艾滋病哨点监测实施方案操作手册（2012版）》对入组的900例个体开展相关问卷调查,并对入组对象进行HCV、TP以及HIV感染血清学检测,分别统计3年总体感染情况、年度感染情况、不同年龄段人群感染情况以及合并感染情况。结果：（1）性工作者HCV、TP以及HIV感染率分别为3.00 %、4.00 %和9.00 %,吸毒人群感染率分别为13.00 %、73.00 %和13.00 %,孕产妇感染率分别为1.00 %、0.67 %和1.33 %,比较显示,吸毒人群HCV、TP以及HIV感染率明显高于其余两类人群（P<0.05）;（2）就各年度不同人群HCV、TP以及HIV感染率开展年度横向比较显示,不同年度不同人群的HCV、TP以及HIV感染率差异无统计学意义（P>0.05）;（3）针对不同年龄段不同人群的HCV、TP以及HIV感染率开展比较显示,吸毒人群中≥50岁HCV和HIV感染率明显高于其他年龄段（P<0.05）,性工作者中18~20岁HIV感染率明显高于其他年龄段（P<0.05）,其余差异无统计学意义（P>0.05）;（4）合并感染情况分析显示合并TP以及HIV感染率要高于其他合并感染。结论：吸毒人群是江苏省HCV、TP以及HIV感染高发群体,以≥50岁年龄段感染率最高,总体来看HCV、TP以及HIV感染率呈现逐年降低趋势,但仍应该加强对上述疾患的防控工作。     

粪菌移植治疗艰难梭菌感染的研究进展

艰难梭菌感染(Clostridium difficile infection,CDI)是院内抗生素相关性腹泻的最重要因素之一,其主要临床表现包括血便、腹泻、中毒性巨结肠、伪膜性肠炎等。近年来,CDI发病率、复发率、死亡率和治疗费用均明显增加,但其各种治疗方法均有局限性,尤其是抗生素治疗复发性艰难梭菌感染已面临许多棘手问题。目前证实肠道菌群失调和CDI感染关系密切,肠道菌群紊乱后导致艰难梭菌过度繁殖并释放毒素,可导致艰难梭菌感染。粪菌移植作为重建肠道菌群的重要方式,已成为复发性、难治性艰难梭菌感染最有效的治疗方式之一,不良反应极少。本文就国内外粪菌移植治疗艰难梭菌感染的研究进展作一综述。     

不同身体质量指数人群肠道菌群结构及共存网络解析

[背景] 人体能量稳态失衡表现为体重过轻、超重和肥胖,肠道菌群与人体能量稳态的维持有关,但不同身体质量指数（Body Mass Index,BMI）人群的肠道菌群特征仍需进一步探究。[目的] 基于美国肠道计划公开数据库,解析4类BMI人群肠道菌群的特征,并探究4类BMI人群肠道菌群共存网络特征及差异,为基于肠道菌群来干预肥胖及体重过轻等不健康状态提供新的理论依据。[方法] 从美国肠道计划数据集中筛选具有BMI信息的肠道菌群样本,并根据世界卫生组织规定的BMI划分标准将筛选后的样本分为4类：体重过轻（BMI<18.5 kg/m²）,正常体重（18.5 kg/m²2）,超重（25 kg/m²2）,肥胖（BMI>30 kg/m²）;通过计算和比较肠道菌群的α多样性和β多样性探究4类BMI人群肠道菌群的整体结构特征及差异;通过多元线性回归模型对不同BMI分类与肠道菌群进行相关性分析,并且将地域、年龄、性别因素作为混杂因素加入到模型中进行校正;采用SparCC分别计算4类BMI人群肠道菌群中菌属相关性,并分别构建肠道菌群共存网络。[结果] 经过Wilcoxon秩和检验,发现体重过轻、超重、肥胖人群的肠道菌群α多样性都显著低于正常体重人群;β多样性分析结果表明4类BMI人群肠道菌群的整体结构存在显著差异;4类BMI人群肠道中厚壁菌门（Firmicutes）和拟杆菌门（Bacteroidetes）的相对含量无显著差异;通过MaAsLin分析,并且将地域、年龄、性别因素作为混杂因素加入到模型中进行校正,共得到49个与BMI类型显著相关的物种;4类BMI人群肠道菌群共存网络的拓扑结构具有一定差异,体重过轻和正常体重人群肠道菌群共存网络的复杂度较高,超重和肥胖人群肠道菌群共存网络的复杂度较低。[结论] 4类BMI人群肠道菌群的多样性、整体结构和共存网络间均存在差异。     

昂立一号优菌多颗粒人群试食研究

昂立一号优菌多颗粒是“昂立一号”家庭新成员,其人群试食研究结果表明,昂立一号优菌多颗粒在短时间（4d）内就能显著改善食欲、胃肠道及代谢排便功能,随着服用时间的延长,改善作用越强;20d服用后可极显著地提高人体肠道菌群中的益生菌（双歧杆菌和乳杆菌）数量,却极显著地抑制肠道有害菌产气荚膜梭菌数量,可调节人体肠道菌群平衡,腹泻便秘双重调节,促进肠道健康。     

人肠道螺旋体分离株对肠上皮细胞吸附特性的研究

肠道螺旋体 (Brachyspirapilosicoli)是一新发现的引起肠道螺旋体病 (intestinalspirochetosis)的病原菌。利用猪等动物模型的感染实验已经证明人的肠道螺旋体可以导致肠螺旋体病。肠道螺旋体既可以感染人 ,也可以感染动物 (如猪、狗、鸡等 )。该螺旋体在世界许多地方都有发现 ,包括北美洲、南美洲、欧洲和亚洲的国家。在美国、澳大利亚以及西欧的一些国家 ,肠道螺旋体在人群中的感染率比较低 ,平均在 1.5 % ,但在HIV阳性病人其感染率超过 30 %。在发展中国家如巴布亚新几内亚和阿曼 ,人群的感染率高达 30 %。在我国尚未见到肠道螺旋体的…     

双叉奶中合生元对改善肠道菌群功效的研究

目的 对双叉奶中合生元改善肠菌群的功效进行研究分析。方法 依卫生部《新增保健功能评价指标及程序的初步方案》,做动物及人体改善肠道菌群试验。结果 1．双叉奶中合生元对小鼠4种肠道菌群数量的影响：与对照组比较,各剂量组小鼠肠道内肠球菌、肠杆菌数量均无显著性差异（P＞0．05）;低剂量、高剂量组乳酸杆菌数量明显增加,有显著性差异（P＜0．05）,中剂量组乳酸杆菌数量增加显著,有非常显著性差异（P＞0．01）;低剂量、中剂量组双歧杆菌数量明显增加,有显著性差异（P＞0．05）。2．双叉奶中合生元对人体5种肠道菌群数量的影响：与饮用前相比,受试人群肠道内肠杆菌、肠球菌数量均无显著性差异（P＞0．05）;双歧杆菌、乳酸杆菌数量增加显著,有非常显著性差异（P＞0．01）。肠梭菌数量降低显著,有非常显著性差异（P＞0．01）。3．受试人群自觉症状观察：所有人无不良反应,可改善便秘、增加食欲、排气。结论 双叉能奶中合生元对小鼠、人体肠道菌群具改善作用。     

甜味剂对七味白术散治疗抗生素相关性腹泻小鼠肠道微生物及酶活性的影响

目的 探讨4种常用甜味剂对七味白术散治疗抗生素相关性腹泻的影响，为药剂辅料的选用对药效的影响及临床治疗指导患者服药提供实验依据。方法 选择42只SPF级昆明种小鼠随机分为正常组、模型组、七味白术散组、蔗糖组、糖精钠组、山梨醇组和木糖醇组，每组6只。造模阶段正常组灌胃无菌水，模型组和治疗组采用抗生素混合液（庆大霉素+头孢拉定）建立小鼠抗生素相关性腹泻模型。治疗阶段对正常组和模型组小鼠灌胃无菌水，5个治疗组小鼠分别灌胃七味白术散、蔗糖+七味白术散、糖精钠+七味白术散、木糖醇+七味白术散及山梨醇+七味白术散。治疗结束后，分别收集各组小鼠脾脏、胸腺以及肠道内容物，进行脏器指数、肠道微生物数量及肠道酶活性分析。结果 与模型组相比，七味白术散组和山梨醇组小鼠的脾脏指数增加，但差异无统计学意义（均P>0.050）；各组小鼠的胸腺指数差异无统计学意义（P>0.050）。与七味白术散组相比，添加甜味剂组别的腹泻小鼠肠道内容物中的细菌数和大肠埃希菌数均有一定程度的增加，其中山梨醇组的大肠埃希菌数量变化最小（P=0.002）；蔗糖组和山梨醇组腹泻小鼠肠道内容物中的双歧杆菌数量（P<0.00...     

中药91－4对抗生素相关性腹泻小鼠肠道膜菌群及腔菌群的影响

本实验以肠道菌群检测与电镜观察法,初步研究了中药９１－４对抗生素相关性腹泻（ＡＡＤ）小鼠肠道菌群的影响。结果表明,盐酸林可霉素对小鼠肠道膜菌群、腔菌群干扰显著,乳酸杆菌、双歧杆菌及肠杆菌等比正常对照组明显减少,致小鼠腹泻或肠炎;中药９１－４能够促进肠道乳酸杆菌、双歧杆菌等生长繁殖,对肠道膜菌群、腔菌群均具有调整作用,加速肠粘膜病变的愈合及修复,可有效地控制ＡＡＤ模型小鼠的腹泻症状。     

生态旅游对川金丝猴肠道寄生虫的影响

非人灵长类接触人类或受人类活动干扰导致肠道寄生虫与宿主关系失衡,这种影响造成肠道寄生虫感染,进而增加肠道寄生虫种类和荷虫量。为检验生态旅游对川金丝猴（Rhinopithecus roxellana）肠道寄生虫的种类和承载是否有影响,本研究收集神农架国家级自然保护区川金丝猴投食群和野生群粪便样品,采用福尔马林乙酸乙酯沉淀法,共发现5种肠道寄生虫：阿米巴原虫（Amoeba）,鞭虫属（Trichuris sp.）,蛔虫（Ascaris lumbricoides）,蛲虫（Enterobius vermicularis）,钩虫（Hookworms）。结果显示,投食群的阿米巴和蛲虫的荷虫量高于野生群;蛔虫在投食群和野生群均有发现,但两者之间无显著性差异;鞭虫和钩虫只在投食群中发现。投食群部分肠道寄生虫具有高荷虫量和新增的两个种类是由于非人灵长类直接或间接与人类接触（生态旅游等）所导致的。     

大连地区人群肠道寄生虫感染调查及流行病学分析

于2002年9～12月采用改良加腾氏法等方法对大连地区人群肠道寄生虫感染开展调查并对此进行流行病学分析。调查结果显示,在被检的10865人群中,肠道寄生虫总感染率为4．38％(重76／10 865),三个片区人群感染率分别为城市2．82％、郊区4．60％和区县7．79％;男性与女性所感染的寄生虫种类及感染率有所差异;在我们所检查出的寄生虫中主要是蛔虫,其次为鞭虫;农民肠道寄生虫感染率最高(6．89％),其次是小学生(4．75％)。本次调查结果表明,大连地区人群肠道寄生虫的感染情况已得到有效的控制．并且感染率呈明显下降趋势。     

维生素A缺乏影响肠道屏障功能的研究进展

维生素A（vitamin A,VA）在维持肠道黏膜上皮屏障功能的完整性、调节黏膜免疫反应以及抗感染中起到重要的作用。肠道相关树突状细胞（dendritic cells,DCs）可表达合成视黄酸（retinoic acid,RA）所必需的酶（retinal dehydrogenase,RALDH）,合成RA。RA通过诱导T、B细胞产生整合素α4β7、CCR9,使其归巢到肠道,并提高肠道黏膜sIgA的水平。RA可增强天然CD4＋T细胞分化为Foxp3＋Treg细胞,抑制Th17细胞的生成。当机体VA缺乏时可降低肠道屏障功能,下调肠道黏膜免疫反应,增加肠道感染性疾病的易感性,容易导致腹泻。针对维生素A在肠道屏障功能的调节作用作一简要概述。