中国毛茛科翠雀属的分类学研究(六):拟川西翠雀花二新异名

通过标本室和野外观察, 发现根据四川丹巴标本描述的毛茛科光果拟螺距翠雀花(Delphinium bulleyanum Forrest ex Dielsvar. leiogynum W. T. Wang)和根据四川汶川标本描述的汶川翠雀花(D. wenchuanense W. T. Wang)与此前发现分布于四川宝兴、都江堰、汶川一带的拟川西翠雀花(D. pseudotongolense W. T. Wang)没有区别, 故将二者均处理为拟川西翠雀花的异名。     

中国毛茛科翠雀属的分类学研究(十):须弥翠雀花二新异名

标本室和野外观察表明匙苞翠雀花(Delphinium subspathulatum W. T. Wang)和吉隆翠雀花(D. tabatae Tamura)与须弥翠雀花(D. himalayae Munz)属于同一种植物,故将前二者均处理为须弥翠雀花的异名。     

中国毛茛科翠雀属的分类学研究(十四):光序翠雀花二新异名

广布于中国-喜马拉雅地区的毛茛科光序翠雀花（Delphinium kamaonense Huth）在我国甘肃、青海、四川和西藏具有相当连续的分布区,在分布区内颇为常见,几为杂草。通过标本室和野外观察,发现根据西藏波密、察隅标本描述的展毛光序翠雀花[D. kamaonense var. glabrescens（W. T. Wang）W. T. Wang]和根据西藏类乌齐标本描述的倒心形翠雀花（D. obcordatilimbum W. T. Wang）与光序翠雀花没有本质区别,故将二者均处理为光序翠雀花的异名。     

中国毛茛科翠雀属的分类学研究(五):秋翠雀花二新异名

通过标本室和野外观察,发现根据四川西南部越西标本描述的毛茛科凉山翠雀花(Delphinium liangshanense W. T. Wang)和根据四川西南部木里标本描述的光轴翠雀花(D. leiostachyum W. T. Wang)只是此前记载分布于四川木里、盐源和云南西北部宁蒗一带的秋翠雀花(D. autumnale Hand.-Mazz.)植株较高的类型,故将二者均处理为秋翠雀花的异名.     

中国毛茛科翠雀属的分类学研究(十一): 巴唐翠雀花二新异名

毛茛科巴塘翠雀花（Delphinium batangense Finet & Gagnep.）是我国四川西部和云南西北部一种较广布的高山植物,形态变异颇大。标本室和野外观察表明白缘翠雀花（D.chenii W.T.Wang）和雅江翠雀花（D.yajiangense W.T.Wang）在形态上处于该种的变异范围之内,故将二者均处理为巴塘翠雀花的异名。     

中国毛茛科翠雀属的分类学研究(八):短尾翠雀花的名实订正

发现近来根据云南西北部丽江标本描述的毛茛科短尾翠雀花(Delphinium brachyurum W. T. Wang)与此前根据该地标本描述的丽江翠雀花(D. likiangense Franch.)属于同一种植物,故将前者处理为后者的异名。     

中国毛茛科翠雀属的分类学研究(十三):狭序翠雀花的名实订正

发现根据甘肃南部标本描述的毛茛科狭序翠雀花（Delphinium angustipaniculatum W.T.Wang）与此前记载分布于甘肃南部和四川北部的松潘翠雀花（D.sutchuenense Franch.）属于同一种植物,故将前者处理为后者的异名。讨论了松潘翠雀花与其可能的近缘种秦岭翠雀花（D.giraldii Diels）和疏花翠雀花（D.sparsiflorum Maxim.）的形态区别。     

中国毛茛科翠雀属的分类学研究(七):岩瓦翠雀花的名实订正

通过标本室和野外观察,发现根据云南西北部维西标本描述的毛茛科岩瓦翠雀花(Delphinium yanwaense W. T. Wang)与云南西北部颇为常见的中甸翠雀花(D. yuanum Chen)没有本质区别,故将前者处理为后者的异名。中甸翠雀花在叶的分裂程度上变异颇大。     

中国毛茛科翠雀属的分类学研究(十二):竞生翠雀花的名实订正

通过标本室和野外观察,发现根据云南西北部中甸标本描述的毛茛科竞生翠雀花（Delphinium yangii W.T.Wang）与此前记载分布于该地及四川西南部（康定、小金、汶川）的宝兴翠雀花（D.smithianum Hand.-Mazz.）属于同一分类实体,故将前者处理为后者的异名。     

云南翠雀花属二新种

该文描述了自云南西北部发现的毛茛科翠雀花属二新种:短葶翠雀花(Delphinium breviscaposum W.T.Wang)和丝苞翠雀花(D.filibracteolum W.T.Wang)。短葶翠雀花与察隅翠雀花(D.chayuense W.T.Wang)在亲缘关系上相近,前者与后者的区别在于短葶翠雀花植株具3条簇生短花葶,总状花序的轴和花梗无毛,小苞片较长,萼片较小,退化雄蕊的瓣片不分裂;丝苞翠雀花与拟长距翠雀花(D.dolichocentroides W.T.Wang)近缘,前者与后者的区别在于丝苞翠雀花的花组成圆锥花序,花梗、萼片和萼距均较短,退化雄蕊的爪无附属物,心皮无毛。     

橡胶树橡胶生物合成调控相关基因表达丰度比较

蛋白质是构成生命系统的基本元件之一,是大部分生物学功能的执行者。蛋白质丰度与其生物学功能息息相关,其丰度受基因表达过程中各环节严格精密的调控。其中,蛋白质丰度与其相应mRNA丰度存在较强的相关性,蛋白质丰度差异的40%可由mRNA丰度来解释。茉莉酸信号途径调节巴西橡胶树中的天然橡胶生物合成,但相关基因彼此间的表达丰度差异尚待阐明。该文比较了S/2D d3割胶制度下,15个橡胶生物合成调控相关基因COI1、JAZ1、JAZ2、JAZ3、MYC1、MYC2、MYC3、MYC4、MYC5、GAPDH、HMGR1、SRPP、REF、HRT1、HRT2以及2个常用内参基因18S、ACTIN1在10个橡胶树种质胶乳中的表达丰度差异;将ACTIN1的表达丰度设定为1,以此为标准计算出样品中其他基因的表达丰度。结果表明:相同个体中不同基因的转录丰度差异明显,不同个体中相同基因集的丰度大小排序存在一定差异;同一基因在不同个体中的转录丰度差异明显,这16个基因的最大丰度分别是最低丰度的9.43、6.04、10.02、12.29、18.82、9.22、38.46、112.83、121.36、15.34、19.09、13.54、10.05、19.80、24.83、11.82倍,他们的变异系数分别为73.05%、55.19%、69.09%、67.37%、66.59%、53.87%、83.25%、122.02%、166.34%、59.89%、70.59%、75.67%、74.20%、68.34%、84.23%、78.59%;总的来说,在群体水平上,16个基因的转录丰度从高到低依次为18S SRPPHMGR1REFMYC2/HRT1COI1MYC1/MYC4GAPDH/JAZ1/MYC5JAZ2HRT2/MYC3/JAZ3,他们的群体平均丰度依次为ACTIN1的28 382.26、43.64、11.39、7.16、5.47、5.10、1.07、0.75、0.74、0.45、0.42、0.33、0.12、0.06、0.06、0.04倍。值得注意的是,无论在个体水平还是群体水平上,18S的丰度毫无疑问是最大的,在mRNA中,SRPP的丰度最大,JAZ1大于JAZ2和JAZ3,MYC2大于MYC1、MYC3、MYC4、MYC5,HRT1大于HRT2。综上结果表明,结构基因和功能基因的丰度高于调控基因。在基因相对表达分析中,常对目的基因和内参基因作均一化处理,从而掩盖了不同基因间的真实丰度差异,因此,在基因表达分析中,既要关注基因的相对表达量,也要关注基因间的丰度差异,这有助于更全面地理解基因的功能。     

表皮葡萄球菌SarA对atlE、lipA和zinC基因表达调控的研究

表皮葡萄球菌 (Staphylococcus epidermids) 是一种条件致病菌，SarA(Staphylococcal accessory regulator A)是该菌中一个全局性调控因子，它控制着细胞中许多与毒性相关的基因表达. 报道了SarA在转录水平直接调控atlE、lipA和zinC基因的表达. RT-PCR和lacZ报告基因的分析结果显示，在表皮葡萄球菌ATCC35984中，SarA对atlE (自溶酶基因) 表达起负调控作用，而对lipA (脂肪酶基因) 和zinC (膜相关锌金属蛋白酶基因) 的表达则有正调控作用. 生物信息学分析表明，SarA控制atlE，lipA和zinC 3种基因表达可能是通过与被调控基因上游的特定DNA序列的结合来实现的，该DNA结合区保守并富含AT碱基. 根据已报道的金黄色葡萄球菌中SarA的结合位点序列，利用Omiga软件分析并推测了SarA结合atlE，lipA和zinC的可能区域. 基于SarA是一种多功能的毒素相关调控因子，结果提示，SarA能调控众多因子，可以作为防治表皮葡萄球菌感染的一个药物筛选靶点.     

OsIMA1增强水稻对镉逆境的适应性

铁(Fe)是植物生长发育所必需的营养元素而镉(Cd)是对植物有害的元素且对植物Fe和Cd的吸收存在拮抗作用。OsIMA是一类正调控水稻Fe吸收的一类小肽,其过表达可以促进Fe的积累。为探究OsIMA是否参与水稻对Cd胁迫的适应性,该研究以水稻为研究材料,利用荧光定量PCR分析了OsIMA基因的表达水平,通过遗传转化和CRISPR/Cas9基因编辑技术构建了OsIMA1过表达植物和ima1突变体植物,评估了OsIMA1过表达和突变体植物在Cd逆境条件下的株高,并利用电联耦合等离子体质谱法测量了根和地上部的Fe和Cd含量。结果表明:(1)Cd处理后,OsIMA1和OsIMA2的转录水平上调。(2)OsIMA1过表达植物比野生型植物对Cd胁迫更耐受。(3)ima1功能缺失突变体比野生型植物对Cd胁迫更敏感。(4)OsIMA1过表达植株根系的Cd含量较高,而ima1突变体植株地上部的Cd含量较高。综上所述,OsIMA1通过限制Cd从根向地上部的转运以增强水稻对Cd逆境的适应能力,该研究结果为定向培育耐Cd作物提供了理论参考。     

中国算盘子属(叶下珠科)一些种的分类学处理

算盘子属(Glochidion J.R.G.Forst.)是叶下珠科(Phyllanthaceae)叶下珠族(Phyllantheae)中一个分类极为困难的类群。基于广泛野外考察与馆藏标本查阅,对中国该属部分物种进行分类学处理。其中,长柱算盘子[G.khasicum(Müll.Arg.)Hook.f.]与倒卵叶算盘子(G.obovatum SieboldZucc.)在中国的分布予以排除,菲岛算盘子[G.philippicum(Cav.)C.B.Rob.]在中国被发现仅分布于台湾地区;G.bodinieri H.Lév.,G.pseudo-obscurum var.glabrum Pamp.与G.pseudo-obscurum var.lanceolatum Pamp.这三个名称被处理为湖北算盘子(G.wilsonii Hutch.)的新异名;G.vaniotii H.Lév.被排除在算盘子属外,并接受为芸香科臭常春(Orixa japonica Thunb.)的异名。另外,对G.khasicum(Müll.Arg.)Hook.f.,G.obovatum SieboldZucc.,G.philippicum(Cav.)C.B.Rob.,G.pseudo-obscurum var.lanceolatum Pamp.及G.wilsonii Hutch.这五个名称进行了后选模式的指定。     

中国异极衣科地衣二新记录种

该文综合运用形态学、解剖学和化学等方法对山东大型地衣进行分类研究,发现了两个中国新记录种,即德氏蜂窝衣(Heppia despreauxii)和多孢小极衣(Lichinella myriospora)。德氏蜂窝衣隶属于蜂窝衣属(Heppia),生于光线充足且裸露的土壤上,主要识别特征为下皮层缺失、子实层IKI+蓝色;多孢小极衣隶属于小极衣属(Lichinella),生于干燥的钙质岩石上,主要识别特征为其子实层IKI+酒红色变为蓝色。该文对这两个中国新记录种进行了详细描述,与近似物种进行了对比讨论,并且提供了其地衣体、子囊盘及其解剖特征图片。同时,该文还补充报道了白棋盘蜂窝衣(Heppia solorinoides)的有性繁殖结构特征和数据。蜂窝衣属和小极衣属均为山东新记录属。以上研究结果为中国异极衣科(Lichinaceae)地衣研究提供基础资料。     

中国星文衣属地衣型真菌的分类研究

星文衣属(Sarcographa)隶属于真菌界(Fungi)、子囊菌门(Ascomycota)、茶渍纲(Lecanoromycetes)、厚顶盘目(Ostropales)、文字衣科(Graphidaceae),该属地衣体为壳状,子囊盘为放射分支状,多具子座,子囊含8孢子,子囊孢子褐色,横隔透镜型或亚砖壁型,主要分布于热带亚热带地区。该文通过形态学、解剖学、化学与分子生物学等方法进行该属分类学研究,共报道了中国该属9种,其中变黄星文衣[Sarcographa flavescens(Dal-Forno & Eliasaro)L. W. Chen & Z. F. Jia]为新组合(≡ Phaeographis flavescens Dal-Forno & Eliasaro); 曲线星文衣[Sarcographa labyrinthica (Ach.)Müll. Arg. ]为中国大陆新记录种。同时,该文对近似属拟星文衣属(Sarcographina)的1物种——异孢拟星文衣[Sarcographina heterospora(Nyl.)Z. F. Jia & Lücking]进行了描述,并提供了10个物种的特征提要及与其近似种的区别特征,并编制了分种检索表。该研究为中国地衣型真菌生物多样性研究提供了基础资料。     

甜荞FeFUL2基因的克隆与表达分析

为了探索甜荞FUL同源基因参与花与籽粒发育调控的分子机制,该文采用同源克隆的方法从甜荞(Fagopyrum esculentum)长花柱和长雄蕊突变体(lpls)中克隆到1个长837 bp的FeFUL2基因(GenBank登录号为MG779493.1),其包含长690 bp的完整开放阅读框,编码1个由229个氨基酸残基组成的MADS-box转录因子。通过对FeFUL2进行分子系统发生、同源蛋白比对与转录因子结构分析,结果显示FeFUL2与核心真双子叶植物AP1/FUL亚家族转录因子中的euFUL进化系聚于1个进化分支,属甜荞euFUL型MADS-box转录因子,且包含1个57个氨基酸残基长的高度保守的MADS结构域、1个69个氨基酸残基长的次级保守的K结构域,其C末端转录激活区在序列长度和氨基酸残基组成上与其他euFUL型转录因子差异较大,但仍含有2个euFUL型转录因子特有的保守基元:FUL motif和paleo AP1 motif。用qPCR检测基因表达的组织特异性显示:FeFUL2基因在甜荞lpls突变体的根、茎、叶、花被片、雄蕊、雌蕊和发育4 d的幼果中均有表达,但其在花被片中表达量极显著高于该基因在其他器官中的表达量(LSD,P0.01)。综合转录因子的结构与基因的表达模式推测,FeFUL2基因与其他euFUL型基因的功能可能存在一定差异,其在花发育过程中可能主要参与甜荞花被片的发育调控。     

中国西藏兰科植物新资料

中国西藏东南地区位于东喜马拉雅和印缅的交接处,是全球生物多样性的热点地区,尤其是位于该地区的墨脱,由于巨大的海拔高差,使该地区的植被类型呈显著的垂直地带性,且植物种类繁多、植被结构复杂。该文报道了西藏野生兰科植物新记录属3个,即线柱兰属(Zeuxine)、爬兰属(Herpysma)和槽舌兰属(Holcoglossum);新记录种27个,即白肋线柱兰(Zeuxine goodyeroides)、爬兰(Herpysma longicaulis)、小花槽舌兰(Holcoglossum himalaicum)、西南齿唇兰(Anoectochilus elwesii)、窄唇蜘蛛兰(Arachnis labrosa)、短足石豆兰(Bulbophyllum stenobulbon)、尖角卷瓣兰(B. forrestii)、南方虾脊兰(Calanthe lyroglossa)、泰国牛角兰(Ceratostylis siamensis)、金唇兰(Chrysoglossum ornatum)、格力贝母兰(Coelogyne griffithii)、云南贝母兰(C. assamica)、斑舌兰(Cymbidium tigrinum)、梳唇石斛(Dendrobium strongylanthum)、狭叶金石斛((D. angustifolium)、厚唇兰(D. mariae)、粗茎苹兰(Pinalia amica)、垂叶斑叶兰(Goodyera pendula)、绿花斑叶兰(G. viridiflora)、狭叶羊耳蒜(Liparis perpusilla)、小花羊耳蒜(L. platyrachis)、三裂羊耳蒜(L. mannii)、镰叶鸢尾兰(Oberonia falcata)、阔瓣鸢尾兰(O. latipetala)、凹唇石仙桃(Pholidota convallariae)、大苞兰(Sunipia scariosa)、滇南矮柱兰(Thelasis khasiana)。这些植物新资料的发现,对于丰富西藏植物种类以及对该地区物种多样性的保护和研究具有重要意义。     

云南东南部楼梯草属二新种

描述了从云南东南部发现的荨麻科楼梯草属二新种,其中黄连山楼梯草隶属于骤尖楼梯草组骤尖楼梯草系,腺点楼梯草隶属于骤尖楼梯草组盘托楼梯草系。     

Essential amino acids of starch synthase IIa differentiate amylopectin structure and starch quality between <Emphasis Type="Italic">japonica</Emphasis> and <Emphasis Type="Italic">indica</Emphasis> rice varieties

Four amino acids were variable between the ‘active’ indica-type and ‘inactive’ japonica-type soluble starch synthase IIa (SSIIa) of rice plants; Glu-88 and Gly-604 in SSIIa of indica-cultivars IR36 and Kasalath were replaced by Asp-88 and Ser-604, respectively, in both japonica cultivars Nipponbare and Kinmaze SSIIa, whereas Val-737 and Leu-781 in indica SSIIa were replaced by Met-737 in cv. Nipponbare and Phe-781 in cv. Kinmaze SSIIa, respectively. The SSIIa gene fragments shuffling experiments revealed that Val-737 and Leu-781 are essential not only for the optimal SSIIa activity, but also for the capacity to synthesize indica-type amylopectin. Surprisingly, however, a combination of Phe-781 and Gly-604 could restore about 44% of the SSIIa activity provided that Val-737 was conserved. The introduction of the ‘active’ indica-type SSIIa gene enabled the japonica-type cv. Kinmaze to synthesize indica-type amylopectin. The starch in the transformed japonica rice plants exhibited gelatinization-resistant properties that are characteristic of indica-rice starch. Transformed lines expressing different levels of the IR36 SSIIa protein produced a variety of starches with amylopectin chain-length distribution patterns that correlated well with their onset temperatures of gelatinization. The present study confirmed that the SSIIa activity determines the type of amylopectin structure of rice starch to be either the typical indica-type or japonica-type, by playing a specific role in the synthesis of the long B₁ chains by elongating short A and B₁ chains, notwithstanding the presence of functional two additional SSII genes, a single SSI gene, two SSIII genes, and two SSIV genes in rice plants.