生物信息数据库知识产权保护初探

生物信息技术是当今生命科学乃至整个自然科学的重大前沿领域之一,生物信息数据库是生物信息技术中非常重要的部分,对生命科学的发展起着重要的推动作用。本文叙述了生物信息数据库的特点及国内外知识产权保护现状,初步讨论了生物信息数据库知识产权保护中存在的问题,提出了保护我国生物信息数据库的建议。     

曙光公司推出国内首例生物专用计算机

日前 ,曙光信息产业 (北京 )有限公司与华大基因联合推出国内首例生物信息专用计算机 ,凭借极具竞争力的数据计算速度和软硬件整体化的优势领先于业界。生物信息专用计算机系统基于今年三月份推出的曙光 4 0 0 0L高性能计算机硬件平台 ,并集成了生物信息研究所需的数据库和应用软件 ,该产品将应用于我国的生物信息研究领域 ,主要针对生物、医药、农业等领域 ,进行快捷的基因组测序查找、药物研发等。生物信息专用计算机的推出将为基因组学、生物信息学研究提供一套完善的整体解决方案 ,全面帮助用户完成从数据传输、存储、管理到注释、分析…     

征稿启事

《生物信息学》期刊主要刊载生物信息及相关领域的研究进展、综述、研究论文、研究简报、技术与方法、专题评论等学术文章。 1.征稿范围：生物信息各分支领域及相关领域。包括基因组学、蛋白质组学、糖原组学、高通量药物筛选、组合化学、统计遗传学、生物数据挖掘、生物数据库、生物软件等。     

征稿启事

《生物信息学》期刊主要刊载生物信息及相关领域的研究进展、综述、研究论文、研究简报、技术与方法、专题评论等学术文章。1.征稿范围:生物信息各分支领域及相关领域。包括基因组学、蛋白质组学、糖原组学、高通量药物筛选、组合化学、统计遗传学、生物数据挖掘、生物数据库、生物软件等。     

征稿启事

<正>《生物信息学》期刊主要刊载生物信息及相关领域的研究进展、综述、研究论文、研究简报、技术与方法、专题评论等学术文章。1.征稿范围:生物信息各分支领域及相关领域。包括基因组学、蛋白质组学、糖原组学、高通量药物筛选、组合化学、统计遗传学、生物数据挖掘、生物数据库、生物软件等。2.征稿体例:研究论文、研究简报、综述进展、学科前沿、论坛、技术与方法、研究快讯(Letter)、评论、动态、产业报道、知识产权、新书推介、展会报道等。     

生物样本库是生物医学研究的重要基础

在生物医学研究飞速发展的今天,随着对健康和疾病认识的不断深入,传统的单病因、单基因研究模式已难以胜任复杂疾病的研究.医学科学的发展需要一种能提供疾病相关的、具有普遍意义的、全局式的分子信息数据库.生物样本库在其中所能发挥的关键作用得到了越来越多的重视.它从最初的小作坊模式经过100多年,尤其是近30年的快速发展已经演化成为科研院所和政府支持的生物样本库、商业化生物样本库及以人口为基础的生物银行等多种模式.伴随存储样本数据信息的复杂度不断快速增加,生物样本库除了收集样本相关的基本数据和诊断信息外,还延伸到配套信息,包括参加人和病人的多种表型,到目前已经迅速扩展到基因组学、蛋白质组学及其他的组学信息.如何科学地建设和管理这种大型复杂模式的生物样本库成为医学科学领域亟待规范、解决的问题.本文将从生物样本库的发展入手重点讨论其建设、管理和应用.     

中国科学院生物多样性委员会介绍

中国科学院生物多样性委员会是一个学术管理机构,其前身是生物多样性工作组。自1990年开展工作到现在,在组织管理、学术研究、国际交流及信息传播与人才培训方面做了大量的工作。在生物多样性保护与研究领域编译、编写并出版了一系列很有价值的书籍,对国内、国际均有深远影响。 生物多样性委员会在中国科学院院领导的大力支持下,积极地与国内外有关机构交流信息、建立联系、开展长期合作,共同保护地球的生物多样性,为人类创造美好的明天。     

生物多样性信息学:一个正在兴起的新方向及其关键技术

生物多样性科学和生物信息学是生命科学中两个极为重要也是十分活跃的交叉学科,生物多样性信息学则是目前正在兴起的一个新方向,基发展必将进一步深化信息技术在生物多样性研究中的应用。本文简要介绍了国内外该领域的主要目标与进展,讨论了有关的关键技术（如数据库间的互操作与数字图书馆）,并列出了两个原型系统（Ｓｐｅｃｉｅｓ２０００和ＧＢＩＦ）和其他相关系统的网址。     

从文献计量角度分析中国生物多样性研究现状

以汤森路透科技集团的WEB OF KNOWLEDGE信息平台提供的Science Citation Index Expanded数据库为数据源,检索到从1997年至2009年期间国际生物多样性研究论文文献219773篇,其中11182篇来自于中国学者。利用NoteExpress软件,对这13a间生物多样性研究论文发表的国家分布、年度分布、研究机构、引用情况、期刊分布和学科分类等做的分析与比较表明:1)全球生物多样性研究的论文数量一直呈增长趋势,中国13年间每年发文量占当年全球生物多样性论文总量的百分率逐年增加;2)从论文总被引频次、篇均引用次数和h-index三项论文影响力特征参数分析,中国与国际其他国家相比有一定差距;3)从学科分类来看,与国际相比,中国在生物多样性保护领域、进化生物学和海洋与淡水生物学领域研究略显不足,昆虫学和真菌学研究领域活跃。     

科研技术的飞速发展

目前,华大拥有近千名具有不同专业背景的生物信息领域专业人才和强大的数据处理、分析存储能力。开发出了一系列具有国际影响力的软件、数据库和服务平台,培养了大量的生物信息以及相关实验技术专业人才。在基因组研究的各个层面都具有强大的科研能力和丰富的科研经验,建立了一整套针对第二     

《生物信息学》征稿

1.征稿范围:生物信息各分支领域及相关领域。包括基因组学、蛋白质组学、糖原组学、高通量药物筛选、组合化学、统计遗传学、生物数据挖掘、生物数据库、生物软件等。2.征稿体例:研究论文、研究简报、综述进展、学科前沿、论坛、技术与方法、研究快讯(Letter)、评论、动态、产业报道、知识产权、新书推介、展会报道等。     

生物信息处理中心的建立

本文提出了一套生物信息处理中心的建立方案,具有实用、建设成本低廉、构建方便、全面共享和可扩展性强等特点。生物信息处理中心以数据库相似性搜索、数据库资源检索和生物序列分析为主线,建立了软硬件环境和应用程序及数据库,能够满足绝大多数科研人员的生物信息学分析需求。     

转基因生物相关平台的构建

在转基因生物全球化形势下,我国十分重视转基因生物安全管理及转基因生物安全性风险交流。通过建设转基因生物相关平台,可以加强我国转基因生物安全评价、转基因生物检测、风险交流及信息的整理和共享,拓宽我国转基因生物安全管理服务和信息交流渠道。平台主要由五部分组成,即:转基因生物安全性评价数据库、转基因生物安全检测方法数据库、转基因生物安全管理政策法规数据库、转基因生物检测服务子平台、公众风险交流子平台。平台的访问界面友好、美观、实用,能方便快捷地为用户提供信息查询和浏览等服务。平台可于此地址浏览:http://www.shgmo.org/。     

四川省生物多样性基础数据库信息系统

生物多样性本底信息是开展生物多样性评价的基础,现有的生物多样性数据分布比较分散,不同的数据掌握在不同的部门,没有得到很好整合。同时,由于缺乏物种分布的空间信息,生物多样性数据很难满足环境影响评价中生物多样性评价的需求,生物多样性评价一般只限于简单的定性分析。为了促使生物多样性评价工作能更深入的开展,切实有效地保护生物多样性资源,以四川省(重点以甘孜州)为研究案例,整合了现有的生物多样性数据资源,主要包括四川省自然保护区生物多样性数据、甘孜州水生和陆生生物多样性数据、四川省环境敏感区数据以及生物多样性现场调查数据等,建立了四川省生物多样性基础数据库,同时通过数据库开发和网络开发,建立了数据库信息系统,实现了生物多样性空间数据库和属性数据库的查询检索、数据显示等功能。     

基于专利信息可视化的生物反应器发展态势分析

德温特创新索引专利数据库收录的制药领域生物反应器相关专利为数据源,对所采集的数据进行时间、地域、研究活跃度、研究领域分析,同时借助信息可视化软件CiteSpace III,以德温特创新索引专利数据库手工代码进行共现分析,绘制知识谱图,对技术合作关系、技术热点领域、技术前沿进行探测,以期为企业了解掌握生物反应器技术发展态势提供必要的情报支持,辅助高校、企业制定技术发展战略、调整技术发展路线、完善技术发展布局,在激烈的市场竞争环境下保持较高的技术竞争优势。     

Fact Sheet Fusion:生物多样性自动化建库工具

随着全球对生物多样性保护和持续利用的重视,在现代信息技术支撑下,生物多样性数据库和信息系统不断趋向多媒体、超链接和分布式等特点.Fact Stleet Fusion (FSF)是一款顺应该发展趋势的生物多样性自动化建库工具,生物分类专家无须设计编辑数据库和网页,就可快速设计与创建规范标准、风格统一、维护简便的生物信息系统.文章介绍它的建库框架和功能特色,并以膜翅目茧蜂科滑茧蜂属Homolobus昆虫为例简要说明如何应用FSF建立昆虫多样性信息系统.     

生物能源领域国际相关专利分析

随着石油资源的日益枯竭,近年来生物能源技术的开发引起了全球各界的广泛重视,加之专利保护意识的增强,生物能源领域的专利数量迅速增长,对专利信息的分析可以了解生物能源技术的发展现状和趋势,为技术创新和战略发展提供参考。本文选取目前生物能源中的三种重要技术――生物乙醇、生物柴油和生物制氢技术,利用专利计量分析的方法对其发展态势进行了研究。研究内容包括：专利申请的时间分布和空间分布,被引专利情况,主要技术领域,以及重要专利权人及其相关信息,从专利分析的角度揭示近年来这三种生物能源技术的研发状况。     

法国农业领域转基因生物研究的有关情况

法国农业领域转基因生物研究的有关情况近年来,生物转基因技术已成为生物领域中一项革命性的技术,其将极大地影响农业、医学、生态以及相关领域的发展。因此世界各发达国家都十分重视这方面的研究。本文就法国农业领域中的转基因生物研究介绍一些情况,供国内有关部门参...     

生物复杂性研究动态

生物复杂性（biocomplexity或biological complexity）是近年来由Rita Colwell等人积极倡导的一个新的学科领域,旨在更好地了解生命系统及其环境组分间的相互作用以及系统复杂性的动态特征与演化机制,目前,生物复杂性的定义与内涵尚不明确,意见纷呈,而有关研究在美国国家科学基金会（NSF）的支持下已迅速开展起来,并即将成为国际合作研究的热点之一。本文简要介绍了有关生物复杂性的不同观点、生物复杂性与生物多样性研究之间的关系,并以若干生态系统和基因组为例,说明了现阶段生物复杂性研究的主要特点。     

基于基因本体论的生物信息个人数据库平台

论述了一个基于基因本体论(geneontology)的生物信息个人数据库平台BIO.该数据库平台根据自身研究的需要,用基因本体论中的相关的规范术语来对基因序列信息进行注释,从而可以让用户从基因本体论的角度对生物信息序列进行查询.由于因特网上生物数据库中大量的关于基因序列信息的术语不统一、不规范,存在大量的信息冗余,用此方式可最大限度地精确所要查找的结果.文中详细论述了该数据库平台的研究背景、查询功能以及维护.