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相似文献
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1.
从死亡大熊猫的肝脏中直接提取细胞总RNA,经反转录后,用犬瘟热病毒的两对引物,分两段扩增出融合蛋白基因3′端的片段。经序列分析表明:此片段的长度为693bp;此毒株在核苷酸和氨基酸水平与某疫苗弱毒株、Onderstepoort弱毒株、海豹瘟热病毒2型毒株和海豹瘟热病毒1型的同源性分别为97.5%和96.2%、88.6%和94.5%、92.9%和95.6%、63.2%和76.5%;大熊猫毒株与其它毒株融合蛋白3′端疏水性和二级结构均有一定差异;其非编码区比国外报道的Onderstepoort弱毒株多9个碱基,在非编码区最后58个碱基,两毒株仅有17个相同。至于这种差异的生物学意义尚待进一步的研究  相似文献   

2.
以来自哈尔滨传染性法氏囊病病毒(IBDV) 强毒株(Harbin 毒株,H) 的基因组RNA为模板,用反转录聚合酶链反应(RT- PCR) 的方法得到了其A 节段的全长cDNA 片段,分5'端(1 659bp) 和3'端(1 444bp) 上下两段分别克隆到pGEMB○R - T 载体上,测定了其核苷酸顺序,在长为3 101 bp 中含有两个阅读框ORFA1 和ORFA2 ,分别编码1 012 个氨基酸的前体蛋白(VP2 - 4 -3) 和145 个氨基酸的VP5,ORFA1 和ORFA2 有部分的重叠。将核苷酸序列及推测出的氨基酸序列与已报道的IBDV 血清Ⅰ型和Ⅱ型毒株的相应序列进行了比较,结果表明:H 毒株与其它血清Ⅰ型毒株之间,在核苷酸水平上存在25bp - 267bp 的差异;在氨基酸水平上存在17 ~40 个氨基酸的差异。在VP2 - 4 - 3 内比较显示,H 毒株与P2 、Cu- 1 之间氨基酸的差异最小为1 .7% ,H 毒株与UK661 之间氨基酸的差异最大为3 .9 % 。变异主要发生在VP2 的可变区(206 - 350 位氨基酸) ,在H 毒株所特有的12 个氨基酸当中,该区就占5 个,代表1 .76 % 的变异。VP4、VP3 和VP5区各有  相似文献   

3.
草鱼出血病病毒多肽的基因定位   总被引:15,自引:3,他引:12  
用聚丙烯酰胺凝胶电泳分离纯化的草鱼出血病病毒GCHV873的基因组ds-RNA的11个片段,分别在麦胚无细胞翻译体系中进行翻译。其翻译产物经SDS-PAGE系统分析。结果表明,基因组片段1、2、3、4、5、和10分别编码病毒核心衣壳的结构多肽VP1、VP2、VP3、VP4、VP5和VP10,片段6和7分别编码病毒外层衣壳的结构多肽VP6和VP7。片段8和9分别编码52kD和41kD的多肽,片段11编码两种多肽,分子量分别为29kD和19.5kD,它们与病毒结构多肽无明显对应关系。病毒基因组与多肽大体是一一对应的关系。  相似文献   

4.
广西壮族自治区HIV-1流行毒株的基因序列测定和亚型分析   总被引:12,自引:0,他引:12  
使用PCR技术对14份广西HIV-1阳性感染者外周血单核细胞(PBMCs)样品进行扩增,获得HIV-1膜蛋白(env)基因的核酸片段,并对其C2-V3及邻区350-450个核苷酸序列进行了测定和分析。结果表明,14份样品中9份为泰国B(B′)亚型,5份为E亚型毒株。其中B′亚型毒株的基因离散率为4.2%,与A-E参考亚型及部分B亚型代表株序列相比较,与包括泰国、缅甸及云南德宏在内的B亚型毒株序列十分接近,相互之间基因离散率在3.0%-4.4%的范围内;而E亚型毒株的基因离散率为2.1%,与国际E亚型毒株的基因离散率最近,为5.6%,与其它国际参考亚型基因离散率很远,在21.1%-27.3%。根据以上数据及其它资料提示,广西存在B′和E两种亚型的HIV-1的流行,且其B′亚型毒株的传入,与流行在云南德宏州的相同亚型HIV-1毒株密切相关,而E亚型毒株则可能是由泰国经越南传入广西的  相似文献   

5.
参考已发表的猪瘟病毒序列,设计并合成了一对引物,应用RTPCR 技术,扩增了猪瘟兔化弱毒(Hog cholera virus lapinized Chinese strain , HCLV) 和石门强毒株的E0 糖蛋白基因,并将其克隆到pGEMT 载体中,测定了其核苷酸序列,并推导了其氨基酸序列。结果表明我国这两株强弱不同毒株E0 糖蛋白核苷酸序列同源性和推导的氨基酸序列同源性分别为95-0 % 和94-3 % ,有13 个氨基酸的差异,HCLV 比石门株多了一个潜在的N糖基化位点。将我国这两株病毒与国外已报导的HCV 毒株E0 基因序列进行了比较,发现石门株与日本的两株毒株ALD 和GPE- 同源性较高,核苷酸序列同源性分别为97-4 % 和96-5 % ,氨基酸同源性分别为97-4 % 和96-0 % ,而与欧洲Brescia 株和Alfort 株同源性较低,核苷酸同源性分别为92-2 % 和86-5 % ,氨基酸同源性为95-2 % 和92-5 % , HCLV 与ALD、GPE- 、Brescia、Alfort 株核苷酸同源性分别为95-6 % 、94-9 % 、91-3 % 、85-5 % …  相似文献   

6.
传染性法氏囊病病毒CJ-801bkf毒株VP2 cDNA基因结构的分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
以传染性法氏囊病病毒(IBDN)中国毒株CJ-801bkf的基因组A片段dsRMA为模板,经反向转录和PCR扩增,克隆了保护性抗原VP2cDNA基因。经Sanger法测序,确定了VP2cDNA基因有1484个核苷酸,推测了VP2氨基酸的顺序,与已报导的6株IBDV毒株CuI、PBG98、52/70、002-73、STC和VariantE的VP2区做了比较,证明:克隆的CJ-801bkfVP2cDNA基因是全长的,含有正确的起始密码子ATG;CJ-801bkf与毒株Cul和pBG98同源性最高;CJ-801bkfVP2高可变区内两个亲水区的氨基酸顺序与CuI、PBG98、52/70、002-73和STC完全相同;7肽区内第三个丝氨酸残基则变异为精氨酸。这些结果提示,中国CJ-801bkf毒株应属标准血清I型IBDV弱毒株。  相似文献   

7.
大熊猫基因指纹探针F2ZGP96060801的研制及比较实验分析   总被引:5,自引:1,他引:4  
方盛国  冯文和 《兽类学报》1997,17(3):165-171
利用ABI-394型DNA合成仪合成的寡核苷酸5-「A(X)n-xTCCAC」n-3,经高效液相色谱仪纯化后,制备成了命名为为F2ZGP96060801的大熊猫基因指纹探针,用同位素标记法标记F2ZGP96060801,LZF-I、朋5、33.6和(CAC)6/GTG)5等5种基因指纹探针,比较检测了大熊猫随机个体的被毛、大熊猫3雄配I雌所产1个双胞胎计6只个体的福尔马林固定的肝组织和粪便中的胃肠  相似文献   

8.
宁晓檬  赵晓岩 《病毒学报》1996,12(4):355-359
提取感染鸡胚成纤维细胞MDV-I弱毒株814病毒DNA为模板,根据RBIB株gB基因5′及3′两端核苷酸离列设计引物,利用PCR技术扩增了我国MDV-I弱毒株814gB基因(2.9kb)将扩增片段平末端克隆到载体pBluescriptSK中EcoRV位点,经BamHI,HindIII酶切鉴定得到不同插入方向的重组质粒。构建圹增片段的酶切图谱及部分序列分析证明与RBIB株gB基因无差异,显示了极高的  相似文献   

9.
Beagle乳狗(5-10日龄)肾块用热消化法制成细胞批放液氮保存,检定合格后做下列试验:(1)复苏培养长满单层后更换维持液,其细胞能维持4天以上,克服了常规消化培养细胞维持时间短(36小时)的缺陷。(2)传代14-2株病毒时,1代病毒的滴度即达6.04-6.24LogPFU/ml,1代后的各代(至11代)病毒滴度无明显提高。(3)该细胞接种14-2株病毒时不产生明显的破坏性病变(CPE),在收毒前采取冻溶1次比冻溶前的病毒滴度提高0.27-0.5LogPFU/ml。以BDK细胞传1代的14-2株病毒作生产毒种,收毒前冻溶1次等工艺法制备五批疫苗,全面检定结果均符合《乙脑活疫苗规程》的质量标准。其中病毒滴度为6.09-6.24LogPFU/ml;免疫效价(ID50=ml)为1.9-4.0×10-5,与相同滴度的原毒株14-2PHK苗对照无明显差异(t=0.968P>0.05),表明其免疫原性与原毒株相似。  相似文献   

10.
冶勒自然保护区大熊猫和小熊猫种群能流分析   总被引:5,自引:0,他引:5  
在冕宁县冶勒自然保护区设站,从各水平对同域分布、以同种竹子为食的大熊猫和小熊猫种群能流进行了研究。结果表明:通过大熊猫种群的能流(1.86*10^6kJ/km^2.yr.)多于小熊猫种群(6.34*10^5kJ/km^2.yr.),前者大约是后者的2.9倍,说明大熊猫在群落中可能处于优势地位。虽然两种熊猫可利用食物资源占地面生物量的比例很大(大、小熊猫分别为12.79%和3.92%),但是其每年摄  相似文献   

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