丙酮醛诱导细胞凋亡相关基因SHMT2L的生物信息学分析

基因芯片是一种高通量地同时研究多个基因表达的有力工具.在用基因芯片技术检测丙酮醛诱导人牙周膜成纤维细胞凋亡的基因表达研究中.发现一个新基因SHMT2L,其表达为显著下调,并推测该基因与细胞凋亡密切相关.利用生物信息学方法对SHMT2L基因及其蛋白产物进行各种分析,结果发现SHMT2L基因与线粒体丝氨酸羟甲基转移酶具有较高的相似性.SHMT2L在细胞中低表达与丙酮醛造成DNA损伤所引发的细胞凋亡相关.     

丙酮醛抗肿瘤机制的研究进展

丙酮醛作为正常的生理代谢产物,可来源于多条代谢通路,最主要的来源是糖酵解途径,丙酮醛分解主要是在乙二醛酶系统的作用下最终转化为D-乳酸。丙酮醛具有高度的活性和细胞毒性,它在多种类型的肿瘤组织中含量较低。丙酮醛能够抑制恶性肿瘤细胞的增殖、诱导其凋亡、抑制肿瘤的转移,并能通过增强机体的免疫力以及提高对现有抗肿瘤药物的敏感性等作用更进一步地发挥抗肿瘤效应。深入研究其抗肿瘤机制能够为临床试验提供依据、使其成为有潜力的新型抗肿瘤药,该文就丙酮醛可能的作用机制予以综述。     

人源COX7A2L基因型的鉴定及其对线粒体功能与超级复合体组装的影响

COX7A2L是一个线粒体呼吸链复合体IVCOX7A2亚基的类似蛋白。已知COX7A2L蛋白能够影响小鼠线粒体的功能,然而,关于该蛋白在哺乳动物细胞中功能亚型的分布及其如何影响线粒体的功能仍不清楚。为了明确COX7A2L蛋白在人源细胞中的表达类型及功能,该文初步分析了COX7A2L在人体细胞中亚型的表达情况及其对线粒体功能和超级复合体组装的影响。该文利用细胞生物学及分子生物学技术,发现COX7A2L在人体细胞中以单一亚型的形式表达并定位于线粒体内膜。研究者对96个中国人COX7A2L基因的测序分析后发现,COX7A2L基因的外显子上不存在任何多态性位点,提示COX7A2L基因序列以及功能在人群中高度保守。通过线粒体功能实验分析我们发现,COX7A2L基因敲除导致细胞线粒体呼吸功能减弱,ATP含量减少。随后的研究发现,人源COX7A2L同小鼠长亚型COX7A2L基因一样能够抑制超级复合体III+IV的组装,但是与小鼠COX7A2L长亚型不同的是,人源COX7A2L的基因敲除能够降低但不能完全去除超级复合体I+III+IV的含量,并且超级复合体III+IV的组装受到的影响远大于超级复合体I+III+IV。这提示,超级复合体I+III+IV的组装不完全依赖于COX7A2L蛋白的表达。综上所述,人源COX7A2L基因虽然对线粒体功能的影响类似于小鼠的长亚型COX7A2L,但是人源COX7A2L基因更保守,并且其对呼吸链超级复合体的影响不同于对应的鼠源基因。     

动物细胞凋亡相关基因在植物中的同源笥研究进展

细胞凋亡是由基因调节的主动过程。对动物细胞凋亡相关基因在植物中的同源性的研究发现,dad—1基因的结构和功能在动物和植物中均具有保守性。动物中的其他细胞凋亡相关基因,如ras、myc、Rb、p53、bcl-2 等基因,在植物中均有其同源序列,有的在植物中找到了功能相似的基因。细胞凋亡的调控机制在生物进化过程中,不但具有一定程度的保守性,而且在调控机制上具有多样性。     

抗凋亡基因与消化系统恶性肿瘤的研究进展

细胞凋亡是机体在基因调控下主动清除多余细胞或缺陷细胞的正常生理现象,又称基因调控下细胞的程序性死亡。细胞凋亡异常在肿瘤发生发展过程中有重要的病理生理意义。自从凋亡理论提出以来,对肿瘤的发生发展有了新的认识。目前,肿瘤发病的观念已经从细胞生长过渡扩展到细胞凋亡障碍,已经发现了许多与细胞凋亡有关的蛋白和基因,其中抑制细胞凋亡的基因和蛋白与肿瘤的发生发展有着密切的关系,现就其与消化系统恶性肿瘤的关系研究新进展作一综述。1抗凋亡基因BAG-1与肿瘤1·1 BAG-1基因结构及其蛋白的功能BAG-1基因是Takayama等[1]于1995年…     

抑瘤基因NGX6对人结肠癌细胞凋亡的影响

NGX6基因是中南大学肿瘤研究所分子遗传室在对鼻咽癌研究中筛选克隆出的一个新基因．以稳定转染并表达NGX6基因的HT-29细胞为实验组,转染空白质粒的HT－29细胞以及HT－29细胞为对照组,利用PI／Annexin—V双染流式细胞仪检测结肠癌细胞的凋亡情况,通过EMSA分析体外培养的结肠癌细胞及种植瘤细胞内核转录因子－κB（NF－κB）的激活情况．研究结果表明：在裸鼠结肠癌种植瘤中,转染了NGX6基因的与未转染及空白载体组比较,结肠癌细胞凋亡率明显增高;EMSA（electrophoretic mobility shif tassay）分析体外培养的结肠癌细胞及种植瘤细胞内核转录因子－κB（NF—κB）的激活情况,发现转染了NGX6基因的细胞NF—κB的激活均明显受到抑制．此研究说明,NGX6基因只有诱导结肠癌细胞凋亡的能力,其可能的机制是抑制了结肠癌细胞NF—κB的激活．     

蓖麻蚕线粒体基因组细胞色素氧化酶亚基Ⅲ的序列及其分子进化分析

测定了蓖麻蚕Samia cynthia ricini线粒体基因组(mtDNA)含完整的细胞色素氧化酶亚基Ⅲ(COX3)、tRNA-Gly和部分的NADH亚基Ⅲ(ND3)基因的DNA片段序列。COX3基因编码框包含789个核苷酸,编码262个氨基酸的蛋白质。通过同源性比较,发现COX3基因的3′端比5′端要保守,其编码的蛋白在C端有两个保守序列存在。COX3的下游为66 bp的tRNA-Gly基因。蓖麻蚕的COX3与家蚕COX3同源性最高,核苷酸和氨基酸序列同源性分别是80.2%和85.6%。根据COX3氨基酸序列进行了12种无脊椎动物的分子进化树分析,认为在采用线粒体基因序列进行分子进化分析时,应该综合考虑物种的繁殖模式及生态特点。     

NF-κB信号转导途径与肿瘤抗凋亡关系的研究进展

细胞核因子κB(NF—κB)家族及其介导的细胞信号转导通路广泛调控着人类免疫和炎症反应中一系列基因的表达,同时也发现它对肿瘤的发生发展有着重要作用,特别是它可以调控一些细胞凋亡相关基因如TRAF家族、IAPs家族、Bcl-2家族及FLIP基因、p53基因、COX-2基因的转录表达,从而大大提高肿瘤细胞的抗凋亡能力。本文就近年来对NF—κB通路与肿瘤抗凋亡关系的研究进展作一综述。     

G-CSF受体胞内区结合蛋白COXⅡ的分子克隆及相互作用验证

为寻找与G-CSF受体胞内区相互作用的蛋白．探讨其可能的信号传导机制,应用酵母双杂交技术从小鼠胎肝文库中筛选到与G-CSF受体胞内区相互作用的蛋白—细胞色素C氧化酶Ⅱ亚基(COXⅡ);采用PCR技术从小鼠肌肉cDNA中克隆到全长COXⅡ,并应用哺乳动物细胞双杂交实验验证了COXⅡ与G-CSF受体胞内区相互作用。构建了一系列G-CSF受体胞内区短截体．应用细胞双杂交技术确定COXⅡ主要结合于G-CSF受体的Box3区：随后构建了COX Ⅱ-GFP融合表达载体,观察到COXⅡ在COS7细胞中为全细胞分布．这些结果为揭示COX Ⅱ的新功能及发现G-CSFR新的信号传递通路提供了线索。     

凋亡调控基因BCL2家族研究的新进展

凋亡的调控是细胞生理死亡和肿瘤发生的重要机制. 对各种刺激诱导下细胞凋亡机制的分析有助于深入了解肿瘤细胞生物学及发现新的治疗对策.凋亡调控基因BCL2家族成员可分为凋亡阻遏基因和凋亡促进基因.这些基因编码的蛋白质分子通过组成和/或影响同二聚体与异二聚体的不同比例而介导其对细胞存活的生物学效应.