羊蹄甲嘱的系统与生理地理学：1.厚盘组的分支分析

羊蹄甲属厚盘组作为一个分类实体包含有约１８个种,本组物主要分布于中国南部及中南关岛等地,其中很多种类在其分布区内地理替代现象相当明显,对此组的分支系统学研究,一方面有助于对本组种类系统进化关系的理解,另一方面又为对热亚热亚洲大陆各区系之间关系的理解提供帮助,为本地区的分支生物地理学研究提供材料。本文用３０个形态及叶脉脉序性状对厚盘组进行了分支分析,云南羊蹄甲被选作外类群,内类群包括龙须藤亚组及攀援     

紫荆族的脉序研究

本文对代表豆科云实亚科紫荆族全部五个属．即紫荆属、腺叶紫荆属、格里芬豆属、拟羊蹄甲属和羊蹄甲属的几乎全部系或亚组的１３４个种或种下分类单元的叶脉序进行了研究,并描述了本族２０个基本脉序类型．在紫荆族中,腺叶紫荆属和拟羊蹄甲属的脉序式样非常相似;紫荆属的种类的脉式样以全绿叶,一级脉不及绿等特征组合有别于本族其它属;格里芬豆属的脉序高度特化,有别于紫荆亚族的所有类群;羊蹄甲属是叶脉序式样最多样化的类群．在羊蹄甲属中,羊蹄甲亚属和显托亚属的脉序式样非常多样化．Ｅｌａｙｕｎａ亚属的两个组和Ｂａｒｋｌｙａ亚属的脉序式样非常相似．Ｂａｒｋｌｙａ亚属的仅有种了香叶羊蹄甲的脉序仅以其叶全缘区别于Ｅｌａｙｕｎａ亚属．脉序性状支持把Ｃａｎｓｅｎｉａ系、白花羊蹄甲系、羊蹄甲系、绿花羊蹄甲亚组、总状花羊蹄甲亚组、Ｅｌａｙｕｎａ亚属、伞房系、Ｃｈｌｏｒｏｘａｎｔｈａｅ系、棒花系、掌叶组和萼管组等作为自然类群的观点．在本族植物的脉序类型中,一级脉及缘、全缘叶、发育完好的脉岛等性状常相关出现;另一方面,一级脉不及缘,具二小叶或叶深裂,脉岛发育不完善及盲脉多分枝等性状常相关出现．如同形态和花粉性状,脉序性状能为紫荆族的分类提供另一方面的佐     

中国植物区系地理学研究的回顾和展望

植物区系地理学是研究世界或某一地区植物种类的组成、现代和过去的分布以及它们的起源和演化历史的科学。植物区系地理学的研究内容包括广义植物地理学中的植物科属地理学、植物分布学和植物历史地理学３个部分。植物区系地理学是生物地理学的一个分支,是植物学和地理学...     

分支系统学评述

本文论述了分支分类学说的主要内容及有关问题。全文包括7方面的内容：(1)分支分类学说 的哲学原理为波普尔的证伪主义科学哲学;(2)分支分析的三个基本原则是近裔共性原则、严格单系 原则及简约性原则;(3)分支分析的工作步骤包括：单系类群的确立、性状分析、分支分析运算、分支图与分类系统的建立及分支图与性状再分析;(4)本文讨论厂分支分类学派、表型分类学派与演化 分类学派;(5)由于板块构造理论及分支分析的兴起,生物地理学发生了重大变化,出现了传统的演化生物地理学、系统发育生物地理学及替代生物地理学争鸣的局面;(6)由于杂交导致性状矛盾,因 此可以由分支分析识别杂种;(7)由科学理论的三条标准来看,分支系统学属于严格意义的科学理论。     

虎耳草属山羊臭组的界定和系统发育: 核糖体DNA ITS序列证据

虎耳草属Saxifraga山羊臭组sect. Ciliatae是该属中最大的一个组, 共有175种, 主要分布在喜马拉雅地区, 我国分布有166种, 占总种数的95%; 其中, 112种为中国特有。约80%的种类分布在我国青藏高原和西南地区, 是中国喜马拉雅植物成分的代表类群。山羊臭组内物种分化十分显著, 分类处理也很困难, 该组是否为单系类群, 组下的系统发育关系也不清楚, 均需进一步验证。本文测定了虎耳草属山羊臭组及其他组33种植物样品的核糖体DNA内转录间隔区ITS序列, 并从GenBank调取虎耳草组sect. Saxifraga等组和近缘属唢呐草属Mitella共22种植物的该序列。ITS分析结果表明: (1)所研究的山羊臭组类群聚为单独一支, 而且与垫状组sect. Porphyrion、虎耳草组、球茎组sect. Mesogyne和仅在欧洲分布的sect. Cymbalaria和sect. Cotylea等8个组聚成的另一分支构成姊妹群; (2)根据形态特征建立的山羊臭组的3个亚组即唐古拉亚组subsect. Hirculoideae、莲座状亚组subsect. Rosulares和具芽亚组subsect. Gemmiparae各自聚为一支, 但是莲座状亚组这一支的支持率较低。同时, 山羊臭组的鞭匐枝亚组subsect. Flagellares和subsect. Hemisphaericae的代表类群单独聚为一支, 位于具芽亚组类群分支内部而不能成立; (3)唐古拉亚组和莲座状亚组又聚为一亚分支与具芽亚组构成姊妹群, 而且具芽亚组最早从山羊臭组这一支中分化出来。我们的研究还发现山羊臭组内种间形态分化较大, 而ITS碱基变异较小, 这可能是山羊臭组类群在青藏高原及毗邻地区的高山环境下物种快速分化的结果。     

最小生成树MST的系统学和生物地理学意义

概述了最小生成树和泛生物地理学中的轨迹分析的概念。采纳Ｐａｇｅ关于轨迹等同于最小生成树的观点。在此基础上分析和阐述了最小生成树四个方面的系统学和生物地理学意义：１作为分类群或分布区一种相似性关系的直观表达;２作为有别于系统聚类的一种数值分类途径;３其网络结构有效地表在字有机体的种系发生关系;４轨迹等同于最小生成,因而是定量生物地理学研究有的效手段。作为一个应用,试构建我国１０个主要山体间种子植物区     

子树分析和TASS程序及其在锦鸡儿属植物中的应用

子树分析和三分法(TASS)程序是历史生物地理学中分布区关系的一种分析途径.它以分类群分支图为基础,以剔除其中分布区关系相悖理的结点并确定具信息的子树为目标,以便更有效地利用分布区信息.对分布区关系可以用若干子树和一个分布区分支图来表示.对锦鸡儿属(Caragana)植物72种和13个分布区的子树分析和TASS程序运算后,得到7个具信息的子树,它们分别表达了锦鸡儿属属内组、系所具有的分布区关系.属的分布区分支图也表达了13个分布区的关系.与以前我们对本属成分分析的结果相吻合.     

中国特有果蝇 Drosophila curviceps 种亚组在Drosophila immigrans种组中的种系发生地位

果蝇immigrans种组中的curviceps种亚组是1992年新建立的中国特有果蝇类群。该种亚组中的物种主要分布在中国大陆和台湾。目前除了形态学水平的研究外,还没有其他证据支持建立该种亚组的合理性及其起源和种系发生地位。为了在DNA分子水平上探讨果蝇curviceps种亚组在果蝇immigrans种组中的种系发生地位,从而为今后更深入地研究中国特有果蝇,甚至为果蝇亚属的进化遗传学提供理论依据,测定了immigrans种组5个种亚组（nasuta、immigrans、hypocausta、quadrilineata、curviceps)中12个代表物种的rDNA的ITS1和部分Adh基因的序列。其中ITS1序列的长度为513－587bp,共有191个信息位点;Adh基因片段的长度在714－747bp之间,共99个信息位点。考虑到单个分子提供的信息较少,将两个分子的序列综合起来,组成一个较长的复合序列。分别根据ITS1,Adh和两个分子的复合序列排比（Alignment)结果,和最大简约法和邻接法构建分子系统树,其中根据复合序列构建的系统树与形态学研究结果最为一致。分子树显示curviceps种亚组的特种确定单独形成一个分枝,为种亚组级的分类阶元,支持了形态学将其建立为一个新种亚组。根据Kimura距离,估算了复合分子的替换速率约为每百万年1．48％,进而计算出5个种亚组的分 歧年代。结合各物种的地理分布,推测了immigrans种组的进化历史：curviceps种亚组与quadrilineata种亚组的亲缘关系最近,主要分布在中国南部的温带地区。它们之间的分歧时间大约为3．4百万年,是最年轻的两个种亚组。主要分布在苏门答腊及附近的热带地区的hypocausta种亚组的物种是最早分化出来的,与其他种亚组的分歧时间约为9．2百万年。该结果与形态学和生物地理学研究相吻合。值得一提是的,目前归属仍存在争议的物种D.neohypocausta,在分子系统树中与hypocausta种亚组的物种相距较远,而与immiagrasn种亚组的关系较近,但分枝置信度较低（＜50％）。由于还缺乏其他方面的证据,因此D.neohypocausta的归属有待今后的研究来作定论。     

子树分析和TASS程序及其在锦鸡儿属植物中的应用

子树分析和三分法 (TASS)程序是历史生物地理学中分布区关系的一种分析途径。它以分类群分支图为基础 ,以剔除其中分布区关系相悖理的结点并确定具信息的子树为目标 ,以便更有效地利用分布区信息。对分布区关系可以用若干子树和一个分布区分支图来表示。对锦鸡儿属 (Caragana)植物 72种和 13个分布区的子树分析和TASS程序运算后 ,得到 7个具信息的子树 ,它们分别表达了锦鸡儿属属内组、系所具有的分布区关系。属的分布区分支图也表达了 13个分布区的关系。与以前我们对本属成分分析的结果相吻合。     

中国姬鼠属的系统学研究述评

姬鼠属分布在欧亚大陆及其邻近的岛屿上, 种类及数量均较多。但对该属的分类和系统发育关系一直存在争议, 尤其近几年对姬鼠属分子系统学的研究, 产生了一些与形态学、生物地理学等研究不同的结果。文章综述了姬鼠属系统学研究的一些工作, 根据所归纳的初步论点, 试拟定了中国现生种类的系谱; 并对中国姬鼠属系统学的进一步研究, 提出了一些建议。     

Circumscription and phylogeny of Saxifraga sect. Ciliatae: Evidence from nrDNA ITS sequences

The largest section of the genus Saxifraga (Saxifragaceae), sect. Ciliatae, consists of 175 morphologically diverse species. This section is mainly distributed in the Qinghai-Tibetan Plateau and adjacent regions of southwest China and more than 80% of the total number of species are endemic to this region. It remains unknown whether this section is monophyletic and up to now no study has been conducted on the infra-sectional phylogeny. In this study, ITS sequences of the nuclear ribosomal DNA were firstly determined for 33 species mainly from this section and related sections. We further downloaded the corresponding sequences of the same DNA region for the other 22 species of Saxifraga and Mitella from GenBank. All sequences were together used to construct the phy-logenetic trees. The main implications of the phylogenetic analyses include: (1) sect. Ciliatae, as traditionally defined, constitutes as a monophyletic clade and its sister group is a well supported clade that includes species from 8 sections such as sect. Porphyrion, sect. Saxifraga and sect. Mesogyne; (2) three morphological subsections, i.e., subsect. Gemmiparae, subsect. Hirculoideae and subsect. Rosulares were tentatively recovered despite the relatively low statistic bootstrap support for the last one; however, subsect. Flagellares and subsect. Hemi-sphaericae were not recognized as separate entities, and nested within subsect. Gemmiparae; (3) subsect. Hircu-loideae and subsect. Rosulares clustered together as sister subclades while subsect. Gemmiparae diverged early. In addition, our results suggest that the paired variation of ITS sequences in sect. Ciliatae is relatively low between the sampled species in spite of their diverse morphology. It is suggested that such a scenario may mirror rapid speciation in this section that probably trigged by the uplifts of the Qinghai-Tibetan Plateau and the extensive selection pressure under the alpine environments.     

Phylogenetic relationships among Lactuca (Asteraceae) species and related genera based on ITS-1 DNA sequences

Internal transcribed spacer (ITS-1) sequences from 97 accessions representing 23 species of Lactuca and related genera were determined and used to evaluate species relationships of Lactuca sensu lato (s.l.). The ITS-1 phylogenies, calculated using PAUP and PHYLIP, correspond better to the classification of Feráková than to other classifications evaluated, although the inclusion of sect. Lactuca subsect. Cyanicae is not supported. Therefore, exclusion of subsect. Cyanicae from Lactuca sensu Feráková is proposed. The amended genus contains the entire gene pool (sensu Harlan and De Wet) of cultivated lettuce (Lactuca sativa). The position of the species in the amended classification corresponds to their position in the lettuce gene pool. In the ITS-1 phylogenies, a clade with L. sativa, L. serriola, L. dregeana, L. altaica, and L. aculeata represents the primary gene pool. L. virosa and L. saligna, branching off closest to this clade, encompass the secondary gene pool. L. virosa is possibly of hybrid origin. The primary and secondary gene pool species are classified in sect. Lactuca subsect. Lactuca. The species L. quercina, L. viminea, L. sibirica, and L. tatarica, branching off next, represent the tertiary gene pool. They are classified in Lactuca sect. Lactucopsis, sect. Phaenixopus, and sect. Mulgedium, respectively. L. perennis and L. tenerrima, classified in sect. Lactuca subsect. Cyanicae, form clades with species from related genera and are not part of the lettuce gene pool.     

铁线莲属菝葜叶铁线莲组修订

对毛茛科Ranunculaceae铁线莲属Clematis的菝葜叶铁线莲组sect. Naraveliopsis进行了全面修订, 确定此组共含21种1亚种和1变种; 写出此组的分类学简史和地理分布, 并讨论了此组在铁线莲属中的系统位置; 将此组划分为3亚组, 写出分亚组、分种检索表, 以及各种植物的形态描述、地理分布、生长环境等, 并附有多数种的墨线图。根据对此组植物形态特征的分析, 观察到以下重要演化趋势: (1)叶从单叶演变到二回羽状复叶或二回三出复叶; (2)花从两性到单性, 从无退化雄蕊到有退化雄蕊; (3)雄蕊从无毛到有毛; (4)药隔突起从短(0.5-0.7 mm)到长(8.5-10 mm)。根据上述演化趋势,花两性、雄蕊被毛、退化雄蕊存在的荔波铁线莲亚组subsect. Liboenses(1种,特产贵州荔波)和花由两性变为单性的亚组subsect. Macgregorianae(2种,特产菲律宾)被认为是菝葜叶铁线莲组的进化群。在原始的菝葜叶铁线莲亚组subsect. Smilacifoliae(花两性,雄蕊无毛; 18种,广布亚洲热带地区)中,具单叶,花无退化雄蕊,药隔突起较短的菝葜叶铁线莲C. smilacifolia和滇南铁线莲C. fulvicoma被认为是较原始的种,而具三出复叶和退化雄蕊的C. vietnamensis和丝铁线莲C. loureiriana,以及具羽状复叶和长药隔突起(长达10 mm)的C. papillosa等3种则被认为是此亚组的进化种。自中南半岛北部山地向西经云贵高原南部至喜马拉雅东部山区集中分布有菝葜叶铁线莲组的13种植物,这一山区地带被认为是此组的分布中心。在此山区地带中,菝葜叶铁线莲的分布区和滇南铁线莲的分布区重叠部分的山区可能是此组的起源中心。     

山茶属油茶组、短柱茶组和红山茶组植物叶的红外光谱分析及其分类学意义

利用傅立叶红外光谱仪和OMNI采样器直接、迅速、准确地测定山茶属Camellia4组63种2变种植物叶片的红外光谱,结果表明：各分类群（种）的红外光谱具有高度特异性,其红外光谱图的变化可以作为山茶属植物属下的分类依据之一。这也暗示了利用标准红外光谱图库,可以区分和鉴定出山茶属植物的种类。经主成分分析后的红外光谱数据构建的树型聚类图与先前的形态分类结果大体一致,能将油茶组sect.Oleifera和短柱茶组sect.Paracamellia植物明显区分,并且各组中亲缘关系较近的种聚在一起。因此支持它们作为两个独立的组处理。但是,红山茶组sect.Camellia内的滇山茶亚组subsect.Lucidissima和光果红山茶亚组subsect.Reticulata植物在聚类图上很难区分,建议将这两个亚组植物进行归并。最后讨论了张宏达和闵天禄系统中存在分歧的油茶组、短柱茶组和红山茶组内的种间分类关系。     

FTIR spectra of Camellia sect. Oleifera,sect. Paracamellia,and sect. Camellia (Theaceae) with reference to their taxonomic significance

Sixty-five leaf samples in sect. Oleifera H. T. Chang, sect. Paracamellia Sealy, sect. Camellia, and sect. Thea (L.) Dyer of genus Camellia L. were discriminated directly with an OMNI-sampler accessory on the basis of biochemical profiles and a hierarchical dendrogram was finally constructed. The results showed that the infrared spectra of Camellia were fingerprint-like patterns which were highly typical for different taxa. The hierarchical dendrogram based on principal component analysis of Fourier Transform Infrared (FTIR) data confirmed most of morphological classifications of the four sections proposed in previous works. Infrared spectra of leaves are of taxonomic value in genus Camellia, and this technique can be widely used for identification and classification of other taxa when standard spectra are available. The relationships between sect. Oleifera and sect. Paracamellia, subsect. Lucidissima H. T. Chang and subsect. Reticulata H. T. Chang in sect. Camellia, and the species/varieties were also discussed, as many dissensions about the classification exist between Chang’s and Ming’s system.     

A revision of Clematis sect. Aspidanthera s.l. （ Ranunculaceae ）

对毛茛科铁线莲属Clematis L.的单性铁线莲组sect. Aspidanthera Spach s.l.进行了全面修订,确定此组共含72种和15变种,这些种被归类于6个亚组中,其中包括首次描述的1系、5种和2变种,以及做出的2新等级.对单性铁线莲组的分类学简史和地理分布做了介绍.写出了组、亚组、系的形态特征和地理分布,分亚组检索表及各亚组的分种检索表;以及各种植物的形态描述、地理分布、生长环境等,并附有多幅插图.在研究了此组全部种类的标本之后,观察到此组几个重要形态特征的演化趋势(1)萼片在数目上由4枚演变到8枚,在开展方向上由平展到直上展,在形状上由长圆形到狭条形,在长度上由比雄蕊稍长到2-4倍长于雄蕊,其卷叠式由镊合状到次生的覆瓦状;(2)花药药隔顶端由不具突起到具短或长的突起;(3)雌花退化雄蕊的数目由多数到定数、少数,以至完全消失;(4)花序自当年生枝的叶腋发生演变到与数叶同自老枝的一腋芽中发出.根据上述演化趋势推断本组各亚组间的亲缘关系如下subsect. Dioicae (34种,广布于北美洲和南美洲)的花构造(萼片4,镊合状排列,平展,通常呈长圆形,稍长于雄蕊或近等长,外面边缘被短绒毛;雄蕊花药呈长圆形,药隔顶端无突起;雌花具多数退化雄蕊;花序自当年生枝的叶腋发出)与具两性花的威灵仙组欧洲铁线莲亚组sect. Clematis subsect. Clematis 的花极为相似,区别主要在于本亚组的花为单性,由此判断subsect. Dioicae可能是单性铁线莲组sect. Aspidanthera的原始群,源出于欧洲铁线莲亚组.本组的第二亚组subsect. Lasianthae(2种,分布于北美西南部)与subsect. Dioicae 在亲缘关系上极为相近,区别只在于其花序或具花当年生枝与数叶一同由老枝的一个腋芽中发出,此亚组当是从subsect. Dioicae衍生出的一个小群.第三亚组subsect. Microphyllae(7种,特产澳大利亚)也与subsect. Dioicae相近缘,但此亚组的萼片变狭长,多呈条形或狭条形,常2-4倍长于多少变短的雄蕊,雌花的退化雄蕊数目变少,16-2枚,根据这些进化特征,推测此亚组也源出于subsect. Dioicae.第四亚组subsect. Aristatae (16种,分布于澳大利亚、新几内亚及邻近岛屿)与subsect. Microphyllae 在亲缘关系上相近,但本亚组的花药药隔顶端具短或长的突起而不同,根据此进化特征,推测本亚组系由后者演化而出.第五亚组subsect. Hexapetalae (11种,特产新西兰)的花构造与分布于澳大利亚的subsect. Microphyllae相似,但其萼片为覆瓦状排列,外面边缘不被短绒毛,在多数种多于4枚,为5-8枚而不同.据Godley 的研究,本亚组中的C. afoliata的花有4枚萼片,排成2轮,每轮的2枚萼片均为近镊合状排列;另外,在C. paniculata花的6枚萼片中,4枚为覆瓦状排列,其他2枚有时内向镊合状排列.从上述情况可见此亚组的萼片覆瓦状卷叠式可能是由镊合状卷叠式演变而来的一种次生现象,并由此推测,此亚组可能与subsect. Microphyllae相同,也源自美洲的subsect.Dioicae.最后一个亚组subsect. Insidiosae(2种,特产马达加斯加)的雌花萼片直上展,退化雄蕊完全消失,具有这些进化特征,当是单性铁线莲组的进化群,可能源出自具定数或少数退化雄蕊的subsect. Microphyllae.     

A revision of Clematis sect. Aspidanthera s.l. (Ranunculaceae)

1　BrieftaxonomichistoryInthefirstrevisionofthegenusClematisL .madebydeCandolle (1818) ,some 17unisexualspecieswererecognizedandallputinthelargeheterogeneoussectionFlammulaDC .,andtogetherwithotherbisexualspecieswereclassifiedintofivegroups:C .peruvianaDC .andC .caracasanaH .B .K .(=C .guadeloupaePers.)with 14speciesofsect.Clematis,sect.Brachiatae ,sect.Meclatis,andsect.Viornasubsect.Connataewereplacedintothefirstgroup ,whichwasdiag nosedas“Floribuspaniculatis,foliispinnatimbipinnatim…     

四川铁线莲属二新种

描述了自四川东南部发现的毛茛科铁线莲属二新种:黄荆铁线莲和古蔺铁线莲。     

铁线莲属单性铁线莲组修订

对毛茛科铁线莲属Clematis L.的单性铁线莲组sect. Aspidanthera Spach s.l.进行了全面修订,确定此组共含72种和15变种,这些被归类于6个亚组中,其中包括首次描述的1系、5种和2变种,以及做出的2新等级。对单性铁线莲组的分类学简史和地理分布做了介绍。写出了组、亚组、系的形态特征和地理分布,分亚组检索表及各亚组的分种检索表;以及各种植物的形态描述、地理分布、生长环境等,并附有多幅插图。在研究了此组全部种类的标本之后,观察到此组几个重要形态特征的演化趋势：(1)萼片在数目上由     

Phylogenetic analysis of Paeonia sect. Moutan (Paeoniaceae) based on multiple DNA fragments and morphological data

Tree peony, being crowned the title “King of Flowers” in China, is of great medicinal, ornamental, and economic values. In the present study, the phylogeny of the wild tree peony species (section Moutan, Paeonia, Paeoniaceae), represented by twelve accessions collected from all eight species in the section, was investigated based on the DNA sequence in five DNA fragments from both nuclear (Adh1A, Adh2 and GPAT) and chloroplast (trnS-trnG and rps16-trnQ) genomes, as well as morphological characters. Both maximum parsimony (MP) and Bayesian inference of phylogeny (BI) trees were reconstructed based on the combined data of the DNA sequences and morphological data, respectively. The MP and BI trees have the similar topology, and the sect. Moutan clearly branched into two clades. One clade consists of two species, P. delavayi and P. ludlowii, corresponding to the subsect. Delavayanae, and another clade is composed of other six species. Within the second clade, the six species can be divided into three subclades consisting of P. rockii and P. decomposita, P. jishanensis and P. qiui, P. suffruticosa and P. ostii, respectively. Among the three subclades, P. jishanensis/P. qiui is most closely related to P. suffruticosa/P. ostii. These results provide up to date the clearest picture of the phylogeny of wild tree peony species in the sect. Moutan.