RT—nested PCR检测肾综合征出血热患者血清病毒核酸

采用异硫氰酸胍－酚－氯仿（ＡＧＰＣ）一步法提取病毒ＲＮＡ,并依据肾综合征出血热病毒（ＨＦＲＳＶ）核蛋白（ＮＰ）编码基因保守区核苷酸序列合成两对巢式引物,建立了逆转录巢式聚合酶链反应（ＲＴ－ｎｅｓｔｅｄＰＣＲ）检测ＨＦＲＳＶＲＮＡ方法,应用此法对ＨＦＲＳＶ感染的ＶｅｒｏＥ６细胞培养液及ＨＦＲＳ患者血清中的病毒ＲＮＡ进行检测。结果显示,感染细胞培养液及３５例ＨＦＲＳ患者血清均为阳性,正常的ＶｅｒｏＥ６     

应用反转录-套式PCR方法检测肾综合征出血热病人血清中的汉坦病毒特异性RNA

采用５′端生物素标记汉滩病毒特异性寡核苷酸探针,结合磁性分离技术和异硫氰酸胍－酚一步法（胍酚法）提取病毒ＲＮＡ,进行反转录－套式ＰＣＲ,检测肾综合征出血热（ＨＦＲＳ）病人血清样本,胍酚法能检测血清中至少几个ＰＦＵ病毒的ＲＮＡ,比磁珠法敏感１０倍,整个检测过程在５小时完成。应用该方法对１３７份汉滩型和汉城型ＨＦＲＳ病人血清进行检测分型,总阳性率达６０．５０％。其中,病程在７日以内（急性期）的病人血清仍能检测到２２．７３％阳性率。扩增产物经打点杂交检测证实为特异性扩增,并能准确分型。与空斑减少中和试验（ＰＲＮＴ）分型的符合率为１００％。对２０份正常人及２４份非ＨＦＲＳ患者血清进行ＰＣＲ扩增,结果均为阴性。将全部试剂做成试剂盒,为基层单位早期诊断肾综合征出血热病人提供了操作简便、特异、敏感、快速、直接的诊断方法。     

植物总DNA样品的快速制备

利用Ｑｉａｇｅｎ微量植物ＤＮＡ提取试剂盒,在１小时内即可从植物组织获得总ＤＮＡ,提取过程中勿需酚／氯仿和ＳＤＳ抽提,操作简便、快捷。所得ＤＮＡ样品的ＯＤ２６０／ＯＤ２８０值在１．７－１．９之间。样品纯度高;该样品不含ＰＣＲ反应抑制剂及其他酶反应抑制剂,可被各种限制性内酶完全降解,适合于ＰＣＲ、印迹、ＲＡＰＤ、ＡＦＬＰ和ＲＦＬＰ分析等各种下游应用。     

一种适宜微量全血检测HBV-DNA裂解液的评价

通过核裂解液与氯仿／酚处理法以及与另四个生产厂家的裂解液对指尖全血处理法的比较,检测ＨＢＶ－ＤＮＡ的结果表明：该裂解液可更有效除去全血中对Ｔａｑ酶有抑制性作用的血卟啉,扩增结果与用血清作标本结果一致,表明指尖全血用这种裂解液处理完全替代血清标本用于ＨＢＶ－ＤＮＡ的ＰＣＲ检测。     

一种适宜微量全血检测HBV—DNA裂解液的评价

通过核裂解液与氯仿／酚处理法以及与另四个生产厂家的裂解液对指法全血处理法的比较,检测ＨＢＶ－ＤＮＡ的结果表明：该裂解液可更有效除去全血中对Ｔａｑ酶有抑制性作用的血卟啉、扩增结果与用血清作标本结果一致,表明指尖全血用这种裂解液处理完全替代血清标本用于ＨＢＶ－ＤＮＡ的ＰＣＲ检测。     

应用反转录——套式PCR方法检测肾综合征出血热病人血清中的汉坦病…

采用５’端生物素标记汉滩病毒特异性寡核苷酸探针,结合磁性分离技术和异硫氰酸胍－酚一步法（胍酚法）提了病毒ＲＮＡ,进行反转录－套式ＰＣＲ,检测肾综合征出血热（ＨＦＲＳ）病人血清样本,胍酚法能检测血清中至少几个ＰＦＵ病毒的ＲＮＡ〉比磁珠法敏感１０倍,整个检测过程在５小时完成。应用该方法对１３７份汉滩型和汉城型ＨＦＲＳ病人血清进行检测分型,总阳性率达６０．５０％。其中,病程在７日以内（急性期）的从血清仍     

聚合酶链反应快速检测胃组织和唾液中的幽门螺杆菌

针对幽门螺杆菌（ＨＰ）尿素酶Ａ基因设计一对引物进行聚合酶链反应,检测１株ＨＰ标准株和７株临床分离株均阳性,而４株其它肠道菌均阴性,特异性１００％。１０倍系列稀释试验表明敏感性达到１００ｐｇＤＮＡ水平。从３５例胃镜检查者取幽门旁组织块进行快速和常规尿素酶试验,细菌培养及ＰＣＲ检测,１５例ＨＰ阳性者ＰＣＲ检测也为阳性,其中７例阳性者有３例唾液ＰＣＲ检测为阳性,表明ＨＰ确存在于口腔中。本研究采用直接热裂解法处理临床标本,取其粗提物行ＰＣＲ,免除复杂的酚一氟仿抽提步骤,该法简便快速,且损失小,成功率高,在临床实验诊断中有推广价值。     

大鼠脑神经元特异性烯醇化酶基因的cDNA克隆及序列分析

用ＲＴ－ＰＣＲ方法快速克隆了Ｗｉｓｔａｒ大鼠脑神经元特异性烯醇化酶（ＮＳＥ）的ｃＤＮＡ,将此包括编码全长ＮＳＥ４３３个氨基醚的ＤＮＡ片段重组入ｐＵＣ质粒,并用ＰＣＲ方法测定了全部顺序,经重复实验,发现Ｗｉｓｔａｒ大鼠与Ｆｏｒｓｓ－Ｐｅｔｔｅｒ报导的ＳＤ大鼠ＮＳＥ基因顺序,有两外单碱基的差别,其中一个涉及氨基酸的改变。同时还对ＲＮＡ的提取及长片段ＤＮＡ的ＲＴ－ＰＣＲ扩增进行了方法学的探讨。     

大鼠脑神经元特异性烯醇化酶基因的cDNA克隆及序列分析

用ＲＴ－ＰＣＲ方法快速克隆了Ｗｉｓｔａｒ大鼠脑神经元特异性烯醇化酶的ｃＤＮＡ,将此包括编码全长ＮＳＥ４３３个氨基酸的ＤＮＡ片段重组入ｐＵＣ质粒,并用ＰＣＲ方法测定了全部顺序,经重复实验,发现Ｗｉｓｔａｒ大鼠与Ｆｏｒｓｓ－Ｐｅｔｔｅｒ报导的ＳＤ大鼠ＮＳＥ基因顺序,有两处单碱基的差别,其中一个涉及氨基酸的改变,同时还对ＲＮＡ的提取及长片段ＤＮＡ的ＲＴ－ＰＣＲ扩增进行了方法学的探讨。     

PCR扩增葡萄球菌肠毒素A全长基因方法的建立及意义

为了分析和克隆葡萄球菌肠毒素（ＳＥ）Ａ全长基因,设计了一对针对ＳＥＡ全长基因的特异性引物,成功地用ＰＣＲ反应从标准产ＳＥＡ的葡萄球菌基因组中扩增出了一条约７７０ｂｐ的条带,为进一步用ＰＣＲ法克隆ＳＥＡ基因,并把它用于抗肿瘤研究奠定了实验基础     

Determination of hepatitis B virus DNA in serum by molecular hybridization

Hepatitis B virus (HBV) DNA was detected by direct spotting of alkali-denatured serum on a nitrocellulose filter and molecular hybridization with cloned HBV DNA as the probe. Measurement of the autoradiographic signals as the intensity of hybridization allowed the quantitation of HBV DNA content in serum specimens in reference to cloned HBV DNA. Direct spotting of denatured serum was approximately three times as sensitive as the conventional method in which proteinase-treated serum was extracted with phenol-chloroform. The intensity of hybridization with 25 specimens of HB virion concentrates correlated well with DNA polymerase activity (r = 0.89, P less than 0.01).     

乙型肝炎病毒DNA在患者血清及肝组织中存在状态的研究

对29例肝炎,1例尸检肝组织和血清中乙型肝炎病毒的DNA(HBV DNA)进行了研究,发现HBsAg( )/HBeAg( )患者中,有9/17(52.94％)血清HBV DNA阳性;HBsAg( )/抗-HBe( )患者中,2/6(33.33％)也为阳性。从30例肝组织中提取DNA经琼脂糖电泳,Southern吸印转移及分子杂交试验结果表明,27例HBV DNA阳性,全部有游离型HBV DNA。27例中有5例经用标记pBR322探针杂交排除非特异杂交带后,在高分子量区有HBV DNA特异的杂交带,提示有HBV DNA整合。     

乙肝病毒标志物在胎儿和胎盘组织中的表达及其与 HBV母婴传播关系的研究

目的通过对乙肝阳性产妇外周血、胎儿及胎儿附属物进行乙肝病毒标志物的检测,探讨HBV宫内感染发生的机制。方法通过ELISA法及实时荧光定量PCR法检测血清标本中HBV标志物及HBV DNA水平;通过对组织标本的免疫组织化学染色检测组织中HBV标志物的表达。结果胎儿脐血HBV DNA水平与母血HBV DNA水平相关,母血HBV DNA高水平(≥107copy/mL)时脐血HBV DNA阳性率明显增高,P<0.05。胎儿脐血HBV DNA水平显著低于母血HBV DNA水平,P<0.05。胎盘组织可见HBsAg免疫组织化学染色阳性,但未发现HBcAg染色阳性。在引产胎儿胎肝和胎肾组织中发现HBsAg和/或HBcAg免疫组织化学染色阳性细胞。结论母亲HBV DNA高水平是发生HBV宫内感染的高危因素。脐血HBV DNA阳性是判断HBV宫内感染的相关指标;HBV可能通过胎盘感染的途径由母体进入胎儿体内,并可能在胎儿体内定位和复制,这可能是导致HBV宫内感染的原因。     

生物素标记HBV RNA探针的制备及应用

本文首次采用ＳＰ６５特殊质粒与人类的乙型肝炎病毒ＤＮＡ重组,制备了Ｂｉｏ－ＨＢＶ ＲＮＡ探针,能特异地与ＨＢＶ ＤＮＡ杂交,将该探针与缺口转移方法标记的Ｂｉｏ－ＨＢＶ ＤＮＡ探针进行了比较,结果显示出Ｂｉｏ－ＨＢＶ ＲＮＡ探针比Ｂｉｏ－ＨＢＶ ＤＮＡ探针的敏感性提高１０倍,并分别应用两种探针同时检测７０例乙肝病人血清中ＨＢＶ ＤＮＡ,阳性率各为３１．４２％、２８．５７％（Ｐ＞０．２５）。对Ｂｉｏ－     

HBV套式PCR技术的建立及HBcAb血清的检测

本文实验设计了套式ＰＣＲ引物进行ＨＢＶＤＮＡ诊断。外引物限定ＨＢＶＣ基因的一个６１３ｂｐ片段,内引物限定其内－５０７ｂｐ的片段,扩增后产物被限制性内切酶图谱证明。该技术的特异性强,重复性好,灵敏性达到１－１０ｆｇ,对ＨＢＶ血清可做出明确诊断。应用这项技术,对４２例ＨＢｃＡｂ血清进行了检测,实验表明仅ＨＢｃＡｂ阳性血清同带ＨＢｓＡｇ的ＨＢｃＡｂ阳性血清一样,体内持续进行着大量ＨＢＶＤＡＮ复制。     

Quantitation of hepatitis B virus DNA in serum of patients with hepatoma

Hepatitis B virus (HBV) DNA in the serum of 31 patients with histologically confirmed primary hepatocellular carcinoma (PHC) from Malaysia and Indonesia was quantitated by densitometric scanning of autoradiograms obtained by Southern blot DNA hybridization, after electrophoresis using a 32P DNA cloned into plasmid pBR325 as a probe. This quantitation after electrophoresis is more informative than the usual spot hybridization technique. Five of the 31 sera were positive for HBV DNA. Levels ranged between 1.36 pq and 143.18 pq per ml of serum, and the levels of HBsAg, anti-HBs, anti-HBc, HBeAg and anti-HBe in the serum were serologically determined. All five sera positive for HBV DNA were also positive for HBsAg. Three of the five positive for HBV DNA were positive for HBeAg and negative for anti-HBe. Two of the sera positive for HBV DNA were negative for HBeAg but positive for anti-HBe. All sera negative for HBV DNA were also negative for HBeAg. Many sera which were negative for HBV DNA and HBeAg were positive for HBsAg. Of the 31 sera from PHC patients, 23 had at least one HBV marker positive (74.2%).     

两种抽提乙型肝炎病毒共价闭合环状DNA方法的效果比较

乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)作为一种嗜肝DNA病毒,在感染肝细胞后会在细胞核中形成病毒转录复制的模板和基因储存库--共价闭合环状DNA(covalently closed circular DNA, cccDNA),其持续存在是乙型肝炎慢性化和难以治愈的核心,也是此研究领域内的重点。从细胞样品中稳定抽提获取cccDNA对于保证cccDNA检测的准确性至关重要。Hirt法是一种抽提真核细胞染色体外DNA的方法,被用于HBV cccDNA的抽提,但存在操作复杂和耗时长等问题。为简化操作,有研究对Hirt法进行改良,结合硅胶膜离心柱来抽提染色体外DNA,但尚不清楚该法用于HBV cccDNA抽提与传统Hirt法的效果差异。本研究基于HBV cccDNA细胞转染系统、HBV复制细胞系及感染系统,以DNA印迹(Southern blot)和定量聚合酶链式反应(quantitative polymerase chain reaction, qPCR)作为检测评价手段,平行比较了传统Hirt-酚/氯仿法与改良Hirt-过柱法抽提HBV cccDNA的效果。结果表明,两种方法具有相当的抽提效率和抽提特异性,而改良Hirt-过柱法耗时更短,提示在进行细胞HBV cccDNA抽提时可选择改良Hirt-过柱法以提高实验效率。     

用rAAV8-1.3HBV制备两种品系小鼠乙型肝炎病毒感染模型的比较研究

我们先前用rAAV8-1.3HBV静脉注射C57BL/6小鼠成功地制备了慢性乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)感染模型。为了探讨不同品系的小鼠对rAAV8-1.3HBV静脉注射是否具有不同反应,本研究比较了C57BL/6和BALB/c小鼠静脉注射重组病毒后外周血中HBV抗原和抗体水平、病毒载量和肝脏组织HBcAg表达情况,以及不同剂量重组病毒注射与这些指标的关系。将低(4×109 Viral genome,vg)、中(4×1010vg)和高(4×1011vg)三种剂量的rAAV8-1.3HBV通过尾静脉注射至C57BL/6和BALB/c小鼠,分别利用ELISA和荧光定量PCR方法检测血清中的HBV抗原、抗体水平以及HBV DNA,利用免疫组化检测肝脏组织HBcAg的表达。结果发现,对于C57BL/6小鼠,三种不同剂量rAAV8-1.3HBV注射均可造成100%小鼠出现HBV持续感染;血清HBsAg、HBeAg和HBV DNA以及肝组织HBcAg稳定表达超过8个月,其表达水平随重组病毒注射剂量的增加而升高,高剂量注射时可造成超过40%的肝细胞感染HBV,血清中HBV DNA可达105 IU/mL以上;未检测到针对HBV的抗体。对于BALB/c小鼠,三种不同剂量rAAV8-1.3HBV注射也可造成100%小鼠出现HBV持续感染;血清HBeAg和HBV DNA以及肝组织HBcAg稳定表达超过8个月,但是血清HBsAg在重组病毒注射2周之后显著下降甚至消失;在中剂量注射组的BALB/c小鼠血清中检测到低水平的Anti-HBs;血清HBeAg和肝组织HBcAg的表达水平随重组病毒注射剂量的增加而增高,并且各剂量组表达水平均高于C57BL/6小鼠,高剂量注射时可造成超过50%的肝细胞感染HBV。本研究表明,低至4×109 vg剂量的rAAV8-1.3HBV注射即可造成C57BL/6和BALB/c两种品系小鼠出现HBV持续感染,并且HBV复制水平随重组病毒注射剂量增加而增高;BALB/c小鼠对HBV的免疫反应强于C57BL/6小鼠,可以产生针对HBsAg的体液免疫反应而使血清HBsAg转阴,但无法清除携带HBV的肝细胞。