| 醉马草免培养内生细菌的多样性 |
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| 引用本文： | 张雪兵,史应武,曾军,娄恺.醉马草免培养内生细菌的多样性[J].生态学报,2011,31(8):2178-2187. |
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| 作者姓名： | 张雪兵 史应武 曾军 娄恺 |
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| 作者单位： | 1. 新疆农业科学院微生物应用研究所,乌鲁木齐,830091;新疆农业大学食品学院,乌鲁木齐,830052
2. 新疆农业科学院微生物应用研究所,乌鲁木齐,830091 |
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| 基金项目： | 973计划前期研究专项(2008CB417214);新疆特殊环境微生物实验室开放课题(XJYS0203-2009-02) |
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| 摘 要： | 为了解醉马草内生细菌的组成和多样性,采用液氮研磨法提取醉马草总DNA,利用内生细菌16S rRNA基因特异性引物对醉马草总DNA 进行16S rRNA 基因扩增,构建醉马草内生细菌16S rRNA基因文库。对筛选到249个克隆进行Hae Ш酶切分析,得到57个操作分类单元(OTUs)。系统发育分析将其归为4个门:变形杆菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)以及1个未知类群。其中74%的克隆与可培养细菌中的37个属具有高的16S rRNA基因序列相似性 (97％-100％),其中芽孢杆菌属(Bacillus spp.)、红球菌属(Rhodococcus spp.)、黄杆菌属(Flavobacterium spp.)、黄单胞杆菌属(Xanthomonas spp.)最为丰富。另外26%的克隆序列与GenBank中已存细菌16S rRNA基因序列相似性小于96%。研究结果表明,醉马草中可培养内生细菌丰富,多样并且可能存在一些潜在新物种或新类群。
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| 关 键 词： | 醉马草 内生细菌 免培养法 生物多样性 |
| 收稿时间： | 4/8/2010 12:00:00 AM |
| 修稿时间： | 2010/7/27 0:00:00 |
Endophytic bacterial diversity in Achnatherum inebrians by culture-independent approach |
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| ZHANG Xuebing,SHI Yingwu,ZENG Jun and LOU Kai.Endophytic bacterial diversity in Achnatherum inebrians by culture-independent approach[J].Acta Ecologica Sinica,2011,31(8):2178-2187. |
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| Authors: | ZHANG Xuebing SHI Yingwu ZENG Jun and LOU Kai |
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| Institution: | Institute of Microbiology, Xinjiang Academy of Agricultural Sciences Urumqi 830091,China;College of Food Science of Xinjiang Agricultural University Urumqi 830052,China;Institute of Microbiology, Xinjiang Academy of Agricultural Sciences Urumqi 830091,China;Institute of Microbiology, Xinjiang Academy of Agricultural Sciences Urumqi 830091,China;Institute of Microbiology, Xinjiang Academy of Agricultural Sciences Urumqi 830091,China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Achnatherum inebrians endophytic bacterial culture-independent biodiversity |
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