| 白菜CesA基因家族鉴定及表达模式分析 |
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| 引用本文： | 马宇辰,赵玉梅,黄丹霖,张梦晴,吴晓宇,王 洁,陈 雨,黄家保,段巧红.白菜CesA基因家族鉴定及表达模式分析[J].广西植物,2022,42(12):2021-2031. |
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| 作者姓名： | 马宇辰 赵玉梅 黄丹霖 张梦晴 吴晓宇 王 洁 陈 雨 黄家保 段巧红 |
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| 作者单位： | 1. 山东农业大学 园艺科学与工程学院, 山东 泰安 271000; 2. 作物生物学国家重点实验室, 山东 泰安 271000 |
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| 基金项目： | 山东省自然科学基金重点项目(ZR2020KC017)[Supported by Natural Science Foundation Shandong Province(ZR2020KC017)]。 |
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| 摘 要： | 为探究CesA基因家族在白菜生长发育及纤维素合成过程中的作用机制,该文通过生物信息学的方法,以白菜的全基因组序列为研究区域,进行理化特征、基因结构、进化特征、保守基序及结构域、顺式作用元件和组织表达等鉴定分析。结果表明:(1)共鉴定出16个编码纤维素合成酶亚基的CesA基因,该家族成员所编码蛋白的理论等电点为4.76～9.12,相对分子量为17.76～122.67 kD,长度为153～1 089 aa。(2)15个基因不均匀地分布于白菜的7条染色体上,Bra036008定位于scaffold上。(3)大部分成员包含4～14个外显子,1～11个保守基序。(4)该家族具有保守的DDD-QXXRW 保守功能域。(5)该家族编码蛋白主要分布在质膜上,二级结构以无规则卷曲与α-螺旋为主,多数成员都含有CesA蛋白典型的N端、C端和跨膜区。(6)CesA基因在茎中表达量相对较高,其中Bra011865、Bra023952和Bra029874在茎、叶、花中显著表达。该研究结果为后续深入研究CesA基因功能以及白菜生长发育研究奠定了基础。
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| 关 键 词： | 纤维素合成酶 白菜 CesA 基因家族 基因表达 |
| 收稿时间： | 2021/12/28 0:00:00 |
Identification and expression analysis of CesA
gene family in Brassica rapa var. glabra |
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| MA Yuchen,ZHAO Yumei,HUANG Danlin,ZHANG Mengqing,WU Xiaoyu,WANG Jie,CHEN Yu,HUANG Jiabao,DUAN Qiaohong.Identification and expression analysis of CesA
gene family in Brassica rapa var. glabra[J].Guihaia,2022,42(12):2021-2031. |
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| Authors: | MA Yuchen ZHAO Yumei HUANG Danlin ZHANG Mengqing WU Xiaoyu WANG Jie CHEN Yu HUANG Jiabao DUAN Qiaohong |
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| Institution: | 1. College of Horticultural Science and Engineering, Shandong Agricultural University, Tai''an 271000, Shandong,
China; 2. State Key Laboratory of Crop Biology, Tai''an 271000, Shandong, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | cellulose synthase Brassica rapa var glabra CesA gene family gene expression |
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