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为探究CesA基因家族在白菜生长发育及纤维素合成过程中的作用机制,该文通过生物信息学的方法,以白菜的全基因组序列为研究区域,进行理化特征、基因结构、进化特征、保守基序及结构域、顺式作用元件和组织表达等鉴定分析。结果表明:(1)共鉴定出16个编码纤维素合成酶亚基的CesA基因,该家族成员所编码蛋白的理论等电点为4.76~9.12,相对分子量为17.76~122.67 kD,长度为153~1 089 aa。(2)15个基因不均匀地分布于白菜的7条染色体上,Bra036008定位于scaffold上。(3)大部分成员包含4~14个外显子,1~11个保守基序。(4)该家族具有保守的DDD-QXXRW 保守功能域。(5)该家族编码蛋白主要分布在质膜上,二级结构以无规则卷曲与α-螺旋为主,多数成员都含有CesA蛋白典型的N端、C端和跨膜区。(6)CesA基因在茎中表达量相对较高,其中Bra011865、Bra023952和Bra029874在茎、叶、花中显著表达。该研究结果为后续深入研究CesA基因功能以及白菜生长发育研究奠定了基础。  相似文献   
2.
慈竹C3H基因克隆及其生物信息学分析   总被引:1,自引:1,他引:0  
香豆酸-3-羟化酶(C3H)是调控植物木质素生物合成的关键酶,本文以慈竹为材料,利用RT-PCR技术克隆慈竹C3H基因,并对其进行生物信息学分析,为通过基因工程手段降低工业用竹木质素含量奠定基础。结果表明,该cDNA序列全长为1 581 bp,编码区为1 539 bp,编码512个氨基酸,蛋白分子量为58.33KD,等电点为9.09;氨基酸序列和结构分析显示C3H有一个保守区域,即P450结构域。系统进化分析表明,该基因与毛竹和水稻的C3H基因具有很高的同源性。慈竹与毛竹和水稻C3H基因编码蛋白为亲水性蛋白,这三种编码蛋白很可能定位在内质网(膜)上,其编码蛋白的二级结构及三级结构都含有丰富的α-螺旋和无规卷曲,β-转角和延伸链的含量较少,都含有2个相对保守的无序化区域。该基因已在GenBank上注册,基因序列登录号为JF693629,可能与慈竹木质素的生物合成有关。  相似文献   
3.
目的:研究活化的巨噬细胞来源外泌体在心肌梗塞后心脏重塑中的作用。方法:采用超高速离心分离提取溶血磷脂酸作用下巨噬细胞来源的外泌体,将其与心脏成纤维细胞共同孵育48小时,利用Edu细胞增殖实验、Transwell实验及免疫荧光等方法检测溶血磷脂酸刺激(LPS)下巨噬细胞来源外泌体对心脏成纤维细胞的增殖、迁移以及分化的影响。选取正常C57雄性小鼠32只,根据其是否结扎左侧冠状动脉前降支及是否进行心脏原位外泌体注射,将实验小鼠随机分为:正常组,假手术组,心梗+空白外泌体组及心梗组+LPS刺激外泌体组。手术完成4周后行心脏超声、Masson染色以检测各组实验小鼠心功能状态及心脏纤维化程度。结果:在细胞实验中,LPS刺激的巨噬细胞来源外泌体可以显著增加心脏成纤维细胞的增殖、迁移以及分化能力;在动物实验中,相对于正常组、假手术组及心梗+空白-外泌体组,心梗+LPS-外泌体组小鼠的左心室射血分数及短轴收缩率显著下降,左心室舒张末及收缩末内径显著增加。Masson染色检测提示心肌梗塞+LPS-外泌体组小鼠心脏纤维化程度显著高于其余三组。结论:活化的巨噬细胞来源的外泌体可以显著加速心梗后心脏重塑的进程。  相似文献   
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