| 西葫芦CCD基因家族鉴定及其在果实发育中的表达北大核心CSCD |
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| 引用本文： | 陈敏氡,王 彬,李永平,刘建汀,裘波音,朱海生.西葫芦CCD基因家族鉴定及其在果实发育中的表达北大核心CSCD[J].西北植物学报,2022,42(7):1124-1132. |
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| 作者姓名： | 陈敏氡 王 彬 李永平 刘建汀 裘波音 朱海生 |
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| 作者单位： | (福建省农业科学院 作物研究所，福建省蔬菜遗传育种重点实验室，福州 350013) |
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| 基金项目： | 福建省属公益类科研院所基本科研专项(2019R1031 7)； |
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| 摘 要： | 类胡萝卜素裂解双加氧酶(carotenoid cleavage dioxygenase,CCD)是类胡萝卜素氧化裂解途径中的关键酶,在植物生长发育、香气形成及胁迫响应等过程中均发挥着重要作用。该研究运用生物信息学方法从西葫芦全基因组中鉴定出13条具有完整RPE65保守结构域的CCD基因,为进一步解析CCD基因家族在西葫芦中的功能奠定基础。结果表明:(1)聚类分析显示,13个西葫芦CCD基因编码的蛋白可分为CCD1、CCD4、CCD7、CCD8、NCED、CCD1-like共6个亚组,且CCD8和CCD7亚组与其他家族成员的遗传距离较远。(2)顺式作用元件预测分析发现,CCD基因启动子中含有光信号、激素、环境胁迫和生长发育响应元件。(3)转录组数据分析显示,CCD家族基因具有组织表达特异性,其中3个CCD基因在组织中不表达,CpCCD1基因在叶和果实中显著高表达。(4)在果实发育过程中,8个CCD基因呈现上调表达,2个CCD基因呈现下调表达,其中CpCCD1、CpCCD4a、CpCCD4b、CpCCD8a这4个CCD基因在果实膨大生长期或成熟期出现显著高表达,推测它们可能在西葫芦果实发育过程中具有重要的调控作用。
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| 关 键 词： | 西葫芦 CCD基因家族 生物信息学分析 表达分析 |
Genome wide Identification and Expression Analysis of CCD Gene Family in Fruit Development of Zucchini |
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| CHEN Mindong,WANG Bin,LI Yongping,LIU Jianting,QIU Boyin,ZHU Haisheng.Genome wide Identification and Expression Analysis of CCD Gene Family in Fruit Development of Zucchini[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2022,42(7):1124-1132. |
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| Authors: | CHEN Mindong WANG Bin LI Yongping LIU Jianting QIU Boyin ZHU Haisheng |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | zucchini CCD gene family bioinformatics analysis expression analysis |
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